NatureCommunications:尿液蛋白质组学研究新突破——标准操作流程(SOP)与全流程质控(QC)体系助力多平台尿液蛋白质组学研究

2025年1月26日,北京航空航天大学医学科学与工程学院刘超团队和中国医学科学院基础医学研究所孙伟团队联合北京理工大学、北京师范大学、中国科学院动物研究所、北京儿童医院、北京协和医院、国家蛋白质科学中心(北京)、中国科学院大连化学物理研究所、北京大学、昌平实验室、深圳湾实验室、广州国家实验室、Thermo公司、Bruker公司、SCIEX公司等共19个实验室/课题组/公司的20个LC-MS平台,在Nature Communications上发表了题为“Standard operating procedure combined with comprehensive quality control system for multiple LC-MS platforms urinary proteomics”的研究成果。图1 文章截图研究背景尿液作为人体排泄物之一,含有丰富的生物信息,尤其是蛋白质信息。尿液蛋白质组学研究有助于发现敏感......阅读全文

Nature发布大规模癌症蛋白质基因组学研究重要成果

  基于来自癌症基因组图谱(TCGA)计划的数据,一个多机构科学家小组完成了首个大规模的乳腺癌“蛋白质基因组学”( proteogenomic)研究,将一些DNA突变与蛋白质信号联系到一起,并帮助确定了一些驱动癌症的基因。  这项研究旨在通过蛋白质和它们的修饰来更好地认识癌症。发表在5月25日《自然

Nature技术:解决组学研究大问题

  METLIN是由美国Scripps研究院Gary J Patti和Gary Siuzdak开发出的新型数据库,将能用于解决代谢组学等领域研究中关于数据处理这个大问题。   在过去十年间,代谢组学 metabolomics 已成为最新“-omic(组学)”(继基因组学和蛋白质组

定量蛋白质组学的诞生

  在现代研究技术,如荧光显微镜,流式细胞仪和蛋白质芯片技术中,抗体仍然扮演着非常重要的角色。但依赖于抗体的蛋白质检测存在一些缺点,其中最大的限制就是,抗体的可用性和质量差别很大。一些大规模项目,比如人类蛋白质图谱(Human Protein Atlas),Antibodypedia,以及美国NIH

蛋白质组学的研究内容

主要有两方面,一是结构蛋白质组学,二是功能蛋白质组学。其研究前沿大致分为三个方面:  ①针对有关基因组或转录组数据库的生物体或组织细胞,建立其蛋白质组或亚蛋白质组及其蛋白质组连锁群,即组成性蛋白质组学。  ②以重要生命过程或人类重大疾病为对象,进行重要生理病理体系或过程的局部蛋白质组或比较蛋白质组学

蛋白质组学质谱分析

Proteomics Primer1. Proteomics2. 2-D PAGE3. Immobilised pH gradients (IPGs)4. Mass spectrometry5. Principles of mass spectrometry6. Matrix assisted la

蛋白质组学鉴定技术流程

蛋白质组(Proteome)的概念,蕞早由澳大利亚Macquarie大学的Wilkins和Williams于1994年首先提出的,是指一个基因组(Genome),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。蛋白质组学(Proteomics)以细胞、组织或生物体全体蛋白质为研究对象,通过高通量的色谱质谱联用技术

定量蛋白质组学方法分类

1 背景和意义从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律(特别是疾病防治和病理研究)已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织或器官中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下蛋白质表达水平变化的研究,识别功能模块和路径,监控疾病的生物标志物,这些研究都

蛋白质组学入门问题FAQ

常见问题——— HPLC 篇 1 . HPLC 灵敏度不够的主要原因及解决办法 样品量不足:解决办法为增加样品量 样品未从柱子中流出:可根据样品的化学性质改变流动相或柱子 样品与检测器不匹配:根据样品化学性质调整波长或改换检测器 检测器衰减太多:调整衰减即可。 检测器时间常数太大:解决办法为降低时间

蛋白质组学的样品制备

想要研究蛋白质,首先要得到高度纯化且具有生物活性的目的物质,因此,蛋白样品的制备是重要前提。蛋白提取的质量和效果对后续的研究分析有重要影响。不同种类的样本在制备过程中,存在一些差异,要根据样本特征调整实验方案和操作细节。基本原则样品处理尽量简单,减少蛋白损失;尽量避免蛋白的降解;尽可能提高样品蛋白的

蛋白质组学实验技术大全

每一个领域的发展都是基于技术的进步和革新,蛋白质组学亦然。蛋白质的可变性和多样性等特殊性质导致了蛋白质研究技术远远比核酸技术要复杂和困难得多,但正是这些特性参与和影响着整个生命过程。在开始实验之前,先看看这篇技术简介吧。一 蛋白质与DNA相互作用在许多的细胞生命活动中,例如DNA复制、mRNA转录与

蛋白质组学入门问题集锦

  1 . HPLC 灵敏度不够的主要原因及解决办法   样品量不足:解决办法为增加样品量   样品未从柱子中流出:可根据样品的化学性质改变流动相或柱子   样品与检测器不匹配:根据样品化学性质调整波长或改换检测器   检测器衰减太多:调整衰减即可。   检测器时间常数太大:解决

北大冷冻电镜技术接连发表Nature,Nature-Communications文章

  蛋白酶体是细胞中用来调控特定蛋白质的浓度和清除错误折叠蛋白质的主要机制的核心组成部分,是细胞中最普遍的不可或缺的大型全酶超分子复合机器之一,也是迄今为止发现的最大的蛋白降解机器。  北京大学物理学院/定量生物学中心毛有东课题组致力于新兴冷冻电镜技术方法的发展,将之用于结构生物学、生物物理、化学生

高福院士Nature-Communications发表研究新成果

  来自中国农业大学、中国科学院微生物研究所、中国疾病预防控制中心等机构的研究人员,在新研究中揭示了人感染H10N8禽流感病毒优先结合禽类受体的结构基础。研究结果发表在1月9日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。  甲型流感病毒家族以病毒表面突起的两种蛋白质,即血凝素

Nature-Communications:与饮食冲动相关的大脑回路

  近日,美国佐治亚大学等高校的科研人员在Nature Communications上发表了题为“Hypothalamus-hippocampus circuitry regulates impulsivity via melanin-concentrating hormone”的文章,发现了大脑中

Nature-Communications:发现神经母细胞瘤癌基因

  神经母细胞瘤占儿童癌症死亡总数的15%。高危神经母细胞瘤患者的生存率为50%。  澳大利亚儿童癌症研究所的研究人员首次发现,一种名为JMJD6的基因在最具侵袭性的癌症中扮演着重要角色。这项研究于近日发表于Nature Communications。这一发现为治疗神经母细胞瘤开辟了一条新途径。图片

Nature子刊实验室洞察:高通量蛋白质组学方法学综述

    在后基因组时代,蛋白质组学在生物医学研究中发挥着重要作用。2022年8月,Nature子刊《Laboratory Investigation》发表了一篇高通量蛋白组的mini-review,概述了高通量蛋白质组学技术、统计和算法的进展。    蛋白质组学作为蛋白质组实验和数据分析的结合,从整

蛋白质组学不能被基因组和转录组取代

基因和蛋白并不存在严格的线性关系ORF并不预示一定存在相应的功能性基因mRNA水平并非与蛋白质的表达水平对应翻译后修饰及同工蛋白质(isforms)等现象在基因水平无从表现

【网络研讨会】蛋白质组学/脂质组学研究进展

  自从精准医学概念提出以来,组学研究一直都是全球最热的研究领域,其技术在临床医学、生物医药和食品安全等领域都占据十分重要的作用。2016年初,中国发起了精准医学研究专项课题,目标在2017年至2019年构建重大疾病的预防诊断和治疗大数据平台,推动一批精准治疗药物和分子检测产品进入国家医保目录。同时

最新《Nature》技术动态:相互作用组学

  1987年,瑞士的研究人员报道了2例来自同一家庭的两姐妹,携带类似的出生缺陷:小脑少一绺组织,且心脏有孔和裂痕(Ritscher–Schinzel综合征)。一位在接受心脏手术后没活过3岁,另一位在4岁接受了类似的心脏手术,存活了下来。  她们的父母并没有携带这些异常,当时的研究人员认为,两位患者

定量蛋白质组学的研究内容

  1.蛋白质鉴定:可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术,利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。  2.翻译后修饰:很多mRNA表达产生的蛋白质要经历翻译后修饰如磷酸化,糖基化,酶原激活等。翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式,因此对蛋白质翻译后修饰的研究对

总裁专访-|-蛋白质组学新里程

  2020年是蛋白质组学发展关键的一年,全球新冠疫情突显了蛋白质组学在应对公共卫生危机中的临床应用。人类可以从这次新冠疫情中汲取许多经验,毫无疑问地,这些将在未来几年内影响蛋白质组学发展。近日,Technology Networks与布鲁克·道尔顿生命科学质谱执行副总裁Rohan Thakur博士

蛋白质组学相关问题与解答

  1.为什么通过elisa、WB能检测到的蛋白在itraq实验中没有检测到?    人血浆中的蛋白是有上万种的,而一般质谱只能检测到五六百种,也就是说只占了其中的百分之几,这是普遍现象,说明咱们的方法是不存在问题的;其次,ELISA/WB与质谱相对来说灵敏度不一样,前者具有放大效应,因为其间会用

蛋白质组学技术的功能介绍

  “读”,在字典里的意思是识取、读取,放在蛋白研究中可以理解为对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的筛选、鉴定或者定量检测。    自2003年4月14日人类基因组计划(HGP)宣告完成以来,基因组研究取得了举世瞩目的成就。基因组学虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力证据,但实际上绝大

《自然方法学》:可视蛋白质组学

  瑞士联邦技术学院的研究人员开发出一种在问号钩端螺旋体(Leptospira interrogans)这种病原体中定位蛋白复合物的新方法,称为“可视蛋白质组学”。文章发表在本期的《自然-方法学》上。   活细胞中的生化进程分为多个功能单元,它们在细胞内有着特定的时间和空间分布。一般来说,这些单元

中国蛋白质组学世界领先

  2003年12月15日,由中国科学院院士贺福初牵头的“人类肝脏蛋白质计划”(HLPP)启动,这是我国领导的第一项重大国际合作计划,也是第一个人类组织/器官的蛋白质组计划。  北京蛋白质组研究中心主任、蛋白质组学国家重点实验室副主任秦钧告诉《中国科学报》记者,十余年来,HLPP经历了三代更迭,从第

蛋白质组学技术的功能介绍

“读”,在字典里的意思是识取、读取,放在蛋白研究中可以理解为对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的筛选、鉴定或者定量检测。自2003年4月14日人类基因组计划(HGP)宣告完成以来,基因组研究取得了举世瞩目的成就。基因组学虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力证据,但实际上绝大多数疾病并不是

定量蛋白质组学方法分类介绍

  【蛋白研究系列专题】-4丨定量蛋白质组学方法,您值得拥有   1 背景和意义    从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律(特别是疾病防治和病理研究)已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织或器官中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下

蛋白质组学研究-可投哪些期刊?

    蛋白质作为功能的直接行使者,已经被科研工作这广泛应用于不同领域中,目前蛋白组学有很多优秀的科研成果,在各个领域及期刊上发表,其中也不乏CNS在内的顶级期刊。那我们的蛋白组学文章可以投哪些期刊呢?了解已发表文章的情况可以帮助我们很好的解决这个问题。这里,我们以“Proteomics”为关键词,

Nature方法:发布蛋白质组检测新技术

  在Fred Hutchinson癌症研究中心癌症蛋白质组学专家Amanda Paulovich博士领导下,一个国际科学家研究小组证实了大规模、标准化蛋白质检测的可行性,这是验证疾病生物标志物和药物靶点的必要条件。   这项在线发表在12月8日《自然方法》(Nature Methods)

鲁克在-timsTOF-4D蛋白质组学和表观蛋白质组学平台上扩展

  在蛋白质组论坛| EuPA 2022,布鲁克公司(纳斯达克股票代码:BRKR)宣布扩展了更深层次的蛋白质组学和表观蛋白质组学覆盖的能力,包括使用创新的 TIMScore 算法增强磷酸肽分析,该算法现在是基于 GPU 的新 PaSER 2022 平台的一部分。新的 TIMScore 算法利用机器学