《科学》:太平洋海底发现上千种新型微生物
美国海洋生物学家在太平洋的俄勒冈州沿海的深海热液喷口发现了上千种微生物新物种。参与该项研究的科学家来自于缅因州的伍兹霍尔海洋生物实验室以及华盛顿大学的大气和海洋联合研究所。 利用一种被称为“454标签测序法”的新型分析技术,科学家们分析了微生物和古生菌的1百万个DNA序列。这些DNA取自于太平洋轴向海山深海火山的两个热液出口处的微生物样本。研究人员最终发现那些地区存在3000种不同的古生菌,微生物的种类更是超过了37000种。 该篇文章的主要作者、海洋生物实验室的Julie Huber表示:这些细菌大多数此前从未见报道过,其中有上百种与我们如今所知的微生物相差甚远,以至于只能判断其所属门类。很明显,继续取样进行研究以确定其所属的种类是必不可少的。 该项研究结果发表在《科学》杂志上。 原文链接:http://www.sciencedaily.com/upi/index.php?feed=Sc......阅读全文
《科学》:太平洋海底发现上千种新型微生物
美国海洋生物学家在太平洋的俄勒冈州沿海的深海热液喷口发现了上千种微生物新物种。参与该项研究的科学家来自于缅因州的伍兹霍尔海洋生物实验室以及华盛顿大学的大气和海洋联合研究所。 利用一种被称为“454标签测序法”的新型分析技术,科学家们分析了微生物和古生菌的1百万个DNA序列。这些DNA取自于太平洋轴向
Science子刊:在深海中,病毒对古生菌进行大屠杀
根据一项新的研究,在深海沉积物的微生物群体中,古生菌(archaea, 也译作古细菌)遭受的病毒感染频率通常是细菌的两倍,尽管后者更加丰富。考虑到深海生态系统的巨大规模,这一结果表明古生菌-病毒关系可能是全球生物地球化学循环的主要促进者。相关研究结果发表在2016年10月12日那期Science
南极古生菌揭示病毒来源
发现pR1SE的南极洲湖泊图片来源:Alyce Hancock 一种罕见的南极微生物或许为破解进化过程中最大的谜题之一 ——病毒的起源提供了线索。相关成果日前发表于《自然—微生物学》杂志。 病毒和其他生命形式不同。可以说,它们根本不算活着。所有其他生命都由细胞构成,而细胞是能独立养活自己和繁
《自然》:科学家找到“隐藏”的新型产甲烷古菌
近日,农业农村部沼气科学研究所厌氧微生物创新团队联合荷兰瓦赫宁根大学等多家单位,发现并分离培养了一株非广古菌门的新型产甲烷古菌。7月24日,相关研究成果发表在《自然》(Nature)期刊上。 产甲烷古菌在地球生命起源进化、全球气候变化和碳素循环中起着重要作用。传统观点认为产甲烷古菌隶属古菌域广
Science:新测序法挖掘新的核糖调控元件
最近,以色列魏茨曼科学研究所分子遗传学系的副教授Rotem Sorek带领的一个研究小组,开发出一种新的测序技术,为细菌核糖调控打开了大门。相关研究结果发表在《Science》杂志。 当涉及到调节基因时,细菌与真核生物有很大的不同。在细菌中,称为核糖开关(riboswitches)的功能性调控
《自然》:科学家找到“隐藏”的新型产甲烷古菌
近日,农业农村部沼气科学研究所厌氧微生物创新团队联合荷兰瓦赫宁根大学等多家单位,发现并分离培养了一株非广古菌门的新型产甲烷古菌。7月24日,相关研究成果发表在《自然》(Nature)期刊上。佛斯特拉门古菌 。受访者供图产甲烷古菌在地球生命起源进化、全球气候变化和碳素循环中起着重要作用。传统观点认为产
南京土壤所氨氧化古菌功能多样性研究取得新进展
地球上的高等动物和植物通常存在一定的地理分异规律,如谚语中常说的“一方水土养一方人”,但长期以来由于技术手段的限制,土壤微生物的地理分异规律及其功能意义却不甚清楚。 最近,中国科学院南京土壤研究所贾仲君课题组与何园球团队合作发现,酸性土壤中(pH4.9)存在一种活性氨氧化古菌,与该古菌亲缘关
新疆生地所揭示咸海岸上土壤微生物对土壤地球化学响应
研究湖域退缩与湖水咸化对咸海湖岸生态组演化的影响具有重要的生态学意义,有助于解释湖岸生态组与环境条件间的相互作用。伴随咸海湖面退缩,干涸的湖床出露地表,被逐渐风化为土壤,形成广泛的现代环境参数梯度(如盐度),咸海是研究湖岸生态组响应湖域退缩的理想场所。目前,对于湖泊持续干涸导致岸上土壤中微生物如
外国学者研究发现土卫二有古菌或微生物
如果冰冷的土卫二和人们推测的相符,则某些微生物可以利用二氧化碳和氢气生长并产生甲烷。除此之外,研究人员认为土卫二岩核内发生的地化反应或能给这些微生物的生长提供充足氢气。相关论文2月28日刊登于《自然—通讯》。土卫二岩核内的反应或能为微生物生长提供氢气。图片来源:美国宇航局 土卫二是人们搜索潜在
昆明植物所在嗜盐古菌质粒研究中取得新进展
古菌是生活在极端自然环境(如高温、低温、强酸、强碱、高压、厌氧或高盐)的一类特殊微生物。嗜盐古菌是古菌域真古菌界中的一个重要类群,主要分布于各种高盐环境,在医药和化工等方面具有应用前景。嗜盐古菌质粒研究为更好地开发利用嗜盐古菌资源和揭示高盐环境基因水平转移奠定基础。 中国科学院昆明植物研究
科学家揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制
中国科学院上海免疫与感染研究所研究员王程远团队、美国罗格斯大学教授理查德·艾布赖特团队及科罗拉多州立大学托马斯·圣唐杰洛团队合作,解析了古菌转录终止因子(FttA)依赖型转录终止复合物的三维结构,揭示了FttA介导古菌RNA聚合酶转录终止的分子机制,为进一步理解古菌转录终止及古菌转录-翻译偶联质量控
科学家揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制
中国科学院上海免疫与感染研究所研究员王程远团队、美国罗格斯大学教授理查德·艾布赖特团队及科罗拉多州立大学托马斯·圣唐杰洛团队合作,解析了古菌转录终止因子(FttA)依赖型转录终止复合物的三维结构,揭示了FttA介导古菌RNA聚合酶转录终止的分子机制,为进一步理解古菌转录终止及古菌转录-翻译偶联质量控
乙烷消失的“幕后推手”是谁
在自然界,许多有机物的生物降解需要氧气来提供能量。 然而,自然界还普遍存在着无氧或缺氧环境,微生物如何在这样的条件下活下去,并且有效处理环境中的“疑难杂症”,其背后机制是科学家们一直想要解析的生命奥秘。 无氧或缺氧,科学上被称为厌氧。 近日,中国科学院生态环境研究中心研究员朱永官团队参与的
微生物限度检查法的菌计数
细菌、霉菌及酵母菌计数计数培养基的适用性检查。 细菌、霉菌及酵母菌计数用的培养基应进行培养基的适用性检查,成品培养基、由脱水培养基或按培养基处方配制的培养基均应检查。菌种试验用菌株的传代次数不得超过5 代(从菌种保存中心获得的冷冻干燥菌种为第0 代)。应采用适宜的菌种保藏技术进行保存,以保证试
我国学者发现海洋异养古菌类群在富营养河口的勃发机制
在国家自然科学基金项目(项目编号:41530105、91428308 )等资助下,南方科技大学海洋与工程系讲座教授张传伦(国家“千人计划”特聘教授)牵头的“南方科技大学古菌地球组学重点实验室”近期取得了重要的研究成果。首次报道了海洋古菌MG-II在富营养河口的持续勃发现象,并获得了该类群的全基因
微生物所在古菌基因组复制起始领域取得新进展
基因组复制是生命得以存在和延续的最重要和最基本的遗传过程。与细菌染色体通常只有一个复制起点不同,真核生物和许多古菌的染色体均具有多个复制起始位点。这些复制起始元件可能具有不同的活性以适应体内外环境的变化,如在真核生物中普遍存在休眠状态的复制起始位点,如何解析这些休眠复制起点的激活机制及
研究发现深海微生物新物种并揭示其元素循环驱动机制
生物地球化学循环是地球系统科学的核心研究方向之一,对碳、氮、磷、硫及重金属等元素在地球圈层中的循环过程进行描述、示踪和预测是生物地球化学循环研究的重要内容。在地球各种生命形式中,微生物因其类型多样、分布广泛、物质代谢方式丰富,在元素生物地球化学循环中发挥着关键的驱动作用。深海微生物具有丰富的遗传
古菌:无所不在-活出极限
22日返回广州的“实验3”号科考船圆满完成中巴首次联合科考任务,两国科学家对莫克兰海沟开展了地质、生物与微生物等综合考察。图为神秘美丽的莫克兰海沟海景“实验3”号科考期间,科学家在莫克兰海沟目标海域首次获得第一手生物样品。 经过12230海里的航行,中国科学院南海海洋研究所“实验3”号科考船圆
科学家用测序技术分析炎热潮湿环境中的古DNA
Loltun灰岩洞凉爽的气候可能保护动物骨头中的DNA免受尤卡坦半岛高温的侵袭。 当2009年Tania Gutiérrez García将40块噬齿类动物的颌骨打包放入比鞋盒还小的包裹并带往加拿大时,她非常确信自己将失望透顶。当时,Gutiérrez是墨西哥国立自治大学生物
中国科学家首次揭示古菌中假尿嘧啶全局图谱
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518082.shtm
关于产甲烷菌的内容简介
产甲烷菌是一类能够将无机或有机化合物厌氧发酵转化成甲烷和二氧化碳的古细菌。产甲烷菌是重要的环境微生物,在自然界的碳素循环中起重要作用。 [1] 1979年,Balch和Wolfe通过16S rRNA测序 将产甲烷菌发展为3目(甲烷杆菌目、甲烷球菌目、甲烷微菌目)4科7属14种。1993年,Bo
Science-:以菌治瘤
尽管嵌合抗原受体(CAR)-T细胞在治疗血液恶性肿瘤方面已取得显着成功,但实体瘤的有效靶向作用仍然有限。与血液恶性肿瘤细胞普遍表达抗原靶标CD19不同,实体瘤上的肿瘤相关抗原具有异质性和缺乏特异性的特点,一方面靶向治疗的选择压力会引起抗原阴性复发,使不表达目的抗原的癌细胞持续增殖,另一方面会导致
微生物污染的排除实验——加温除菌法
实验材料细胞实验步骤根据支原体对热耐受性差的特点,有人把受污染的细胞置41 ℃中作用5~10 小时,最长可达18 小时,以杀灭支原体。注意事项但41 ℃对培养细胞本身也有很大影响,故在处理前,应先进行预试验,确定出最大限度杀伤支原体而对细胞影响较小的最佳处理时间;加温处理很难避免不伤害细胞,是其不足
微生物污染的排除实验——加温除菌法
实验材料细胞实验步骤根据支原体对热耐受性差的特点,有人把受污染的细胞置41 ℃中作用5~10 小时,最长可达18 小时,以杀灭支原体。注意事项但41 ℃对培养细胞本身也有很大影响,故在处理前,应先进行预试验,确定出最大限度杀伤支原体而对细胞影响较小的最佳处理时间;加温处理很难避免不伤害细胞,是其不足
微塑料影响土壤微生物群落结构等的研究获进展
微塑料污染已在世界范围内成为日益普遍的问题,但其对土壤环境的影响有待探究。近日,中国科学院城市环境研究所研究员姚槐应团队利用磷脂脂肪酸(PLFA)技术、实时荧光PCR方法、细菌16S rRNA和真菌ITS高通量测序技术以及温室气体监测气相色谱(GC)法,研究了微塑料污染对菜地土壤微生物群落结构和
古菌揭示潜在抗生素宝库
根据本周发表的两份报告,古菌是生命之树上最不为人所知的微生物分支,是研究新型抗生素的重要线索。古菌以其在极端环境(如热泉和盐碱地)中茁壮成长的能力而闻名,它们也与细菌共存于于多种环境中。现在,两组研究人员认为,这种邻近的关系可能促使数百种古菌进化出独特的化学防御能力,其中一些能够杀灭对传统抗生素
“生长曲线”当指挥:难养微生物也能唱“独角戏”
在地球的深海热泉、湿地,或者动物肠道和沉积物等环境中,生活着一群“无氧居民”——厌氧微生物。他们能分解有机废物、产生甲烷等可再生能源,还能参与温室气体的生成和消减——从污水处理厂到畜禽养殖、从沼气利用到肠道健康,都离不开它们。 然而,人类想要分离得到有益的厌氧微生物,却很困难——它们异常难养。
DNA测序——自动测序法
DNA测序可用于:(1)测定未知序列;(2)确定重组DNA的方向与结构;(3)对突变进行定位和鉴定比较研究。实验方法原理ABI PRISM 310型基因分析仪(即DNA测序仪),采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳,应用该公司ZL的四色荧光染料标记的ddNTP(标记终止物法),因此通过单
单细胞DNA测序揭示微生物“暗物质”
据《自然》杂志网站7月14日(北京时间7月15日)报道,天文学家们认为,宇宙总物质量的23%由弥漫于其间且肉眼看不见的“暗物质”组成;现在,美国科学家进行了微生物“暗物质”研究,他们用单细胞DNA测序技术对多种微生物的基因组进行测序后发现,微生物远比我们所知道的要丰富多样,研究同时揭示了不同物种
黑土农田氨氧化微生物和古菌的生物地理分布研究获进展
微生物群落组成与多样性的空间格局及对环境变化的响应研究,是揭示地球上生物多样性产生和维持机制的前提。近年来,土壤微生物的分布格局及其驱动机制研究成为国际上的研究热点。 中国科学院东北地理与农业生态研究所农田分子生态学科组科研人员对我国东北典型黑土农田样带细菌、真菌和酸杆菌地理分布格局进行了深入