我国科学家利用多组学解析小麦穗器官发育调控网络

近日,中国科学院植物研究所研究员郭自峰团队与合作者,通过多组学整合系统揭示了小麦穗器官发育的关键遗传与代谢调控网络。相关研究成果发表于《植物细胞》(Plant Cell)。小麦穗部的发育是决定籽粒大小和数目等产量性状,其发育调控机制涉及复杂的遗传与代谢过程。长期以来,穗发育过程中基因表达动态、代谢变化及其相互作用机制尚不明确。研究团队通过整合代谢组学与转录组学数据,对小麦穗器官发育的12个发育阶段进行了系统解析,共检测到1105种代谢物,包括穗、小穗及小花等233个组织样品。研究发现,与植物激素相关的代谢物在穗部不同组织间分布极不均衡。进一步的外源激素处理实验证实,植物激素在穗形态建成过程中发挥重要调控作用。基于子房的高分辨率时空组学数据,研究人员构建了小麦子房发育的调控网络,鉴定出一批关键基因,包括TaOPR3、GL1和GL2等。这些基因在籽粒大小调控中发挥重要作用。基因组水平的分析揭示,这些关键基因的单倍型存在明显的地理分化......阅读全文

我国科学家利用多组学解析小麦穗器官发育调控网络

近日,中国科学院植物研究所研究员郭自峰团队与合作者,通过多组学整合系统揭示了小麦穗器官发育的关键遗传与代谢调控网络。相关研究成果发表于《植物细胞》(Plant Cell)。小麦穗部的发育是决定籽粒大小和数目等产量性状,其发育调控机制涉及复杂的遗传与代谢过程。长期以来,穗发育过程中基因表达动态、代谢变

水稻多器官单细胞多组学图谱问世

  记者杨舒从中国农业科学院生物技术研究所获悉,该所作物耐逆性调控与改良创新团队日前联合国内外研究机构,构建了首个水稻的多器官单细胞多组学图谱,系统解析了水稻不同细胞类型的功能及其对复杂性状的调控作用,有力助力水稻设计育种。相关研究成果近日发表在国际学术期刊《自然》上。  单细胞组学是近年来生命科学

遗传发育所鉴定出小麦穗发育的转录调控因子

  小麦是重要的粮食作物之一。小麦的产量主要由亩穗数、千粒重和穗粒数决定。穗型结构影响小麦的小穗数、穗粒数和产量,是育种改良地重要的选择性状。挖掘小麦穗发育重要调控因子与解析分子调控机制,对小麦穗型的分子设计与精准改良、突破产量瓶颈具有重要意义。由于小麦功能基因组学发展较晚,穗发育关键基因挖掘及作用

Cell:构建出可以研究人类小胶质细胞发育功能器官模型

小胶质细胞位于人类免疫系统和大脑的交汇处,是一种专门的大脑免疫细胞,在发育和疾病中发挥着至关重要的作用。尽管小胶质细胞的重要性是无可争议的,但对它们进行建模和研究仍然是一项艰巨的任务。与一些可以在体外或非人类模型中研究的人类细胞不同,当将人类小胶质细胞从人脑环境中移除时,很难对它们进行研究。为了克服

申小涛等人开发基于微量血样多组学精准健康监测平台

  静脉穿刺取血的成本较高并具有高侵入性,因此在临床或研究中研究血液生物标志物仍然具有很大的挑战性。此外,现有的医疗实践大多是“被动”的,仅基于有限的生理和临床信息,且通常很难做到高频率连续收集,往往只能数月或数年才收集一次。  近日,来自斯坦福大学的研究团队建立了一种从微量取血并从其中采集多组学数

成都生物所定位新的小麦穗发育调控基因

  小麦(Triticum aestivum L.)是重要的粮食作物之一,随着世界人口增多、耕地面积减少以及气候变化,提升小麦产量是育种的重要目标。小麦穗主要由附着于穗轴两侧交替互生的小穗构成。小穗进一步分化成数目不定的小花,其中3-5朵小花能最终形成籽粒。因此,小麦穗型的发育与籽粒产量密切相关。挖

重新理解衰老,华大通过多组学发现不同器官有不同年龄

我们有时会发现,一个人看起来比实际年龄沧桑很多,但衰老不仅仅显现在皮肤表面上。事实证明,即使在我们的皮肤之下,我们的各种器官和系统也可能有不同的年龄。2022年3月9日,深圳华大生命科学研究院主导的一项多组学研究发表在国际行业期刊Cell Reports,研究团队利用多组学生物指标开发了测量各种器官

类器官发育指标首次定义

  近日,德国和奥地利的联合科研团队首次定义了器官发育的指标,揭示了组织中三维结构的连通性和结构的出现之间的联系,将有助于科学家设计模仿人体器官的自组织组织。  人体器官具有复杂的充满液体的管路和环路网络。它们具有不同的形状,并且不同器官的三维结构彼此之间的连接也不同。这方面的一个例子是肾脏的分支网

麦穗形态测量仪测量麦穗形态

    小麦品种的优劣和生长情况一般可以通过外部特征体现,其中穗部特征参数尤为重要,农业研究人员通常会对这个部位进行观察测量,而且穗部参数与小麦最终的产量也有着直接关系    现有的穗长测量仪器还是以直尺或卷尺为主,测量时芒的两端端点和穗的颈节点准确位置不易掌控,容易造成误差。而小穗数的计算主要是通

心脏类器官可模拟胚胎心脏发育

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517628.shtm

发育生物学

In Vitro Production of Bovine Embryos (P.J. Hansen Lab, Dept. of Animal Sciences, University of Florida)This protocol describe procedures for in vitro

首个菊科多组学数据平台AMIR发布

10月8日,华中农业大学果蔬园艺作物种质创新与利用全国重点实验室、药用植物资源可持续利用团队梅之南教授和杨庆勇教授课题组,发布了首个专门面向菊科植物的多组学数据库平台——Asteraceae Multi-omics Information Resource(AMIR)。该平台涵盖了74种菊科植物的多

中药多组学研究取得重大突破

  中药材基因资源是国家战略资源,其挖掘、保护和利用是中药资源可持续发展的首要关键。近期,中国中医科学院中药研究所团队基于多组学技术成功揭示了紫苏、黄连、大青叶等药用植物的基因遗传背景,相关研究成果以三篇研究论文形式连续发表在国际著名权威学术期刊《自然通讯》上,引起了国际学术界对我国中药应用基础性研

中药多组学研究取得重大突破

  中药材基因资源是国家战略资源,其挖掘、保护和利用是中药资源可持续发展的首要关键。近期,中国中医科学院中药研究所团队基于多组学技术成功揭示了紫苏、黄连、大青叶等药用植物的基因遗传背景,相关研究成果以三篇研究论文形式连续发表在国际著名权威学术期刊《自然通讯》上,引起了国际学术界对我国中药应用基础性研

麦穗茅根的

  产自广东、海南、江苏(连云港)、台湾(系根据Bor,1960的记载,分布于印度、斯里兰卡、缅甸、泰国、马来西亚等国。此种的不连续分布与侯鸟携带南北迁移有关。

首例六基因编辑猪猴多器官多组织同期联合移植

异种移植技术要大规模进入临床应用,还需要更长时间、更谨慎的观察探索。作为一项新兴的科学技术,异种移植是人类探索生命科学奥秘的有效手段和模型,尤其如果能彻底地突破该技术,将打开人类免疫新纪元,从长远发展来看,有利于科学发展和人类进步。 10月25日,空军军医大学西京医院宣布,由中国科学院院士、该院

我国科研团队揭示灵长类多组织器官妊娠期代谢适应

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517077.shtm

麦穗形态测量仪实现麦穗形态特征的无损测量

    对于有经验的农民来说,可以从小麦的外观来看出小麦的生长状况,因此说明,小麦品种的优劣和生长状态是可以通过外部特征表现出来的,尤其是小麦穗部的特征参数尤为重要。对于育种专家而言,也常常是利用麦穗形态测量仪来测量小麦的穗部特征,为小麦的育种工作开展提供育种材料。    传统的芒长和穗长测量主要

简述牛磺酸对免疫器官发育的影响

  胸腺、脾脏是动物的主要免疫器官,参与机体的体液免疫和细胞免疫;法氏囊是家禽特有的体液免疫中枢器官。胸腺指数、法氏囊指数和脾脏指数反映了机体3个主要免疫器官的生长发育程度,是从免疫器官发育的角度评价机体免疫状态的主要指标。牛磺酸是猫的必需氨基酸,因而猫是研究牛磺酸理想的动物模型。Schuller等

首个免疫衰老多组学数据库设立

记者12月17日从中国科学院基因组所(国家生物信息中心)了解到,该所研究员张维绮团队、鲍一明团队与中国科学院动物研究所研究员刘光慧、曲静研究组合作,建立了免疫衰老领域首个多组学数据库Immunosenescence Inventory,旨在为整合和分析与免疫衰老相关数据提供一体化平台。随着全球人口老

Illumina完成收购SomaLogic,强势整合多组学版图

  美通社消息,2026年1月30日 ,Illumina公司(纳斯达克股票代码:ILMN)今日宣布,已完成对数据驱动的蛋白质组学技术领导者SomaLogic的收购。此次收购将高度互补的蛋白质组学能力纳入Illumina的多组学产品组合,加强客户大规模获取蛋白质组学洞察的途径,以助力加速药物发现并对医

CASMS分论坛:多组学整合与大数据

  分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日,首届美国华人质谱学会(CASMS)学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。在13日“Multi-omics Integration and Big Data”分论坛中,哈沃德医学院Steven Gygi博士、太平洋西北国家实验

解析肿瘤HiC多组学研究策略

Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S

单细胞多组学高通量测序平台(二)

虽然single-cell sequencing的方法仍在不断推出,但是目前使用最为广泛、商业化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系统。1.2以RNA-seq为例介绍高通量单细胞测序技术单细胞测序的最主要难点是如何在短时间内分离得到最可能多的单个细胞,早期的技术代表F

单细胞多组学高通量测序平台(一)

一单细胞多组学高通量测序技术简介通过测序手段检测细胞多层次信息,如基因组、表观组、转录组甚至蛋白组已经成为生物学研究的重要手段。几乎一切生命体的活动都围绕着DNA->RNA->蛋白质的过程,而现有的组学技术也围绕这一过程获取信息(如DNA层面的基因序列),从而解读生物体运行机制,应用于疾病的诊断和治

植物多组学比较和进化研究平台发布

近日,西北农林科技大学生命科学学院马闯教授团队发布了植物多组学数据跨物种比较和进化研究的在线分析平台,相关成果发表在Molecular Biology and Evolution上。进化是植物性状遗传多样性和适应生存环境的基础,而基因变异是物种进化的源动力。随着后基因组时代高通量技术的发展和应用,在

动物所等揭示灵长类多组织器官妊娠期代谢重编程

妊娠对于女性而言,是重要且具有挑战的过程。然而,并非所有孕妇都能够正常度过十月怀胎并产下健康婴儿。较多孕妇在妊娠过程中易患各种疾病,如妊娠期高血压、子痫前期、妊娠期糖尿病等。这些疾病会引起孕妇多种组织器官的功能障碍,导致不良妊娠结局,严重时甚至导致孕妇或胎儿死亡。因此,研究正常妊娠过程孕妇多种组织器

科学家拍摄器官发育三维影片

  如果你曾想了解一个小鼠胚胎如何形成内脏,那么这就是为你而拍的电影。  该动画通过对一个胚胎的薄切片成像,随后再将这些图像堆叠,从而制作出一部三维电影(如上图)。影片的摄制者、澳大利亚莫纳什大学的发育生物学家Ian Smyth指出:“如果你仔细观察,可以看到发育

空间多组学质谱技术研讨会(2023)

  空间多组学技术结合了组学技术(如基因组学、转录组学、蛋白质组学、金属组学等)和组织学技术,有助于更好地理解生物体内各种生物分子与金属元素在空间上的分布、相互作用及其对生理功能和疾病发生发展的影响。  质谱成像技术是近年来快速发展的空间多组学技术之一,可以在组织的空间层面上同时测定多种生物分子(如

多组学研究助力玉米种质资源创新利用

近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联