昆明植物所在嗜盐古菌质粒研究中取得新进展
古菌是生活在极端自然环境(如高温、低温、强酸、强碱、高压、厌氧或高盐)的一类特殊微生物。嗜盐古菌是古菌域真古菌界中的一个重要类群，主要分布于各种高盐环境，在医药和化工等方面具有应用前景。嗜盐古菌质粒研究为更好地开发利用嗜盐古菌资源和揭示高盐环境基因水平转移奠定基础。 中国科学院昆明植物研究所研究员杨祝良指导的博士生陈绍兴等从29株嗜盐古菌中分离到一新型质粒，命名为pHRDV1。在对该质粒进行了基因组测序的基础上，开展了生物信息学预测分析和分子遗传学特征鉴定研究。研究结果表明，该质粒的基因组大小为13053 bp，共有19个开放阅读框，并组成了两个头对头转录方向的操纵子结构;生物学软件所预测出的双复制区中的一个具有复制起始活性;不可思议的是，在其基因组上具有三个类似于嗜盐古菌多形病毒特征性蛋白基因;依据该特征，该质粒可归为嗜盐古菌多形病毒II型，但该质粒又具有该型病毒不具备的复制蛋白基因;此外，在质粒基因组上，还具有......阅读全文
昆明植物所在嗜盐古菌质粒研究中取得新进展
古菌是生活在极端自然环境(如高温、低温、强酸、强碱、高压、厌氧或高盐)的一类特殊微生物。嗜盐古菌是古菌域真古菌界中的一个重要类群，主要分布于各种高盐环境，在医药和化工等方面具有应用前景。嗜盐古菌质粒研究为更好地开发利用嗜盐古菌资源和揭示高盐环境基因水平转移奠定基础。 中国科学院昆明植物研究
南极古生菌揭示病毒来源
发现pR1SE的南极洲湖泊图片来源：Alyce Hancock 一种罕见的南极微生物或许为破解进化过程中最大的谜题之一 ——病毒的起源提供了线索。相关成果日前发表于《自然—微生物学》杂志。 病毒和其他生命形式不同。可以说，它们根本不算活着。所有其他生命都由细胞构成，而细胞是能独立养活自己和繁
古菌：无所不在－活出极限
22日返回广州的“实验3”号科考船圆满完成中巴首次联合科考任务，两国科学家对莫克兰海沟开展了地质、生物与微生物等综合考察。图为神秘美丽的莫克兰海沟海景“实验3”号科考期间，科学家在莫克兰海沟目标海域首次获得第一手生物样品。 经过12230海里的航行，中国科学院南海海洋研究所“实验3”号科考船圆
人类肠道宏基因组的古菌病毒研究新进展
2022年12月30日，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所马迎飞团队在《自然-通讯》（Nature Communications）上，发表了题为Metagenomic analysis reveals unexplored diversity of archaeal virome in
古菌揭示潜在抗生素宝库
根据本周发表的两份报告，古菌是生命之树上最不为人所知的微生物分支，是研究新型抗生素的重要线索。古菌以其在极端环境（如热泉和盐碱地）中茁壮成长的能力而闻名，它们也与细菌共存于于多种环境中。现在，两组研究人员认为，这种邻近的关系可能促使数百种古菌进化出独特的化学防御能力，其中一些能够杀灭对传统抗生素
科研人员深度挖掘人类肠道宏基因组的古菌病毒
北京时间12月30日，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所马迎飞团队在国际学术期刊《自然-通讯》（nature communications，IF=17.69）上发表了题为"Metagenomic analysis reveals unexplored diversity of arch
基因置换实验——质粒改组
实验材料酵母菌株7-2 2404质粒pDB141pRG68试剂、试剂盒诱变的pDB141 DNA仪器、耗材YPD 平板HC-leu平板5-FOA平板实验步骤第 1 天将菌株 7-2 在 YPD 平板上划线，30°C 培养。第 3 天挑一个丰满的菌株 7_2 菌落，接种到 5 mlYPD 培养液，30
微生物所在古菌基因组复制起始领域取得新进展
基因组复制是生命得以存在和延续的最重要和最基本的遗传过程。与细菌染色体通常只有一个复制起点不同，真核生物和许多古菌的染色体均具有多个复制起始位点。这些复制起始元件可能具有不同的活性以适应体内外环境的变化，如在真核生物中普遍存在休眠状态的复制起始位点，如何解析这些休眠复制起点的激活机制及
“深部生物圈”古菌揭示生命起源
生活在阳光下，我们看惯了飞禽走兽、树木花草，不会对“万物生长靠太阳”产生怀疑。最近几十年，随着海洋科技不断发展，科学家们发现在海洋底部一些黑暗的极端环境下，也有微生物活动的迹象。 最近，上海交通大学微生物海洋学实验室教授王风平领导的研究团队在《自然—微生物学》（Nature Microbio
工程菌质粒拷贝数是什么
质粒拷贝数是指质粒在工程菌非复制分裂时期稳定存在质粒数量，一般为单拷贝，少量属于多拷贝。楼上说的是可以将质粒DNA整合进基因组的整合型质粒，另一种常见的质粒是基因组之外独立复制质粒。
细菌阿尔古蛋白在沉默外来核酸中的作用
在真核细胞中，阿尔古蛋白在由小RNA调节的基因沉默中扮演了一个重要角色。在最近一期的《分子细胞》中，Alexei Aravin和同事证明了一种细菌阿尔古蛋白在沉默外来核酸中的作用。 阿尔古蛋白被发现存在于一系列的细菌和古生菌中。尽管已经有几种晶体结构可用，并且对于一些细菌阿尔古蛋白的基
进击的古基因组研究
今年5月，《科学》在线发表了一项中国科学院古脊椎动物与古人类研究所（以下简称古脊椎所）领衔的关于华夏族群探源的突破性研究成果，它揭开了有关中国南北方史前人群格局及迁移与混合这一重大学术问题上的若干谜团；两个月后，该团队又发布最新发现：通过古基因组研究最新发现距今约1.1万年的中国南方未知现代人群
古基因组改写大象历史
古基因组改写大象历史 灭绝大象DNA揭示物种间复杂关系 本报讯 一个神秘古化石的基因组已经动摇了大象的家族树。 现代大象被划分为3个种：亚洲象（Elephas maximus）和两种非洲象——森林象（Loxodonta cyclotis）以及那些生活在热带草原的草原象（Loxodonta
基因分析揭示古猫迁徙历史
对古代猫的脱氧核糖核酸（DNA）进行的第一次大规模研究表明，在猫咪主宰互联网文化的几千年之前，这种动物便已经通过早期农民、古代水手乃至维京人遍布古代欧亚大陆和非洲。 这项研究对生活在距今15000年前至18世纪之间的200多只猫的基因组进行了测序。研究人员在9月15日召开的一次会议上公布了这
澳大利亚科学家南极发现罕见微生物:为病毒起源提供
英国《自然•微生物学》杂志近日发表的一篇论文称，科学家在南极发现一种独特且罕见的微生物，对该微生物的分析能为进化中最大的奥秘——病毒的起源提供极其重要线索，有助于解决病毒如何首次出现的谜团。 病毒不同于其他生命形式。所有其他的生命形式是由细胞构成的，细胞是复杂的机器，可以独立生存和繁殖。病
南极罕见微生物或可揭示病毒起源
英国《自然·微生物学》杂志近日发表的一篇论文称，科学家在南极发现一种独特且罕见的微生物，对该微生物的分析能为进化中最大的奥秘——病毒的起源提供极其重要线索，有助于解决病毒如何首次出现的谜团。 病毒不同于其他生命形式。所有其他的生命形式是由细胞构成的，细胞是复杂的机器，可以独立生存和繁殖。病毒却
古菌、细菌和真核生物的形态特征对比
在细胞结构和代谢上，它在很多方面接近其它原核生物。然而在基因转录这两个分子生物学的中心过程上，它们并不明显表现出细菌的特徵，反而非常接近真核生物。比如，它的转译使用真核的启动和延伸因子，且转译过程需要真核生物中的TATA框结合蛋白和TFIIB。它还具有一些其它特徵。与大多数细菌不同，它们只有一层细胞
研究揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制
9月25日，中国科学院上海免疫与感染研究所王程远研究组联合美国罗格斯大学Richard Ebright团队、美国科罗拉多州立大学Thomas Santangelo团队，在《自然》（Nature）上发表了题为Structural basis of archaeal FttA-dependent tra
老油田有望“复活”？神秘古菌“吃”石油产甲烷
荧光显微镜照片（CARD-FISH)，绿色代表新古菌Ca. Methanoliparum。承磊供图 传统的原油开采技术，难以驱动地下油藏全部原油的运移，仍然有过半原油开采不出来。科学家相信，能在油藏环境中存活的厌氧微生物有可能成为人类的帮手。利用沼气发酵原理，将液态原油降解成气态甲烷，形成油气共采
研究揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制
9月25日，中国科学院上海免疫与感染研究所王程远研究组联合美国罗格斯大学Richard Ebright团队、美国科罗拉多州立大学Thomas Santangelo团队，在《自然》（Nature）上发表了题为Structural basis of archaeal FttA-dependent tra
研究解析野古草基因组
近日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心完成了禾本科C4植物野古草的全基因组测序、组装与注释，并结合单细胞角度揭示了其类花环状排列的特化C4细胞（DC细胞）的功能特性和分子特征，剖析了其独立发育和可塑性排布的机制。C4植物通过特化的叶片结构与CO2浓缩机制实现高效光合作用。在玉米的“花环状叶片结构”
抗微生物药物耐药性的产生与对策（一）
耐药性(resistance) 又称抗药性,是微生物对抗微生物药物的相对抗性。微生物产生耐药性是自然界的规律。生物进化论早就指出 “适者生存” 。即微生物耐药性的产生,是耐药基因长期进化的必然结果, 并非在抗微生物药物问市之后才出现。大千世界，有矛就有盾, 有抗微生物药物就一定有对抗微生
哪些细菌对氨苄西林有耐药性？
许多细菌已经对氨苄西林产生了耐药性。 耐药性是指细菌对抗生素的敏感性降低，导致抗生素在治疗感染时效果减弱或失效。细菌产生耐药性的原因包括基因突变、水平基因转移和质粒介导的耐药性等。 以下是一些对氨苄西林具有耐药性的细菌： 肺炎克雷伯菌(Klebsiellapneumoniae) 大肠杆菌
哪些细菌对氨苄西林有耐药性？
许多细菌已经对氨苄西林产生了耐药性。 耐药性是指细菌对抗生素的敏感性降低，导致抗生素在治疗感染时效果减弱或失效。细菌产生耐药性的原因包括基因突变、水平基因转移和质粒介导的耐药性等。 以下是一些对氨苄西林具有耐药性的细菌： 肺炎克雷伯菌(Klebsiellapneumoniae) 大肠杆菌
《自然》：科学家找到“隐藏”的新型产甲烷古菌
近日，农业农村部沼气科学研究所厌氧微生物创新团队联合荷兰瓦赫宁根大学等多家单位，发现并分离培养了一株非广古菌门的新型产甲烷古菌。7月24日，相关研究成果发表在《自然》（Nature）期刊上。 产甲烷古菌在地球生命起源进化、全球气候变化和碳素循环中起着重要作用。传统观点认为产甲烷古菌隶属古菌域广
《自然》：科学家找到“隐藏”的新型产甲烷古菌
近日，农业农村部沼气科学研究所厌氧微生物创新团队联合荷兰瓦赫宁根大学等多家单位，发现并分离培养了一株非广古菌门的新型产甲烷古菌。7月24日，相关研究成果发表在《自然》（Nature）期刊上。佛斯特拉门古菌 。受访者供图产甲烷古菌在地球生命起源进化、全球气候变化和碳素循环中起着重要作用。传统观点认为产
高耐庆大霉素肠球菌耐药性接合转移试验的方法探讨1
肠球菌是医院感染的重要病原菌 [1] ，对多种抗菌药产生耐药性，而且耐药菌株不断增加，接合转移是导致肠球菌庆大霉素等耐药基因转移、耐药性播散的重要原因，深入研究接合转移试验有助于了解肠球菌耐药性的产生机理。我们研究了不同培养基和不同转移方法对肠球菌质粒转移试验结果的影响，并对接合前后菌株的耐药性
一种罕见的南极微生物为揭示病毒来源提供线索
病毒是古老、简单的生命形式，还是细胞进化后出现的寄生生物？它们来源于何处，一直是令生物学家困惑的问题。 最近，澳大利亚新南威尔士大学的里卡多·卡维切奥利和他的同事在临近南极洲海岸的劳尔群岛湖泊中，发现了一种或许能为解决上述问题带来一些曙光的微生物。这是一种古生菌，看上去像细菌的单细胞生物，但实
科学家揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制
中国科学院上海免疫与感染研究所研究员王程远团队、美国罗格斯大学教授理查德·艾布赖特团队及科罗拉多州立大学托马斯·圣唐杰洛团队合作，解析了古菌转录终止因子（FttA）依赖型转录终止复合物的三维结构，揭示了FttA介导古菌RNA聚合酶转录终止的分子机制，为进一步理解古菌转录终止及古菌转录-翻译偶联质量控
科学家揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制
中国科学院上海免疫与感染研究所研究员王程远团队、美国罗格斯大学教授理查德·艾布赖特团队及科罗拉多州立大学托马斯·圣唐杰洛团队合作，解析了古菌转录终止因子（FttA）依赖型转录终止复合物的三维结构，揭示了FttA介导古菌RNA聚合酶转录终止的分子机制，为进一步理解古菌转录终止及古菌转录-翻译偶联质量控