Nature子刊解码中国仓鼠基因组
在Alfred Pühler教授的领导下，来自比勒菲尔德大学生物技术中心(CeBiTec)的基因组研究人员，成功地对中国仓鼠(Chinese hamster)的基因组进行了测序。研究人员现将他们的结果发表了在国际期刊《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上。 CeBiTec科学主任Thomas Noll相信，他们获得的数据将引起科学和工业团体的兴趣。制药行业一直利用来自中国仓鼠的细胞培养物来生成诸如医用抗体等生物药品。“在未来，解码的仓鼠基因组将大大推动利用这些细胞系来生产药物制剂，”Noll说。 中国仓鼠基因组包含11对染色体。解码这样的大型基因组需要生成大的数据集，然后利用生物信息学对其进行处理。为了更容易地分析生成的数据，比勒菲尔德大学的研究人员和他们的同事，应用了一种全新的程序来对基因组单条染色体进行分类。CeBiTe的Karina Brinkrolf博士完成了对仓鼠......阅读全文
中国农大团队构建首个苹果属图形泛基因组
中国农业大学教授韩振海团队基于30份苹果属植物高质量基因组，系统解析了苹果属数千万年的演化历程，并构建了首个苹果属图形泛基因组，发布了苹果属遗传多样性全景图。日前，相关研究成果发表于《自然-遗传学》。苹果属植物倍性复杂，分布横跨欧亚、美洲等多个地理区域，是研究基因组多倍化与杂交的重要木本植物类群。全
分析比产生更快？中国“智”造全基因组组装算法
10年前，Illumina基因组测序技术进入市场时，前所未有的庞大数据量淘汰了较早开发的测序分析工具。 历史总是重演。如今，第三代测序技术已经达到低成本群体测序规模的临界点。 12月10日，《自然—方法学》在线发表了第一个能够跟上基因组测序产生速度的组装算法。 论文作者、中国农业科学院农业
RPS14基因的结构特点和主要作用
核糖体是催化蛋白质合成的细胞器，由一个小的40s亚基和一个大的60s亚基组成。这些亚基由4种RNA和大约80种结构上不同的蛋白质组成。这个基因编码一个核糖体蛋白，它是40S亚单位的一个组成部分该蛋白属于核糖体蛋白s11p家族。它位于细胞质中。文献中已经描述了利用替代转录起始位点的转录变体。作为编码核
武汉植物园等完成中国莲基因组框架图谱绘制
中科院武汉植物园与美国、澳大利亚科学家合作完成了对中国古代莲的基因组测序和分析，相关研究成果已于5月10日刊登在《基因组生物学》杂志上。 研究人员利用全基因组鸟枪测序法完成了对中国莲(Nelumbo nucifera)基因组的测序。结果显示，莲基因组大约有2.7万个基因，全长9.3亿个
中国科大攻克复杂肿瘤全基因组异常的检测难题
中国科学技术大学信息科学与技术学院副教授李骜研究组以原创性论文（Original paper）的形式，在Bioinformatics上在线发表了最新研究成果。论文的第一作者是博士生余振华。 基因组异常是多种恶性肿瘤的标志性特征，在肿瘤发病机理、临床诊断和治疗等研究中具有极为重要的作用。传统的
中国科学家启动国际“大熊猫基因组研究”项目
由中国科学家发起，加拿大、英国、美国、丹麦等国科学家联合参与的国际“大熊猫基因组研究”项目6日正式启动。中国科学家表示，将在半年之内完成大熊猫基因组的框架图。 据深圳华大基因研究院介绍，国际“大熊猫基因组研究”项目所产生的基因组信息将会对生态、进化、测序技术等众多科研领域产生深远的影响。该项目的实
中国学者连发Science，GenomeRes参与国际基因组项目
生物通报道：在2001年，人类基因组计划产生了近乎完整的人类DNA。但是研究人员还希望了解这些GS，CS，和TS是如何利用，控制或组织，比它们少得多的编码区域，造就活生生的人。9月，一个聚集了422位科学家的国际团队，在经过十年的努力后，完成了解析基因组剩余部分(非编码区域)的工作，宣布了
中国完成海带等7种海洋生物全基因组测序
中国科学家10月30日在青岛首次披露了海带、栉孔扇贝和南美白对虾全基因组测序的部分成果，至此中国已完成7种大型海洋生物的全基因组测序，为改良这些海洋生物品质、提高产量奠定了科学基础。 中国的海洋生物基因组学研究虽然起步较晚，但现在一些研究成果已达到国际前沿水准。目前，人类完成全基因组测序的
基因组技术来了，“人人基因”时代中国产业如何争上游？
何菊虹(化名)41岁时怀上了二胎，在西安一家民营医院产检“唐氏筛查”时，被医生告知“一切正常”，但孩子出生后被确诊为唐氏综合征患者，一家人的生活从此陷入为孩子康复、治疗的绝望里。 “如果当时就有无创产前基因检测，这样的悲剧就基本不会发生了。”深圳华大基因执行副总裁朱岩梅在朋友圈如此评论。 何
中国农科院首次解码颚口线虫线粒体基因组
近日，中国农科院兰州兽医研究所朱兴全研究员领导的家畜寄生虫病创新团队，在世界上首次解码了颚口下目线虫的线粒体基因组，为颚口线虫的分子流行病学、群体遗传学和系统分类学研究奠定基础。相关研究成果发表在国际学术期刊《科学报告》上。 据悉，颚口线虫是重要的人兽共患寄生线虫，但对其分子生物学研究甚少。兰
JMCB:中国科学家应用CRISPR破解基因组“未解之谜”
近日，来自上海交通大学的研究人员在国际学术期刊JMCB发表了一项最新研究进展，他们发现应用CRISPR/Cas9技术可以轻松实现对DNA片段的倒位和重复，对于基因组中存在的大量DNA调控元件和大量基因簇的功能研究具有一定意义。 研究人员指出，人类基因组中包含了几百万个DNA调控元件和大量的基因
中国科学家绘就谷子基因组单倍型图谱
由中国农科院作物科学研究所、中科院上海生科院国家基因研究中心、中科院遗传与发育生物学研究所等8家单位组成的科研团队，在国际上率先完成了谷子单倍体型图谱的构建和47个主要农艺性状的全基因组关联分析。相关成果6月23日在线发表于《自然—遗传学》杂志。 据介绍，谷子为二倍体，基因组小、自花
中国科学家启动国际“大熊猫基因组研究”项目
新华网2008年3月6日电 由中国科学家发起，加拿大、英国、美国、丹麦等国科学家联合参与的国际“大熊猫基因组研究”项目6日正式启动。中国科学家表示，将在半年之内完成大熊猫基因组的框架图。 据深圳华大基因研究院介绍，国际“大熊猫基因组研究”项目所产生的基因组信息将会对生态、进化、测序技术等众多科研领
中国花生基因组计划取得阶段性研究成果
近日，由山东圣丰种业科技有限公司、广东省农业科学院、山东省农业科学院和Macrogen千年基因联合启动的中国花生基因组计划取得了阶段性研究成果，该成果报告会于Macrogen千年基因圆满举办。本次会议总结了中国花生基因组计划的阶段性研究成果及国际上花生基因组研究的进展，并讨论了花生基因组计划后期
中国古代家犬线粒体全基因组揭示其种群扩散
1月8日，中科院生物一区杂志《分子生物学与进化》（Molecular Biology and Evolution）在线发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所古DNA实验室付巧妹研究员团队与中国科学院昆明动物研究所、陕西省考古研究院、浙江省文物考古研究所、兰州大学和四川大学等合作完成的关于中国古
中国热科院揭示香蕉亚基因组进化及功能分化规律
近日，中国热科院生物所联合华大基因、法国农业研究国际合作中心、国际生物多样性中心、美国罗格斯大学、中国热科院海口实验站等11家单位，绘制了双单倍体香蕉野生种Pisang Klutuk Wulung（BB基因组）的精细基因组图谱，揭示了香蕉A、B基因组的分化，二倍化进程中A、B基因组的特点、多倍体
中国科学家发表在《Nature》《Science》封面的基因组文章
随着测序技术的便捷化、廉价化进程的推进，中国已经逐步进入基因组测序普及化的时代，目前，我国已经获得多个物种的基因组图谱。 其中，影响比较大的基因组图谱成果都发表在国际一流期刊《Nature》或《Science》的封面上。 2002年 水稻基因组图谱 《Science》 《Nat
中国成为基因组编辑领域的世界领导者了么？
对很多人来说，CRISPR+中国等同于生物物理学家贺建奎(He Jiankui)。贺建奎去年臭名昭着地利用基因组编辑改变了将成为双胞胎女孩的两个人类胚胎的DNA。在他宣布这一消息之前，他在中国的CRISPR社区中还鲜为人知。中国的CRISPR社区发展迅速，现在在使用这一强大工具方面正在挑战美国，
中国科研人员揭秘全球首个牧草领域图形泛基因组
记者3日从四川农业大学获悉，该校草业科技学院黄琳凯教授团队构建了全球首个牧草领域图形泛基因组——美洲狼尾草图形泛基因组，并揭示了狼尾草耐热的分子机制。 这一研究成果于北京时间3日以《Pangenomics identifies structural variation associated w
中国科学家开发出高质量基因组组装软件
高质量基因组序列对于研究一个物种基因组的结构、功能、进化、基因定位和克隆等都至关重要。目前单分子测序技术的发展，已使得构建高质量基因组草图越来越容易。然而，这些草图序列仍然存在着由于组装序列碎片化而导致的多种错误，比如不完整的基因序列、排列到染色体上之后的片段遗漏、排列顺序错误和方向错误等。这些
中国学者葡萄基因组学研究取得新进展
葡萄是世界上第二大果树作物，鲜果及用其加工品葡萄酒一直广受消费者喜爱。随着社会对葡萄需求量进一步增加，如何高效快速地培育优良葡萄品种是目前葡萄产业发展的瓶颈。近年来，通过新一代测序技术和生物信息学手段相结合，对植物基因组结构和特点深入解析，将获得的信息应用于分子辅助或基因工程育种，成为植物品种选
绵羊基因组揭示中国游牧民族发展史
近日，中国科学院动物研究所李孟华研究组在《分子生物学与进化》杂志在线发表了一篇研究中国绵羊的起源、分化、扩张和混合，以及早期游牧民族发展史的文章。 绵羊作为最早的驯化动物之一，与人类生活，尤其是游牧民族的生活息息相关。通过解析绵羊的种群历史，如迁徙、扩散、品种选育历史，在一定程度上揭示了早期人
中国科学院开发比较群体基因组学新算法
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510371.shtm随着基因组测序技术的发展，物种和群体水平基因组数据呈指数增长。这些数据为从基因组水平鉴定和解析自然选择机制提供了前所未有的机遇。但是，目前的分析方法面临着一些技术瓶颈和挑战，其中一个
中国团队发现：吸烟可引起癌旁正常肺组织基因组突变
吸烟及空气污染是目前全球面临的两个主要公共健康问题，均可引起人体基因组突变而导致疾病发生。全球每年有182万新发肺癌病例，死于肺癌者达159万人。85%的肺癌是由吸烟所引起，空气污染则每年引起22万新发肺癌病例。为揭示肺癌发生的机理，研究人员往往利用癌旁正常肺组织作为对照，剖析肺癌基因组发生的异
中国科研团队研发出精准检测评估基因组组装新工具
近年来，随着基因测序技术和算法不断发展，大量物种基因组被陆续测序和组装，为相关研究和应用提供重要遗传信息。因此，如何精准检测评估基因组组装质量高低、避免组装错误等非常关键，也备受关注。 记者19日从中国科学院植物研究所获悉，该所焦远年研究团队最新研究开发出一种不依赖参考基因组的组装质量评估新工
国际癌症基因组联盟在中国发起四个新项目
2012年12月5日，国际癌症基因组联盟(ICGC)宣布在中国发起四个新项目，主要对结直肠癌、食道癌、肝癌和鼻咽癌的驱动基因进行检测，为实现个体化医疗奠定基础。中国是ICGC的创始成员之一，在2008年时曾经发起了胃癌基因组项目。 ICGC带领全球科学家对各种常见和罕见的癌症进行基因组图谱
中国科大CRISPRCas系统调控细菌基因组重塑研究获进展
CRISPR-Cas（成簇的规律间隔的短回文重复序列及其相关蛋白质）系统是原核生物特有的一类适应性免疫系统，可以保护宿主不受外源核酸的入侵。目前关于CRISPR-Cas系统的研究主要集中在防御机制、被开发为基因编辑工具运用于原核和真核生物的基因组编辑等方面，而关于CRISPR-Cas系统对于宿主
中国科大研究组在CRISPRCas系统调控细菌基因组重塑...
近日，中国科学技术大学生命学院及医学中心孙宝林研究组在CRISPR-Cas系统领域研究取得进展，在美国微生物学会知名期刊mSphere上发表题为《Chromosomal Targeting by the Type III-A CRISPR-Cas System Can Reshape Genom
中国科学家Nature子刊发布藏羚羊基因组草图
来自青海大学、深圳华大基因研究院和中科院昆明动物研究所等处的研究人员成功绘制出了藏羚羊(Tibetan antelope)的基因组序列草图，揭示出了高原适应的遗传机制。相关论文“Draft genome sequence of the Tibetan antelope”发表在5月14日的
中国学者《Nature》《PloS－One》公布两个基因组图谱
继中国科学家在《Nature》上公布首个中国人基因组“炎黄一号”后，近期中国的科学家又在《Nature》及《PLoS One》上公布新的基因组序列。 陈竺领导的研究小组在Nature发表血吸虫基因组 犹他大学病理学系博士解析“第二代测序前的序列捕获芯片及比较基因组杂交芯片在临床