9月26日《自然》杂志精选
早期地球的大陆动态 地球历史上的“冥古宙”(距今45亿~38亿年前)是地质上的黑暗时期，人们只能从零星的数据去了解它。根据以前应用于木星具有活跃火山活动的卫星“木卫一”的一个地球动力学模型，William Moore和 Alexander Webb提出一个“热管模型”来解释早期地球在早期岩浆海洋和板块构造时期之间过渡阶段的热传输和岩石圈动态。 该模型表明，由于经常发生将表面物质向下循环的火山喷发，形成了一个又冷又厚的单块岩石圈。该模型的预测结果与地质记录很相符，说明随着时间推移不断减少的热源可能加快了向板块构造阶段的突然转变。 人类转录组的深度分析 这项研究通过对来自“1000 Genomes Project”的462个人的类淋巴母细胞系的信使RNA和微RNA进行测序和深度分析来确定人类基因组中的调控变化。 分析显示了影响绝大部分基因的调控的普遍存在的基因变化，其中转录结构和表达水平的变......阅读全文
Cell－Systems：构建RNA结合蛋白的剪接调控作用预测模型
基因组研究结果显示，人体内超过90%的基因存在选择性剪接(alternative splicing)。该过程在不同组织以及不同生理阶段受到严格的调控，其失调会导致多种疾病的发生。选择性剪接的体内调控主要由前体mRNA中的顺式元件(cis-elements) 招募反式剪接作用因子（trans-a
体外三维模型或揭示癌细胞转移机制
癌症之所以致命，根本原因之一在于肿瘤细胞临床上的转移性，但是人们对肿瘤细胞侵袭和转移过程的认识尚不清楚。 现在，一项研究有望揭示肿瘤细胞的转移机制，帮助我们更加深入理解癌症的致命机理，从而为探索新治疗手段提供思路。 近日，中科院物理研究所公布了一项新研究进展。该所刘雳宇研究员与美国科学家合作
神奇数据模型定量CART细胞疗法
图片来源于网络 在弗吉尼亚联邦大学梅西癌症中心，科学家正在进行一项可能改变细胞免疫治疗方式的基础研究，该项目获得弗吉尼亚联邦大学梅西癌症中心（VCU Massey）试点资助。该项研究从精确的定量角度分析了免疫系统如何响应细胞疗法，从而寻求一种新的细胞免疫治疗方式，干细胞移植和CAR-T细胞疗法的协
双转基因模型证明干细胞促进再生新理论
《JCI-Insight》杂志近期发表了他们的研究成果——注射后，干细胞通过协调内源性细胞导致愈合效果，并不直接负责软骨再生。 间充质干细胞（所谓的结缔组织祖细胞）在治疗软骨组织再生领域极具潜力，但是，干细胞疗法如何促进受损结缔组织愈合的机制尚不明确。生物医学科学系的研究者为解决这一问题首先需
培育人类脊索组织的干细胞模型成功开发
英国弗朗西斯·克里克研究所科学家开发了一种能培育出人类脊索的干细胞模型，这是人类首次在干细胞模型中培育出脊索组织。在胚胎发育过程中，脊索就像是一个GPS导航系统，引导细胞构建脊柱和神经系统。这一成果标志着科学家在研究人体早期发育形态方面迈出了重要一步，相关论文18日发表在《自然》杂志上。人类躯干状类
高胰岛素血症细胞模型研究获进展
6月9日，NPG系列期刊《科学报告》（Scientific Reports）在线发表了中国科学院广州生物医药与健康研究院李尹雄课题组郭东升等的最新研究成果Modeling Congenital Hyperinsulinism with ABCC8-Deficient Human Embryoni
脊髓星形胶质细胞机械性损伤的体外培养模型
1.材料与方法取新生的wistar 大鼠脊髓,剪碎,0125 %胰蛋白酶消化1h ,用含血清的DMEM培养液终止胰蛋白酶的作用; 而后吹打成散在的单个细胞,进行细胞计数,按5 ×105 个Pcm2 密度进行接种。培养至第10天时加10mM Leu2methy12ester 除杀小胶质细胞。于16d
通过细胞计数对疾病模型小鼠进行免疫监测
通过细胞计数对疾病模型小鼠进行免疫监测 摘要生物样本往往是非单一细胞的混合物，如原代分离的细胞样本和许多培养的细胞样本都是由不同种类或不同功能的细胞组成。而对于样本中不同细胞亚群的区分和定量恰恰是很多研究中的关键一环。这些混合在一起的不同细胞通常是使用流式细胞仪和荧光标记的细胞类型特异性抗体来进行
《机器智能》：秒级预测蛋白质结构的大模型上线
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510009.shtm
最新模型定义蛇毒进化－剧毒蛋白质进化于无毒基因
据科学日报报道，目前描绘蛇或者蜥蜴嘴巴内部主要基因的科技改变了科学家们将动物定义为有毒的方式。如果口腔腺体能够表达与“毒素”相关的20个基因家族中的一些基因，那么这个物种就被定义为有毒。然而，美国德克萨斯大学阿灵顿分校的一项最新研究挑战了这一定义，这些研究还建立了一个描述蛇毒是如何产生的新模型。
蛋白质三级机构预测－同源模型化法2
5、构建目标蛋白质的环区：在第2步的序列比对中，可能加入空位，这些区域常常对应于二级结构元素之间的环区，对于环区需要另外建立模型。一般也是采用经验性方法，从已知结构的蛋白质中寻找一个最优的环区，拷贝其结构数据。如果找不到相应的环区，则需要用其它方法。6、优化模型：通过上述过程为目标蛋白质U建立了一个
蛋白质三级机构预测－同源模型化法1
蛋白质结构预测的生物学意义生物信息学研究的一个主要目标是了解蛋白质序列与三维结构的关系，但是序列与结构之间的关系是非常复杂的。人们已经掌握了一些蛋白质序列与二级结构之间的关系，但是对于蛋白质序列与空间结构之间的关系了解得比较少。预测蛋白质的二级结构只是预测折叠蛋白的三维形状的第一步。一些结构不是很规
计算机模型可揭示整联蛋白的运行机制
据物理学家组织网3月21日报道，最近，美国加利福尼亚大学(UC)伯克利分校和劳伦斯·伯克利国家实验室科学家开发出一种整联蛋白的计算机模型，只有约20纳米长，能模仿真实的整联蛋白在细胞中的活动，且对能量和其他变化产生的反应。这一成果为人们探索整联蛋白如何把细胞内外环境联系在一起开辟了新途径。相关论
尿红细胞（THP）蛋白
THP 是肾小管髓袢升支粗段和远曲小管近段上皮细胞分泌的一种大分子糖蛋白。已证明肾小球来源的尿红细胞表面被覆THP ，而非肾小球来源的红细胞则没有，应用THP 细胞化学技术亦可鉴别肾性或非肾性血尿。（一） 参考值尿细胞THP 细胞化学定位：阴性（二） 临床意义鉴别肾性和非肾性血尿。
细胞化学基础锌指蛋白
定义通常由一系列锌指组成。 具有重复结构的氨基酸模式，相隔特定距离的胱氨酸结合锌指，能与某些RNA/DNA 结合。作用锌指蛋白是一类具有手指状结构域的转录因子，对基因调控起重要的作用。根据其保守结构域的不同，可将锌指蛋白主要分为C2H2型、C4型和C6型。锌指通过与靶分子DNA、RNA、DNA－RN
如何研究细胞关键蛋白
来自上海生科院生化与所的研究人员利用多种细胞手段发现了两种关键细胞蛋白的作用机理，这两种蛋白分别是C末端Src激酶(C-terminal Src kinase，Csk)和细胞极性封闭蛋白Occludin。研究论文分别发表在《Proteomic》和《Developmental Cell》上。
除了指数增长模型和逻辑斯蒂增长模型，还有哪些增长模型？
除了指数增长模型和逻辑斯蒂增长模型，还有以下一些增长模型： **一、Gompertz 增长模型** 1. 特点： - Gompertz 模型也是描述种群增长的一种模型，其增长曲线也呈“S”型。与逻辑斯蒂增长模型相比，Gompertz 模型在初期增长相对较慢，然后逐渐加速，最后增长速度
“细胞多能性和人类重大疾病的猴模型研究”启动
日前，国家重大科学研究计划重大科学目标导向项目“细胞多能性和人类重大疾病的猴模型研究”在昆明启动。通过该项目的实施，将整合全国同行专家的优势力量，共同努力解决生殖发育和干细胞生物学等重要科学问题，为神经退行性疾病、心血管疾病等一系列人类重大疾病的治疗提供科学基础。
关于细胞核起源的共营模型的基本介绍
共营模型（syntrophic model）认为，古菌与细菌共生导致了含细胞核的真核细胞的诞生，但是，古菌与细菌均无细胞核（Hogan 2010）。共营模型认为，与现代产甲烷古菌类似的某些古老的古菌，侵入并生活在类似于现代粘细菌的细菌体内，形成了早期的细胞核。古菌与真核生物在特定蛋白质（如组蛋白
上海巴斯德所建立新型丙型肝炎病毒细胞感染模型
12月，国际著名病毒学期刊Journal of Virology在线发表了中科院上海巴斯德研究所钟劲研究组的最新成果，该研究主要阐明了一种新型的丙型肝炎病毒细胞感染模型的建立。 丙型肝炎病毒(hepatitis C virus, HCV)主要经过血液传播，能导致急性和慢性肝炎，肝硬
关于细胞核起源的自演化模型的基本介绍
细胞核起源的自演化模型（autogenous model）认为原真核（proto-eukaryotic）细胞直接自细菌演化而来，需要通过内共生。证据来自一类专性好氧菌——浮霉菌（Planctomycete），它们具有清晰的胞内膜结构，其中，有一种称之为Gemmata obscuriglobus的
用多人干细胞培育的三维大脑模型面世
美国哈佛大学科学家将来自5个捐赠者的干细胞，浸泡在一种精确配制的混合溶液中，培育出首个包含多人细胞的3D大脑模型。这些大脑类器官有助揭示人脑发育和药物反应的个体差异。相关研究论文发表于26日的《自然》杂志。大脑类器官生长一个月后，宽度超过一毫米。图片来源：《自然》网站由于大脑类器官生长特别缓慢，研究
Cell：重大进展！构建出“培养皿冬眠”细胞模型
在冬眠期间，十三条纹地松鼠（13-lined ground squirrel）耐受接近冰点的温度，显著地减慢它的心率和呼吸。这种地松鼠的组织如何适应寒冷和代谢压力一直困扰着科学家们。 已知易受寒冷影响的细胞中的结构是微管细胞骨架。细胞内的这种小管网络给细胞提供结构支持，并作为细胞内部的一种运输
我科学家发现IKK抑制细胞凋亡“非经典模型”
从中科院生物化学与细胞生物学研究所获悉，最新一期国际权威学术期刊《细胞》发表了该所林安宁研究团队的最新成果，修改了为时15年的蛋白激酶IKK抑制肿瘤坏死因子TNF诱导细胞凋亡的理论，揭示了TNF不仅能调控细胞膜受体介导的凋亡通路，还能调控线粒体介导的凋亡通路，提出IKK抑制细胞凋亡的非经典模型。
《细胞》：日本培育出自闭症模型实验鼠
该成果可帮助科学家研究自闭症的致病基因 日本广岛大学的一个研究小组在6月26日出版的《细胞》杂志上报告说，他们已成功培育出自闭症模型实验鼠，该成果可帮助专家研究自闭症的致病基因。 自闭症是一种脑发育障碍，患者在社会交往方面有严重障碍。专家认为自闭症的发病与多个基因相关，但是目前尚有许
成纤维细胞生长因子诱导血管生成模型
机体新血管的形成，通常情况下，除了女性月经周期和胚胎发育外，很少发生，但在病理情况下，如损伤治愈、炎症、糖尿病性视网膜病变、银屑病及硬皮病等都有血管生成，特别是实体肿瘤的生长和转移与血管生成密切相关。因此，抑制血管生成可能是抗肿瘤生长和转移的有救途径。建立各种体内血管生成模型及体外检测与血管生成有关
ALS细胞模型有助于寻找更有效的药物疗法
根据一项最近发表于《Cell Reports）》期刊的新研究，美国德州大学西南医学中心（UT Southwestern Medical Center）研究人员们开发出一种细胞模型，可能有助于筛选新药物以治疗肌萎缩侧索硬化（amyotrophic lateral sclerosis，ALS）。
哮喘大鼠模型的制作和T淋巴细胞的分离
大鼠哮喘模型的分组及建立实验大鼠分组：根据随机化原则，将24只雄性Wistar大鼠（体重190-250g） 按体重编号，采取随机排列表法分为以下4组：（1）正常对照组、（2）哮喘一周组（激发一周）、（3）哮喘两周组（激发二周）和（4）哮喘四周组（激发四周及以上）。哮喘模型的建立：第一天三组哮喘组大鼠
关于抗中性粒细胞胞浆抗体的染色模型介绍
用经典的间接免疫荧光技术（IIF）检测ANCA，阳性荧光染色模型分两种：胞浆型（cANCA）和核周型（pANCA）。近来报道一种特殊的荧光谱称之为非典型ANCA（xANCA）。ANCA常与疾病的活动性有关，疾病缓解期滴度下降或消失。
Stem－Cell－Reports：成功构建星形胶质细胞体外仿生模型
红色的是星形胶质细胞，绿色的是神经元，蓝色的是细胞核。 神经元在神经科学中一直很受关注，原因很好解释，它们是神经活动的重要的执行细胞。但是越来越多的证据表明，数量众多的星形细胞又称为星形胶质细胞（astrocytes）可不止是大脑赛场的占位队员。 众所周知，星形细胞以多种方式供养着神经元细胞，为