中国科研人员揭秘全球首个牧草领域图形泛基因组

记者3日从四川农业大学获悉,该校草业科技学院黄琳凯教授团队构建了全球首个牧草领域图形泛基因组——美洲狼尾草图形泛基因组,并揭示了狼尾草耐热的分子机制。 这一研究成果于北京时间3日以《Pangenomics identifies structural variation associated with heat tolerance in pearl millet》为题在国际权威学术期刊《自然遗传学》(Nature Genetics)在线发表。 美洲狼尾草又名珍珠粟,全球种植面积约达3100万公顷。在中国,美洲狼尾草是重要的饲草、饲料。在非洲等热带干旱地区,美洲狼尾草是重要的杂粮作物。 2019年,黄琳凯教授团队首次公布了鸭茅的高质量参考基因组,是中国公布的首个牧草参考基因组。随着研究的深入以及技术的进步,构建高质量的图形泛基因组成为黄琳凯教授团队的重要目标。 通过联合国内外多家单位,本次研究从全球8个地区收集的394份......阅读全文

全球首个牧草图形泛基因组发布

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495404.shtm 3月3日,四川农业大学(以下简称四川农大)草业科技学院教授黄琳凯团队在国际权威学术期刊《自然—遗传学》(Nature Genetics)在线发表了题为《美洲狼尾草泛基因组构建、结构变

中国科研人员揭秘全球首个牧草领域图形泛基因组

  记者3日从四川农业大学获悉,该校草业科技学院黄琳凯教授团队构建了全球首个牧草领域图形泛基因组——美洲狼尾草图形泛基因组,并揭示了狼尾草耐热的分子机制。  这一研究成果于北京时间3日以《Pangenomics identifies structural variation associated w

我国科研人员揭秘全球首个牧草领域图形泛基因组

记者3日从四川农业大学获悉,该校草业科技学院黄琳凯教授团队构建了全球首个牧草领域图形泛基因组——美洲狼尾草图形泛基因组,并揭示了狼尾草耐热的分子机制。 这一研究成果于北京时间3日以《Pangenomics identifies structural variation associated wi

认识泛基因组测序

什么是泛基因组?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念(pangenome,pan源自希腊语‘παν’,全部的意思),泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年,Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接,发现了个体独有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“

5年磨一剑,就为了一棵小草

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495565.shtm在四川农业大学(以下简称四川农大)草业科技学院的实验室里,种着许多看似普通的小草,教授黄琳凯却对它们寄予了厚望,5年时间倾尽全力去探索平凡之下埋藏的秘密。这个陪伴了很多学生整个本科或研

人类泛基因组首个草图发布

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500424.shtm5月10日,《自然》发表了人类泛基因组参考的初稿,这一集合旨在最终代表整个人类物种中尽可能多的DNA序列。该项研究组合的人群遗传物质来自47个遗传多样化个体,为人类基因组提供了更完整的

我国首个以牧草为主的多组学数据库平台建立

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/505990.shtm美洲狼尾草一类的小米(millets)是抗非生物胁迫能力强、营养丰富的禾本科优质牧草及粗粮。它可保证生活在极端气候条件地区人们的粮食安全,并为其它作物提供与耐非生物胁迫有关的遗传资源。

我国率先构建野生大豆泛基因组

  中国农业科学院作物科学研究所与诺禾致源等合作,在国际上率先构建和分析了一年生野生大豆的泛基因组,为作物种质资源研究和利用提供了新的方法和启示。该研究成果9月14日在线发表于国际著名学术期刊《自然—生物技术》。  项目牵头人、中国农科院作科所研究员邱丽娟介绍,大豆是重要的油料和高蛋白粮饲兼用作物。

《自然》发表首个人类泛基因组草图

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500364.shtm 该研究为当前的人类参考基因组(GRCh38)增加了1.19亿个碱基对(指在DNA双螺旋结构中的两个互补配对的碱基)和1115个基因重复,并由此得到了两个新发现。未来,该计划旨在观

《自然》发表首个人类泛基因组草图

   当地时间5月10日,人类泛基因组参考联盟(Human Pangenome Reference Consortium)发表了首个人类泛基因组草图。相关的四篇论文均已发布,其中三篇发布在《自然》(Nature)杂志,一篇发布在《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)杂志。  

首个棉花泛基因组图谱助力分子育种

  近日,华中农业大学棉花遗传改良团队发表了题为“Cotton pan-genome retrieves the lost sequences and genes during domestication and selection”的研究论文,公布了目前为止变异类型最丰富的棉花遗传变异数据集。文章

视频图形显示

中文名称视频图形显示英文名称videographic display定  义利用阴极射线管装置扫描标本的视频互动显示系统。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生物学技术(二级学科)

高质量豌豆参考基因组和泛基因组解析完成

9月22日,中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外多家合作单位,成功绘制了中国豌豆基因组高质量精细物理图谱,构建了栽培和野生豌豆泛基因组,解析了豌豆基因组进化特征、群体遗传结构,为揭示豌豆起源驯化,以及基因挖掘、种质创新、育种改良提供了宝贵资源及数据支撑。

我国科学家首提“人类泛基因组”

人类基因组存在着种群特异甚至个体独有的DNA序列和功能基因   经过不懈研究和攻关,我国科研人员在人类基因组研究中获得新的重大进展――发现人类基因组中存在着种群特异甚至个体独有的DNA序列和功能基因。科研人员还首次提出了“人类泛基因组”的概念。   由深圳华大基因研究院领衔,华南理工大学参与的研

我国牵头完成高质量豌豆参考基因组和泛基因组解析

  9月22日,中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外多家合作单位,成功绘制了中国豌豆基因组高质量精细物理图谱,构建了栽培和野生豌豆泛基因组,解析了豌豆基因组进化特征、群体遗传结构,为揭示豌豆起源驯化,以及基因挖掘、种质创新、育种改良提供了宝贵资源及数据支

泛基因组:赋能未来作物育种的基石

 绘图:黄怡可 泛基因组(Pan-genome)是一个物种内所有基因组信息的总和,它比单一参考基因组涵盖了更多的遗传多样性。 近年来,科学家已经获得了多个作物的泛基因组。如何利用这些更为全面的基因组信息培育下一代良

我国完成世界首个番茄超泛基因组构建

  4月6日,由新疆农科院加工番茄生物育种创新团队牵头,联合中国农业科学院、新疆大学、新疆农业大学等多家单位,在国际学术期刊《自然·遗传》在线发表了题为《超泛基因组研究揭示野生和栽培番茄物种基因组和结构变异多样性》的科研成果。这是新疆农科院首次以第一单位在《自然·遗传》发表论文。  新疆农科院余庆辉

水稻泛基因组研究方面取得突破性进展

  近日,广东省农业科学院水稻研究所分子育种团队在水稻泛基因组研究方面取得突破性进展。相关研究发表于基因组学研究知名杂志Genome Biology。该论文第一单位为广东省农业科学院水稻研究所,王健博士为第一作者,杨武副研究员为共同第一作者,胡海飞博士和赵均良副研究员为通讯作者,澳大利亚莫道克大学教

-“超级牧草”有助预防气候变暖

  日本国际农林水产业研究中心最新宣布,其研究人员与总部位于哥伦比亚的国际热带农业研究中心合作,开发出一种“超级牧草”,不但能大幅遏制化肥产生的温室气体,还能让牛吃了更肥壮,提高肉奶产量。   化肥中的氮肥广泛应用,但是土壤中的氮肥会由于微生物作用转变为硝酸,一部分会生成一氧化二氮而释放到大气中,

小牧草成就大梦想

  新的一年,郭旭生又踏上了新的征程,在美国知名高校深造。他期望和美国同行深入合作,在草产业研究上获得更多成果,将草产业关键技术推广到更多有需要的地方。  作为兰州大学草地农业生态系统国家重点实验室教授,郭旭生专注牧草加工利用研究。在企业和农民眼中,他是能够解决实际生产问题的农民科学家。  2012

视频图形显示的定义

中文名称视频图形显示英文名称videographic display定  义利用阴极射线管装置扫描标本的视频互动显示系统。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生物学技术(二级学科)

CAD如何测量图形尺寸

cad测量尺寸的话,方法有很多种啊。看你怎么测量。标注测量的话,也分很多的种类:一、线性标注线性标注可以水平、垂直或对齐放置。可根据放置文字时光标的移动方式,使用 DIM 命令创建对齐标注、水平标注或垂直标注。二、半径标注径向标注可测量圆弧和圆的半径或直径,具有可选的中心线或中心标记。下图中显示了多

“人类泛基因组项目”将极大促进疾病防治

科技日报北京4月21日电 (记者刘霞)一个国际科学家联盟在20日出版的《自然》杂志上发表论文称,十多家研究机构正在合作开展“人类泛基因组项目”,该项目旨在创建一个囊括全球各人种遗传多样性的参考基因组。研究人员表示,“这是人类遗传学的未来”,有望应用于疾病预防与治疗等多领域。这项工作由美国国家人类基因

首个玉蜀黍属超级泛基因组助力玉米遗传改良

 玉蜀黍属超级泛基因组特征    受访者供图8月24日,《基因组生物学》(Genome Biology)在线发表华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室和洪山实验室玉米团队最新研究成果。该团队利用721份玉蜀黍属材料的基因组数据,构建了首个玉蜀黍属“超级泛基因组(super pan-genome)”图

保护牧草种质资源迫在眉睫

  牧草种质资源更新繁殖 中国农科院草原所供图  中国天然草原面积近60亿亩,占国土面积的41.7%,牧草种子和植株的保存数量位居世界第二位,保存5.6万份,但乡土草种质资源仅占20%~30%,保存数量较少。  近日,国家牧草种质资源中期库开工建设。中国农业科学院草原研究所(以下简称草原所)草资源与

牧草DNA指纹图谱应用前景看好

  牧草品种的真假和种子质量的优劣直接关系到草业生产安全、农民增收和农(牧)区社会稳定。随着农牧业生产对优良牧草品种需求的提高,每年进入市场的育成牧草新品种数量也在快速增加,各种优良牧草品种越来越受到青睐,种植面积越来越大。而一些不法商家在利益驱动下,在种子生产经营过程中以假乱真、以次充好,坑农害农

透过大规模基因组分析推出-泛癌症图谱-开启癌症治疗

  【Technews科技新报】美国国立卫生研究院(NIH)资助的研究团队已经完成了一份详细的基因组分析,这个被称为泛癌症图谱(PanCancer Atlas)的研究结果收录了 27 篇论文,并包含了 33 种癌症、1 万多个种不同肿瘤分子和临床讯息的数据资料。   泛癌症图谱主要是针对癌症基因组

科学家绘就全球首张家蚕超级泛基因组图谱

家蚕是重要的经济昆虫和新兴模式生物,10月9日,西南大学发布最新科研成果:家蚕基因组生物学国家重点实验室团队完成家蚕大规模种质资源基因组解析,在全球首次绘就家蚕超级泛基因组图谱,并率先创建“数字家蚕”基因库,将我国家蚕基因研究推向设计育种阶段。对于家蚕基因的研究,之前仅有单一参考基因组及部分重测序数

超级泛基因组助水稻种质资源遗传变异挖掘利用

 水稻泛NLRs家族基因的共线性位点(左);基于全基因组SNPs的水稻系统发生树(右)。中国农科院供图 近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所与国内多家高校、科研单位合作,组装了251份高质量的水稻基因组,构建了目前植物中群体规模最大、基因组充分注释、稻属中最为系统的超级泛基因组。该图谱

联动、创新、融合——泛生子倡导生命科学与健康领域新格局

  2016年12月17日,由北京市科委大力推动,京区多家科研机构和企业共同参与的“北京生命科学与健康协同创新联合体”启动仪式于北京召开。北京市科学技术委员会主任闫傲霜、副主任郑焕敏,北京昌平区副区长苏贵光,海淀区政府副区长李长萍,北京科技协作中心副主任雷霆等莅临启动仪式现场。  作为协同创新联合体