DNA搜索引擎MetaGraph研发成功
瑞士苏黎世联邦理工学院科学家在最新一期《自然》杂志上发表论文称，他们开发出一款名为MetaGraph的DNA搜索引擎，能快速、高效地检索公共生物学数据库中的海量信息，为研究生命科学提供了强大的专业工具。MetaGraph索引及大量DNA、RNA和蛋白质序列档案。图片来源：《自然》网站MetaGraph的研发，源于科学界对日益庞大的基因测序数据“用不好、找不着”的现实困境。过去几十年来，各类生物学数据库规模呈爆炸式增长，然而原始测序数据往往碎片化、噪声多、体量庞大，科学家难以直接从中高效提取有用信息。MetaGraph的核心突破在于采用数学中的“图结构”，将相互重叠的DNA片段智能联结。其原理类似于图书索引中将含有相同关键词的句子关联起来，形成知识网络。研究团队整合了7个公共资助数据库，构建出一个跨越病毒、细菌、真菌、植物、动物乃至人类的生命全谱系索引。该索引共涵盖1880万个独特的DNA与RNA序列集，以及2100亿个氨基酸序列......阅读全文
DNA搜索引擎MetaGraph研发成功
瑞士苏黎世联邦理工学院科学家在最新一期《自然》杂志上发表论文称，他们开发出一款名为MetaGraph的DNA搜索引擎，能快速、高效地检索公共生物学数据库中的海量信息，为研究生命科学提供了强大的专业工具。MetaGraph索引及大量DNA、RNA和蛋白质序列档案。图片来源：《自然》网站MetaGrap
新工具可轻松搜索世界已知10％的基因
一种功能类似于谷歌搜索的计算工具已经证明了它的前景——可以廉价且容易地搜索生物序列数据。开发该工具的瑞士团队表示，在一项原理验证研究中，他们利用该工具成功索引了10%世界已知DNA、RNA和蛋白质序列，同样的方法也可以用于完成其余部分。日前，该进展在预印本平台bioRxiv上公布。这款名为MetaG
新工具可轻松搜索世界已知10％的基因
一种功能类似于谷歌搜索的计算工具已经证明了它的前景——可以廉价且容易地搜索生物序列数据。开发该工具的瑞士团队表示，在一项原理验证研究中，他们利用该工具成功索引了10%世界已知DNA、RNA和蛋白质序列，同样的方法也可以用于完成其余部分。 日前，该进展在预印本平台bioRxiv上公布。这款名为M
谷歌向23对染色体进军－DNA搜索引擎暗暗轰鸣
网易探索4月23日讯，网络搜索巨头谷歌日前启动基因搜索研究和投资计划，有朝一日，也许网络的触角会伸向我们每一个人的身体。 你体内的DNA现在也成了“世界信息”的一部分，而谷歌正开始着手制定关于这些信息的游戏规则。2007年，谷歌顶着巨大压力向基因检测公司“23andMe”投资了440万美元。而这家
美国推出“材料计划”网络搜索引擎
据美国物理学家组织网近日报道，美国能源部劳伦斯伯克利国家实验室和麻省理工学院联合推出了一项名为“材料计划”的最新网络引擎，专门用于搜索查找各种材料的性质，能让来自大学、国家实验室和私人企业的科学家共享信息，以促进新材料和关键材料的研发。 “加速新材料的研发，能促进在清洁能源和公共消费产品领
振动筛与网络搜索引擎优化
近期在振动筛行业有许多号称专业优化网络公司的出现，直接影响和考验着搜索引擎的公平与合理性，不管你的振动筛站点是否，不管你的振动筛企业内容是否健全，不管你是否能提供给振动筛客户zui佳的产品，也不管你的企业是否有一定实力，只要你愿意出资金，便有大量的网络优化公司为你提供振动筛的排名服务。优化是网络行业
综合搜索引擎网站市场群雄逐鹿
根据中国互联网数据中心统计表明，中国综合搜索引擎格局正在发生深刻变化：搜索引擎市场第一阵营与第二阵营之间差距正在缩小，第二阵营两大竞争对手谷歌和搜搜不相伯仲。虽然谷歌仍以微弱优势领先，但腾讯搜搜以其较强大的用户群为基础，结合各种有效的网络推广方式，正在有力扩张用户市场份额。 今年第一季度，百度以较为
人工智能大举“入侵”科学搜索引擎
当前，互联网搜索引擎中出现了越来越多的人工智能（AI）聊天机器人，如谷歌的Bard、微软的Bing等。这似乎将要改变科学搜索引擎。 据《自然》报道，8月1日，荷兰出版业巨头爱思唯尔向其Scopus数据库的部分用户发布了一个基于ChatGPT的AI界面。当天，英国数字科学公司（Digital S
人工智能工具大举“入侵”科学搜索引擎
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/505983.shtm
全球微生物组大数据搜索引擎上线
日前，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心正式发布首个微生物组大数据搜索引擎——MSE（Microbiome Search Engine； http://mse.single-cell.cn），使得以整个微生物组为分析单元的智能搜索和大数据挖掘成为现实。 微生物组，又称“菌群”。
类似Google的蛋白功能搜索引擎研究进展
细胞通过成千上万控制其生长和分化的蛋白相互协作而发挥功能，关键蛋白功能失常常会导致疾病。目前已经有许多关于探索所有人类蛋白功能的大规模研究项目。最近，de Recherches Cliniques de Montréal (IRCM)研究所Benoit Coulombe博士率领的研究小组新发展了一套
加强互联网销售药品监管－重点监测搜索引擎
国家食品药品监管局、工业和信息化部、公安部、国家工商总局日前就进一步严厉打击利用互联网发布虚假药品信息和非法销售药品联合发出通知，明确从6个方面，加强对已审批的互联网药品信息服务和交易服务网站的日常监管。 通知指出，动态监测集中针对发布治疗糖尿病、高血压、肾病、风湿、痛风、性功能障碍、皮肤病等
百度、360搜索大战升级－搜索引擎市场或变局
8月中旬，周鸿祎宣布推出综合搜索业务后，搜索引擎市场领头羊百度的“太平”日子即将终结。 28日晚，百度低调反击360，趁夜“围堵”其搜索业务。昨天下午4点多，奇虎360发声明称要建设一个安全、干净、有效竞争的互联网搜索市场。百度有关负责人接
Enveda获6800万美元B轮融资，开发药物发现搜索引擎
近日，Enveda Biosciences宣布完成6800万美元的股权和债权融资。本轮融资由Dimension领投，多家新机构投资者的参与，包括FPV，Jazz Venture Partners，Level Ventures，Amino Collective，Allen & Co和Possi
类似－ChatGPT－的人工智能即将出现在主要科学搜索引擎中
人工智能驱动的会话式聊天机器人已经出现在互联网搜索引擎中，例如谷歌的 Bard 和微软的 Bing，看起来也将越来越多地改变科学文献搜索方式。8 月 1 日，荷兰出版巨头 Elsevier 为其 Scopus 数据库的部分用户发布了由 ChatGPT 支持的 AI 界面，而英国公司 Digita
OpenAI推出人工智能搜索引擎，和多家新闻出版商合作
人工智能开发机构OpenAI终于进入搜索引擎市场，正在推出由AI驱动的搜索引擎SearchGPT的测试版，可实时访问互联网上的信息。该产品引用的信息来源将包括新闻集团、美联社、《大西洋》月刊和Vox Media等商业合作伙伴的新闻。随着OpenAI的快速发展，该公司的运营成本也在不断增加。美国科技媒
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA序列测定3
2．利用末端转移酶和α-32P-ddNTP标记DNA的3ˊ-末端 在二价阳离子存在下，末端转移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羟基末端，如果作为底物的核苷酸经过修饰（如ddNTP），则可以在DNA的3ˊ-OH上仅加入一个核苷酸。对于双链DNA片段，亦存在DNA的两侧均被标记问题，可通过上述同
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA序列测定2
目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等（1977）提出的酶法（双脱氧链终止法）和Maxam（1977）提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭，但这两种方法都同样生成相互独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸，每组核苷酸都有共同的起点，却随机终止于一种（或多种）特定的残基，形成一系列以某一特定核苷酸
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA序列测定1
㈣ DNA聚合酶 如前所述，选用合适的DNA聚合酶进行测序反应也是保证测序质量的重要因素之一。常用于双脱氧末端终止法测序的有几种不同的酶： 1．大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ大片段（Klenow片段） 此酶是最早用于建立Sanger测序的酶。但通常会有两个问题：①Klenow片段的持续合成能力较
DNA重组技术(DNA－Recombination)
一、DNA 的酶切与连接（1）酶切反应：同质粒DNA 的鉴定，只不过是质粒DNA 换为载体DNA 。若大量酶切，则成比例增加。（2）加2倍体积的预冷无水乙醇和1/10体积的3mol/l NaAc混匀，-20℃2h以上。（3）15000rpm离心15min，弃上清。（4）加入75%乙醇洗涤2次，离心弃
百度退位！百度已不是中国第一大桌面搜索引擎
长久以来，百度不只是一个名词，它早已成为人们搜索内容时使用的动词，可见其影响力之大。不过，根据5月22日StatCounter的数据显示，百度已不是中国最大的桌面搜索引擎了。根据数据，到2023年4月，微软必应的份额再次创出历史新高，达到了37.4%，而百度的份额为26.32%。微软必应、搜狗、Ya
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA重组与鉴定2
（1）CaCl2处理以后的转化: 当细菌处于0℃、二价阳离子（如Ca2+、Mg2+等）低渗溶液中时，细菌细胞膨胀成球形，处于感受态；此时转化混合物中的DNA形成抗DNA酶的羟基-钙磷酸复合物粘附于细胞表面，重组DNA在42℃短时间热冲击后吸附在细胞表面，在丰富培养基中生长数小时后，球状细胞恢复原
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA重组与鉴定3
当多克隆位点有外源DNA片段插入时，破坏此酶的N端阅读框架，产生无α互补功能的N端片段，因此在带有外源DNA片段的细菌在含有IPTG/X-gal的培养基上呈白色，见图7-11 。如果外源DNA插入片段相当短，不破坏β-半乳糖苷酶的氨基端氨基酸序列的阅读框，有时产生的重组体菌落不呈白色而是呈浅蓝色。4
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA重组的载体1
载体（vector）是携带靶DNA（目的DNA）片段进入宿主细胞进行扩增和表达的运载工具。常用的载体是通过改造天然的细菌质粒、噬菌体和病毒等构建而成。目前已构建成的载体主要有质粒载体、噬菌体载体、病毒载体和人工染色体等多种类型，亦可根据其用途不同分为克隆载体和表达载体二类。载体的构建和选择应考虑以下
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA重组的载体2
二、噬菌体载体作为细菌寄生物的噬菌体，大多数具有编码多种蛋白质的基因，能利用宿主细胞的蛋白质合成体系，进行生长和增殖。构建的噬菌体载体，以λ噬菌体、M13和粘粒最为常用。㈠ λ噬菌体载体野生型λDNA是一种基因组为4.8 kb的线性双链DNA，全部序列已知，共编码50多个基因。其中约一半基因参与
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA重组的载体3
在作为载体时，这些噬菌体有一个很大的优点，即克隆到M13mp载体的外源DNA片段（双链），在子代噬菌体便成为了单链形式。故应用M13mp进行克隆，可方便地分离到大量含有外源DNA某一单链的DNA分子。这种单链DNA可在下列工作中作模板：①主要用作双脱氧链终止法进行DNA序列测定的模板；②制备仅有一条
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA重组与鉴定1
重组DNA是在体外用限制性内切酶，将不同来源的DNA分子进行特异地切割，获得的目的基因或DNA片段与载体重新连接，从而组成一个新的DNA杂合分子。重组的DNA分子能够通过一定的方式进入相应的宿主细胞，在宿主细胞中进行无性增殖，获得大量的目的基因或DNA片段，此过程称基因克隆。重组的DNA分子也能够在
DNA编码化合物库技术的学习和追踪“神器”——DELFinder
实际应用案例 近日，Scott E. Wolkenberg博士团队利用药明康德HitS事业部自主开发并运维的DELFinder搜索引擎和DELopen平台，顺利完成DEL相关领域论文的检索工作，并成功在《ACS Medicinal Chemistry Letters》杂志上发表论文。 近年来
DNA合成（DNA－synthesis－）技术介绍
蛋白质概念提出：DNA多肽合成（DNA synthesis ）：按照预定核苷酸的顺序，将脱氧核苷酸逐个进行人工连接合成DNA链的方法。目前多是采用固相合成法，即是在多聚体支持物上从3′端延伸核苷酸，可自动化操作。)目前，oligo DNA合成一般都采用固相亚磷酰胺三酯法合成DNA片段，此方法具有高效
数据标注优秀案例集之四十七－|－云藏搜索引擎藏文信息处理数据标注
云藏搜索引擎藏文信息处理数据标注 申报单位：海南藏族自治州藏文信息技术研究中心 推荐单位：青海省数据局 一、案例简介 藏文信息处理面临语言结构复杂、标注标准缺失、数字化资源不足等问题。本案例通过系统化数据标注技术，构建高质量藏文语料库，赋能藏文信息化行业，推动藏文自然语言处理技术的进步和实用