人血细胞中的所有蛋白编码基因进行全基因组转录组分析
在临床和研究环境中,血液都是对人类进行分子分析的主要来源,并且是许多治疗策略的目标,这突显了需要对构成人类血液的细胞进行全面的分子图谱构建。人类蛋白质图谱计划(www.proteinatlas.org)是一个开放式数据库,旨在通过整合各种组学技术(包括基于抗体的成像)来绘制所有人类蛋白的图谱。在此之前,人类蛋白质图谱包括来自外周血单核细胞的基因表达信息,但不包括来自许多其他血细胞亚群的基因表达信息。为了提高分辨率,人们需要对血液中的细胞进行了深入表征,以提供人血细胞中基因表达的详细细节,并将它们与体内的其他组织相关联在一起。 为此,在一项新的研究中,来自瑞典卡罗林斯卡研究所等研究机构的研究人员对通过流式细胞仪分选技术分离出的18种经典免疫细胞群体进行了基于转录组学的表达分析。他们将血细胞表达谱与组织表达谱相结合在一起,包括来自外部来源的转录组学数据以扩大这个开放式数据库中包含的组织类型和大脑区域的数量。他们依据血细胞和组织......阅读全文
蛋白质组学不能被基因组和转录组取代
基因和蛋白并不存在严格的线性关系ORF并不预示一定存在相应的功能性基因mRNA水平并非与蛋白质的表达水平对应翻译后修饰及同工蛋白质(isforms)等现象在基因水平无从表现
蛋白质组学牛人利用新技术分析蛋白质图谱
蛋白质组(proteomics)分析是针对不同条件下细胞中蛋白的功能和特性进行研究的统称,这一领域的研究一直以来都落后于基因组研究,后者在技术创新方面取得了不少成果,一些令人眼花缭乱的快速基因组图谱绘制技术,还有无需借助核心实验室设备就能完成实验的技术,都令我们印象深刻。 但是与基因组研究
转录图谱的转录图谱的意义
在于它能有效地反应在正常或受控条件中表达的全基因的时空图。通过这张图可以了解某一基因在不同时间不同组织、不同水平的表达;也可以了解一种组织中不同时间、不同基因中不同水平的表达,还可以了解某一特定时间、不同组织中的不同基因不同水平的表达。人类基因组是一个国际合作项目:表征人类基因组,选择的模式生物的D
转录物组学的定义
中文名称转录物组学英文名称transcriptomics定 义研究基因组转录产生的全部转录物的种类、结构和功能的学科。应用学科遗传学(一级学科),总论(二级学科)
转录物组学的定义
中文名称转录物组学英文名称transcriptomics定 义研究基因组转录产生的全部转录物的种类、结构和功能的学科。应用学科遗传学(一级学科),总论(二级学科)
家蚕丝腺单细胞转录组图谱绘成
中新网重庆6月15日电 (记者 钟旖)记者15日从家蚕基因组生物学国家重点实验室(西南大学)获悉,我国家蚕研究又有新进展。该实验室徐汉福教授课题组近日在国际知名期刊Nature Communications《自然通讯》上发表相关主题研究论文,以单细胞分辨率揭示了家蚕丝腺的全细胞异质性及其基因转
用蛋白质组学方法绘制磷酸化位点图谱
方案1 用带有 Fe(Ⅲ) 和 Ga(Ⅲ)的 IMAC 纯化磷酸化多肽 方案2 在 MALDI 分析之前或之后对磷酸化多肽进行碱性磷酸酶处理 方案3 结合固定化金属离子亲和介质和 MALDI-TOF-MS 直接分析方法对磷酸化多肽进行特征分析实验 方
人脑多区域时空发育转录组图谱获解析
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514996.shtm
人脑多区域时空发育转录组图谱获解析
科学家通过单细胞和时空转录组研究,首次解析迄今为止跨时间点最广(GW6-GW23)、面积最大(最大4cm x 3cm)的人脑多区域时空发育转录组图谱,为解码人脑发育及区域特化研究提供了新见解。日前,相关研究成果发表在《细胞》上。 脑是人类最复杂和神秘的器官。解剖学上,脑可以被划分为不同的区域,
Science:构建出真涡虫细胞类型转录组图谱
真涡虫是一类相对简单的动物,具有不同寻常的生物学特征:成年真涡虫维持着其他有机体仅在胚胎中短暂存在的发育信息和祖细胞(progenitor cell)。真涡虫获得人们的大量研究,部分原因在于它们具有再生丢失的或受损的身体部位的独特能力。图片来自Christopher Fincher/Whiteh
与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有何优点
那年夏天Forever与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有以下优点:①代谢组学放大了基因和蛋白表达的微小变化,从而使检测更容易;②代谢组学的研究不需建立全基因组测序及大量表达序列 标签(EST)的数据库,且代谢产物的种类要远小于基因和蛋白的数目.③ 由于给定的代谢产物在每个组织中都是一样的,所以研究
转录组和蛋白质组有何异同之处
转录组是RNA转录后的全部产物,而转录后的产物经过加工修饰(例如甲基化、拼接、加尾等)后才变成蛋白质.相同之处就是他们的大部分结构相同.不同之处就是一个有加工过程,一个没有.
2025蛋白质组学大会之蛋白质组学新技术
2025年10月13日上午,蛋白质组学新技术(Emerging proteomics technologies)专题分论坛顺利召开。本场会议由本领域学者陆豪杰教授、王初教授、谭敏佳教授、秦伟捷教授和Yasushi Ishihama教授共同召集和组织。来自海内外的多位知名学者围绕该领域的前沿进展,分享
实质等同性(转录组学)实验
实验材料:小麦 试剂、试剂盒:β-巯基乙醇 氯仿
实质等同性(转录组学)实验
实验材料小麦试剂、试剂盒β-巯基乙醇氯仿异戊醇SSTE 缓冲液仪器、耗材SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤3.1 芯片背景我们使用了 19846 个点,包含 9246 个 Unigene 序列的小麦 cDNA 芯片(http://www . cerealsdb. uk. net/index. htm
空间转录组学研究案例简析
01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1]影响因子:11.878发表时间:2018.06发表期刊:Nat Commun肿瘤内异质性是当今癌症治疗中最大的挑战之一。在这里,研究人员使用空间转录组学(ST)技术研究整个多灶性前列腺癌的全组织基因表达异质性。利用一种新的去卷积方法,分析12个区域的近6
灵长类原肠胚期至早期器官发育转录组图谱绘制
安徽医科大学国家卫生健康委配子及生殖道异常研究重点实验室教授蒋祥祥,与中科院动物研究所王红梅、郭帆团队,美国得克萨斯大学西南医学中心吴军团队合作,绘制了食蟹猴CS8-CS11时期(E20-E29)胚胎的单细胞转录组图谱。相关研究成果近日发表于《自然》。 上世纪早期,科学家将人类胚胎发育的前60
复旦大学Nature子刊绘制大鼠转录组图谱
来自复旦大学、美国食品药品监督管理局(FDA)国家毒理学研究中心、洛马林达大学等机构的研究人员,成功绘制出了涵盖11种器官和4个发育阶段的大鼠RNA测序转录组图谱,这一重要的研究成果发表在2月10日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。 复旦大学的石乐明(
杨树次生木质部单细胞转录组图谱建立
近日,北京林业大学教授张德强团队在《植物生物技术杂志》发表研究论文。该研究以杨树为研究模式,利用单细胞测序技术、基因组分析、RNA原位杂交、愈伤组织遗传转化等技术建立了杨树次生木质部的单细胞转录组图谱,重构了完整的杨树次生木质部细胞类群,鉴定了调控木质部发育过程的关键转录因子,系统解答了次生木质
2025蛋白质组学大会之蛋白质组学与多组学的融合
本次分论坛以“Proteomics Marries Other Omics(蛋白质组学与多组学的融合)”为主题,围绕蛋白质组学在疾病机制研究、代谢重编程、肿瘤学与免疫学中的最新应用展开。会议旨在探讨蛋白质组学与代谢组学、转录组学等多组学技术的深度融合与交叉创新,为精准医学与系统生物学的发展提供新
蛋白质组与蛋白质组学简介2
3 甲基化干扰实验用来检测蛋白质的结合位点。甲基化修饰的DNA探针可以干扰蛋白质的结合。结合位点上未被修饰的DNA片段才能与蛋白结合,然后将DNA从被修饰的碱基处切割,电泳分离,结合蛋白的DNA在结合位点上不能被修饰,不能切断,可确定结合位点的位置。 4 Dnase I 足纹分析 蛋白
蛋白质组与蛋白质组学简介1
一、蛋白质组概念:一个细胞、一个组织或一个机体全部基因所表达的全部蛋白质。 二、蛋白质组学研究范畴 1.蛋白质和蛋白质间 2.蛋白质和核酸之间 3.蛋白质及其组成质点的分离、分析、鉴定 4.蛋白质结构分析 5.生理、病理或不同发育状态下蛋白质组表
转录图谱的原理
所有生物性状和疾病都是由结构或功能蛋白质决定的,而已知的所有蛋白质都是由mRNA编码的,这样可以把mRNA通过反转录酶合成cDNA或称作EST的部分的cDNA片段,也可根据mRNA的信息人工合成cDNA或cDNA片段,然后,再用这种稳定的cDNA或EST作为“探针”进行分子杂交,鉴别出与转录有关的基
转录图谱的定义
转录图谱是在识别基因组所包含的蛋白质编码序列的基础上绘制的结合有关基因序列、位置及表达模式等信息的图谱。在人类基因组中鉴别出占具2%~5%长度的全部基因的位置、结构与功能,最主要的方法是通过基因的表达产物mRNA反追到染色体的位置。
2025蛋白质组学大会之微生物蛋白质组学
2025年10月14日下午,聚焦于微生物蛋白质组学领域的专题分会场在广州白云国际会议中心107会议室正式拉开帷幕。会议由王恒樑、马庆伟、刘小云、李乐园四位教授召集,现场由刘小云、Paola Roncada教授主持。来自意大利卡坦扎罗“大希腊”大学、比利时根特大学、复旦大学、西湖大学、国家蛋白质科学中
2025蛋白质组学大会之单细胞蛋白质组学研究
2025年10月13日上午10:10,第12届AOHUPO大会暨第8届AOAPO大会、π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会“Single Cell Proteomics”分论坛在广州白云国际会议中心汕头厅(Shantou Hall)成功举行。 本场论坛由浙江大学方群
2025蛋白质组学大会之非质谱蛋白质组学专场
2025年10月14日上午10点10分,第12届AOHUPO大会暨第8届AOAPO大会暨π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会“非质谱蛋白质组学” (Proteomics Beyond Mass Spectrometry) 分会场于广州白云国际会议中心岭南B厅拉开序幕。
2025蛋白质组学大会之跨物种蛋白质组学研究
2025年10月14日下午,第12届AOHUPO大会、第8届AOAPO大会、π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会“Cross-species Proteomics(跨物种蛋白质组学)”分会场于广州白云国际会议中心国际会堂顺利举行。会议由中国科学院北京基因组研究所 (国
2025蛋白质组学大会之蛋白质组学驱动的精准医学(A)
2025年10月13–14日,在第12届AOHUPO大会暨第8届AOAPO大会暨π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会上,以“蛋白质组学驱动的精准医学(Proteomics-Driven Precision Medicine)”为主题的分会于梅州厅举行。会议由中国人民解
上海生科院等建立小鼠早期胚胎空间转录组图谱
3月22日,国际学术期刊《细胞》子刊《发育细胞》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所景乃禾研究组与中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所韩敬东研究组合作的最新研究成果“Spatial Transcriptome for the Molecular Annotatio