新工具发现230种海洋巨型病毒

美国迈阿密大学罗森斯蒂尔海洋、大气与地球科学学院的科学家开发出一种创新性生物信息工具BEREN,利用高性能计算机,在海洋宏基因组数据集中识别出230种新型巨型病毒,并对其功能进行了表征。研究成果发表于最新一期《NPJ病毒》期刊上。巨型病毒在单细胞海洋生物,即原生生物的生存中发挥着重要作用。原生生物包括藻类、变形虫和鞭毛虫等,它们构成了海洋食物网的基础。由于这些原生生物是食物链的重要组成部分,因此,一些大型DNA病毒往往会引发有害藻华暴发等危害,影响人类健康。此前,因生物信息学流程局限,巨型病毒长期未被充分检测。此次,团队开发了一种名为BEREN(从环境宏基因组中恢复真核病毒的生物信息工具)的新工具,能从庞大的公共DNA测序数据集中高效识别巨型病毒基因组。他们利用迈阿密大学的“飞马座”超级计算机处理并组装了大量宏基因组,重建了数百个微生物群落数据集。团队还发现,这些巨型病毒基因组中包含530种新功能性蛋白质,其中9种参与光合作用,......阅读全文

新工具发现230种海洋巨型病毒

美国迈阿密大学罗森斯蒂尔海洋、大气与地球科学学院的科学家开发出一种创新性生物信息工具BEREN,利用高性能计算机,在海洋宏基因组数据集中识别出230种新型巨型病毒,并对其功能进行了表征。研究成果发表于最新一期《NPJ病毒》期刊上。巨型病毒在单细胞海洋生物,即原生生物的生存中发挥着重要作用。原生生物包

格陵兰冰盖惊现巨型病毒

据最新一期《微生物组》杂志报道,丹麦奥胡斯大学研究人员在格陵兰冰盖上发现一种巨型病毒。它生活在以微藻为主的冰雪表面。研究人员认为,这种巨型病毒以雪藻为食,可以间接减缓冰的融化。病毒通常比细菌小得多。普通病毒的大小为20到200纳米,而细菌则为2到3微米。换句话说,普通病毒大小约为细菌的千分之一。但巨

巨型病毒点燃进化树之争

  进化生物学家从来都不知道是什么制造了病毒,对它们的起源争论了十几年。但一组叫作Klosneuviruses的巨型病毒的新发现可能是“缺失的环节”,有助于解决争论——或者引发更多的争论。  2003年,研究人员报道发现了巨型病毒,并将其命名为Mimiviruses。其携带的基因表明,它们的原型可以

美森林惊现“外星”巨型病毒

  据生物预印本网站bioRxiv刊载的一项最新研究,科学家在美国马萨诸塞州哈佛森林的土壤中发现了一组巨型病毒。这些巨型病毒具有“仿佛来自外星的”附属物和前所未见的内部结构。  尽管新发现的这些病毒样颗粒尚未经过基因组分析,但研究人员认为,由于其独特的衣壳结构,它们属于巨型病毒。  早在2018年,

全域型海洋生态牧场:走向深蓝的巨型“粮仓”

  位于黄渤海交汇处的长岛,水天一色。  站在长岛岸边,远远望去,海面上均匀分布着一座座“微型牧场”——这些长、宽各70米的海面平台,容纳水体达7万立方米,搭载了水下声呐、水下机器人、5G通信、海洋数据监测等多种系统。平台里面,鱼群穿梭涌动,生机无限。平台周围,一条条海参捕捞船在繁忙作业,收获满满。

巨型潘多拉病毒擅长创造新基因

  科研人员新发现了三种潘多拉病毒,并发现这类病毒庞大的基因组中有许多“孤儿基因”。这意味着潘多拉病毒可能擅长创造全新的基因。图片来源于网络  潘多拉病毒是2013年才被发现的一类巨型病毒,寄居在变形虫体内,形似细菌。其体积在病毒界位居第二,基因组规模则位居第一。  法国国家科学研究中心日前发布的新

4.7亿年前巨型节肢动物统治海洋

在摩洛哥一个重要的新化石遗址发现的化石表明,巨型节肢动物——包括虾、昆虫和蜘蛛在内的现代生物的近亲,在4.7亿年前统治着海洋。此项研究发表在最近的《科学报告》杂志上。 泰舒特(Taichoute)遗址的早期证据记录了无数大型“自由游动”节肢动物,泰舒特曾经是海底,现在是沙漠。此次,英国埃克塞特大

法国科学家发现新种巨型病毒

  据国外媒体报道,法国科学家在变形虫体内发现一种巨型病毒新类型,它的基因库里包括来自其他物种的遗传物质。法国艾克斯-马赛第二大学(Aix-Marseille 2 University)的迪德尔·拉奥尔特(Didier Raoult)说,这种病毒“是一种全新类型”。 巨型病毒的结构分析   

海洋所揭示海底滑坡内部巨型块体形成过程

近日,中国科学院南海海洋研究所边缘海与大洋地质重点实验室研究员李伟团队联合挪威科技大学、英国卡迪夫大学,以及中国海洋大学的科研团队,利用地震解释和数据统计方法,在大陆边缘海底滑坡的沉积过程研究上取得重要进展。相关研究发表于《美国地质学会学报》(Geological Society of Americ

未知基因组的神秘“巨型病毒”揭示病毒世界变异性

  据国外媒体报道,目前,科学家最新发现一种具有未知基因组的神秘巨型病毒。  该病毒被称为“Yaravirus”,是在巴西贝洛哈里桑塔城帕普哈人工湖中发现的,它是以巴西神话传说中“水仙(Yara)”的名字命名的。尽管该病毒可能不是什么超自然警报,但它可能像神话中的“水仙(Yara)”一样神秘。  因

海王星与天王星或存在巨型液态钻石海洋

    海王星照片。科学家经研究发现天王星和海王星表面可能被巨大的液态钻石海洋覆盖,海上漂浮着巨大的固态“钻石山”,体积与冰山相当。巨大的液态钻石海洋能够解释海王星和天王星的一些怪异特征。在与海王星相同的环境下,液态钻石海上会漂浮着巨大的固态钻石山。  北京时间12月3日消息,据国外

Nature:巨型病毒也有类似细菌CRISPR的免疫系统

  就像细菌,体型较大的病毒也需要保护自己,免受其他微小生物入侵。根据法国科学们的一项新研究,这些巨型病毒有类似于细菌中的CRISPR系统的免疫系统,来保护自己。相关工作发表在近期的《Nature》上。  2003年,法国艾克斯-马赛大学的 Didier Raoult和Bernard La Scol

格陵兰冰盖惊现巨型病毒,或可减缓冰的融化

科技日报讯 (记者张佳欣)据最新一期《微生物组》杂志报道,丹麦奥胡斯大学研究人员在格陵兰冰盖上发现一种巨型病毒。它生活在以微藻为主的冰雪表面。研究人员认为,这种巨型病毒以雪藻为食,可以间接减缓冰的融化。格陵兰冰盖的一部分,其冰面因藻类而变黑。图片来源:物理学家组织网病毒通常比细菌小得多。普通病毒的大

火星曾拥有海洋?巨型混沌谷为远古水文史提供关键线索

火星上是否曾经存在过海洋?这是行星科学中一个长期争议、 yet极富吸引力的问题。欧洲航天局(ESA)的火星快车号(Mars Express)任务通过高分辨率立体相机(HRSC)对火星赤道附近的沙拉巴塔纳谷(Shalbatana Vallis)进行持续观测,为解答这一谜题提供了重要的地质证据。 沙拉巴

首次全球海洋病毒生态多样性调查-鉴定了20万株海洋病毒

  一个国际小组用一艘单帆船进行了首次全球海洋病毒生态多样性远征调查。他们发现了近20万种海洋病毒,远远超过了之前在这些水域海洋调查中已知的15000种,以及从培养的微生物病毒中获得的大约2000个基因组。文章发表在4月25日的《Cell》杂志,这对理解从进化到气候变化的各种问题都有意义,因为它们有

科学新发现丨美国森林土壤发现奇异巨型病毒

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/505995.shtm

PNAS:沉睡万年的第四类巨型病毒

  ——科学家们从之前发现过巨型病毒的西伯利亚永冻土中发现了第四种类型的巨型病毒  生物通报道:法国科学家从俄罗斯远东地区的楚科奇自治区采集到一份冻土样本,并且从中发现了一种被命名为Mollivirus sibericum的古老巨型病毒,这些史前病毒已经在俄罗斯西伯利亚地区的冻土层中沉睡了3万多年,

PLOS-ONE报道一种新噬菌体——巨型长尾病毒

  目前,一个国际研究小组,在南部非洲纳米比亚平原的一具斑马尸体中,发现了一种新的巨型长尾病毒(或噬菌体),这种病毒能够感染引起炭疽病的细菌。这种新的噬菌体,最终可能会为检测、治疗或净化炭疽杆菌(anthrax bacillus)及其引起食物中毒的近缘菌种,开辟新的途径。这项研究成果发

法国科学家在西伯利亚冻土中发现史前巨型病毒

  一个法国病毒学家团队4日宣布,他们发现了世界上第三种超大型病毒。这种史前病毒已经在俄罗斯西伯利亚地区的冻土层中封存了3万多年。   法国国家科研中心与马赛大学的联合实验室当天发表新闻公报说,其科研团队从俄罗斯远东地区的楚科奇自治区采集到一份冻土样本,证实了“西伯利亚阔口罐病毒”(Pithovi

研究揭示巨型恐龙演化

图片来源:《自然—生态与演化》研究人员近日介绍了最新发现的生活在三叠纪晚期(约2.37~2.01亿年前)的阿根廷地区的恐龙化石。这一标本来自地球上最早出现的巨型蜥脚类动物之一。比其近亲泰坦龙还要早3000万年。这一发现改变了人们之前的认知,有助于更好地理解这一分支如何演化成如此庞大的体型。 脖子

研究揭示巨型恐龙演化

  研究人员近日介绍了最新发现的生活在三叠纪晚期(约2.37~2.01亿年前)的阿根廷地区的恐龙化石。这一标本来自地球上最早出现的巨型蜥脚类动物之一。比其近亲泰坦龙还要早3000万年。这一发现改变了人们之前的认知,有助于更好地理解这一分支如何演化成如此庞大的体型。  脖子细长、身形巨大、四足行走的腕

巨型结构“宇宙藤蔓”发现

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512759.shtm “宇宙藤蔓”图像。图片来源:物理学家组织网 一个国际天文学家小组报告称,他们发现了一个由至少20个大质量星系组成的巨型天体结构,这个结构现在被称为“宇宙藤蔓”,大小约

外国学者发现巨型病毒拥有最大的构建蛋白质的基因集

  近日,《自然—通讯》发表的一项研究报告发现了巨型病毒Tupanvirus的两个毒株。该病毒包含所有已知病毒中蛋白质组装所需的最全的基因集,通过它们可以了解病毒的演化。  巨型病毒的发现引发了有关病毒演化的激烈争论,主要理论有两种。一种认为复杂的巨型病毒由简单的祖先通过获取被感染宿主的基因演化而来

研究揭示海洋巨型单细胞多核钙化藻基因组异源多倍化与生物钙化机制

近日,中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室研究员林强团队,联合厦门大学、美国康涅狄格大学等的科研人员,获得了海洋典型钙化藻——仙掌藻和叉节藻的全基因组,揭示了仙掌藻基因组异源多倍化与不对称进化机制,阐明了钙化藻生物钙化与单细胞多核发生的遗传与分子调控机理。仙掌藻是一类胞外钙化绿藻

科学家或发现最大海洋病毒

科学家发现迄今为止海洋中最大的病毒  大多数的病毒都是轻装旅行的。它们仅仅携带了合成新病毒所需的少量基因,并依赖其宿主的机制来完成剩下的工作。  然而新近发现的这种病毒——被称为Cafeteria roenbergensis病毒——却是一个“收破烂的”:它携带了令人难以置信的约73万

巨型船虫凶猛的“爱情”

研究人员已经捕捉到了船虫(一种软体动物)杂技般的性行为的视频。船虫是一种以船只、码头和浮木为幼虫的软体动物,它们一生都在周围的木头上钻洞,并以此为食。 船虫的长而柔软的身体,在木制的藏身之处外唯一可见的部分是一个可伸缩的“虹吸管”—— 一种用来携带食物和氧气并排出废物的管子。面对持续不断的吃掉自

专家揭开巨型叶片生长之谜

记者日前从中科院西双版纳热带植物园获悉,通过研究巨型叶片植物在自然界稀少、叶片最大生长面积与叶片结构功能关系等问题,科研人员发现,叶片边缘部位的生理功能受到抑制,会限制叶片面积的继续扩大。相关研究发表在《公共科学图书馆·综合》上。  据悉,热带典型巨型叶片天南星科植物海芋的叶片直径可

国际巨型高原研究会成立

  1月11日,由我国科学家牵头发起的国际巨型高原研究会(International PlateauPlus Association,PlateauPlus)在北京成立。  研究会旨在联合全球巨型高原的五大洲20多个国家的科研机构及科学团队,搭建巨型高原研究的国际平台,发展形成跨学科、跨地域的地球系

陕西发现7.4米巨型恐龙足迹

留下足迹的巨齿龙日前,中国古生物学者与考古学家宣称,在陕西省商洛市邵涧村发现了恐龙足迹,为迄今为止我国境内最大的肉食恐龙足迹之一。  “目前我国已发现的长度超过50厘米的大型兽脚类足迹,仅有内蒙古查布地区的一例,长度约58.2厘米。此次我们描述的邵涧标本长达57.5厘米,已经是中国最

巨型食肉恐龙“吃相”各不同

仔细观察巨型恐龙的头骨,人们发现,一些恐龙喜欢撕碎猎物,而另一些则用足以咬碎骨头的力量发动攻击。英国布里斯托尔大学的Andre Rowe 和Emily Rayfield 研究了来自整个中生代的18 种兽脚类食肉恐龙的头骨。这个多样化的恐龙类群包括霸王龙、南方巨兽龙和棘龙。它们用后腿行走,拥有巨大的头