这一分子工具有望成基因调控新“秘钥”

近年来,环状单链DNA(Css DNA)因其稳定性高、免疫原性弱、可编程性强,成为基因调控、细胞治疗等医学合成生物学领域很有潜力的分子工具之一。 近期,中国科学院杭州医学研究所研究员宋杰团队针对此前开发的Css DNA调节器1.0 版的局限,成功研发出Css DNA调节器2.0 版,为合成生物学在基因调控领域提供了创新思路与方法。相关成果发表于《科学进展》。 宋杰团队一直聚焦环状单链DNA生物学效应及基因治疗研究。他们的前期研究表明,Css DNA可作为可编程的基因表达载体,在哺乳动物细胞和无细胞蛋白质表达系统中实现基因表达的抑制与重新激活,从而成为基因调控领域的新兴力量。 团队此次研发的升级版Css DNA调节器主要解决了阻断链设计的限制问题。他们通过在阻断链交联位置引入双链桥结构的方法,既保证了对Css DNA表达的抑制,又使触发输入链不受序列限制;同时利用ATP、APE1和RNase H等内源性分子调节双链桥结构......阅读全文

江苏疾控首次鉴定一种新型环状单链DNA病毒

  该病毒是我中心病原所对今年9月27日江苏出入境检验检疫局送检的一例从新加坡回国的发热病人咽拭子样本进行病原体检测后所得。病原所实验室人员通过对送检样本用高通量测序技术检测发现其中含有一种新型环状单链DNA病毒片段,后根据高通量测序reads序列设计特异引物,对病人咽拭子样本进行PCR扩增,产物经

江苏疾控首次鉴定一种新型环状单链DNA病毒

  该病毒是我中心病原所对今年9月27日江苏出入境检验检疫局送检的一例从新加坡回国的发热病人咽拭子样本进行病原体检测后所得。病原所实验室人员通过对送检样本用高通量测序技术检测发现其中含有一种新型环状单链DNA病毒片段,后根据高通量测序reads序列设计特异引物,对病人咽拭子样本进行PCR扩增,产物经

单链互补DNA的定义

中文名称单链互补DNA英文名称single-strand cDNA;sscDNA定  义在逆转录酶催化下,以信使核糖核酸(mRNA)为模板合成与mRNA序列互补的单链DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

单链DNA探针技术简介

用双链探针杂交检测另一个远缘DNA时,探针序列与被检测序列间有很多错配。而两条探针互补链之间的配对却十分稳定,即形成自身的无效杂交,结果使检测效率下降。采用单链探针则可解决这一问题。单链DNA探针的合成方法主要有下列两种:(1) 以M13载体衍生序列为模板,用Klenow片段合成单链探针; (2)

单链DNA的结构特点

单链DNA就是指以这种状态存在的DNA。单链DNA在分子流体力学性质、吸收光谱、碱基反应性质等方面都和双链DNA不同。某些噬菌体粒子内含有单链环状的DNA,这样的噬菌体DNA在细胞内增殖时则形成双链DNA。

细胞化学词汇单链DNA

中文名称:单链DNA外文名称:single-stranded DNA术语含义:单链DNA就是指以这种状态存在的DNA。单链DNA在分子流体力学性质、吸收光谱、碱基反应性质等方面都和双链DNA不同。某些噬菌体粒子内含有单链环状的DNA,这样的噬菌体DNA在细胞内增殖时则形成双链DNA。

抗单链DNA抗体的概述

  抗ssDNA是抗DNA抗体中临床意义和重要性都不如抗dsDNA的一种,DNA是一个大分子的复合物,由两条核苷酸链形成的双螺旋结构。加热时碱基间的氢键断裂,DNA变性产生ssDNA。抗ssDNA的反应位点主要是ssDNA上的嘌呤和嘧啶构成的碱基。

细胞化学词汇单链互补DNA

中文名称:单链互补DNA英文名称:single-strand cDNA;sscDNA定  义:在逆转录酶催化下,以信使核糖核酸(mRNA)为模板合成与mRNA序列互补的单链DNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科) 

单链DNA文库的SELEX筛选实验

单链DNA文库的SELEX筛选实验可用于:(1)体外诊断;(2)体内治疗等。实验方法原理SELEX 技术除了可以使用 RNA 文库以外,还可以使用单链 DNA 文库进行筛选。单链 DNA 形成高级结构的丰富性也足够用于对许多靶分子的筛选,而且 DNA 文库具有更好的稳定性,操作也相对简便。实验材料3

分子遗传学词汇单链DNA

中文名称:单链DNA外文名称:single-stranded DNA定义:大部分DNA以双螺旋结构存在,但一经热或碱处理就会变为单链状态。

单链DNA的功概念和作用

单链DNA就是指以这种状态存在的DNA。单链DNA在分子流体力学性质、吸收光谱、碱基反应性质等方面都和双链DNA不同。某些噬菌体粒子内含有单链环状的DNA,这样的噬菌体DNA在细胞内增殖时则形成双链DNA。

单链DNA文库的SELEX筛选实验

            实验方法原理 SELEX 技术除了可以使用 RNA 文库以外,还可以使用单链 DNA 文库进行筛选。单链 DNA 形成高级结构的丰富性也足够用于对许多靶分子的筛选,而且 DNA 文库具有更好的稳定性,操作也相对简便。

单链DNA结合蛋白的功能简介

  单链DNA结合蛋白(Single-stranded DNA-binding protein,缩写SSB或SSBP)又称单链结合蛋白,是专门负责与DNA单链区域结合的一种蛋白质,为DNA复制、重组和修复所必需的成分。  防止两条互补单链再次结合为双螺旋,维持单链状态。防止单链区域形成链内二级结构。

单链DNA文库的SELEX筛选实验

实验方法原理 SELEX 技术除了可以使用 RNA 文库以外,还可以使用单链 DNA 文库进行筛选。单链 DNA 形成高级结构的丰富性也足够用于对许多靶分子的筛选,而且 DNA 文库具有更好的稳定性,操作也相对简便。实验材料 3' 引物链亲和素磁珠仪器、耗材 电泳仪PCR 仪离心机凝胶成像仪

这一分子工具有望成基因调控新“秘钥”

  近年来,环状单链DNA(Css DNA)因其稳定性高、免疫原性弱、可编程性强,成为基因调控、细胞治疗等医学合成生物学领域很有潜力的分子工具之一。  近期,中国科学院杭州医学研究所研究员宋杰团队针对此前开发的Css DNA调节器1.0 版的局限,成功研发出Css DNA调节器2.0 版,为合成生物

单链DNA结合蛋白的基本内容

  单链结合蛋白(SSB,single strand DNA-binding protein):结合于螺旋酶沿复制叉方向向前推进产生的单链区,防止新形成的单链DNA重新配对形成双链DNA或被核酸酶降解的蛋白质。  螺旋酶沿复制叉方向向前推进产生了一段单链区,但是这种单链DNA不会长久存在,会很快重新

单链Oligo合成与DNA组装技术-(一)

合成生物学作为迅速发展的交叉学科,已在生物医药、新材料、诊断、能源和数据储存等领域展现越来越广泛的应用潜力。合成基因组学作为合成生物学的重要研究方向,着重于新生命体系的从头设计与合成,其以Oligo(寡核苷酸链)合成、拼装和转移等核心技术为支撑。新生命体系的从头设计与合成不仅需要合成组成基因组的小片

单链Oligo合成与DNA组装技术-(二)

2.2 Golden Gate组装Golden Gate组装技术是基于非同源重组的代表性技术,其利用Ⅱ型限制性酶 BsaⅠ在识别位点外部切割的特性,设计特异的突出序列同时组装多个片段,且酶切和酶连可以同时进行,原理如图3所示。首先,扩增目的片段,在两端加上BsaⅠ识别序列,同时在识别序列内侧

细胞化学词汇环状DNA

中文名称:环状DNA分       类:环状单链DNA和环状双链环状DNA也有两种,环状单链DNA和环状双链,一般存在于病毒、细菌和真核生物的线粒体和叶绿体中, 环状DNA一般比线性DNA结合更紧密更稳定,储存的遗传信息更多(重复序列)。原核生物的拟核是大型环状DNA。定       义:超螺旋,D

环状DNA的结构特点

超螺旋,DNA双螺旋本身进一步盘绕称超螺旋,超螺旋有正超螺旋和负超螺旋两种。当盘旋方向与DNA双螺旋方向相同时,其超螺旋结构为正超螺旋,反之则为负超螺旋,负超螺旋的存在对于转录和复制都是必要的。

制备DNA测序模板实验——制备单链M13噬菌体DNA

本实验包含了用于制备适用于双脱氧测序的模板及适用于末端标记和化学测序的DNA的实验方案。所有用于双脱氧测序的双链模板在与引物退火前必须变性,在一般应用上,碱变性在测序中的效果比热变性好。实验材料大肠杆菌试剂、试剂盒LBTEM13聚乙二醇容易让顶层琼脂乙酸钠乙醇仪器、耗材巴斯德吸管试管离心机实验步骤1

如何从单链dna中获取核酸适配体

加随机序列进行封闭

用噬菌粒载体制备单链DNA

            实验方法原理 噬菌粒巧妙地组合了质粒和丝状噬菌体的特征。除了基本特征外,这些质粒通常是高拷贝数的,并带有一个修饰后的丝状噬菌体的主要基因间区。这个区域 ( 野生型为 508 bp)不表达蛋白,但含有全部的顺式作用序列,该作用是病毒 DNA

用噬菌粒载体制备单链DNA

实验方法原理 噬菌粒巧妙地组合了质粒和丝状噬菌体的特征。除了基本特征外,这些质粒通常是高拷贝数的,并带有一个修饰后的丝状噬菌体的主要基因间区。这个区域 ( 野生型为 508 bp)不表达蛋白,但含有全部的顺式作用序列,该作用是病毒 DNA 合成起始和结束及噬菌体颗粒的形态发生必不可少的。实验材料

抗单链DNA(ssDNA)抗体检测的介绍

  抗单链DNA(ssDNA)是抗DNA抗体中临床意义和重要性都不如抗dsDNA的一种,DNA是一个大分子的复合物,由两条核苷酸链形成的双螺旋结构。加热时碱基间的氢键断裂,DNA变性产生ssDNA。抗ssDNA的反应位点主要是ssDNA上的嘌呤和嘧啶构成的碱基。

牛单链DNA(ssDNA)酶联免疫分析(ELISA)

牛单链DNA(ssDNA)酶联免疫分析(ELISA)试剂盒使用说明书本试剂仅供研究使用       目的:本试剂盒用于测定牛血清,血浆及相关液体样本中单链DNA(ssDNA)的含量。实验原理:  本试剂盒应用双抗体夹心法测定标本中牛单链DNA(ssDNA)水平。用纯化的牛单链DNA(ssDNA)抗体

分子遗传学词汇单链DNA结合蛋白

中文名称:单链DNA结合蛋白外文名称:Single-stranded DNA-binding protein定义:单链DNA结合蛋白(Single-stranded DNA-binding protein,缩写SSB或SSBP)又称单链结合蛋白,是专门负责与DNA单链区域结合的一种蛋白质,为DNA复

M13噬菌体单链DNA的制备

            实验方法原理 M13 噬菌体单链 DNA 是从感染细胞分泌至周围培养液中的病毒颗粒中制备的,首先在高盐存在下,丝状病毒被聚乙二醇(PEG) 沉淀浓缩,然后用酚抽提释放单链 DNA,最后乙醇沉淀收集单链 DNA。

M13噬菌体单链DNA的制备

M13 噬菌体单链 DNA 是从感染细胞分泌至周围培养液中的病毒颗粒中制备的,首先在高盐存在下,丝状病毒被聚乙二醇(PEG) 沉淀浓缩,然后用酚抽提释放单链 DNA,最后乙醇沉淀收集单链 DNA。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理M13 噬菌体单链 DNA 是从感染细胞分泌

用噬菌粒载体制备单链DNA

噬菌粒巧妙地组合了质粒和丝状噬菌体的特征。除了基本特征外,这些质粒通常是高拷贝数的,并带有一个修饰后的丝状噬菌体的主要基因间区。这个区域 ( 野生型为 508 bp)不表达蛋白,但含有全部的顺式作用序列,该作用是病毒 DNA 合成起始和结束及噬菌体颗粒的形态发生必不可少的。本实验来源「分子克隆实验指