9月26日《自然》杂志精选
早期地球的大陆动态 地球历史上的“冥古宙”(距今45亿~38亿年前)是地质上的黑暗时期，人们只能从零星的数据去了解它。根据以前应用于木星具有活跃火山活动的卫星“木卫一”的一个地球动力学模型，William Moore和 Alexander Webb提出一个“热管模型”来解释早期地球在早期岩浆海洋和板块构造时期之间过渡阶段的热传输和岩石圈动态。 该模型表明，由于经常发生将表面物质向下循环的火山喷发，形成了一个又冷又厚的单块岩石圈。该模型的预测结果与地质记录很相符，说明随着时间推移不断减少的热源可能加快了向板块构造阶段的突然转变。 人类转录组的深度分析 这项研究通过对来自“1000 Genomes Project”的462个人的类淋巴母细胞系的信使RNA和微RNA进行测序和深度分析来确定人类基因组中的调控变化。 分析显示了影响绝大部分基因的调控的普遍存在的基因变化，其中转录结构和表达水平的变......阅读全文
预测蛋白质序列的新AI模型问世
使用CARBonAra进行序列预测（示意图）。图片来源：瑞士洛桑联邦理工学院科技日报北京8月8日电 （记者张佳欣）瑞士洛桑联邦理工学院开发了一种名为CARBonAra的新型人工智能（AI）驱动模型。该模型可以根据不同分子环境所施加限制的主链支架预测蛋白质序列，有望在蛋白质工程及包括医学和生物技术在内
蛋白质折叠的拼版模型的介绍
此模型[9]的中心思想就是多肽链可以沿多条不同的途径进行折叠,在沿每条途径折叠的过程中都是天然结构越来越多,最终都能形成天然构象,而且沿每条途径的折叠速度都较快,与单一途径折叠方式相比,多肽链速度较快,另一方面,外界生理生化环境的微小变化或突变等因素可能会给单一折叠途径造成较大的影响,而对具有多
预测蛋白质序列的新AI模型问世
瑞士洛桑联邦理工学院开发了一种名为CARBonAra的新型人工智能（AI）驱动模型。该模型可以根据不同分子环境所施加限制的主链支架预测蛋白质序列，有望在蛋白质工程及包括医学和生物技术在内的多个领域带来重大进展。这一成果发表在最新一期《自然·通讯》杂志上。CARBonAra是在一个包含约370000个
预测蛋白质序列的新AI模型问世
瑞士洛桑联邦理工学院开发了一种名为CARBonAra的新型人工智能（AI）驱动模型。该模型可以根据不同分子环境所施加限制的主链支架预测蛋白质序列，有望在蛋白质工程及包括医学和生物技术在内的多个领域带来重大进展。这一成果发表在最新一期《自然·通讯》杂志上。CARBonAra是在一个包含约370000个
极低密度脂蛋白结构模型的介绍
极低密度脂蛋白：运输肝脏中合成的内源性甘油三酯。无论是血液运输到肝细胞的脂肪酸，或是糖代谢转变而形成的脂肪酸，在肝细胞中均可合成甘油三酯。在肝细胞内，甘油H酯与APOB100、胆固醇等结合，形成VLDL并释放入血。在低脂饮食时，肠粘膜也可分泌一些VLDL入血。VLDL入血后的代谢，大部分变成低密
细胞化学词汇沃森克里克模型
中文名称：沃森-克里克模型英文名称：Watson-Crick model定 义：沃森(J. D. Watson)和克里克(F. Crick)于1953年提出的DNA立体结构模型，认为DNA为两股反向平行的多聚脱氧核糖核苷酸，由互补碱基的氢键连接，并呈右手螺旋方式围绕同一轴心盘绕。应用学科：遗传学（
体外抗药肿瘤细胞模型的建立实验
实验方法原理 抗药性细胞模型的筛选大多采取长时间药物处理、诱导抗性，最总筛选出具有一定抗性的细胞克隆。实验材料 小鼠试剂、试剂盒 小牛血清DMEMDOX仪器、耗材 CO2培养箱无菌钢圈实验步骤 一、培养条件用含10%小牛血清的DMEM培养液，5%CO2，37℃培养。二、实验步骤1. 将CHO细胞培
细胞膜的流动镶嵌模型的简介
流动镶嵌模型突出了膜的流动性和不对称性，认为细胞膜由流动的脂双层和蛋白质组成。磷脂分子以疏水性尾部相对，极性头部朝向水相组成生物膜骨架，蛋白质或嵌在脂双层表面，或嵌在其内部，或横跨整个脂双层，表现出分布的不对称性。 不足之处： 1）不能说明膜在变化过程中如何保持膜的完整性和稳定性； 2）忽
学者开发出MIST模型解析T细胞功能
暨南大学基础医学与公共卫生学院教授罗钧洪团队基于变分自编码器深度学习框架开发了人工智能模型Multi-Insight for T cell（MIST），针对scRNA-seq与scTCR-seq数据的联合分析，创新性地构建了跨组学数据深度融合、可解释性和适配性强的分析框架。近日，相关成果发表于《
关于细胞膜的晶格模型的介绍
1975年，Wallach提出晶格模型。晶格模型是对流动镶嵌模型的补充，强调流动的整体性。用膜脂可逆地进行无序（液态）和有序（晶态）的相变来解释生物膜的流动性。膜镶嵌蛋白对脂类分子的运动具控制作用。镶嵌蛋白和它周围的脂类分子形成晶格状态，这些不移动的脂类分子称界面脂质，而流动的脂质呈小片、点状分
关于蛋白质折叠的格点模型的介绍
格点模型（也简称HP模型）,最早是由Dill等人1989年提出的。格点模型可分为二维模型和三维模型两类。二维格点模型就是在平面空间中产生正交的单位长度的网格,每个氨基酸分子按在序列中排序的先后顺序依次放置到这些网格交叉点上,在序列中相邻的氨基酸分子放置在格点中时也必须相邻,即相邻氨基酸分子在格点
培养乳鼠心肌细胞的缺氧损伤模型和缺氧预处理(APC)模型
原代心肌细胞培养及APC模型的制作参照先前报道的方法[2]。即取出生后1－2 d乳鼠心尖部组织, 胰酶消化, 离心后用含20%小牛血清的DMEM培养基制成细胞悬液, 过滤, 按差速贴壁分离法纯化心肌细胞, 以1×105 cells/cm2接种于24孔板, 每24 h更换培养液。贴壁生长2 d, 于实
体外抗药肿瘤细胞模型的建立实验_细胞培养技术
实验方法原理体外抗药肿瘤细胞模型的建立实验采取长时间药物处理、诱导抗性，最终筛选出具有一定抗性的细胞克隆。实验材料小鼠试剂、试剂盒小牛血清DMEMDOX仪器、耗材CO2培养箱无菌钢圈实验步骤一、培养条件用含10%小牛血清的DMEM培养液，5%CO2，37℃培养。二、实验步骤1. 将CHO细胞培养在
概述成视网膜细胞瘤模型的测试内容
儿童肿瘤——成视网膜细胞瘤是抗癌基因活动的最富有特征性的模式。在这种以遗传或散发式发生的肿瘤中，成视网膜细胞瘤基因即是隐性癌基因，正常情况下它可阻遏成视网膜细胞的恶性转化。根据knudson所提出的“两次碰撞”假说，具家族性病发危险的成员继承了一个已损伤的非功能性基因。在这样的成员中，第二次“碰
细胞生物学术语结合变构模型
中文名称结合变构模型英文名称binding-change model定 义20世纪60年代美国学者博耶（P.Boyer）在研究ATP酶结合构象变化的基础上，提出的ATP合酶合成ATP的机制模型，主张在H＋浓度梯度的驱动下，F0的c环和F1的γ轴旋转时，F1的3个活性部位轮流发生构象变化，合成ATP
关节炎中软骨破坏方向的细胞模型
借用医疗百科的描述“关节炎泛指发生在人体关节及其周围组织的炎性疾病，可分为数十种。我国的关节炎患者有1亿以上，且人数在不断增加。临床表现为关节的红、肿、热、痛、功能障碍及关节畸形，严重者导致关节残疾、影响患者生活质量。” 关节炎以慢性炎症为起始，但最终是导致功能障碍及关键畸形。从病理改变来
细胞膜的板块镶嵌模型的功能简介
1977年，Jain和White提出生物膜是由具有不同流动性的板块镶嵌而成的动态结构。 脂筏模型 脂筏（lipid raft）是质膜上富含胆固醇和鞘磷脂的微结构域（microdomain）。大小约70nm左右，是一种动态结构，位于质膜的外小页。由于鞘磷脂具有较长的饱和脂肪酸链，分子间的作用
关节炎中软骨破坏方向的细胞模型
借用医疗百科的描述“关节炎泛指发生在人体关节及其周围组织的炎性疾病，可分为数十种。我国的关节炎患者有1亿以上，且人数在不断增加。临床表现为关节的红、肿、热、痛、功能障碍及关节畸形，严重者导致关节残疾、影响患者生活质量。”关节炎以慢性炎症为起始，但最终是导致功能障碍及关键畸形。从病理改变来说，软骨层消
实验鼠新模型“嫁接”人体免疫干细胞
美国华盛顿大学科学家9月22日表示，他们新近开发的实验室模型有望帮助寻找到更好治疗和预防伤寒的途径。据悉，科学家是将取自人体脐带血中的免疫干细胞移植到易感染疾病的实验鼠内后建立起该实验室模型的。 移植进实验鼠的细胞存活在其免疫系统中。虽然实验鼠通常能抵抗有害的、导致伤寒的沙门氏菌种，
首次用干细胞制备人类心脏早期发育模型
近期，加州大学伯克利分校的研究人员，与Gladstone研究所的科学家合作，开发出一种模板，利用干细胞制备跳动的心脏组织，从而创建了一种系统，可以作为早期心脏发育模型，以及让怀孕更安全的一种药物筛选工具。延伸阅读：PNAS：多能干细胞来源的体外心脏组织模型。 相关研究结果发表在七月十四日的《N
AI新模型精准预测细胞内基因活动
哥伦比亚大学瓦格洛斯内外科医学院团队开发了一种创新的人工智能（AI）模型——通用表达转换器（GET），该模型能够精确预测人类细胞内的基因活动，为理解细胞内部工作机制提供了全新视角。这项突破性成果可帮助科学家以前所未有的方式，探索从癌症到遗传疾病等一系列健康问题，推动医学研究向前迈进一大步。相关论文发
基因工程猪模型揭示免疫细胞“致命对话”
亨廷顿病（HD）又称大舞蹈病或亨廷顿舞蹈症，是一种由HTT基因CAG重复序列异常扩增引起的常染色体显性遗传性神经退行性疾病。该病的核心病理特征极为明确：纹状体中的中型棘状神经元发生选择性死亡。然而，驱动这种选择性神经元丢失的精确机制，尤其是神经免疫系统在其中扮演的角色，长期以来一直是领域内亟待破
staurosporine诱导小鼠心肌细胞凋亡模型构建
原代心肌细胞的培养及实验方案取出生后0~24 h C57BL/6cr小鼠心脏，按改良的Lader方法进行细胞的分离。 获取博动的心脏迅速放置于无Ca2+、Mg2+的Hank’s平衡液中。剪碎心脏，放置在4℃条件下100 g/L的Trypsin溶液中消化16~18 h，用Trypsin抑制剂中止消化。
关节炎中滑膜方向的细胞模型
为了跟前文“关节炎中软骨破坏方向的细胞模型”相对应，这里标题还用了“关节炎”这个描述，但其实，关节炎中涉及滑膜炎症的主要是类风湿关节炎（rheumatoid arthritis,RA）。也是关节炎中研究最广泛的类型之一。在类风湿关节炎发病进展中，至少涉及三大类细胞，免疫细胞，骨细胞，滑膜细胞。免疫细
AI新模型精准预测细胞内基因活动
哥伦比亚大学瓦格洛斯内外科医学院团队开发了一种创新的人工智能（AI）模型——通用表达转换器（GET），该模型能够精确预测人类细胞内的基因活动，为理解细胞内部工作机制提供了全新视角。这项突破性成果可帮助科学家以前所未有的方式，探索从癌症到遗传疾病等一系列健康问题，推动医学研究向前迈进一大步。相关论文发
IL36靶点药物细胞筛选模型药
IL-36和IL36R通路在人体的炎症反应中扮演着非常重要的角色，是炎症性疾病的重要因素，属于IL-1家族成员。IL-36亚家族由3种相似的激动性配体IL-36α、IL-36β、IL-36γ和IL-36拮抗性配体(IL-36 receptor antagonist, IL-36Ra)组成。IL-36
帕金森体外模型帕金森体外模型
体外培养的中脑多巴胺能神经元MPTP损伤模型l实验操作：实验采用胚胎龄14一16天的大鼠，剖子宫取胎，取胎鼠中脑腹侧区。可将多个胚胎来源的组织收集在一起，置Fl2培养基（Gibco）至35mm的培养皿中，以细剪刀剪碎。将2ml含0.125％的胰酶的F12加入到组织中，该混合物于37oC孵育10分钟后
关于极低密度脂蛋白结构模型的基本介绍
极低密度脂蛋白：运输肝脏中合成的内源性甘油三酯。无论是血液运输到肝细胞的脂肪酸，或是糖代谢转变而形成的脂肪酸，在肝细胞中均可合成甘油三酯。在肝细胞内，甘油H酯与APOB100、胆固醇等结合，形成VLDL并释放入血。在低脂饮食时，肠粘膜也可分泌一些VLDL入血。VLDL入血后的代谢，大部分变成低密
酪蛋白胶粒的双结合模型的基本信息介绍
由Home1998年在Holt基础上提出的。在双结合模型中，胶粒的集结和生长是通过聚合过程（polymerization）实现的。这种模型最终聚合的结果也是在酪蛋白胶粒表面形成κ-casein层。 这三个模型的共同点是表层都为κ-asein，κ-casein含有169个氨基酸残基，在phe（1
小鼠肾炎模型诱导阳离子牛血清白蛋白（cBSA）
肾小球肾炎是指一系列由免疫应答介导的导致肾小球炎症。膜性肾病和膜性肾小球肾炎是人类肾病综合征常见的病因。膜性肾病的特征是由免疫复合物沿着基底膜与内皮细胞之间的间隙沉积，导致基底膜增厚激活补体。激活的炎症级联导致肾功能受损，包括蛋白尿和肾功能衰竭。有研究报道用大鼠膜性肾病模型（Heymann肾炎），研