9月26日《自然》杂志精选
早期地球的大陆动态 地球历史上的“冥古宙”(距今45亿~38亿年前)是地质上的黑暗时期，人们只能从零星的数据去了解它。根据以前应用于木星具有活跃火山活动的卫星“木卫一”的一个地球动力学模型，William Moore和 Alexander Webb提出一个“热管模型”来解释早期地球在早期岩浆海洋和板块构造时期之间过渡阶段的热传输和岩石圈动态。 该模型表明，由于经常发生将表面物质向下循环的火山喷发，形成了一个又冷又厚的单块岩石圈。该模型的预测结果与地质记录很相符，说明随着时间推移不断减少的热源可能加快了向板块构造阶段的突然转变。 人类转录组的深度分析 这项研究通过对来自“1000 Genomes Project”的462个人的类淋巴母细胞系的信使RNA和微RNA进行测序和深度分析来确定人类基因组中的调控变化。 分析显示了影响绝大部分基因的调控的普遍存在的基因变化，其中转录结构和表达水平的变......阅读全文
细胞化学词汇沃森克里克模型
中文名称：沃森-克里克模型英文名称：Watson-Crick model定 义：沃森(J. D. Watson)和克里克(F. Crick)于1953年提出的DNA立体结构模型，认为DNA为两股反向平行的多聚脱氧核糖核苷酸，由互补碱基的氢键连接，并呈右手螺旋方式围绕同一轴心盘绕。应用学科：遗传学（
细胞膜的流动镶嵌模型的简介
流动镶嵌模型突出了膜的流动性和不对称性，认为细胞膜由流动的脂双层和蛋白质组成。磷脂分子以疏水性尾部相对，极性头部朝向水相组成生物膜骨架，蛋白质或嵌在脂双层表面，或嵌在其内部，或横跨整个脂双层，表现出分布的不对称性。 不足之处： 1）不能说明膜在变化过程中如何保持膜的完整性和稳定性； 2）忽
关于细胞膜的晶格模型的介绍
1975年，Wallach提出晶格模型。晶格模型是对流动镶嵌模型的补充，强调流动的整体性。用膜脂可逆地进行无序（液态）和有序（晶态）的相变来解释生物膜的流动性。膜镶嵌蛋白对脂类分子的运动具控制作用。镶嵌蛋白和它周围的脂类分子形成晶格状态，这些不移动的脂类分子称界面脂质，而流动的脂质呈小片、点状分
培养乳鼠心肌细胞的缺氧损伤模型和缺氧预处理(APC)模型
原代心肌细胞培养及APC模型的制作参照先前报道的方法[2]。即取出生后1－2 d乳鼠心尖部组织, 胰酶消化, 离心后用含20%小牛血清的DMEM培养基制成细胞悬液, 过滤, 按差速贴壁分离法纯化心肌细胞, 以1×105 cells/cm2接种于24孔板, 每24 h更换培养液。贴壁生长2 d, 于实
关于蛋白质折叠的格点模型的介绍
格点模型（也简称HP模型）,最早是由Dill等人1989年提出的。格点模型可分为二维模型和三维模型两类。二维格点模型就是在平面空间中产生正交的单位长度的网格,每个氨基酸分子按在序列中排序的先后顺序依次放置到这些网格交叉点上,在序列中相邻的氨基酸分子放置在格点中时也必须相邻,即相邻氨基酸分子在格点
帕金森体外模型帕金森体外模型
体外培养的中脑多巴胺能神经元MPTP损伤模型l实验操作：实验采用胚胎龄14一16天的大鼠，剖子宫取胎，取胎鼠中脑腹侧区。可将多个胚胎来源的组织收集在一起，置Fl2培养基（Gibco）至35mm的培养皿中，以细剪刀剪碎。将2ml含0.125％的胰酶的F12加入到组织中，该混合物于37oC孵育10分钟后
体外抗药肿瘤细胞模型的建立实验_细胞培养技术
实验方法原理体外抗药肿瘤细胞模型的建立实验采取长时间药物处理、诱导抗性，最终筛选出具有一定抗性的细胞克隆。实验材料小鼠试剂、试剂盒小牛血清DMEMDOX仪器、耗材CO2培养箱无菌钢圈实验步骤一、培养条件用含10%小牛血清的DMEM培养液，5%CO2，37℃培养。二、实验步骤1. 将CHO细胞培养在
概述成视网膜细胞瘤模型的测试内容
儿童肿瘤——成视网膜细胞瘤是抗癌基因活动的最富有特征性的模式。在这种以遗传或散发式发生的肿瘤中，成视网膜细胞瘤基因即是隐性癌基因，正常情况下它可阻遏成视网膜细胞的恶性转化。根据knudson所提出的“两次碰撞”假说，具家族性病发危险的成员继承了一个已损伤的非功能性基因。在这样的成员中，第二次“碰
staurosporine诱导小鼠心肌细胞凋亡模型构建
原代心肌细胞的培养及实验方案取出生后0~24 h C57BL/6cr小鼠心脏，按改良的Lader方法进行细胞的分离。 获取博动的心脏迅速放置于无Ca2+、Mg2+的Hank’s平衡液中。剪碎心脏，放置在4℃条件下100 g/L的Trypsin溶液中消化16~18 h，用Trypsin抑制剂中止消化。
关节炎中软骨破坏方向的细胞模型
借用医疗百科的描述“关节炎泛指发生在人体关节及其周围组织的炎性疾病，可分为数十种。我国的关节炎患者有1亿以上，且人数在不断增加。临床表现为关节的红、肿、热、痛、功能障碍及关节畸形，严重者导致关节残疾、影响患者生活质量。” 关节炎以慢性炎症为起始，但最终是导致功能障碍及关键畸形。从病理改变来
首次用干细胞制备人类心脏早期发育模型
近期，加州大学伯克利分校的研究人员，与Gladstone研究所的科学家合作，开发出一种模板，利用干细胞制备跳动的心脏组织，从而创建了一种系统，可以作为早期心脏发育模型，以及让怀孕更安全的一种药物筛选工具。延伸阅读：PNAS：多能干细胞来源的体外心脏组织模型。 相关研究结果发表在七月十四日的《N
实验鼠新模型“嫁接”人体免疫干细胞
美国华盛顿大学科学家9月22日表示，他们新近开发的实验室模型有望帮助寻找到更好治疗和预防伤寒的途径。据悉，科学家是将取自人体脐带血中的免疫干细胞移植到易感染疾病的实验鼠内后建立起该实验室模型的。 移植进实验鼠的细胞存活在其免疫系统中。虽然实验鼠通常能抵抗有害的、导致伤寒的沙门氏菌种，
细胞膜的板块镶嵌模型的功能简介
1977年，Jain和White提出生物膜是由具有不同流动性的板块镶嵌而成的动态结构。 脂筏模型 脂筏（lipid raft）是质膜上富含胆固醇和鞘磷脂的微结构域（microdomain）。大小约70nm左右，是一种动态结构，位于质膜的外小页。由于鞘磷脂具有较长的饱和脂肪酸链，分子间的作用
IL36靶点药物细胞筛选模型药
IL-36和IL36R通路在人体的炎症反应中扮演着非常重要的角色，是炎症性疾病的重要因素，属于IL-1家族成员。IL-36亚家族由3种相似的激动性配体IL-36α、IL-36β、IL-36γ和IL-36拮抗性配体(IL-36 receptor antagonist, IL-36Ra)组成。IL-36
细胞生物学术语结合变构模型
中文名称结合变构模型英文名称binding-change model定 义20世纪60年代美国学者博耶（P.Boyer）在研究ATP酶结合构象变化的基础上，提出的ATP合酶合成ATP的机制模型，主张在H＋浓度梯度的驱动下，F0的c环和F1的γ轴旋转时，F1的3个活性部位轮流发生构象变化，合成ATP
关节炎中软骨破坏方向的细胞模型
借用医疗百科的描述“关节炎泛指发生在人体关节及其周围组织的炎性疾病，可分为数十种。我国的关节炎患者有1亿以上，且人数在不断增加。临床表现为关节的红、肿、热、痛、功能障碍及关节畸形，严重者导致关节残疾、影响患者生活质量。”关节炎以慢性炎症为起始，但最终是导致功能障碍及关键畸形。从病理改变来说，软骨层消
关节炎中滑膜方向的细胞模型
为了跟前文“关节炎中软骨破坏方向的细胞模型”相对应，这里标题还用了“关节炎”这个描述，但其实，关节炎中涉及滑膜炎症的主要是类风湿关节炎（rheumatoid arthritis,RA）。也是关节炎中研究最广泛的类型之一。在类风湿关节炎发病进展中，至少涉及三大类细胞，免疫细胞，骨细胞，滑膜细胞。免疫细
Cell－Systems：构建RNA结合蛋白的剪接调控作用预测模型
基因组研究结果显示，人体内超过90%的基因存在选择性剪接(alternative splicing)。该过程在不同组织以及不同生理阶段受到严格的调控，其失调会导致多种疾病的发生。选择性剪接的体内调控主要由前体mRNA中的顺式元件(cis-elements) 招募反式剪接作用因子（trans-a
小鼠肾炎模型诱导阳离子牛血清白蛋白（cBSA）
肾小球肾炎是指一系列由免疫应答介导的导致肾小球炎症。膜性肾病和膜性肾小球肾炎是人类肾病综合征常见的病因。膜性肾病的特征是由免疫复合物沿着基底膜与内皮细胞之间的间隙沉积，导致基底膜增厚激活补体。激活的炎症级联导致肾功能受损，包括蛋白尿和肾功能衰竭。有研究报道用大鼠膜性肾病模型（Heymann肾炎），研
双转基因模型证明干细胞促进再生新理论
《JCI-Insight》杂志近期发表了他们的研究成果——注射后，干细胞通过协调内源性细胞导致愈合效果，并不直接负责软骨再生。 间充质干细胞（所谓的结缔组织祖细胞）在治疗软骨组织再生领域极具潜力，但是，干细胞疗法如何促进受损结缔组织愈合的机制尚不明确。生物医学科学系的研究者为解决这一问题首先需
脊髓星形胶质细胞机械性损伤的体外培养模型
1.材料与方法取新生的wistar 大鼠脊髓,剪碎,0125 %胰蛋白酶消化1h ,用含血清的DMEM培养液终止胰蛋白酶的作用; 而后吹打成散在的单个细胞,进行细胞计数,按5 ×105 个Pcm2 密度进行接种。培养至第10天时加10mM Leu2methy12ester 除杀小胶质细胞。于16d
高胰岛素血症细胞模型研究获进展
6月9日，NPG系列期刊《科学报告》（Scientific Reports）在线发表了中国科学院广州生物医药与健康研究院李尹雄课题组郭东升等的最新研究成果Modeling Congenital Hyperinsulinism with ABCC8-Deficient Human Embryoni
神奇数据模型定量CART细胞疗法
图片来源于网络 在弗吉尼亚联邦大学梅西癌症中心，科学家正在进行一项可能改变细胞免疫治疗方式的基础研究，该项目获得弗吉尼亚联邦大学梅西癌症中心（VCU Massey）试点资助。该项研究从精确的定量角度分析了免疫系统如何响应细胞疗法，从而寻求一种新的细胞免疫治疗方式，干细胞移植和CAR-T细胞疗法的协
体外三维模型或揭示癌细胞转移机制
癌症之所以致命，根本原因之一在于肿瘤细胞临床上的转移性，但是人们对肿瘤细胞侵袭和转移过程的认识尚不清楚。 现在，一项研究有望揭示肿瘤细胞的转移机制，帮助我们更加深入理解癌症的致命机理，从而为探索新治疗手段提供思路。 近日，中科院物理研究所公布了一项新研究进展。该所刘雳宇研究员与美国科学家合作
通过细胞计数对疾病模型小鼠进行免疫监测
通过细胞计数对疾病模型小鼠进行免疫监测 摘要生物样本往往是非单一细胞的混合物，如原代分离的细胞样本和许多培养的细胞样本都是由不同种类或不同功能的细胞组成。而对于样本中不同细胞亚群的区分和定量恰恰是很多研究中的关键一环。这些混合在一起的不同细胞通常是使用流式细胞仪和荧光标记的细胞类型特异性抗体来进行
计算机模型可揭示整联蛋白的运行机制
据物理学家组织网3月21日报道，最近，美国加利福尼亚大学(UC)伯克利分校和劳伦斯·伯克利国家实验室科学家开发出一种整联蛋白的计算机模型，只有约20纳米长，能模仿真实的整联蛋白在细胞中的活动，且对能量和其他变化产生的反应。这一成果为人们探索整联蛋白如何把细胞内外环境联系在一起开辟了新途径。相关论
蛋白质三级机构预测－同源模型化法2
5、构建目标蛋白质的环区：在第2步的序列比对中，可能加入空位，这些区域常常对应于二级结构元素之间的环区，对于环区需要另外建立模型。一般也是采用经验性方法，从已知结构的蛋白质中寻找一个最优的环区，拷贝其结构数据。如果找不到相应的环区，则需要用其它方法。6、优化模型：通过上述过程为目标蛋白质U建立了一个
《机器智能》：秒级预测蛋白质结构的大模型上线
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510009.shtm
最新模型定义蛇毒进化－剧毒蛋白质进化于无毒基因
据科学日报报道，目前描绘蛇或者蜥蜴嘴巴内部主要基因的科技改变了科学家们将动物定义为有毒的方式。如果口腔腺体能够表达与“毒素”相关的20个基因家族中的一些基因，那么这个物种就被定义为有毒。然而，美国德克萨斯大学阿灵顿分校的一项最新研究挑战了这一定义，这些研究还建立了一个描述蛇毒是如何产生的新模型。
蛋白质三级机构预测－同源模型化法1
蛋白质结构预测的生物学意义生物信息学研究的一个主要目标是了解蛋白质序列与三维结构的关系，但是序列与结构之间的关系是非常复杂的。人们已经掌握了一些蛋白质序列与二级结构之间的关系，但是对于蛋白质序列与空间结构之间的关系了解得比较少。预测蛋白质的二级结构只是预测折叠蛋白的三维形状的第一步。一些结构不是很规