人工智能推动病原菌效应蛋白功能鉴定
华东理工大学生物反应器工程全国重点实验室教授王启要团队,开发了人工智能赋能的蛋白质功能预测新方法,利用蛋白质语言模型进行效应蛋白预测鉴定,为病原菌毒力因子的大规模挖掘提供了技术平台,推动了病原菌效应蛋白的功能鉴定,为复杂的病原菌效应蛋白-宿主免疫互作机制网络的解析奠定了技术基础。相关研究近日发表于《自然-通讯》。 效应蛋白是一类由细菌病原微生物分泌到环境以及宿主细胞内的关键毒力蛋白,可以通过干扰宿主免疫信号通路、调控细胞代谢、协助摄取营养等方式促进病原菌感染。鉴定效应蛋白以及进行其分子机制研究对解析病原菌-宿主免疫互作机制和抗感染药物靶点开发具有重要意义。然而,许多效应蛋白在功能和蛋白质序列特征上具有多样性,使得基于序列保守性的预测方法较难有效预测未知效应物,而基于实验的筛选方法则存在着通量低和时间成本高等问题。 在前期研究基础上,研究团队结合预训练蛋白质语言模型和对比学习技术,构造了名为CLEF的神经网络模型。该模型能......阅读全文
病原菌效应蛋白阻断植物免疫信号的新机制
病原微生物在侵染植物过程中,需要分泌效应蛋白,干扰宿主细胞活动,以利于病原微生物的侵染和定殖。但是植物通过进化,能够识别监控效应蛋白在宿主细胞内的生化活性,从而激活免疫反应。效应蛋白因此会“背叛”病原微生物,导致宿主产生抗病性。 中国科学院遗传与发育生物学研究所周俭民研究组发现,丁香假单胞菌效
周俭民Cell子刊发表病原菌效应蛋白最新机制
病原微生物在侵染植物过程中,需要分泌效应蛋白,干扰宿主细胞活动,以利于病原微生物的侵染和定殖。但是植物通过进化,能够识别监控效应蛋白在宿主细胞内的生化活性,从而激活免疫反应。效应蛋白因此会“背叛”病原微生物,导致宿主产生抗病性。 中国科学院遗传与发育生物学研究所周俭民研究组发现,丁香假单胞菌效
脑功能关键蛋白被鉴定出
美国麻省理工学院的研究人员确定出了一个对正常大脑功能至关重要的交流网络形成非常关键的蛋白质家族。这项研究的结果分两部分刊登在11月11的《神经元》(Neuron)杂志和11月18日的《自然—细胞生物学》(Nature Cell Biology)杂志的网络版上。 这个由Frank Gertler教授领
效应细胞功能鉴定和抗体药物研发之ADCC分析(二)
8.不同效靶比(E:T)对ADCC作用的影响 10:1 5:1 2.5:1 1.3:1 0.6:1 0.3:1
效应细胞功能鉴定和抗体药物研发之ADCC分析(一)
1.ADCC作用ADCC作用即抗体依赖细胞介导的细胞毒性作用(antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity):指表达IgGFc受体的NK细胞、巨噬细胞和中性粒细胞等,通过与已结合在病毒感染细胞和肿瘤细胞等靶细胞表面的IgG抗体的Fc段结合,而达到杀伤这些
病原菌的分离鉴定及其疫苗的制备(1)
一、实验目的熟悉水产细菌性病原的分离、培养、纯化与鉴定的基本方法,了解所分离细菌性病原的形态特征及培养特点,了解细菌性灭活疫苗制备的基本过程。二、实验材料患白内障病虎纹蛙(或其他患细菌性疾病的水产动物)、健康虎纹蛙、脑膜炎败血黄杆菌(虎纹蛙白内障病的病原)三、实验药品、用具2216E 琼脂平板、 2
病原菌的分离鉴定及其疫苗的制备(3)
(二)疫苗制备1 .病原菌的扩大培养与分离液体培养:按配方配制 2216E 液体培养基,将培养基用 三角烧瓶分装并盖上棉塞后置 于高压蒸汽锅内, 121 ℃ 灭菌 15 ~ 30min ,冷却后于超净工作台内加入 1ml 左右预先制备的病原菌菌液,盖上棉塞,用摇床于 28~ 30 ℃ 下震荡(约
病原菌的分离鉴定及其疫苗的制备(2)
2 .病原菌的分离与培养分离病原菌的材料要求是具有典型患病症状的活的或刚死不久的患病生物,病原菌的分离方法如下。体表分离:先将病灶部位表面用 70% 酒精酒精棉球擦拭消毒或取病灶部分小片或 用经酒精灯灼烧的解剖刀烫烧消毒,再 用接种环刮取病灶深部组织或直接挑取部分深部患病组织,接种于普通肉汤培养基增
科学家发现miRNA和效应蛋白新功能
与人类一样,植物在生长发育过程中也会受到各种病原微生物的侵袭,在长期共进化中形成了复杂的防御体系,而病原微生物也发展出对抗寄主抗性的多种多样的策略。近日,中国科学院生物互作卓越创新中心研究员郭惠珊团队发现miRNA和效应蛋白在植物与病原微生物战役中调控免疫和抑制免疫的新功能,并详细解析了它们的作
促进公众理解-推动人工智能深度创新
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/509246.shtm“生成式人工智能这个生产力已经到来,我们要驾而驭之。”9月20日,2023世界公众科学素质促进大会“促进公众理解人工智能”专题论坛上,中国电子学会副理事长、中国新一代人工智能发展战略研
酵母多糖的功能介绍吸附病原菌作用
酵母细胞壁多糖能吸附病原菌的主要机理是: 甘露聚糖能干扰肠道病原菌的定殖, 从而降低动物肠道病原微生物数量如沙门氏菌和大肠杆菌的数量。肠道中的病原菌(大肠杆菌、沙门氏菌、梭状芽孢杆菌等) 细胞表面或绒毛上具有一种蛋白质物质(类丁质结构) , 通过识别动物肠壁细胞上的特异性, 而与之糖类结合, 在肠壁
世界人工智能大会磁场效应显现
7月6日至8日,2023世界人工智能大会在上海举办。大会共对接210家上下游企业,达成110亿元意向采购金额,推动32个重大产业项目签约,项目投资总额288亿元。面向未来,上海将强化“四大功能”,充分利用大会的磁场效应,以更大力度推动人工智能健康发展。 7月6日至8日,2023世界人工智能大会
蛋白的常用蛋白鉴定方法
传统的蛋白鉴定方法,如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白comigration分析,或者在一个有机体中有意义的基因的过表达通常耗时、耗力,不适合高流通量的筛选。目前,所选用的技术包括对于蛋白鉴定的图象分析、微量测序、进一步对肽片段进行鉴定的氨基酸组分分析和与质谱相关的技术。 “满天星”式的2
人工智能技术赋能商品鉴定
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504757.shtm7月7日,《人工智能物像特征同一性鉴定技术规范》团体标准应用与推广会在京召开。该标准由中国科学院计算技术研究所、公安部第一研究所、国家电子商务消费品质量检验检测中心、北京网络行业协会和
2024南京人工智能展览会:推动南京地区人工智能产业快速发展
南京,作为长三角地区的一颗璀璨明珠,近年来在人工智能产业的发展上取得了举世瞩目的成绩。这座城市以其深厚的科技底蕴和前瞻的战略眼光,正逐步成为国内外人工智能技术研发和应用的重要基地。近年来,随着人工智能技术的快速发展和普及,南京的人工智能产业呈现出蓬勃发展的态势。众多知名的科技企业和研究机构纷纷在南京
谭铁牛院士:需推动人工智能政策及时落地
2016中国人工智能大会今天在北京召开。中国科学院副院长、中国科学院院士、中国人工智能学会副理事长谭铁牛先生做了《关于人工智能发展的思考》的主题演讲。他表示,我国人工智能面临重大发展机遇也面临诸多挑战,需要制定人工智能创新发展的战略规划,推动人工智能诸多利好政策及时落地,建设我国自主的人工智能体
谭铁牛院士:需推动人工智能政策及时落地
2016中国人工智能大会今天在北京召开。中国科学院副院长、中国科学院院士、中国人工智能学会副理事长谭铁牛先生做了《关于人工智能发展的思考》的主题演讲。他表示,我国人工智能面临重大发展机遇也面临诸多挑战,需要制定人工智能创新发展的战略规划,推动人工智能诸多利好政策及时落地,建设我国自主的人工智能体
脑科学进展将推动人工智能重大突破
人工智能什么时候能够像人一样思考?这一天也许很快就要到来。图片来源于网络 “科学家们希望在人脑研究中取得重大进展,更深入解析人脑工作的模式,为人工智能发展的革命性突破提供基础。”全国政协委员、中国科学院院士、中国神经科学学会理事长、浙江大学医药学部主任段树民在两会现场接受采访时表示。 脑科学
聚焦人工智能领域,推动产业创新发展
为响应政府建设数字经济,聚焦人工智能领域,推动产业创新发展的号召,近日,由上海数据交易所、上海市数商协会举办,上海合合信息科技股份有限公司(以下简称“合合信息”)承办的“数商沙龙-走进合合信息”在上海举行。来自上海市数商协会、宁波银行、微众银行等政企单位的50余人共同参与,围绕“AI+大数据,赋
相互作用蛋白鉴定实验——鉴定诱饵蛋白(LacZ的活性分析)
实验方法原理捕捉相互作用蛋白的第一步是构建能够表达 LexA 与目的蛋白的融合体的质粒。这种质粒转化到包含 LEU2 和lacZ 报道基因的报道酵母株中,并要行一系列的对照实验来鉴定所构建的诱饵蛋白是否适用,是否需要修饰,或是否应改变酵母菌报道条件。这些对照实验实现了诱饵蛋白在酵母菌中作为一种稳定蛋
人工智能模型鉴定出有高风险肾功能障碍的糖尿病患者
Medial EarlySign最近宣布了在糖尿病领域开展的临床数据研究结果,该研究旨在通过机器学习的人工智能,鉴定糖尿病患者中会在一年内发生肾功能障碍的高风险患者。Medision EarlySign首席医疗官Ran Goshen博士(图片来源:Medision EarlySign) 肾脏问
利用蛋白质同源性鉴定突变功能残基的概述
利用蛋白质同源性鉴定突变功能残基:将感兴趣的目的蛋白质序列与同源蛋白质进行序列比较,可以发现一些高度保守的残基,这些残基与同源蛋白的共同功能以及维持结构有关,因此通常将它们作为突变及功能进化的候选残基。每个残基所起作用的信息能够通过与不同种同源蛋白的序列比较或一类具有相应活性的蛋白质的序列比较而
诱饵蛋白特性鉴定实验
实验材料 蛋白质试剂、试剂盒 CM培养基仪器、耗材 水浴锅培养箱电转仪实验步骤 一、lacZ激活试验 1. 采用标准的亚克隆技术,将编码目的蛋白质的DNA插入pEG202的多接头中,构建一个符合读框的融合蛋白。2. 将下列组合的质粒,分别按“乙酸锂转化法”转化酵母菌EGY48。(1)pBait+
诱饵蛋白特性鉴定实验
基本方案 实验材料 蛋白质 试剂、试剂盒
诱饵蛋白特性鉴定实验
实验材料蛋白质试剂、试剂盒CM培养基仪器、耗材水浴锅培养箱电转仪实验步骤一、lacZ激活试验 1. 采用标准的亚克隆技术,将编码目的蛋白质的DNA插入pEG202的多接头中,构建一个符合读框的融合蛋白。2. 将下列组合的质粒,分别按“乙酸锂转化法”转化酵母菌EGY48。(1)pBait+pSH1
如何鉴定蛋白质
双缩脲反应产物双缩脲结构双缩脲试剂是由双缩脲试剂A和双缩脲试剂B两种试剂组成. 双缩脲试剂A的成分是氢氧化钠的质量分数为0.1 g/mL的水溶液; 双缩脲试剂B的成分是硫酸铜的质量分数为0.01 g/mL的水溶液。 双缩脲试剂可以验证蛋白质的存在。 具体方法是: 先将双缩脲试剂A加入组织样液,摇荡均
蛋白质鉴定方法
最简单的方法,也是人们最耳熟能详的方法,就是对物体进行灼烧,看是否能问到烧焦的羽毛味,如果可以问到烧焦的羽毛味,那么证明有蛋白质的存在。2中学的化学课上也教过我们不少的方法,比如说吧蛋白质和浓HNO3进行反应,如果能够变性产生黄色不溶性物质,那么该物体是蛋白质。3还有一种方法就是把含有蛋白质的屋子磨
相互作用蛋白鉴定实验——鉴定诱饵蛋白(半乳糖苷酶)
通过确定与之结合的其他蛋白质来理解某种特定蛋白质的功能,常常是十分有用的方法。这可以通过从文库中选择或筛选与靶蛋白相互作用的新蛋白来实现。现有一种特别有用的方法即双杂交系统或相互作用阱, 用来测定新的相互作用蛋白,这种方法采用充当「试管」的酵母菌和一种报道系统的转录激活作用来识别结合蛋白。本方法也可
Rab效应子的功能介绍
中文名称Rab效应子英文名称Rab effector定 义能与Rab蛋白特异结合的蛋白质。与Rab蛋白一起参与运输小泡到靶膜的停靠过程。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生理(二级学科)
简述效应B细胞的功能
浆细胞具有合成、贮存抗体即免疫球蛋白(immunoglobulin)的功能,参与体液免疫反应。免疫球蛋白主要在粗面内质网池内形成,用免疫荧光技术已证实注射一种抗原到机体后,相应的抗体首先在浆细胞的细胞质中出现。