我国科学家利用多组学解析小麦穗器官发育调控网络

近日,中国科学院植物研究所研究员郭自峰团队与合作者,通过多组学整合系统揭示了小麦穗器官发育的关键遗传与代谢调控网络。相关研究成果发表于《植物细胞》(Plant Cell)。小麦穗部的发育是决定籽粒大小和数目等产量性状,其发育调控机制涉及复杂的遗传与代谢过程。长期以来,穗发育过程中基因表达动态、代谢变化及其相互作用机制尚不明确。研究团队通过整合代谢组学与转录组学数据,对小麦穗器官发育的12个发育阶段进行了系统解析,共检测到1105种代谢物,包括穗、小穗及小花等233个组织样品。研究发现,与植物激素相关的代谢物在穗部不同组织间分布极不均衡。进一步的外源激素处理实验证实,植物激素在穗形态建成过程中发挥重要调控作用。基于子房的高分辨率时空组学数据,研究人员构建了小麦子房发育的调控网络,鉴定出一批关键基因,包括TaOPR3、GL1和GL2等。这些基因在籽粒大小调控中发挥重要作用。基因组水平的分析揭示,这些关键基因的单倍型存在明显的地理分化......阅读全文

空间多组学质谱技术研讨会(2023)

  空间多组学技术结合了组学技术(如基因组学、转录组学、蛋白质组学、金属组学等)和组织学技术,有助于更好地理解生物体内各种生物分子与金属元素在空间上的分布、相互作用及其对生理功能和疾病发生发展的影响。  质谱成像技术是近年来快速发展的空间多组学技术之一,可以在组织的空间层面上同时测定多种生物分子(如

多组学研究助力玉米种质资源创新利用

近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联

多组学研究助力玉米种质资源创新利用

  近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。   农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联分析(GWAS)是通过推断

单细胞多组学整合技术有了新突破

近日,军事科学院军事医学研究院应晓敏团队在国际著名学术期刊《自然·生物技术》以Article类长文形式在线发表重大原创研究成果。该团队自主研发的用于单细胞多组学数据马赛克整合的人工智能算法取得新突破。细胞是生物体内发挥功能的基本结构单元。单细胞测序技术是近年来生命科学领域的突破性技术,能够检测单个细

多组学手段揭示苦荞“不怕冷”的奥秘

苦荞       董玉梅摄低温胁迫是影响植物生化、分子、代谢调控的主要环境因素之一。长期在暴露于低温而引导植物胁迫耐受性的提高,即耐寒性或冷驯化。阐明植物对低温响应的分子机制对育种和基因发掘至关重要。有研究表明苦荞可以通过增加花色苷和原花青素的积累增强其耐寒性。苦荞的每个器官几乎都含有芦丁,包括种子

P4-China-2016多组学与系统生物学论坛

  自从精准医学概念提出以来,它一直都是全球最热的研究领域,政府的大力支持也了推动精准医疗行业的蓬勃发展。对于任意一项划时代的大工程而言,基础科研永远是其第一驱动力。P4 China 2016 多组学与系统生物学论坛,从系统生物学出发,对生物信息学与生命组学技术进行了深入探讨,并分享了科研成果应用于

动物所等建立衰老生物学多组学数据库

  随着人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题。近年来,随着衰老相关研究成果的不断增多以及高通量测序技术的日益发展,衰老相关多组学数据层出叠见。然而,目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。  中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组,与北京基因组研

P4-China-2016多组学与系统生物学论坛

  P4 China 2016国际精准医疗大会将于2016年12月16-18日于北京召开,由中国生物工程学会,上海商图信息咨询有限公司(BMAP)等多家单位联合举办。峰会将会邀请近60位演讲嘉宾,预计近800位精准医疗行业与临床科研资深人士与会。  个体化精准诊疗医学是近年卫生保健领域发展最广泛、最

研究人员建立衰老生物学多组学数据库

  随着人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是亟待解决的社会问题和科学问题。近年来,随着衰老相关研究成果的不断增多和高通量测序技术的日益发展,衰老相关多组学数据层出叠见。然而,目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。  中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组,与北京基因组研究所(

遗传发育所等在小麦穗型调控分子模块解析中获新进展

  小麦是世界上最重要的粮食作物之一,在我国粮食安全中发挥着重要作用。如何提高小麦产量是小麦研究与育种中长期以来的热点与难点问题。小麦穗分枝等穗型性状是单株产量的重要决定因素,也是小麦选育的关键农艺性状之一。然而,小麦是异源六倍体,基因组庞大复杂,约是水稻的34倍、大豆的16倍、玉米的7倍、大麦的3

麦穗茅根的形态特征

  一年生草本。须根细而柔韧。秆丛生,高25-75厘米,基部通常倾斜。叶鞘无毛,通常短于节间;叶舌膜质,长不及0.5毫米;叶片卵状或长卵状披针形,长2-4厘米,宽4-7毫米,两面无毛,边缘上部稍粗糙,下部常疏生纤毛,基部略呈心形而抱茎。穗形总状花序细柱形,直立或稍弯曲,长10-20厘米,宽1-1.5

新开发心脏类器官系统可模拟胚胎心脏发育

  美国科学家开发了一种人类心脏类器官系统,可以模拟妊娠期糖尿病样情况下的胚胎心脏发育。这些类器官涵盖了在小鼠和人类妊娠期糖尿病引起的先天性心脏病的特征。研究表明,内质网应激和脂质失衡是导致这些疾病的关键因素,使用omega-3可以改善这些疾病。相关研究近日发表于《干细胞报告》。  “采用基于干细胞

灵长类原肠胚期至早期器官发育转录组图谱绘制

  安徽医科大学国家卫生健康委配子及生殖道异常研究重点实验室教授蒋祥祥,与中科院动物研究所王红梅、郭帆团队,美国得克萨斯大学西南医学中心吴军团队合作,绘制了食蟹猴CS8-CS11时期(E20-E29)胚胎的单细胞转录组图谱。相关研究成果近日发表于《自然》。  上世纪早期,科学家将人类胚胎发育的前60

What肠道微生物菌群能够促进器官发育?

   肠道是一个复杂的生态系统,也是多种寄生微生物与动物宿主微生物之间相互共生的地点。动物的宿主微生物菌群能够促进动物胃肠道发育的作用已经不容置疑。 然而,动物体内的寄生微生物菌群对消化器官发育所产生的影响仍然难以捉摸。 在本文中,研究人员Hill 等人提出肠道微生物菌群在斑马鱼早期幼鱼发育过程中,

三维光刻打印重现器官真实发育过程

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506557.shtm

类器官常用小分子及应用文献汇总

小分子(small molecules)是指分子量小于1000道尔顿(尤其小于400道尔顿),并具有生物学功能的化合物。此类化合物与细胞因子和蛋白不同,其可直接穿过细胞膜进入细胞,进而发挥相应的功能,适用于各种属的细胞。小分子化合物的作用靶点众多,已广泛应用于干细胞,类器官,免疫学,神经生物

科学家合作构建再生生物学多组学数据库

  随着细胞重编程、基因编辑、合成生物学、高通量测序等技术的快速发展,再生生物学进入前所未有的蓬勃发展时期,助力解决组织替代、功能修复、衰老干预、疾病治疗等一系列生命医学领域的重要科学难题。面对科学数据的爆炸式增长,亟需建立以再生生物学为核心的开放数据库,以存储世界范围内的组学研究数据为基础,推动再

研究团队部合作建立衰老生物学多组学数据库

  随全球人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题.近年来,随衰老相关研究成果不断增多及高通量测序技术日益发展,衰老相关多组学数据逐渐增多.然而目前,尚缺乏一个综合性的、整合衰老生物学多组学数据的数据资源库.  中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)研究员鲍一明研

2025蛋白质组学大会之蛋白质组学与多组学的融合

  本次分论坛以“Proteomics Marries Other Omics(蛋白质组学与多组学的融合)”为主题,围绕蛋白质组学在疾病机制研究、代谢重编程、肿瘤学与免疫学中的最新应用展开。会议旨在探讨蛋白质组学与代谢组学、转录组学等多组学技术的深度融合与交叉创新,为精准医学与系统生物学的发展提供新

科学家开发出新型空间多组学技术

  5月25日,中国科学院广州生物医药与健康研究院彭广敦课题组在《自然-方法》(Nature methods)上,发表了题为Simultaneous profiling of spatial gene expression and chromatin accessibility during mou

多组学数据库“齐聚荟”-助力油菜“全能”竞技

油菜产业集观赏、蜜源、生态、经济作物等多种功能于一身,是新兴的“全能选手”。围绕油菜,我国科学家近年来实现了从理论、技术、产品到转化的链式创新,推动了我国油菜基础研究与应用步入世界第一方阵。 然而,如何将基础研究中长期积累的资源和多组学数据优势转化成育种优势,仍是当前乃至未来很长一段时期油

犬科动物多组学资源库iDog-2.0建立

近日,国家生物信息中心研究员赵文明团队与昆明动物研究所副研究员柳延虎团队合作,发布犬科动物多组学资源库iDog 2.0,提供了更加全面的多组学数据资源及更加丰富的在线分析工具,为全球犬类研究者提供更高质量的数据服务。家犬是自然界中种内遗传多样性最为丰富的物种之一,也是研究人类遗传性疾病的重要动物模型

布鲁克质谱:拓展多组学研究边界-推动临床转化

  --布鲁克中国区经理何磊先生专访  分析测试百科网讯,自2017年推出timsTOF以来,布鲁克每年都在为科学家们带来创新的产品,今年六月就推出了第二代timsTOF Pro 2和单细胞蛋白质组研究平台timsTOF SCP。布鲁克质谱中国区业务快速增长,不仅来源于创新的产品,也同中国团队的努力

多组学大数据与医学发展论坛在南宁召开

7月2-3日,多组学大数据与医学发展论坛在广西南宁召开,主题为“多组学大数据促进生物医药创新发展”。论坛围绕基因等多组学大数据整合与标准化、新药靶点挖掘、数据安全与隐私保护,数据可视化与交互、基因大数据伦理与法律问题、医药产业转化等领域的现状与未来发展,展开跨学科学术研讨。论坛坚持学术为本的原则,组

研究揭示小胶质细胞发育的调控机制

  小胶质细胞是脑中固有的免疫细胞,是脑中重要的免疫防线,保护大脑免受病毒细菌的入侵和破坏。小胶质细胞也在大脑的损伤、炎症和神经退行性疾病方面扮演着重要角色。小胶质细胞除了在成年生理病理条件下发挥作用外,还在脑发育的整个阶段都发挥着重要作用。小胶质细胞的这些重要作用与其在胚胎大脑皮层中特定的时空分布

大咖云集,共襄单细胞多组学及空间组学线上峰会

  2009年,第一篇单细胞mRNA测序的文章的发表,标志着单细胞转录组测序的时代正式来临。2013年,单细胞测序技术被《Nature Methods》评为年度技术。同年,《Science》将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首,认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。  目前,基于单细胞技

GCMS+多组学软件包高效开展合成生物学代谢途径分析

 合成生物学领域是备受关注的新兴领域。通过设计和构建新的生物系统,或者改造现有的生物系统,合成生物技术能够实现生物体的功能改造和新功能的创造。合成生物学在医药领域具有巨大的应用潜力。通过合成基因组和基因编辑技术,设计特定的药物合成途径,并改造微生物,使其能够高效地生产药物及中间体。这对于药物开发和生

大咖云集,共襄单细胞多组学及空间组学线上峰会

  2009年,第一篇单细胞mRNA测序的文章的发表,标志着单细胞转录组测序的时代正式来临。2013年,单细胞测序技术被《Nature Methods》评为年度技术。同年,《Science》将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首,认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。  目前,基于单细胞技

综述推荐|-多维单细胞技术解析器官发育与维持

  近年来,依靠表观遗传组学、转录组学、细胞谱系示踪和高通量mRNA分子原位分析等技术在单细胞分辨率上的突破,研究人员对脊椎动物器官发育与维持过程中细胞与分子机制的解析取得了一系列重大进展【1-3】。目前,运用各种先进的单细胞分析技术,研究人员可以从细胞图谱绘制(cell atlas profili

人类胃器官早期发育机制与体外重构研究获突破

清华大学副教授邵玥团队与合作者利用人多能干细胞,首次在体外培养出一种包含胃底和胃窦双极分布的胃器官发育模型,破解了WNT信号梯度悖论,建立了微尺度组织定向组装技术,可对类胃囊中不同谱系的组织模块独立开展基因编辑。相关研究成果近日发表于《自然》。胃是人体内结构精密的消化器官。在胃部结构中,胃底和胃窦两