研究揭示链过氧化合物生物合成的酶学基础
过氧化合物是临床药物与活性天然产物中的明星分子。但温和条件下通过酶催化构建高选择性O–O共价键，仍是生物催化领域悬而未决的问题。目前，仅有少数能催化环内过氧键形成的酶被鉴定，而链过氧化合物的生物合成酶学机制尚未被阐明。近日，中国科学院微生物研究所揭示了链过氧化合物——氧蒽酮霉素（oxanthromicin）中过氧键构建的酶学基础。研究以来源于链霉菌与马杜拉放线菌的oxanthromicin天然对映异构体为研究对象，结合生物信息学分析、体内基因敲除与回补、体外生物合成途径重构等方法，鉴定出两个生物合成基因簇oxa及otn，并挖掘出两种高度同源的黄素依赖酶OxaJ和OtnJ。这两种酶可分别催化oxanthromicin生物合成过程中对映选择性的链过氧键形成。研究进一步发现，OxaJ与OtnJ中存在一段保守的β-loop-β结构基序。该基序通过阻挡NADPH进入酶活性中心，发挥“氧化还原门控”功能，从而驱动过氧键的形成；删除该保守结构......阅读全文
研究揭示链过氧化合物生物合成的酶学基础
过氧化合物是临床药物与活性天然产物中的明星分子。但温和条件下通过酶催化构建高选择性O–O共价键，仍是生物催化领域悬而未决的问题。目前，仅有少数能催化环内过氧键形成的酶被鉴定，而链过氧化合物的生物合成酶学机制尚未被阐明。近日，中国科学院微生物研究所揭示了链过氧化合物——氧蒽酮霉素（oxanthromi
萜类化合物的生物合成方法
在生物体内，萜类化合物是由乙酰辅酶A转化而来的。首先乙酰辅酶A和二氧化碳结合转化为丙二酰辅酶A，后者再和一分子的乙酰辅酶A形成乙酰乙酰辅酶A，这个中间体再和一分子乙酰辅酶A进行羟醛缩合反应，就得到一个六碳中间体，然后还原水解，产生萜的生物合成前体，3-甲基-3，5-二羟基戊酸。经过腺苷三磷酸（ATP
利用“微生物细胞工厂”高效生物合成抗肿瘤活性化合物
中国医学科学院药物研究所朱平研究团队利用“微生物细胞工厂”高效生物合成具有良好抗肿瘤活性的达玛烯二醇-Ⅱ糖苷，该成果近期作为杂志封底图片发表于国际著名期刊《Green Chemistry》，论文标题为 “Construction and Optimization of Microbial Cel
链霉菌抗生物素蛋白过氧化物酶连结法
SP（streptavidin-perosidase）法，即链霉菌抗生物素蛋白-过氧化物酶连结法。按标记物质的种类，如荧光染料、放射性同位素、酶（主要有辣根过氧化物酶和碱性磷酸酶）、铁蛋白、胶体金等，可分为免疫荧光法、放射免疫法、酶标法和免疫金银法等。按染色步骤可分为直接法（又称一步法）和间接法（二
单链－cDNA－的合成实验
一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水10XRT-PCR 缓冲液（去除 RNA 酶的双蒸水，100 mmol/LTris-HCl、pH8.3，500 mmol/LKC1,15 mmol/LMgCl2)2. 酶和酶缓冲液MMLV 逆转录酶（100~200U/ul)SUPERaseIN
单链－cDNA－的合成实验
本方案利用的是总RNA，因为如果使用18SrRNA作内对照，在后续实验中就不能使用带poly(A)的RNA。并且必须用DNA酶处理RNA，以去除所有污染的基因组DNA。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。实验步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水10X
单链－cDNA－的合成实验
实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂去除 RNA 酶的双蒸水10XRT-PCR 缓冲液（去除 RNA 酶的双蒸水，100 mmol/LTris-HCl、pH8.3，500 mmol/LKC1,15 mmol/LMgCl2)2. 酶和酶缓冲液
甲醇生物转化可高效合成萜类化合物
近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员周雍进团队在甲醇生物转化研究方向取得新进展。研究团队以多形汉逊酵母为宿主，构建并优化倍半萜β-法尼烯的生物合成，实现以甲醇为唯一碳源高效合成β-法尼烯。相关成果发表在《代谢工程》上。 β-法尼烯可用于制备生物燃料、维生素E和橡胶材料。目前，其来源主要从植
甲醇生物转化可高效合成萜类化合物
近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员周雍进团队在甲醇生物转化研究方向取得新进展。研究团队以多形汉逊酵母为宿主，构建并优化倍半萜β-法尼烯的生物合成，实现以甲醇为唯一碳源高效合成β-法尼烯。相关成果发表在《代谢工程》上。合成过程。大连化物所供图β-法尼烯可用于制备生物燃料、维生素E和橡胶材料。目前
什么是开链族化合物？
有机化合物的数目庞大，结构复杂。但有机化合物的结构和性质是密切相关的。将有机化合物按照分子结构中的骨架和官能团进行分类，就可使数百万种有机化合物各有归属。这种建立在结构基础上的分类系统，有助于阐明有机化合物的结构、性质以及它们之间的相互联系，也有助于有机化学这门学科的学习、研究和发展。按照碳链结合方
我国学者在长链α烯烃生物合成研究取得新进展
近日，我所合成生物学与生物催化创新特区研究组周雍进研究员与瑞典查尔姆斯理工大学Jens Nielsen教授合作，通过构建酵母细胞反应器，高效的合成出了长链α-烯烃。相关研究成果发表于合成生物学领域杂志《美国化学会—合成生物学》（ACS Synthetic Biology, 2018, DOI:
微生物所等解析出青蒿素类过氧桥键的生物合成机制
自然界中含有过氧桥键的化合物具有多种生物活性，包括抗感染、抗肿瘤、以及抗心律失常，其中最具代表性的青蒿素（artemisinin)已经作为抗疟疾药物应用于临床近40年。我国学者屠呦呦近日也因青蒿素研究工作共同获得2015年诺贝尔生理学或医学奖。美国加州大学伯克利分校教授Jay Keas
成都生物所在合成有机亚砜化合物方面取得新发现
反应过程 有机亚砜作为一种关键结构单元，不仅存在于许多重要药物分子中，而且在不对称催化反应领域也是一种被广泛使用的配体。对该类化合物的合成主要是硫化物的氧化和有机金属亲核试剂与亚磺酸酯进行亲核加成反应得到，但所用金属试剂昂贵且反应条件相当苛刻，如强碱、低温等，大多数反应的结果也不
反转录合成单链－cDNA－实验
cDNA 合成反应的体积，依赖于所用的锚定-任意引物组合的数目。下面提供的方案，适用于 24 个引物组合和两个样品。对于更多的样品和/或更多的引物组合，调整相应主体混合液的体积。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。试剂、试剂盒RNART主体混合液仪器、耗材薄壁PCR管离心管
反转录合成单链－cDNA－实验
试剂、试剂盒 RNART主体混合液仪器、耗材 薄壁PCR管离心管热循环仪实验步骤 一、材料1.核酸和寡核苷酸来自方案2的RNA为每个单独的H-T11M引物，分别配制RT主体混合液蒸馏水 28.2ul5XRT缓冲液
反转录合成单链－cDNA－实验
试剂、试剂盒 RNA RT主体混合液 仪器、耗材 薄壁PCR管 离心管 热循环仪
中科院大连化物所长链α烯烃生物合成研究取得新进展
近日，大连化物所合成生物学与生物催化创新研究团队周雍进研究员与瑞典查尔姆斯理工大学Jens Nielsen教授合作，通过构建酵母细胞反应器，高效的合成出了长链α-烯烃。相关研究成果发表于合成生物学领域杂志《美国化学会—合成生物学》上。 长链（C12―C20）α-烯烃（long-chain
糖资源生物基平台化合物合成方面获新进展
近日，广东省科学院生物与医学工程研究所糖资源生物团队在糖资源生物基平台化合物合成研究方面取得新进展。相关成果发表于《化学工程杂志》（Chemical Engineering Journal）。生物基能源化学品替代传统石油基化学品是解决当前过度利用化石燃料引起生态及环境问题的理想途径，对经济社会的可持
大连化物所发表生物合成碳氢化合物综述文章
近日，中国科学院大连化学物理研究所合成生物学与生物催化创新特区研究组（18T6）研究员周雍进与瑞典查尔姆斯理工大学教授Jens Nielsen、Eduard Kerkhoven联合发表综述文章，探讨了生物化工路线制备生物能源碳氢化合物的最新进展、机遇与挑战。该综述发表在能源期刊《自然-能源》（N
糖资源生物基平台化合物合成方面获新进展
近日，广东省科学院生物与医学工程研究所糖资源生物团队在糖资源生物基平台化合物合成研究方面取得新进展。相关成果发表于《化学工程杂志》（Chemical Engineering Journal）。 生物基能源化学品替代传统石油基化学品是解决当前过度利用化石燃料引起生态及环境问题的理想途径，对经济社
大连化物所发表生物合成碳氢化合物综述文章
近日，中国科学院大连化学物理研究所合成生物学与生物催化创新特区研究组（18T6）研究员周雍进与瑞典查尔姆斯理工大学教授Jens Nielsen、Eduard Kerkhoven联合发表综述文章，探讨了生物化工路线制备生物能源碳氢化合物的最新进展、机遇与挑战。该综述发表在能源期刊《自然-能源》（N
体外转录合成单链RNA探针
实验方法原理 制备特异性的单链 RNA 探针不仅比 DNA 探针更容易，在杂交反应中一般也比具相同比活性的 DNA 探针产生更强的信号，这可能是由于含有 RNA 的杂合链固有的更高稳定性的缘故（Casey and Davidson 1977)。虽然 DNA 探针仍普遍地应用于 Norther
cDNA第一链的合成的方法
所有合成cDNA第一条链的方法都要用依赖于RNA的DNA聚合酶(反转录酶)来催化反应，主要有两个关键因素，一个是mRNA模板，另一个是反转录酶 。商品化反转录酶有从禽类成髓细胞瘤病毒纯化到的禽类成髓细胞病毒（AMV）逆转录酶和从表达克隆化的Moloney鼠白血病病毒反转录酶基因的大肠杆菌中分离到的鼠
双链DNA探针随机引物合成法
随机引物合成双链探针是使寡核苷酸引物与DNA模板结合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探针。合成产物的大小、产量、比活性依赖于反应中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,产物平均长度为400-600个核苷酸。利用随机引物进行反应的优点是：(1)Klenow片段没有5'→3'外切
关于cDNA第一链的合成介绍
所有合成cDNA第一条链的方法都要用依赖于RNA的DNA聚合酶(反转录酶)来催化反应,主要有两个关键因素,一个是mRNA模板,另一个是反转录酶 [3] 。商品化反转录酶有从禽类成髓细胞瘤病毒纯化到的禽类成髓细胞病毒（AMV）逆转录酶和从表达克隆化的Moloney鼠白血病病毒反转录酶基因的大肠杆菌
RLMRACE法合成双链cDNA
实验概要掌握合成双链cDNA的RLM-RACE技术，可构建高质量的cDNA文库。主要试剂1. 酶类及分子量标准 1) 高保真酶Easy-A high fidelity cloning enzyme,Merck公司Stratagene系列； 2) Taq DNA Polymerase，上海申
cDNA第二链的合成方法
cDNA第二链的合成方法有以下几种：（1）自身引导法。合成的单链eDNA3’端能够形成一短的发夹结构，这就为第二链的合成提供了现成的引物。当第一链合成反应产物的DNA—RNA杂交链变性后利用大肠杆菌DNA聚合酶I Klenow片段或反转录酶合成eDNA第二链，最后用对单链特异性的S1核酸酶消化该环，
体外转录合成单链RNA探针
实验方法原理 制备特异性的单链 RNA 探针不仅比 DNA 探针更容易，在杂交反应中一般也比具相同比活性的 DNA 探针产生更强的信号，这可能是由于含有 RNA 的杂合链固有的更高稳定性的缘故（Casey and Davidson 197
微生物所等破解过氧化氢酶参与天然产物生物合成机制
麦角生物碱类化合物最早于上世纪从真菌中分离得到，并广泛产生于多种曲霉和青霉，被誉为最重要的临床药用分子和天然毒素（图1A），在欧美市场上被广泛用来治疗癌症、偏头疼、产后大出血和帕金森症，FDA批准的上市药物有12种。研究表明，麦角生物碱结构中的Ergoline四元环是该类化合物的药效团，它与神经
脂环化合物的合成反应
合成反应在有机合成中环状化合物的合成方式有很多，如：分子内成环，重排反应成环等，最为常见的便是双烯合成（Diels-Alder反应）。具有双键的环烯烃与共轭二烯烃的性质相似，可以发生双烯合成反应，如果是两分子的环戊烷即使是常温下也可以发生双烯合成反应，生成二聚环戊二烯。合成反应