蛋白质数据+基因序列精准构建进化树
西班牙基因组调控研究中心的科学家们在最新一期《自然·通讯》上发表了一项创新研究，展示了如何利用蛋白质三维形状，解开生命中古老的“历史密码”，揭示了生命之树中最古老的进化关系。这项研究首次将蛋白质的形状数据与基因序列数据结合，提高了进化树的准确性。蛋白质结构解决“饱和问题”（艺术概念图）。图片来源：《自然·通讯》进化树对于理解生物间的亲缘关系、病原体传播路径、疫苗研发及新发疾病治疗非常重要。传统上，科学家通过比较DNA或蛋白质的线性序列来构建进化树，但这种方法在处理非常古老的物种时，遇到了“饱和问题”。这是因为随着时间推移，基因组序列变化很大，以至于原始的遗传信息几乎消失。这就如同古老文本因时间久远而字迹模糊，难以辨认。为了解决这个问题，团队开始关注蛋白质的物理结构。因为这些结构比序列更稳定，能够更长时间保留祖先的特征。即使氨基酸序列发生变化，只要保持了相同的三维折叠模式，蛋白质就能继续发挥相同的功能。此次团队使用了一种名为“互距......阅读全文
益生乳酸菌全基因组序列测定完成
内蒙古农业大学正式公布,益生乳酸菌的全基因组序列测定分析全部完成,这是我国第一个完成的乳酸菌基因全序列测定。 由内蒙古农业大学“乳品生物技术与工程”教育部重点实验室主持进行的益生乳酸菌的全基因组序列测定Lb.casei Zhang科技项目是经过6年分离、筛选,并进行系统研究开发的具有完全自主知识产
美研究称基因序列预测长寿准确率高达77％
美国研究人员宣布，他们发现基因序列可以预测人能否长寿，预测准确率高达77%。研究论文7月1日由《科学》（Science）杂志发表。长寿老人多有长寿基因 波士顿大学一个研究小组调查1000多名百岁老人，根据收集数据开发出一个基因分析系统。使用这个系统，可以预测人们是否有相当大机会“格外
我国完成世界首张西瓜基因组序列图谱
我国主导完成世界首张西瓜基因组序列图谱的绘制与破译，相关研究成果于北京时间11月26日凌晨在国际学术顶级刊物《自然·遗传学》上在线发表。 西瓜是全球重要的经济作物和夏季消暑水果，但就是这样一种常见的水果，人们却始终未能从内到外了解它。过去，各国科学家虽然知道栽培西瓜遗传多样性狭窄是制约西瓜
新算法TRFill解决生物基因组重复序列组装难题
近日，中国农业科学院农业基因组研究所农业基因组学技术研发与应用创新团队开发出了一种新算法——TRFill，解决了现有工具无法完全填补基因组间隙的难题，显著提升了基因组质量。相关研究成果发表在《基因组生物学》（Genome Biology）上。 动植物基因组的许多区域存在大量高度重复的DNA片段
遗传发育所等解析盐芥全基因组序列
盐芥是十字花科盐芥属的一种盐生植物，与双子叶植物研究中所常用的模式植物拟南芥亲缘关系较近。盐芥具有作为模式植物的一系列良好特征，如个体较小、生活周期短、自花授粉、种子量大、基因组较小，而且易于转化。最重要的是，盐芥具有对高盐、干旱和低温等非生物胁迫极高的耐受能力，这使其成为研究植物耐受非生物胁迫
台湾首例猴痘病人病情严重，基因序列出炉
据台湾“中央社”报道，台湾6月底出现首例境外移入的猴痘病例，台“疾病管制署”7日公布此个案病毒全基因序列，确认为死亡率较低的B.1西非株基因型。 台“疾病管制署”6月24日公布台湾地区出现首例猴痘境外移入病例，为20多岁台湾男性，自德国返台后出现发烧、喉咙痛、肌肉酸痛、身体出现红疹及鼠蹊部淋巴肿
《自然》：2种疟疾寄生虫基因组序列测定
疟疾裂殖子 一个由美英等国科学家组成的国际研究小组近日测定了两种致命疟疾寄生虫的基因组序列。这两种疟疾寄生虫分别名为Plasmodium knowlesi和Plasmodium vivax，其中P. knowlesi最近被认为是感染人类的一个主要疟疾病原体，而P. vivax则会致人极度虚弱，
关于H7N9禽流感的基因序列介绍
科学家们说，一种此前从未在人体内发现的致命禽流感病毒的基因序列数据显示，这一病毒已经发生某些可能使之更易在人类中大流行的变异。 2013年4月3日，迄今没有证据显示，H7N9禽流感病毒正在人际间传播，也存在以下可能性：这种病毒可能会逐渐销声匿迹，不会完全变异为一种人流感。就在中国宣布已确诊多例
关于真核基因组的高度重复序列的介绍
1、真核基因组的高度重复序列— 简介 高度重复序列在基因组中重复频率高，可达10^3以上，因此复性速度很快。在基因组中所占比例随种属而异，约占10-60%，在人基因组中约占20%。高度重复顺序又按其结构特点分为三种。 2、真核基因组的高度重复序列—倒位重复序列 这种重复顺序复性速度极快，即
深圳华大基因研究院完成大熊猫基因组序列图谱
揭开大熊猫黑眼圈的奥秘 深圳华大基因研究院十月十一日在深圳第十届“高交会”上宣布，大熊猫“晶晶”基因组框架图绘制完成，这是世界首例用短序列进行新物种测序与组装新技术完成的大型基因组序列图。 据深圳华大基因研究员王俊博士介绍，大熊猫有二十一对染色体，基因组大小与人相似，约为三十亿个碱基对，包含二到
核酸序列分析
【实验目的】1、 掌握已知或未知序列接受号的核酸序列检索的基本步骤；2、 掌握使用BioEdit软件进行核酸序列的基本分析；3、 熟悉基于核酸序列比对分析的真核基因结构分析（内含子/外显子分析）；4、 了解基因的电子表达谱分析。【实验原理】针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因，找出基因的位置和
设计引物用cds序列和cdna序列的区别
cDNA和mRNA的序列是互补的，如果用两个引物，最后的两条DNA序列分别对应于mRNA和cDNA中的一段。由于引物方向从5‘至3’，所以两个引物对应于mRNA和cDNA中相应序列即可。
冲激序列信号与阶跃序列信号各有什么特性
单位脉冲序列只在n=0 处有一个单位值1，其余点上皆为0；单位阶跃序列只有在n>=0时，才取非零值1，当n
中科院等完成橡胶草基因组序列解析
中国科学院遗传与发育生物学研究所李家洋研究组与中国农业科学院、中国热带农业科学院等合作，在橡胶草基因组序列解析方面取得重要进展，标志着以橡胶草作为模式植物进行天然橡胶合成研究进入后基因组时代。研究成果近日在线发表在权威学术期刊《国家科学评论》（National Science Review）杂
基因序列仪在感染性疾病诊断上的应用
测序技术可以精确的分析碱基序列，通过序列比对，对各种病原体直接进行鉴定、分型和溯源，明确某一感染性疾病对应病原体的基因序列，可以有针对性地用药和预防，提高用药的有效性和安全性。同时基因测序可以用于发现新型病原体，能更好地做好预防工作。
英国拟为癌症病人绘基因序列图以研发新药
据英国路透社12月10日报道，英国拟为近10万癌症或其它罕见疾病的患者绘制基因序列图，以研发新的药物。 英国首相卡梅伦10日表示，他希望英国能够成为第一个将基因排序引入健康服务的国家。 据报道，卡梅伦政府计划在未来3至5年内投入1亿英镑(约合人民币10亿元)用于基因排序项目。绘制病人
蝴蝶兰光周期相关基因序列及其应用获发明ZL
由中科院华南植物园张建霞、段俊等完成的“蝴蝶兰光周期相关基因PhalCOL的序列及其应用”于6月29日获国家发明ZL授权(ZL号：ZL 200910042303.9)。 蝴蝶兰是兰科植物中栽培最广泛、最受欢迎的种类之一，花形似蝴蝶，别致美丽、色彩艳丽，花期长达数月之久，观赏价
新技术90分钟完成全基因组序列分析
美国国家儿童医院（Nationwide Children's Hospital）的研发人员最近在Genome Biology上发布了一个自主开发的分析软件，表示这个软件使寻找全基因组致病变异从几周缩短到按几十个小时。 第一个人类基因组测序完成耗时大约13年，耗费30亿美元，而现在技术测序技术的
我国完成首部高原濒危物种全基因组序列图谱
12月25日，由青海大学和深圳华大基因研究院共同发起并承担的藏羚羊基因组序列图谱在青海大学医学院宣告绘制完成，这是世界上第一部绘制完成的高原濒危物种全基因组序列图谱，也是中国科学家对全球基因组科学的又一重大贡献。 藏羚羊是我国青藏高原特有的物种，其生存环境高寒、缺氧，自然条件极为严酷。在喜
更改小白菜基因序列亩产可提高2000公斤
“目前我们已经发现了小白菜中的分蘖基因，如果更改普通小白菜中的基因序列，让它们拥有分蘖基因的功能，亩产可达6000公斤，提高近2000公斤。”昨天，在南京农业大学召开的“百家名企进南农”活动中，该校园艺学院院长、博士生导师侯喜林向记者表示。 不结球白菜俗称青菜、小白菜，原产中国。2009年
科学家发现奇异基因序列或来自全新生物域
沃斯的“三域说”是目前生物分类界的主流学说。 “科学坏小子”文特尔（左）参与了这次的研究项目。 在过去的近300年中，生物分类法从两界、三界一直被扩充到六界三域，分类系统不断被改写。然而，演化树的改写可能还会继续下去。美国加州大学基因中心和文特尔研究所对海洋水样本中的DNA序列分
蔬菜中心：绘成世界首张西瓜基因组序列图谱
我国是世界第一西瓜生产与消费大国，但是人们却始终未能从外到内了解它，直到2013年1月，国际学术顶级刊物《自然·遗传学》发表了世界首张西瓜基因组序列图谱（影响因子35.532），标志着人类成功破译了西瓜遗传“密码”。这项由蔬菜中心主任许勇的研究团队牵头进行的科研创新，为高效培育兼具优质、高产、抗
Nature－Methods：De－Novo基因组序列组装的新方法
对于de novo人类基因组序列组装而言，短读长简直意味着不可能的任务。不过，加州大学旧金山分校、BioNano Genomics和10X Genomics的研究人员近日开发出一种新的组装方法，它将short-read测序与10X的linked-read测序相结合。这项成果于近日发表在《Natu
首个亚洲人源基因检测序列标准物质完成研制
6月，中国计量科学研究院和深圳华大基因研究院共同发布首个亚洲人源(炎黄一号)DNA序列标准物质(BW-5201)和大肠杆菌O157基因组DNA序列标准物质(BW-5202)。这是全球首次发布亚洲人源DNA和微生物基因组DNA序列标准物质，为基因检测产业评估测序和数据分析的准确性提供了参考标准。
Science：新研究揭示短串联重复序列如何影响基因表达
几十年来，科学家们已经知道，“垃圾 DNA（junk DNA）”实际上起着至关重要的作用：尽管基因组中的蛋白编码基因提供了构建蛋白的蓝图，但是基因组中的一些非编码部分，包括以前被认为是 “垃圾DNA”的基因组区域，似乎可以提高或降低这些基因的表达。但人们一直不清楚某些非编码区域如何影响基因表达水
BZ010－水稻Cry1Ac－基因序列定性PCR－检测
BZ010 -水稻Cry1Ac 基因序列定性PCR 检测试剂盒 包括100 个扩增反应所需的试剂 【试剂盒组成】 2 x 275 μl Cry1Ac 反应试剂 (Cry1Ac mastermix； -20oC 保存) 1 x 50 μl 阳性对照 (Positive co
哈尔滨病毒基因序列确定为德尔塔－详细信息公开
9月24日，哈尔滨市召开疫情防控新闻发布会。会上通报，9月23日0时-24时，哈尔滨市新增新冠肺炎确诊病例15例，均在巴彦县 。根据目前已检出病例基因测序情况看，显示为德尔塔毒株 ，相关流调溯源工作正在国家、省疾控专家指导下，紧张有序开展，如果有结果将及时向社会公布。 上述新增确诊病例均是在集
基因组学突破性成果：斑马鱼序列解析
人类发育，生理功能及疾病发生的过程涉及到成千上万的基因和其变异体，但是大部分的基因和其变异体的功能依然是未知的。过去的20年里，斑马鱼逐渐成为研究人类基因功能的重要模式动物。在《自然》杂志网站发表的两篇文章里1,2，报道了斑马鱼参考基因组序列和完成超过10,000个蛋白编码基因的断裂性突变体的鉴
蚜虫mtDNACOI/COII基因序列测定及系统发育分析
实验概要本研究通过分析三种蚜虫mtDNA COI/COII基因序列的进化，揭示了三种蚜虫与已知其它蚜虫的该段序列的进化关系。实验材料本研究中的蚜虫为桃蚜、豆蚜、棉蚜。桃蚜、豆蚜、棉蚜在实验室内分别用萝卜、菜豆、黄瓜进行饲养；各种群分别置于50X50X50的正方体铁架外罩100目双层沙网内，饲养条件为
昆明动物所发现白介素3基因序列变异影响人类大脑容量
神经系统是人类区别于其他物种最显著的特征之一。相对于其他物种，人类的大脑高度发达，主要体现在全脑容量的变化。如人类的大脑容量是旧大陆猴-如猕猴脑容量的20.6倍，长臂猿的14.4倍，与人类亲缘关系最近的灵长类-黑猩猩的4.3倍。 近年来，基于核磁共振（MRI）脑影像学研究表明