我国学者与海外合作者在利用人工智能识别潜在RNA病毒研究方面取得进展
图 使用人工智能对全球病毒圈的深度挖掘 在国家自然科学基金项目（批准号：82341118、32270160）等资助下，中山大学医学院施莽教授团队、阿里云李兆融团队，联合悉尼大学Edward Holmes教授团队，在人工智能（artificial intelligence，AI）算法识别潜在的RNA病毒种（species）及RNA病毒超群（supergroups）研究方面取得进展。相关成果以“利用人工智能揭示隐藏的RNA病毒圈（Using Artificial Intelligence to Document the Hidden RNA Virosphere）”为题，于2024年10月9日在《细胞》（Cell）杂志在线发表。论文链接：https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)01085-7。 病毒是地球生态系统的重要组成部分，与人类健康关系密切。目前人类对病毒多样性的认......阅读全文
新型跨界侵染植物与真菌负单链RNA病毒被发现
西北农林科技大学植物保护学院教授孙丽英课题组发现了一种新型跨界侵染植物与真菌的负单链RNA病毒（VmNSRV1），相关研究成果近日发表在PNAS上。 ?该研究发现的新型真菌病毒VmNSRV1分离自苹果树腐烂病的病原菌（Valsa mali）。（课题组供图）该研究发现的新型真菌病毒VmNSRV1分离
古老的RNase－III抗病毒防御系统有望引发RNA治疗变革
尽管人类主要依赖更加复杂的更加强大的抗病毒防御系统，但是早期的生命形式在十亿年前形成的让它们自己抵抗病毒感染的原始防御系统仍然能够在人细胞中发现到。如果科学家们能够设计出有益的病毒，让这些病毒利用这种古老的系统直接运送药物到患病组织中，那么这种系统尽管比较简单，但可能成为下一个精准医疗时代的基础
Cell－Research：研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络
RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病，比如冠状病毒（如新冠病毒，SARS-CoV-2）、黄病毒属（如寨卡病毒，ZIKV；登革热病毒，DENV）、丝状病毒（如埃博拉病毒，EBOV）以及流感病毒（Influenza virus）等。由RNA病毒引起的疾病，比
Carl－June团队：非病毒RNA转导的CART19细胞治疗复发
目前，CAR-T细胞疗法正在针对多种恶性血液肿瘤进行临床研究，其中包括经典型霍奇金淋巴瘤(cHL)。但由于cHL在免疫抑制肿瘤微环境(TME)中缺乏HRS细胞的独特生物学特性，使得直接针对HRS表达抗原的细胞治疗面临着很大的挑战。 从左到右依次为：Bruce Levine, David Por
RNA干涉(RNA－Interference，RNAi)（2）
早期的 RNAi 技术可用在研究与胚胎发育相关基因的功能上，但是由于细胞分裂造成 dsRNA 的稀释，使得这种方法在研究成体的基因功能时有一定的局限性。为弥补早期 RNAi 技术的不足，Tavernarakis 等将 RNAi 技术做了一些改进及更动，将目的基因之标的序列以反向重复的方式，由
RNA干涉(RNA－Interference，RNAi)（1）
基因沉默（gene silencing）是生物体内特定基因由于种种原因不表达的遗传现象。一方面，基因沉默是生物遗传操作创造新的遗传修饰生物（genetically modified organisms）的障碍，另一方面，它又是植物抵抗外来核酸入侵（如病毒）的一种反应，为植物抗病毒的遗传育
RNA干扰技术(RNA－interference，RNAi)
1995年，康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线虫（C. elegans）中的par-1基因时，发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达，而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA（sense RNA）以期观察到基因表达的增强。但得到的结果
RNA提取时RNA降解原因
1 ) 新鲜细胞： 裂解液的量不足，使得裂解不充分。 2 ) 新鲜组织： 某些含有内源性核酸酶的样品，很难避免RNA酶的降解，建议采用的方法为在液氮条件下将组织研碎，并且，匀浆时采用更多的裂解液。 3 ) 冷冻样品： 样品取材后应该迅速置于液氮中冷冻存放，然后转移到-70℃冰箱存
研究团队揭示海洋无脊椎动物RNA病毒的遗传多样性
5月6日，《中国科学：生命科学》（SCIENCE CHINA Life Sciences）在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所研究员崔杰课题组题为Virome in Marine Ecosystems Reveal Remarkable Invertebrate RNA virus Divers
北大，中科院Nature－Plants发表新成果：RNA沉默与病毒防御
生物通报道：来自北京大学生科院，中科院遗传发育所的研究人员通过分子生物学、遗传学以及生物信息学等手段，发现了一个单子叶植物特有、且能够被病毒侵染所抑制的水稻负调控抗病因子miR528，揭示了该miRNA及其调控的靶基因在水稻与病毒相互作用过程中的抗病机制，并进一步发现该机制具有广谱抗病毒功能。
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—病毒篇
RNA甲基化领域是当前最耀眼的国际科研明星，也是国自然申请的大热点；究其原因，是因为最近一两年，RNA甲基化的功能与分子机制方面取得了巨大的进展。RNA甲基化已被证实在癌症发生发展，病毒感染，神经发育，干细胞分化等过程中发挥着关键作用。今天，我们承接上一期的癌症篇，为您带来病毒领域的RNA甲基化
全套病毒RNA－m6A甲基化修饰研究工具的使用（二）
那么，病毒RNA修饰的研究工作流程有哪些呢？ 首先，提取病毒RNA 无论您是从细胞，组织还是病毒等样品开始实验，高效而快速的RNA提取通常都是成功进行实验的第一步。工作流程的这一部分至关重要，因为足够的纯度和产量都是确保下游应用程序平稳准确运行的基本要求。
上海研制的“新冠病毒体外转录RNA标准物质”获批
记者23日从上海市市场监管局获悉，上海研制的“新冠病毒体外转录RNA标准物质”近日被批准为国家级标准物质，能有效评价新冠病毒核酸检测试剂盒的准确性。这是新冠病毒首个由地方研制成功并获国家批准的体外转录RNA标准物质，可供国内外核酸试剂盒生产企业和研发机构使用，研制及审批时间从一年以上缩短至两个月
全套病毒RNA－m6A甲基化修饰研究工具的使用（三）
随后, 需要检测m6A甲基化酶和脱甲基酶活性 如果您打算研究RNA甲基化酶或去甲基化酶的活性/抑制作用，我们建议您使用上述提到的功能强大的核提取试剂盒（OP-0002），该试剂盒可以快速提取核蛋白，同时可确保提取后的酶活性保持完整。 收集了核提取物后，进行甲
研究人员揭示锌指抗病毒蛋白ZAP识别RNA的分子机制
2020年1月7日，Cell Reports 杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所高璞课题组与高光侠课题组合作的研究论文“Molecular Mechanism of RNA Recognition by Zinc-finger Antiviral protein”。该研究工作解析了锌指抗病毒
,流感病毒基因终于能直接以它原始－RNA－形式被测出
最新的一项技术，使流感病毒第一次以它原始 RNA 的形态被测序出来。流感病毒的基因编码，同其他病毒一样，都储存在 RNA 中，因此若想测得其基因序列，在之前有限的技术下，只能通过测序其逆转录后的 DNA 而获得。但是，这项新发明，使用了纳米孔测序技术，当基因通过一个微小的分子泵时，能够直接读出其
我国科学家建立植物负义链－RNA－病毒反向遗传学体系
近日，美国《国家科学院院刊》在线发表了南京农业大学植物病毒学实验室教授陶小荣团队的最新研究成果。他们成功拯救出番茄斑萎病毒，在全球首次建立植物多分体负义链 RNA 病毒的反向遗传学体系，攻克了植物多分体负义链 RNA 病毒研究中的 “卡脖子” 难题。 论文通讯作者陶小荣介绍，负义链 RNA 病
研究解析新冠病毒RNA聚合酶三维精细结构
由饶子和院士/娄智勇教授/王权教授等组成的“上海科技大学-清华大学抗新冠病毒联合攻关团队”率先在国际上成功解析了新型冠状病毒转录复制机器核心单元“RdRp-nsp7-nsp8”复合体的三维空间结构，整体分辨率达到2.9 埃（Å）。 该研究揭示了该病毒遗传物质转录复制机器核心“引擎”的结构特征，
寨卡病毒基因组RNA结构与感染性的关系
2018年11月21日，清华大学生命科学学院张强锋课题组、药学院谭旭课题组在《细胞宿主与微生物》（Cell Host & Mircobe）期刊在线发表题为《寨卡病毒基因组RNA结构的综合分析揭示了病毒感染性的关键决定因素》（Integrative Analysis of
Cell子刊：研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络
RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病，比如冠状病毒（如新冠病毒，SARS-CoV-2）、黄病毒属（如寨卡病毒，ZIKV；登革热病毒，DENV）、丝状病毒（如埃博拉病毒，EBOV）以及流感病毒（Influenza virus）等。由RNA病毒引起的疾病，
全套病毒RNA－m6A甲基化修饰研究工具的使用（一）
如果新冠病毒SARS-CoV-2的大流行对我们有任何启发的话，那么要数对RNA修饰的研究了，此时研究病毒RNA以及其甲基化修饰等功能，显得比以往任何时候都更加重要。 而这是否意味着要研究病毒RNA本身不同的各种突变体或者表观遗传变化如何使这些病毒更灵活和感染力？还是研究从细胞和
RNA提取心得（组织RNA提取和培养细胞的RNA提取）
一.组织RNA提取 1.最好新鲜组织，这样RNA提取的效果比较好，这是肯定的。 2. 如果不是新鲜的（最好在半年之内，-80℃或者液氮中冻存的）组织，注意不要反复冻融，从冰冻状态拿到0-4℃，注意不要拿到常温，待组织解冻后，用 DEPC泡过的剪刀剪一小块组织，称重后，放到预冷的匀浆器中，然后
反义技术——RNA干扰（RNA－interference，RNAi）
最近由于RNA干扰（RNA interference，RNAi）的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的（1），是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在RNAi领域取得的进步，已经有许多这方面的综述发表（2-4）。RNA干扰是由长的双链 RNA
RNA干扰相关知识RNARISC
RNA-induced silencing complex（RISC）：一种RNA-蛋白质复合物，通过与目标mRNA完全或者部分的互补配对来实施切割或者翻译抑制功能。SiRNA组装siRISC，miRNA组装miRISC。RISCs（无论siRISC还是miRISC）包括两种类型：切割型和不切割型。
RNA分离与分析实验_分离RNA
实验材料标记细胞试剂、试剂盒乙酸缓冲液仪器、耗材漩涡器实验步骤1. 收获标记细胞。2. 小心处置上清液，用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸缓冲液悬浮细胞沉淀，每 1 ml 压积细胞用 10 ml 缓冲液。3. 于室温用漩涡器振荡裂解细胞。4. 加等体积的水饱和酚，充分混匀，于 60
RNA干扰相关知识RNARITS）
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing（RITS）：是一种组织染色质变型的复合物。RITS复合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白质，通过结合到异染色质的基因池上来促使异染色质上基因的沉默。
我国科学家首次解析病毒RNA与宿主蛋白质互作网络
以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康，甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质，在致病过程中发挥着关键作用，但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期，我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络，研究成果发表在《Cell Research
科学研究！新冠病毒RNA是否能够整合进宿主基因组？
新型冠状病毒SARS-CoV-2是造成COVID-19在全球范围肆虐的病因。该病毒为一种单股正链RNA病毒，具有高传染性特性，能够感染人体各代谢系统的多种组织器官，并引发严重的临床症状，深入研究新冠病毒基因组RNA的特性十分必要。 2021年8月2日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中
我国科学家首次解析病毒RNA与宿主蛋白质互作网络
以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康，甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质，在致病过程中发挥着关键作用，但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期，我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络，研究成果发表在《Cell Research
我国科学家发现有重大生物学意义的全新RNA病毒
我国科学家从蜱中发现一种从未被报道过的分节段RNA病毒，该病毒在分类上可能代表着一个新病毒科。该病毒由中国疾控中心传染病所张永振研究员及其研究团队发现，文章日前发表在《美国科学院院报》杂志上，国际著名学术期刊《Nature Reviews Microbiology》高度评价了该论文的重要意义、《