我国学者与海外合作者在利用人工智能识别潜在RNA病毒研究方面取得进展
图 使用人工智能对全球病毒圈的深度挖掘 在国家自然科学基金项目(批准号:82341118、32270160)等资助下,中山大学医学院施莽教授团队、阿里云李兆融团队,联合悉尼大学Edward Holmes教授团队,在人工智能(artificial intelligence,AI)算法识别潜在的RNA病毒种(species)及RNA病毒超群(supergroups)研究方面取得进展。相关成果以“利用人工智能揭示隐藏的RNA病毒圈(Using Artificial Intelligence to Document the Hidden RNA Virosphere)”为题,于2024年10月9日在《细胞》(Cell)杂志在线发表。论文链接:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)01085-7。 病毒是地球生态系统的重要组成部分,与人类健康关系密切。目前人类对病毒多样性的认......阅读全文
研究揭示正单链RNA病毒编码小蛋白新策略
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510524.shtm
马尔堡病毒核蛋白RNA复合物形成结构
京都大学领导的研究小组正在利用最近获得的马尔堡病毒核心结构的知识,试图通过它的角提取马尔堡病毒。最近的一项研究结果表明,未来的药物开发可能基于核衣壳形成的目标,这可能会抑制马尔堡病毒的复制能力。“在非洲马堡病毒和埃博拉病毒的零星和反复爆发导致严重出血热的情况下,既没有针对马堡病毒的特殊治疗方法,也没
研究揭示甘蔗花叶病毒干扰RNA剪接促进侵染
近日,中国农业大学植物保护学院教授周涛课题组在甘蔗花叶病毒(SCMV)相关研究上获得了新进展。研究发现,SCMV侵染改变了玉米八氢番茄红素合成酶基因(ZmPSY1)的转录本可变剪接模式,因此促进病毒侵染。相关成果发表于《植物生理学报》。 SCMV是我国和非洲玉米生产上的一种主要病原,广泛分布于世
科学家在海洋中发现5500种RNA新病毒
图片来源:YustynaOlha / stock.adobe.com近日在线发表于《科学》的一项新研究显示,从世界各地收集的海水样本为人们提供了一个关于RNA病毒的新数据宝库,增加了生态学研究的可能性,重塑了人们对这些微小但重要的亚微观颗粒如何进化的理解。将机器学习分析与传统发育树相结合,一个国际
前沿报道|新冠病毒改变感染细胞RNA首次获证
北京11月10日。据物理学家组织网9日报道,通过分析研究病毒、人类和动物细胞RNA获得的13个数据集,巴西圣保罗联邦大学(UNIFESP)的科学家首次证明,新冠病毒会改变宿主细胞RNA的功能。相关论文发表于最新一期《细胞与感染微生物学前沿》杂志。在本研究中,来自UNIFESP的科研团队通过直接RNA
RNA病毒复制酶从细胞核转运至细胞质并启动病毒复制机制
近日,作物有害生物功能基因组研究创新团队在国际知名期刊《新植物学家(New Phytologist)》在线发表研究论文“Nuclear exportin 1 facilitates turnip mosaic virus infection by exporting the sumoylated
70种节肢动物中发现112种全新病毒-负链RNA病毒危害最大
中国疾控中心张永振研究员带领的人兽共患病研究团队,在70种节肢动物中发现了112种从未被报道过的全新病毒,并命名了一个全新病毒科。该研究成果日前发表在生命科学领域的顶级期刊eLife杂志上。 张永振介绍,该研究在我国的湖北、浙江、新疆等地采集了昆虫纲、蛛形纲、唇足纲、软甲亚纲的70种节肢动物,
研究揭示锌指抗病毒蛋白ZAP识别RNA的分子机制
锌指抗病毒蛋白(Zinc-finger Antiviral protein,ZAP)是一种由宿主编码的重要抗病毒因子,ZAP特异能够抑制包括小鼠白血病病毒、艾滋病病毒、埃博拉病毒等在内的多种病毒复制。ZAP特异结合病毒的靶RNA序列,干扰靶mRNA的翻译起始。而ZAP识别RNA的序列特征和作用分
时隔一年-华人教授再次发表Nature文章解析RNA病毒
去年,来自加州大学洛杉矶分校(UCLA)加州纳米技术研究院的周正洪教授与其合作者在Nature杂志上发文,揭示了双链RNA(dsRNA)病毒的三维原子结构,首次指出了病毒如何感知宿主细胞内的环境条件以触发转录,并阐述了dsRNA基因组在病毒内如何组构以及RNA自我复制的机制。 时隔一年,周正洪
我国科学家发现RNA病毒聚合酶独特催化机制
RNA病毒包括SARS冠状病毒、高致病性流感病毒、埃博拉病毒、寨卡病毒等,在过去十五年间多次造成全球性影响,对人类健康构成严重威胁,而针对RNA病毒的药物和疫苗目前严重匮乏。聚合酶作为RNA病毒所必需的复制酶,在病毒RNA基因组复制过程中发挥核心作用,深入了解其催化机制,将为有效应对RNA病毒提
新型鼻腔内RNA疗法有望靶向治疗西尼罗病毒感染
近日,来自耶鲁大学的研究人员通过研究开发了一种新型的RNA疗法来靶向治疗西尼罗病毒感染,这种创新性的方法或能降低患者脑部的病毒水平,从而促进机体免疫系统有效摧毁病毒,同时也能给患者带来抵御西尼罗病毒感染的长效保护机制,相关研究刊登于国际杂志Cell Host & Microbe上。图片摘自:ss
时隔一年-华人教授再次发表Nature文章解析RNA病毒
生物通报道:去年,来自加州大学洛杉矶分校(UCLA)加州纳米技术研究院的周正洪教授与其合作者在Nature杂志上发文,揭示了双链RNA(dsRNA)病毒的三维原子结构,首次指出了病毒如何感知宿主细胞内的环境条件以触发转录,并阐述了dsRNA基因组在病毒内如何组构以及RNA自我复制的机制。 时隔
曹雪涛等发现RNA病毒逃逸机体天然免疫机理
中国工程院院士曹雪涛研究团队在最新研究中,获得了RNA病毒如何通过其独特方式逃逸天然免疫细胞监控清除作用的研究结果,并发现了天然免疫识别与调控的新型分子机制。相关研究论文近日发表在《细胞》(Cell)杂志上。 巨噬细胞、树突状细胞等天然免疫细胞,是机体感知与识别外源病原体入侵的第一道防线。
我国科学家发现RNA病毒聚合酶独特催化机制
RNA病毒包括SARS冠状病毒、高致病性流感病毒、埃博拉病毒、寨卡病毒等,在过去十五年间多次造成全球性影响,对人类健康构成严重威胁,而针对RNA病毒的药物和疫苗目前严重匮乏。聚合酶作为RNA病毒所必需的复制酶,在病毒RNA基因组复制过程中发挥核心作用,深入了解其催化机制,将为有效应对RNA病毒提
研究揭示锌指抗病毒蛋白ZAP识别RNA的分子机制
2020年1月7日,Cell Reports 杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所高璞课题组与高光侠课题组合作的研究论文“Molecular Mechanism of RNA Recognition by Zinc-finger Antiviral protein”。该研究工作解析了锌指抗病毒
研究发现鞘磷脂能够激活丙型肝炎病毒RNA聚合酶
HCV聚合酶的鞘磷脂结合结构域 10月,病毒研究领域著名学术期刊Journal of Virology在线发表了中科院上海巴斯德所最新研究成果,该研究揭示了作为脂筏主要结构成分之一的鞘磷脂能够以基因型特异性的方式激活丙型肝炎病毒(HCV)1b亚型的RNA聚合酶,并且找到了其结合和激
Nature-Microbiology:流感病毒聚合酶调控RNA合成机制
流感病毒是危害全球公共卫生健康的重要病原之一,能在人群中引起大规模流行和季节性流感,每次暴发都会引起人类死亡并造成巨大的经济损失。流感病毒(Influenza virus)是分节段的负链RNA病毒(Segmented Negative-Sense RNA virus, sNSV),属于正粘病毒科
揭示宿主内的小RNA参与乙肝病毒表达调控
乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染可引起肝脏的急性和慢性炎症。急性感染一般表现为自限性肝炎,除爆发性肝炎外,对人体的危害较小;而慢性感染则与肝硬化(cirrhosis)和原发性肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的发生密切相关。全球
武汉病毒所在病原细菌小RNA调控机制研究中取得进展
小RNA(Small non-coding RNA, sRNA)是细菌重要的转录后调控因子,广泛参与调控细菌各方面的功能。由于不同sRNA调控的靶标及其调控机制不相同,多数已鉴定sRNA 的靶基因未知,且一些已知靶基因的sRNA 是否存在新的调控靶标及调控机制也不清楚,因此sRNA一直是原核生物
新冠病毒RNA直接测序-这次科学家得到了什么?
澳大利亚墨尔本大学微生物和免疫学系的Lachlan Coin和Sebastian Duchene团队及合作者,提供了新冠病毒的第一个直接RNA序列,详细介绍了该冠状病毒亚基因组长度的mRNA结构,并描述了从共享数据中揭示的冠状病毒进化遗传学的各个方面。相关论文3月7日发布于预印本服务器bioRx
借助人工智能技术,研究团队发现大量全新RNA病毒
记者10日从中山大学获悉,该校医学院施莽教授团队与阿里云李兆融团队将人工智能技术应用于病毒鉴定,发现了传统研究方法未能发现的病毒“暗物质”,探索了病毒学研究的新路径。相关成果近日发表在国际期刊《细胞》上。据介绍,传统的病毒发现方法包括病毒分离和生命组学的生物信息学分析,高度依赖既有知识,对RNA病毒
古老的RNase-III抗病毒防御系统有望引发RNA治疗变革
尽管人类主要依赖更加复杂的更加强大的抗病毒防御系统,但是早期的生命形式在十亿年前形成的让它们自己抵抗病毒感染的原始防御系统仍然能够在人细胞中发现到。如果科学家们能够设计出有益的病毒,让这些病毒利用这种古老的系统直接运送药物到患病组织中,那么这种系统尽管比较简单,但可能成为下一个精准医疗时代的基础
Carl-June团队:非病毒RNA转导的CART19细胞治疗复发
目前,CAR-T细胞疗法正在针对多种恶性血液肿瘤进行临床研究,其中包括经典型霍奇金淋巴瘤(cHL)。但由于cHL在免疫抑制肿瘤微环境(TME)中缺乏HRS细胞的独特生物学特性,使得直接针对HRS表达抗原的细胞治疗面临着很大的挑战。 从左到右依次为:Bruce Levine, David Por
基因编辑:经编程后杀死人细胞中RNA病毒的新技术
世界上许多最常见或致命的人类病原体都是RNA病毒,比如埃博拉病毒、寨卡病毒和流感病毒,并且大多数都没有美国食品药品管理局(FDA)批准的治疗方法。在一项新的研究中,来自美国麻省理工学院、哈佛大学和布罗德研究所等研究机构的研究人员将一种CRISPR RNA切割酶转变为一种经编程后检测和破坏人细胞中
新RNA疗法通过鼻腔给药,有望治疗西尼罗河病毒感染
耶鲁大学和韩国汉阳大学的研究小组开发了一种针对西尼罗河病毒(WNV) 的新型RNA疗法。近日,一篇发表在《Cell Host&Microbe》的文章提出了一种在WNV侵入大脑和中枢神经系统后的突破性治疗策略。通过siRNA治疗WNV病毒感染(图片来源:《Cell Host&Microbe》)
病毒基因组DNA/RNA提取试剂盒使用说明
病毒基因组DNA/RNA提取试剂盒一、简介病毒总核酸提取试剂盒适合于从血清、血浆、组织匀浆等样品中提取病毒总核酸。试剂盒基于硅胶柱纯化技术,提取过程中无需使用有毒的酚氯仿抽提,也无需进行耗时的醇类沉淀。该产品已经成功地提取了乙肝A/C、丙肝、以及诺如病毒标准品等的核酸。获得的DNA/RNA可直接用于
贝克曼RNA提取试剂盒在面向病毒研究的应用
印第安纳州印第安纳波利斯,2020年5月12日,贝克曼库尔特生命科学公司宣布推出RNAdvance Viral XP。这是一种经验证可用于传染病和病原体实时PCR病毒研究的新型RNA提取试剂盒。为满足全球各高通量实验室剧增的RNA提取需求,目前该试剂盒已经可以购买。 RNAdvance Vira
新型跨界侵染植物与真菌负单链RNA病毒被发现
西北农林科技大学植物保护学院教授孙丽英课题组发现了一种新型跨界侵染植物与真菌的负单链RNA病毒(VmNSRV1),相关研究成果近日发表在PNAS上。 ?该研究发现的新型真菌病毒VmNSRV1分离自苹果树腐烂病的病原菌(Valsa mali)。(课题组供图)该研究发现的新型真菌病毒VmNSRV1分离
新型跨界侵染植物与真菌负单链RNA病毒被发现
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519441.shtm西北农林科技大学植物保护学院教授孙丽英课题组发现了一种新型跨界侵染植物与真菌的负单链RNA病毒(VmNSRV1),相关研究成果近日发表在PNAS上。 ?该研究发现的新型真菌
揭示寨卡病毒RNA结构及固有免疫MAVS信号通路调控分子
本周,Cell Host & Microbe 杂志在线发表了两篇来自国内学者的研究论文。 第一篇是由清华大学张强锋课题组与谭旭课题组联合发表的题为Integrative Analysis of Zika Virus Genome RNA Structure Reveals Critical D