科学家开发出配体靶蛋白质鉴定新方法

近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员叶明亮团队和中国科学院上海药物研究所研究员罗成团队合作,利用蛋白质在结合配体后局部稳定性的变化,开发了一种在复杂体系中可以同时鉴定配体结合蛋白和结合位点的蛋白质组学分析新方法。该方法无需对配体进行化学修饰,广谱适用于包括药物、代谢物、污染物等不同结构配体的靶蛋白质鉴定,将为药学、基础生物学、环境毒理学等领域提供新的研究工具。相关成果于12月10日发表在《自然-方法》。配体靶蛋白质的鉴定新方法。大连化物所供图 生物体仿佛拥有一套精密的“钥匙与锁”系统,其中的“钥匙”便是各式各样的配体分子,而“锁”则是蛋白质上那些特定的结合位点。这些配体与蛋白质的结合,就像是一场场精准无误的“对接仪式”,触发了生物体内的化学反应和生物功能。例如,当代谢物与蛋白质结合能使细胞感知到营养状态,而药物与蛋白质结合能够调控机体生理状态等。所以,充分了解和“捕捉”生物分子的“配对”蛋白质及“配对”位点,有助于揭示......阅读全文

蛋白质组鉴定技术简述

如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE,那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定。在这里,我们不考虑传统的蛋白鉴定方法,如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达。并不是因为这些方法无效,而是因为它们通常耗时、耗力,不

蛋白质组的鉴定方法

如蛋白质鉴定结果、蛋白质的亚细胞定位、蛋白质在不同条件下的表达水平等信息。目前应用最普遍的数据库是NRDB和dbEST 数据库。NRDB由SWISS2PROT 和GENPETP 等几个数据库组成,dbEST是由美国国家生物技术信息中心(NCBI)和欧洲生物信息学研究所(EBI)共同编辑的核酸数据库;

蛋白质组的鉴定方法

如蛋白质鉴定结果、蛋白质的亚细胞定位、蛋白质在不同条件下的表达水平等信息。目前应用最普遍的数据库是NRDB和dbEST 数据库。NRDB由SWISS2PROT 和GENPETP 等几个数据库组成,dbEST是由美国国家生物技术信息中心(NCBI)和欧洲生物信息学研究所(EBI)共同编辑的核酸数据库;

科学家发展聚集态蛋白质组邻近标记分析新方法

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519687.shtm

深度学习模型筛查新药快千倍

据美国麻省理工学院(MIT)官网12日报道,该校科学家开发出一款名为EquiBind的几何深度学习模型,其将类药物分子与蛋白配对的效率比现有最快的计算分子配对模型QuickVina2-W快1200倍。相关研究已经提交预印本服务器,并将提交给国际机器学习大会。 在药物开发之前,研究人员必须找到有潜

科学家开发出测量海洋中二氧化碳浓度新方法

  一个国际科研小组日前开发出一种新方法,能够对海洋中二氧化碳的浓度进行较精确的测量,并据此绘制出二氧化碳分布图,这一成果将有助开发预测气候变化的新方式。   参与研究的法国国家科研中心介绍说,海洋能够吸收大气中的二氧化碳,降低人类活动对环境造成的影响,从而在抑制全球变暖方面发挥巨大作用。通常情况

科学家开发出应用荧光光谱技术研究膜蛋白运动的新方法

加拿大和美国科学家联合研究小组开发出一种应用荧光光谱技术观察研究单个膜蛋白运动的新方法。膜蛋白的主要功能是控制细胞与其周边环境的离子交换。专家认为,该项研究成果有助于人们增强对离子通道的认识和了解。相关研究文章发表在最新出版的《美国国家科学院院报》上。 离子通道类似于一台小型纳米机器或纳米阀门,如

日本开发出iPS细胞大量制备新方法

  据日本媒体4月25日报道,京都大学中迁宪夫教授等与日产化学工业组成的研究小组开发成功利用功能性聚合物大批量制备iPS细胞和ES细胞的新方法。   目前,iPS细胞制备主要有粘结培养法和悬浮培养法。粘结培养法不适合大量制备;利用悬浮培养法制备时,因细胞块的大小不均,易导致细胞坏死和自我分化。新方

英开发出制造纳米多孔材料新方法

  据美国物理学家组织网11月28日(北京时间)报道,最近,英国剑桥大学科学家开发出一种名为“集合渗透震动”(collective osmotic shock,COS)的新方法来制造多孔纳米材料,可大大提高制造效率,在水资源过滤、发光设备制造和化学传感器等方面具有广阔应用前景。新研究发表在《自然·材

研究开发出细胞重新编程新方法

  据物理学家组织网近日报道,最近,美国波士顿大学和哈佛医学院、马萨诸塞州总医院合作,开发出一种给细胞重新编程、设计基因线路的新方法,能大大增加基因“零件”的数量,构建更大更复杂的基因网络。该方法不仅大大丰富了合成生物学家的工具箱,还能帮人们理解生物行为及其发展演变,发挥多种实际应用价值。

德国开发出“饿”死癌细胞新方法

  德国维尔茨堡大学3月28日发表新闻公报说,虽然对付癌细胞很困难,但该校研究人员发现一种关键酶,抑制它可以让癌细胞“饿”死。与切断营养源让癌细胞“饿”死的办法相比,这是一种新的使其“饿”死的方法,且实施起来更方便。   正如其他体细胞一样,癌细胞也需要补充营养,以完成自身代谢。不过,癌细胞通常还

日开发出吸附空气中氧气新方法

  近日,日本京都大学物质细胞统合系统据点的研究人员开发出一种能够从空气中单单吸附氧气的新方法。这种方法应用了大型放射光设施“Spring-8”制造的一种新型材料,为气体吸附产业开拓了一条新的思路。   据介绍,研究人员是利用空气中氧气和氦气分子中各自电子运行方式存在差异的特点,首

日本开发出制造纳米粒子新方法

  日本物质材料研究机构联合科学技术振兴机构6月24日发布消息称,该机构的几名科学家开发出一种制造纳米粒子新方法,能极大提高用作汽车排烟净化触媒的白金等稀有金属的利用效率。   据介绍,这种制造方法是在由白金、界面活性剂与溶媒组成的水溶液中添加还原剂,在投入还原剂后约10分钟就可以快速产生白金纳米

美开发出DNA损伤快速检测新方法

  华盛顿5月3日电 美国麻省理工学院科学家3日表示,他们开发出了对脱氧核糖核酸(DNA)损伤进行快速分析的新方法。此方法将有助于试验潜在的抗癌药物和了解环境毒素的影响。   在麻省理工学院生物工程系副教授贝文・恩格尔沃德与电子工程和计算机科学系教授桑吉塔・巴蒂亚的领导下,研究人员将已有30年历史

德研发出检测兴奋剂新方法

  据外电报道,德国体育大学的一个科研小组,研发出了一种能够检测运动员是否服用了苯二氮卓类药物的新技术。苯二氮卓类物质能够改善生理机能,不久之后可能被当做兴奋剂使用。   研究人员在刚刚出版的一份刊物《药物检测与分析》中解释了他们是如何研发出这种用于检测人尿样中是否存在一些目前只运用在动物身上的化

印研发出结核病测试新方法

用于测试对药物敏感和对利福平具有抗药性的结核病结核分枝杆菌Truenat目前进入性能验证和操作可行性测试的最后阶段,该测试由印度负责生物医学研究制定、协调和推广的机构-印度医学研究理事会开展。报道称,结核分枝杆菌Truenat是当地一家诊断公司研发的分子测试,由创新诊断方法基金会提供技术援助和资源,

英开发出通过尿检诊断癌症新方法

  英国研究人员最新开发出通过尿检诊断上消化道癌症的新方法,只需要检测尿液中某些蛋白质的含量,就可以比较准确地诊断出是否患有相关癌症。这一发现有助于对癌症患者进行早期诊断和及时治疗。  英国爱丁堡大学的研究人员在新一期《蛋白质组学临床应用》杂志上报告说,他们对60名上消化道癌症患者和60名健康人的尿

配体配体相互作用的功能

中文名称配体-配体相互作用英文名称ligand-ligand interaction定  义泛指不同配体之间的相互作用。如受体上有多个配体结合位点时,一个配体与受体的结合可能影响另一个配体与受体的结合。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),信号转导(二级学科)

我国科学家研发出活体内蛋白质瞬时原位激活新技术

  在活细胞等复杂的生命体系中原位研究蛋白质功能具有重要的科学意义。以往在活细胞内开展的蛋白质原位研究只能在某些特定蛋白家族中应用,如何进一步发展广泛适用于不同类型蛋白家族的原位研究方法一直是困扰众多生物学家的科学难题。  在国家重点研发计划“蛋白质机器与生命过程调控”重点专项“信号转导过程中蛋白质

科技杂谈:科学家该不该开公司

  ■不宜对科研人员独立创业过度“发难”,同时也应正视风险和挑战,完善相关机制和政策  不久前笔者在调查采访时发现,对于科研人员该不该开公司、转化技术成果,意见分歧较大,正反双方往往各执一词。  反对者认为,科研人员长期待在实验室,不了解市场、不会经营,自己开公司势必处处碰壁,还会荒废科研事业、耽误

让“玄学”为科学家开脑洞

  100年前,中国思想文化领域发生了一场影响深远的“科玄论战”,又称“科学与人生观论战”。2023年2月10日,本报邀请科学史家刘钝发表署名文章《“科玄论战”百年祭》,对这一场科学派、玄学派和唯物史观派的思想大碰撞进行回顾与梳理,在学界引发热烈反响。  100年前的这场争论本质上是从逻辑经验主义视

领先的生物医学研究者使用QTRAP技术开发出蛋白质定量新方法

自然生物技术杂志发表的科学论文详细阐明了科学家如何深入了解与癌症及其它复杂疾病相关的信号通路   福雷明罕- 2011年6月29日   全球生命科学分析技术的领导者AB SCIEX今天宣布,来自安大略(Ontario)西奈山医院Samuel Lunenfeld研究所的科学

科学家发现镇痛新靶点

  头痛、牙痛、腰背痛、炎症痛、神经源性痛……每一种慢性疼痛都能将人折磨到“痛不欲生”,现有镇痛手段却不多。上海交大一科研团队近日宣布,首次发现脊髓胰高血糖素样肽—1(GLP-1)受体可产生有效镇痛作用,成为治疗慢性疼痛的新潜在性镇痛靶点分子。该成果发表于当期国际神经科学权威性杂志《神经科学杂志》上

用肽适配体正向分析细胞过程实验2

辅助方案 肽适配体靶点的鉴定实验方法原理通过配对相互作用或捕获法鉴定的肽适配体的假定靶点应当通过遗传学测试进行验证,例如:1. 用免疫沉淀法确定体内适配体的相互作用;2. 通过上位(显)性分析以确定适配体在与靶蛋白相同的区域发挥功能;3. 比较由靶蛋白删除或过表达引起的表型与由适配体造成的表型。实验

我所发展高效药物靶标鉴定新方法

原文地址:http://www.dicp.cas.cn/xwdt/kyjz/202210/t20221024_6538609.html  近日,我所生物分离分析新材料与技术研究组(1809组)叶明亮研究员团队和吉林大学胡良海教授团队、我所分子模拟与设计研究组(1106组)李国辉研究员团队合作,利用蛋

叶明亮:发展高效药物靶标鉴定新方法

  近日,大连化物所生物分离分析新材料与技术研究组(1809组)叶明亮研究员团队和吉林大学胡良海教授团队、我所分子模拟与设计研究组(1106组)李国辉研究员团队合作,利用蛋白质结合药物以后对变性引起的沉淀具有更高的耐受性原理,发展了一种新型的药物靶标蛋白质鉴定方法。  靶标蛋白的发现对药物作用机制的

微生物生理生化鉴定的新方法

微生物鉴定中的生理生化试验代谢,在所有活细胞中存在的全部生物化学反应称之为代谢,代谢过程主要是酶促反应过程。各种微生物具有不同的酶系统,利用的底物不同,或虽利用相同的底物但产生的代谢产物不同,因此可以利用各种生理生化反应来鉴别不同的细菌,尤其是在肠杆菌科细菌的鉴定中,生理生化试验占有重要的地位

mtSC:单细胞类型自动鉴定的新方法

  单细胞测序技术有助于刻画细胞层面的异质性,为进一步探索细胞功能和内在作用机制等奠定了基础。在单细胞转录组测序数据的分析过程中,细胞类型鉴定是必须且重要的一步。常规的细胞类型鉴定依赖于细胞类型标记基因,这种方法费时费力且不稳定,可重复性差,易导致不同实验室的鉴定结果不可比较。随着单细胞测序技术的迅

微生物生理生化鉴定的新方法

微生物鉴定中的生理生化试验代谢,在所有活细胞中存在的全部生物化学反应称之为代谢,代谢过程主要是酶促反应过程。各种微生物具有不同的酶系统,利用的底物不同,或虽利用相同的底物但产生的代谢产物不同,因此可以利用各种生理生化反应来鉴别不同的细菌,尤其是在肠杆菌科细菌的鉴定中,生理生化试验占有重要的地位。 常

科学家开发出基于凝集素糖类分子识别的热泳生物传感新方法

  近日,中国科学院国家纳米科学中心孙佳姝团队联合北京大学药学院、中国人民解放军总医院第五医学中心、北京大学口腔医院等,开发了基于凝集素糖类分子识别的热泳生物传感新方法,实现了血浆中细胞外囊泡(EV)聚糖图谱的快速、高灵敏、选择性分析,并用于三阴性乳腺癌(TNBC)精准诊断、疗效监测与预后预测。相关