新策略助力蛋白蛋白相互作用先导化合物设计
中国科学院上海药物研究所研究员罗成、周兵、陈奕和华东师范大学研究员陈示洁合作，提出“强支点占据-杠杆干扰”（FOLP）的蛋白-蛋白相互作用（PPI）先导化合物设计策略，为PPI领域研究提供新的概念和方法，将有助于未来其他PPI调控剂的开发。相关研究8月19日发表于《德国应用化学》，并被推荐为“Hot Paper”。 PPI参与信号转导、结构组装以及细胞周期调控等过程，其失衡或异常可直接引发癌症、神经退行性病变及自身免疫病等一系列疾病。与传统药物靶标相比，PPI界面具有开放性、动态性、广泛性等特点。但受限于界面平坦、亲和力低等问题，难以快速获得高活性、高选择性的PPI先导化合物。 针对以上问题，研究团队提出FOLP新策略，即将已知高亲和力片段作为“支点”稳固锚定正构口袋，再利用分子模拟技术设计“杠杆”伸入邻近的互作界面处潜在变构口袋，扰动互作界面，快速获得高活性PPI抑制剂，从而实现撬动PPI、最终破坏PPI的目的。 在......阅读全文
蛋白质相互作用组研究获进展
蛋白质相互作用组是指蛋白质之间的基本相互作用，对于大多数物种而言，其在很大程度上都是未知的。因而，研究探索膜蛋白潜在的相互作用组必然是一项极具挑战性的工作。 美国斯坦福大学卡耐基科学研究所Jones等研究人员，使用构建好的分裂泛素化酵母试验系统，从拟南芥中筛选鉴定出超过3000个膜蛋白之间的相
蛋白质间相互作用研究方法1
确定各种可能与目标蛋白相互作用的蛋白质，“撒大网”l 双杂交和其他双成分系统第一阶段：诱饵-LexA融合蛋白的鉴定诱饵-LexA融合蛋白的构建1．将编码诱饵蛋白的靶DNA克隆到LexA融合载体的多聚接头处，以合成一种框架内的LexA融合基因。确定诱饵序列的羧基端存在翻译终止序列。形成的
Far－Western分析蛋白质相互作用实验
使用 Far Western blot 分析蛋白质相互作用时，目的蛋白固定在一个固体支持膜上，然后用非抗体蛋白探测。 Far Western blot 能够用于识别复杂的蛋白复合物中蛋白质的特异性相互作用。实验材料待分析的样品编码目的蛋白的 cDNA（已经克隆到体外表达载体中）试剂、试剂盒1 × S
质谱研究蛋白质相互作用（一）
质谱技术已经成为了蛋白质组学研究的主力。这种技术方法能精确的检测多肽，从而帮助研究人员识别并测序多肽分子，分析它们的特征，了解它们如何进行化学修饰的。 但大多数蛋白质并不是单独行动的，一些关键的生物学过程，如DNA 复制、转录、翻译、细胞分裂和能量生成都依赖于大型蛋白复合物的行为，这些蛋白复合
邻位连接技术PLA在蛋白蛋白相互作用，蛋白磷酸化修饰..
邻位连接技术PLA在蛋白-蛋白相互作用，蛋白磷酸化修饰的应用摘要 邻位连接技术（ｐｒｏｘｉｍｉｔｙｌｉｇａｔｉｏｎａｓｓａｙ，ＰＬＡ），是新研发的一项高灵敏度的蛋白质体外分析技术。该方法利用一对邻位探针（ｐｒｏｘｉｍｉｔｙｐｒｏｂｅｓ）对靶分子进行双识别，通过连接反应产生可扩增的检测信号，以实时ＰＣ
表面等离子共振技术在蛋白蛋白相互作用的应用（二）
控制软件SensiQ的控制软件在原始反应曲线生成时，同时并实时获取和展示两个通道内的数据。参照通道内的数据被减除，以补偿热漂移、非特异性结合、总折射指数移相等效应，从而得到清晰高质的实验数据。控制软件在反应曲线上简单加入报告点，用来确定样品注入后产生的结合反应。报告点的添加可在实验中的任何时候由人工
蛋白质与水的相互作用：蛋白质的水溶性
蛋白质与水之间的作用力主要是蛋白质中的肽键（偶极-偶极相互作用或氢键），或氨基酸的侧链（解离的、极性甚至非极性基团）同水分子之间发生了相互作用。 影响蛋白质水溶性的应素很多： （1）pH>pI 时，蛋白质带负电荷，pH=pI 时，蛋白质不带电荷，pH 时，蛋白质带正电荷。溶液的pH 低于或高
JCIM：计算提升蛋白质蛋白质相互作用的预测精度
蛋白质-蛋白质相互作用和识别在生物学过程中有着非常重要的作用。尽管结构生物学已经取得了较大的进展，但直接采用实验方法确定蛋白质-蛋白质复合物结构仍然非常困难。分子对接技术是预测蛋白质-蛋白质复合物结构的有效方法。蛋白质-小分子之间的相互作用一般蛋白质受体有结合口袋，相互作用区域比较明确，而蛋白质
表面等离子共振技术在蛋白蛋白相互作用的应用（一）
应用领域结合特异性、抗体选择、抗体质控、疾病机制、药物发明、生物治疗、生物处理、生物标记物、配体垂钓、基因调控、细胞信号传导、亲和层析、结构-功能关系、小分子间相互作用等检测原理表面等离子共振（SPR）是一种光学现象，可被用来实时跟踪在天然状态下生物分子间的相互作用。这种方法对生物分子无任何损伤，且
Nat－Met：新技术可揭示蛋白间相互作用
加拿大多伦多大学研究人员开发出一种研究人体蛋白质的新技术。该技术可追踪膜蛋白与其他蛋白之间的相互作用 据报道，加拿大多伦多大学研究人员开发出一种研究人体蛋白质的新技术。该技术可追踪膜蛋白与其他蛋白之间的相互作用。 膜蛋白占人体所有蛋白的约三分之一，有500多种疾病与其失能相关
P53与蛋白质的相互作用
一些蛋白质能与P53蛋白作用，导致其正常生物学功能的丧失，DNA肿瘤病毒如 HPV16、18、SV40和腺病毒编码癌蛋白，引起宿主细胞的恶性病变，这些癌蛋白如 SV40T抗原、腺病毒ELa、ELb、HPVE6能与Rb，P53结合。Scheffner证实，HPVE6结合 P53后，启动细胞内蛋白酶降解
米粒子与蛋白质之间的相互作用
蛋白质是生命中比较重要的物质组成部分，它们在体内是有着很多的特殊功能的，像一些催化功能，能量的转运以及保护等。但是我们都了解到蛋白质的能量高度都是和疾病联系在一起的，经常还会有一些疾病的信号发生。我们需要通过粗蛋白测定仪来检测，再通过我们现在比较实用的纳米技术来不断的增加疾病的发生率。随
实质上研究核酸与蛋白的相互作用
人生的另一项“重大效果”却是让庄小威欣喜的有时候做学问也是有好处的还能给你带来幸福的生活，然而。认识了丈夫，不但如此，现在还有了一个两岁的女儿。很多女生有些害怕做科学，想说幸福的家庭生活和做科学事业是不矛盾的当然，需要有牺牲，经常觉得见女儿的时间少到让自己伤心，但是并不是说我没有享受到家庭的幸福。
预测蛋白质相互作用的计算方法
蛋白质相互作用研究能够从分子水平上揭示蛋白质的功能，帮助揭示生长发育、新陈代谢、分化和凋亡等细胞活动的规律。在全基因组范围内识别蛋白质相互作用对是解释细胞调控机制的重要一步。随着蛋白质相互作用实验技术的发展，人们能够获得大量的蛋白质相互作用数据，甚至能够在全基因组范围内对蛋白质相互作用进行分析。
表面等离子共振检测蛋白相互作用实验
实验方法原理 实验材料 CM-5 葡聚糖芯片（BIAcore）配体蛋白靶蛋白试剂、试剂盒 PBS胺-偶联试剂盒（详见「其他」）仪器、耗材 BIAcore SPR 设备BIA 评估软件（point-and-click）实验步骤 1. 插入一个新的 BIAcore CM-5 葡聚糖芯片。2. 用 PBS
蛋白质相互作用研究：从整体到局部
随着越来越多的物种基因组测序完成，对全蛋白质组与相互作用组的解释已经成为近期研究的热点。虽然蛋白质组研究阐述了表达蛋白质的所有组成成分，但是相互作用组包括了生物体内存在或者可能存在的成对蛋白质-蛋白质相互作用，因此，形成了庞大且稀疏的网状结构。伦敦帝国理工学院生物信息学中心的WP Ke
表面等离子共振检测蛋白相互作用实验
用 BlAcore 芯片 用 NTA-SAM 芯片 实验方法原理 实验材料 CM
蛋白分离纯化方法之疏水相互作用层析法
由于在自然界生命活动中起重要作用的蛋白质在机体细胞内的浓度比较低，并且存在于细胞的各个机构中的蛋白质几乎都是以复杂的混合形式存在的。为了在不破坏蛋白质的空间结构及一级结构，和不影响其生理功能的情况下，把蛋白质分离、纯化出来，需要使用一些技术，如重组蛋白纯化技术。疏水相互作用层析法是蛋白分离纯化的一种
蛋白分离纯化方法之疏水相互作用层析法
由于在自然界生命活动中起重要作用的蛋白质在机体细胞内的浓度比较低，并且存在于细胞的各个机构中的蛋白质几乎都是以复杂的混合形式存在的。为了在不破坏蛋白质的空间结构及一级结构，和不影响其生理功能的情况下，把蛋白质分离、纯化出来，需要使用一些技术，如重组蛋白纯化技术。疏水相互作用层析法是蛋
蛋白分离纯化方法之疏水相互作用层析法
由于在自然界生命活动中起重要作用的蛋白质在机体细胞内的浓度比较低，并且存在于细胞的各个机构中的蛋白质几乎都是以复杂的混合形式存在的。为了在不破坏蛋白质的空间结构及一级结构，和不影响其生理功能的情况下，把蛋白质分离、纯化出来，需要使用一些技术，如重组蛋白纯化技术。疏水相互作用层析法是蛋白分离纯化的一种
破伤风免疫球蛋白的药物相互作用
免疫球蛋白制品中的抗体可能干扰活病毒疫苗（如麻疹、腮腺炎、脊髓灰质炎和疱疹疫苗）的反应，所以建议应在注射破伤风人免疫球蛋白大约3个月后再使用这些疫苗。
研究蛋白质RNA相互作用的新工具
近日，赛默飞世尔科技全新推出了一款Pierce Magnetic RNA-Protein Pull-Down Kit，让研究人员能够以末端标记的RNA作为诱饵，轻松富集蛋白质-RNA的相互作用。与抗体捕获相比，这种方法的优势在于脱硫生物素化的目标RNA能够直接富集RBP(或复合物)。 蛋白
破伤风免疫球蛋白的药物相互作用
免疫球蛋白制品中的抗体可能干扰活病毒疫苗（如麻疹、腮腺炎、脊髓灰质炎和疱疹疫苗）的反应，所以建议应在注射破伤风人免疫球蛋白大约3个月后再使用这些疫苗。
蛋白质间相互作用研究方法3：BIAcore
快速分析过去已确定的相互作用l 利用BIAcore通过表面胞质基因共振光谱学分析相互作用的蛋白质RAMc通过伯氨基与CM-5传感芯片表面的结合1．将CM-5传感芯片模块嵌入BIAcore仪器。2．全部采用过滤并除气的HEPES缓冲盐溶液。3．将分别含有NHS、EDC、乙醇胺和RAM Fc以
蛋白质相互作用(protein－interaction)实验方法
免疫共沉淀和亲和层析共分离：免疫共沉淀是证明蛋白质-蛋白质相互作用的最直接最经典和最有效的方法，如蛋白A能与B相互作用结合成异源二聚体，无论用抗A或抗B的抗体或与A或 B的亲和物偶联的agarose小珠都能把A和B沉淀下来。因此广泛用于蛋白质相互作用研究。常用的小珠：GST-Agarose（不需要抗
组蛋白分子伴侣DAXX和染色质重塑蛋白ATRX相互作用模式
近日，中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈勇研究组的最新研究成果，以Structural basis for DAXX interaction with ATRX为题，发表在Protein & Cell上，该成果揭示了组蛋白分子伴侣DAXX蛋白与染色质重塑蛋白ATRX相互作用
方案11－标记蛋白并通过阵列检测探究蛋白质间相互作用
实验材料用于荧光标记的目标蛋白制成蛋白质阵列的玻片试剂、试剂盒单功能活性染料Cy-3或Cy-5磷酸盐缓冲溶液含有 500mmol L甘氨酸的 PBSPBST标记缓冲液仪器、耗材亲和层析设备离心机透析设备荧光片扫描仪保湿器孵育箱特定规格的层析设备玻片转子实验步骤一、蛋白标记1.将染料溶人 250ul
蛋白质蛋白质相互作用理论预测和药物设计新法获进展
11月29日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院上海药物研究所蒋华良课题组和美国莱斯大学（Rice University）José N. Onuchic 课题组合作的论文Elucidating the druggable interface of protein-protei
新冠N蛋白与α突触核蛋白相互作用促进淀粉样纤维形成
导致COVID-19的冠状病毒SARS-CoV-2正在全球肆虐。关于相对年轻的COVID-19患者在感染这种病毒后数周内患上帕金森病的案例报告，使科学家们怀疑这两者之间是否存在联系。 如今，在一项新的研究中，来自荷兰屯特大学的研究人员发现至少在试管中，SARS-CoV-2的N蛋白与一种称为α突
Cell重磅：人类病毒蛋白质相互作用图谱面世
图片来源：《寄生虫》海报 近日，一部豆瓣评分9.2的韩国电影《寄生虫》广受大家的好评。故事也正如片名一样，讲述了一个贫困家庭“寄生”于富人家庭的故事。说到寄生，其实人体内的寄生事件更是数不胜数，最常见的便是病毒的感染。 病毒是一种比真菌和细菌小得多的感染性微生物，要想生存，它就必须找到合适的活体