蛋白质蛋白质相互作用理论预测和药物设计新法获进展
11月29日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院上海药物研究所蒋华良课题组和美国莱斯大学（Rice University）José N. Onuchic 课题组合作的论文Elucidating the druggable interface of protein-protein interactions using fragment docking and coevolutionary analysis。 该项研究成果在可药性蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）界面预测与识别计算方法发展方面取得新进展。蛋白质-蛋白质相互作用在细胞命运决定、信号转导等重要生命过程中起重要作用，也是疾病发生和发展的重要环节。因此，蛋白质-蛋白质相互作用界面已经成为新药发现的重要靶标。然而，蛋白质界面具有作用面积大、相对平坦等特点，不利于药物分子、特别是小分子药物结合，使得基于蛋白质-蛋白质界面的药物设计面临严峻挑战。因此，发展......阅读全文
分子探针还是分子铁锤？
这一期的《Nat. Chem. Biol.》有一篇题为“The promise and peril of chemical probes”的评论文章，二十几个作者都是化学生物领头人，其中包括Stuart Schreiber和Brian Shoichet这样的大腕。文章回顾了早期分子探针的缺陷并对
核酸基因分子探针
从化学和生物学的意义上理解，探针是一种已知特异性的分子，它带有合适的标记物供反应后检测。探针和靶的相互反应如抗原-抗体、血凝素-碳水化合物、亲合素-生物素、受体和配体，以及核酸与其互补核酸间的杂交等反应均属此类。用核酸探针与待检标本中核酸杂交，形成杂交体，再用呈色反应显示。此方法用于疾病的诊断，称为
新型蛋白质分子探针－核酸适配体－治疗高度恶性肺腺癌
肺癌是发病率与死亡率最高的恶性肿瘤，而肺腺癌是肺癌的主要病理亚型。以EGFR抑制剂为代表的靶向治疗及以PD1/PDL1靶向性抗体为代表的免疫治疗极大地改善了肺腺癌病人的生存预后。然而，肺腺癌中恶性程度最高、以细胞快速增殖为主要特征的PP（Proximal-Proliferative）分子亚型肺腺
核酸分子杂交探针的介绍
若杂交的目的是识别靶DNA中的特异核苷酸序列，这需要牵涉到另一项核酸操作的基本技术─探针（probe）的制备。探针是指带有某些标记物（如放射性同位素32P，荧光物质异硫氰酸荧光素等）的特异性核酸序列片段。若我们设法使一个核酸序列带上32P，那么它与靶序列互补形成的杂交双链，就会带有放射性。以适当
分子探针的概念和分类
分子探针是指能精准回答生物医学问题的功能性物质。分子探针是实现分子成像的先决条件和核心技术。分子影像技术的发展除了需要先进的成像设备外，还需要发展新型而高效的分子探针。分子探针种类繁多，根据成像设备的不同，分子探针分为光学、核医学、磁学、声学、光声等不同种类。
靶向探针精确操纵蛋白质
北京大学化学与分子工程学院教授陈鹏正在实验中。 作为生物体内含量最多的一类生物大分子，蛋白质是生物功能的主要执行者，在各种生命活动中扮演着关键角色。科学家一直在探索适用于活体环境的蛋白质操纵工具，以实现对目标蛋白质结构和功能的深入研究，这已经成为当今化学生物学领域的前沿热点之一。 在
“分子影像探针”平台启动建设
2月8日，分子影像与医学诊疗探针创新平台在北京怀柔科学城启动建设。该平台是“十四五”北京市交叉研究平台项目，也是我国生物医学成像领域大科学工程、国家重大科技基础设施——多模态跨尺度生物医学成像设施项目工程的二期建设内容，建成后将助力成像设施全功能运行和技术转化，更精准“看见”疾病发生全程，补齐国家生
分子杂交基因探针的类型介绍
分子杂交基因探针根据标记方法不同可粗分为放射性探针和非放射性探针两大类，根据探针的核酸性质不同又可分为DNA探针，RNA探针，cDNA探针，cRNA探针及寡核苷酸探针等几类，DNA探针还有单链和双链之分。
新型分子探针临床转化获突破
近日，北京协和医院教授李方、博士张静静与美国国立卫生研究院教授陈小元等合作，在国际上首次报道了正电子核素68Ga-NEB新型分子探针在临床转化方面的新突破，为大血管疾病及恶性肿瘤患者的淋巴系统受侵犯程度的评估，提供了精准的术前探查、术中诊断及预后方法，在推进靶向治疗的进一步精准化上显现了突出优
分子杂交基因所用DNA探针应用介绍
DNA探针是最常用的核酸探针，指长度在几百碱基对以上的双链DNA或单链DNA探针。现已获得DNA探针数量很多，有细菌、病毒、原虫、真菌、动物和人类细胞DNA探针。这类探针多为某一基因的全部或部分序列，或某一非编码序列。这些DNA片段须是特异的，如细菌的毒力因子基因探针和人类Alu探针。这些DNA探针
分子杂交技术RNA探针的相关介绍
许多载体如pBluescript, pGEM等均带有来自噬菌体SP6或E.coli噬菌体T7或T3的启动子,它们能特异性地被各自噬菌体编码的依赖于DNA的RNA聚合酶所识别,合成特异性的RNA。在反应体系中若加入经标记的NTP，则可合成RNA探针。RNA探针一般都是单链,它具有单链DNA探针的优
分子杂交技术的核酸探针标记法
核酸探针根据核酸的性质，可分为DNA和RNA探针;根据是否使用放射性标记物的与否,可分为放射性标记探针和非放射性标记探针;根据是否存在互补链,可分为单链和双链探针;根据放射性标记物掺入情况,可分为均匀标记和末端标记探针。下面将介绍各种类型的探针及标记方法。 分子生物研究中，最常用的探针即为双链DNA
蛋白质芯片技术探针的制备方法
低密度蛋白质芯片的探针包括特定的抗原、抗体、酶、吸水或疏水物质、结合某些阳离子或阴离子的化学集团、受体和免疫复合物等具有生物活性的蛋白质。制备时常常采用直接点样法，以避免蛋白质的空间结构改变。保持它和样品的特异性结合能力。高密度蛋白质芯片一般为基因表达产物，如一个cDNA文库所产生的几乎所有蛋白质均
蛋白质的内源荧光与荧光探针
利用荧光光谱法研究蛋白质一般有两种方法。一是测定蛋白质分子的自身荧光(内源荧光)，另一种是当蛋白质本身不能发射荧光时，通过非共价吸附或共价作用向蛋白质分子的特殊部位引入外源荧光(也称荧光探针)，然后测定外源荧光物质的荧光。 蛋白质的内源荧光 含有芳香族氨基酸(色氨酸(tryptophan ,Trp
分子影像研究中分子探针技术的应用的领域有哪些？
1.分子标的照影（molecular-targetingimaging）：其将所对感兴趣疾病蛋白质具有专一性结合力之抗体或胜肽，予以标誌萤光、冷光、放射核种、顺磁性物质及微气泡粒子作为分子探针（molecularprobe）并且搭配其互补照影系统如活体光学影像系统（invivoopticalima
应加速研制新一代分子探针
近日，香山科学会议第554次学术讨论会在北京召开。此次会议以“医学分子探针关键技术”为主题。与会专家认为，目前，我国对进口医学分子探针尚存依赖，为打破这一局面，应加速研制高特异性、高靶向性、智能化、高灵敏度的新一代分子探针。 为了更全面、更完整地获取生物体解剖结构水平、功能代谢水平和细胞分子水
蛋白质分子的组成
一、蛋白质的元素组成 单纯蛋白质的元素组成为碳50～55%、氢6%～7%、氧19%～24%、氮13%～19%，除此之外还有硫0～4%。有的蛋白质含有磷、碘。少数含铁、铜、锌、锰、钴、钼等金属元素。 各种蛋白质的含氮量很接近，平均为16%。由于体内组织的主要含氮物是蛋白质，因此，只要测定生物样
分子杂交RNA探针的技术特点及应用介绍
在DNA序列未知而必须首先进行克隆以便绘制酶谱和测序时，也常应用克隆。克隆探针一般较寡核苷酸探针特异性强，复杂度也高，从统计学角度而言，较长的序列随机碰撞互补序列的机会较短序列少，克隆探针的另一优点是，可获得较强的杂交信号，因为克隆探针较寡核苷酸探针掺入的可检测标记基因更多。但是，较长的探针对于靶序
新型分子影像探针助力卵巢癌精准诊治
卵巢癌是致死率最高的妇科肿瘤，绝大多数患者会经历复发，从铂敏感发展为铂耐药。因此，对于铂类敏感复发的治疗管理尤为重要。 近日，复旦大学附属肿瘤医院核医学科主任宋少莉教授团队和复旦大学附属肿瘤医院妇瘤科主任吴小华教授团队合作，在《欧洲核医学和分子成像杂志》（EJNMMI）在线发表论文，全球首次证实
分子杂交RNA探针的技术特点及应用介绍
RNA探针是一类很有前途的核酸探针，由于RNA是单链分子，所以它与靶序列的杂交反应效率极高。早期采用的RNA探针是细胞mRNA探针和病毒RNA探针，这些RNA是在细胞基因转录或病毒复制过程中得到标记的，标记效率往往不高，且受到多种因素的制约。这类RNA探针主要用于研究目的，而不是用于检测。例如，在筛
分子杂交CDNA探针的技术特点及应用介绍
cDNA（complementary DNA）是指互补于mRNA的DNA分子。cDNA是由RNA经一种称为逆转录酶（reversetranscriptase）的DNA聚合酶催化产生的，这种逆录酶是Temin等在70年代初研究致癌RNA病毒时发现的。该酶以RNA为模板，根据碱基配对原则，按照RNA的核
分子探针红外之—固体表面酸性的测定
本期给大家普及一种可以分析不同强度Lewis酸的分子探针红外光谱技术——乙腈红外光谱。相较于吡啶红外光谱，乙腈红外光谱技术略显“小众”。不过，作为一种吸附质红外光谱技术，它凭借自身的特点在一定程度上弥补了吡啶红外光谱的不足。特别是在面对一些需要精细解析表面酸强度的材料时，乙腈红外能很好地展现出它
“分子诊断万花筒”——新型双向置换荧光探针
随着化学合成核酸技术的不断发展，利用核酸探针进行相关研究已成为当今生物和医学领域常用分子生物学技术之一。核酸荧光探针则是对特定的核酸探针进行荧光基团标记，通过记录荧光信号的变化来分析和检测对应目标分子的一种核酸探针形式。作为最常用的信号转导媒介，核酸荧光探针具备分析灵敏度高、检测手段简单和对生物分子
蛋白质的内源性荧光与荧光探针
利用荧光光谱法研究蛋白质一般有两种方法。一是测定蛋白质分子的自身荧光(内源荧光)，另一种是当蛋白质本身不能发射荧光时，通过非共价吸附或共价作用向蛋白质分子的特殊部位引入外源荧光(也称荧光探针)，然后测定外源荧光物质的荧光。 蛋白质的内源荧光 含有芳香族氨基酸(色氨酸(tryptophan
JBC：分子伴侣帮助蛋白质折叠的分子机理
分子伴侣是一种协助蛋白质进行折叠的分子助手，其中一种伴侣分子是所谓的热激蛋白60（Hsp60），这种蛋白可以在线粒体中形成一种类似于“桶状”的结构，从而便于蛋白折叠过程的发生，近日刊登于the Journal of Biological Chemistry上的一篇研究论文中，来自弗莱堡大学的研究
球状蛋白质的分子特性
球状蛋白质分子形状接近球形，水溶性较好，种类很多，可行使多种多样的生物学功能。具有球形或近于椭球体分子形状的蛋白质之总称。是纤维状蛋白质的对应词。凡不属于纤维状蛋白质，而一般的单纯蛋白质（清蛋白、球蛋白等）和许多复合蛋白质均属于此类，与纤维状蛋白质相比，溶液的粘度低，流动双折射弱。
球状蛋白质的分子特性
球状蛋白质分子形状接近球形，水溶性较好，种类很多，可行使多种多样的生物学功能。具有球形或近于椭球体分子形状的蛋白质之总称。是纤维状蛋白质的对应词。凡不属于纤维状蛋白质，而一般的单纯蛋白质（清蛋白、球蛋白等）和许多复合蛋白质均属于此类，与纤维状蛋白质相比，溶液的粘度低，流动双折射弱。
蛋白质根据蛋白质分子的外形进行分类
1．球状蛋白质分子形状接近球形，水溶性较好，种类很多，可行使多种多样的生物学功能。2．纤维状蛋白质分子外形呈棒状或纤维状，大多数不溶于水，是生物体重要的结构成分，或对生物体起保护作用。3．膜蛋白质一般折叠成近球形，插入生物膜，也有一些通过非共价键或共价键结合在生物膜的表面。生物膜的多数功能是通过膜蛋
关于活性氧分子荧光探针标记法的应用
众所周知，氧气是生命运动过程中不可缺少的一种气体,而细胞使用氧气时会产生副产品，以高能氧气分子形式存在的废弃物质即为自由基。自由基会对人体组织和细胞结构造成损害，我们把这种损害称为氧化应激，人体在利用氧气过程中会加重自身的压力。活性氧(ROS)是含有氧的化学活性分子，ROS是需氧细胞在代谢过程中产生
Chemical－Society－Reviews：发表小分子荧光探针研究“指南综述”
近日，中国科学院上海药物研究所李佳团队联合华东理工大学贺晓鹏团队、英国巴斯大学Tony D. James团队，以及美国德克萨斯大学奥斯汀分校Jonathan L. Sessler团队，撰写“指南综述”（Tutorial Review）文章Small-molecule fluorescence-b