传统方法与全基因组分析谁更胜一筹
在南非开普植物区（Cape Floristic Region）的山野间，生活着一群体重只有其他非洲豹一半的“迷你豹”。数十年来，生态学家一直争论它们体型缩小是营养不足还是基因原因。如今，一项发表于《Nature Heredity》的全基因组研究给出了终极答案：这既不是营养不良，也不是随机的基因漂变——而是一场跨越两万年的自然选择塑造出的精细局部适应。 研究团队对南非开普豹的整个基因组进行了深度测序，解析了25.7亿个碱基对的完整序列。这是迄今为止对非洲豹进行的最详尽的基因组分析。传统方法依赖对体长、体重、头骨尺寸等外部特征的测量和比较，虽然能揭示群体间的差异，却无法回答“为什么”——为什么这些豹子会小到只有正常体型的一半？基因分析则让科学家能够直接“看到”答案：约90个与体型发育、肌肉生长和骨骼结构相关的基因发生了显著改变，形成了一个独特的遗传特征组合。 最令人震撼的是时间深度。基因组数据显示，开普豹与其他非洲豹的分化发生在......阅读全文
传统方法与全基因组分析谁更胜一筹
在南非开普植物区（Cape Floristic Region）的山野间，生活着一群体重只有其他非洲豹一半的“迷你豹”。数十年来，生态学家一直争论它们体型缩小是营养不足还是基因原因。如今，一项发表于《Nature Heredity》的全基因组研究给出了终极答案：这既不是营养不良，也不是随机的基因漂变—
全基因组测序揭示喀斯特植物适应性进化机制
中国南方喀斯特起源古老、分布广泛，被认为是生态与进化研究的“天然实验室”。中国科学院华南植物园研究员康明团队等完成了首个喀斯特植物怀集报春苣苔的全基因组测序。相关研究近日在线发表于《新植物学家》。 喀斯特植物是我国植物多样性和特有性的重要组成部分，但迄今为止对喀斯特植物的多样性起源和适应性进
解析斑鳖的全基因组序列及其适应性进化基础
斑鳖（Rafetus swinhoei）是目前地球上现存体型最大的鳖类物种，其背甲长度可达1.5米、体重可达115公斤。此外，斑鳖也是全球目前最濒危的龟鳖类物种。在2019年初，全球已经明确记录的斑鳖个体仅仅只有4只。然而，2019年4月13日，我国的雌性个体意外死亡（这也是当时全球唯一确定性别
谷子单倍体型图谱及全基因组关联分析研究出炉
由中国农科院作物所、中科院上海生科院植生生态所国家基因中心、中科院遗传发育所等8家单位合作，在国际上率先完成了谷子单倍体型图谱的构建和大量农艺性状的全基因组关联分析，该成果于6月24日在Nature Genetics(自然-遗传学)发表，标志着我国在谷子遗传学研究领域取得了重要的突破。
Science子刊：大型猫科动物是如何演化的
老虎、狮子和豹子是我们都很熟悉的大型猫科动物，但对于它们的进化史，我们却不大了解。近日，巴西、美国等地的研究人员组装了美洲豹（Panthera onca）的de novo基因组，并测序了多头美洲豹的外显子组，以便了解豹属的适应性和相互关系。这项成果于7月19日发表在《Science Advanc
GenomeBiology发布基因组测序重要成果
Genome Biology杂志发布了远东豹（Far Eastern Amur leopard）的首个全基因组序列，为人们揭示了肉食对基因多样性和种群规模的影响。“我们将远东豹基因组与其它哺乳动物基因组进行比较，发现肉食似乎是很强的选择压力。这种现象在杂食动物和食草动物中并不明显。举例来说，牛吃肉对
海马基因组及环境适应进化机制获揭示
记者从中国科学院南海海洋研究所获悉，由该所研究员林强课题组主导，联合德国康斯坦茨大学、新加坡国家科技局和华大基因等共同揭示了海马在海洋近岸和岛礁栖息过程中的体型特化和繁殖适应性进化特征。相关研究12月15日以封面文章的形式发表在《自然》杂志上。 林强团队在国际上率先完成了海马的全基因组研究，揭
CG、GP开放共享至今最大实验单体型定相全基因组测序成果
2016年10月11日，美国加州山景城——华大基因子公司Complete Genomics(简称CG)与个人基因组计划项目（简称PGP）共同发布了过百人的实验单体型定相全基因组测序结果。这组数据采用长片段阅读技术（简称LFR）读取，是目前最大的有全面实验确认单体型的高覆盖度全基因组组装。“绝大多
专家破解大白鲨全基因组－发现抗癌进化机制
香港《星岛日报》报道，日前，一个国际科研团队破解了大白鲨的全基因组，发现其依靠在进化过程中产生的基因序列变化，获得了一种抗癌能力，寿命可长达七十岁。 资料图：大白鲨。 美国诺瓦东南大学和康奈尔大学的研究人员18日在美国《国家科学院学报》发表论文说，大白鲨体型庞大，身长五至六米，体重可超过三吨
花椒基因组进化和适应性演化研究获进展
中国热带农业科学院香料饮料研究所（以下简称香饮所）热带香辛饮料种质资源研究室在中国花椒基因组进化和适应性演化研究方面取得重要进展。研究团队在实现竹叶花椒和红花椒基因组的高质量拼接和染色体锚定的基础上，揭示了花椒独特的花器官退化、利己素合成和适应性表型创新的遗传基础，表明花椒基因组进化和表型创新与晚新
我国学者揭示海龙科鱼类复杂性状的适应进化机制
近日，国际著名学术期刊《国家科学评论》（National Science Review）在线刊发了由中国科学院南海海洋研究所林强研究员团队主导，新加坡国家科技局等科研单位合作完成的研究论文“Comparative genomics reveal shared genomic changes in
国际首例猪T2T全基因组组装成功
2月8日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所张龙超研究员、黑龙江省农业科学院畜牧研究所刘娣研究员、重庆市畜牧科学院王金勇研究员、岳麓山实验室印遇龙院士、四川农业大学李明洲教授联合发布消息，国际首个猪T2T全基因组组装——民猪完整全基因组构建成功完成，标志着猪基因组研究迈入“完整解析”时代，为我国养殖业
研究人员揭示海龙科鱼类复杂性状的适应进化机制
2020年1月9日，国际学术期刊《国家科学评论》（National Science Review）在线刊发了由中国科学院南海海洋研究所研究员林强团队主导、新加坡国家科技局等科研单位合作完成的研究论文“Comparative genomics reveal shared genomic chang
多国实施全基因组分析计划
由于基因测序可以探查与特定疾病相关的基因，该疗法正在成为日益受欢迎的诊断方法。 英国计划到2017年对10万人进行基因组测序。 美国加州一对龙凤胎出生后，他们的父母非常忧虑：两个婴儿不仅发育缓慢，而且肌肉松软无力。大脑扫描结果显示，男婴或存在大脑性麻痹；然而医生对造成女婴震颤和癫痫的原因却不
科学及揭示高山植物双参适应高海拔环境的基因组进化机制
近日，中国科学院植物研究所研究员陈之端团队与合作者完成了首个双参染色体级别基因组和13个川续断目植物转录组的组装和注释，揭示了高山植物双参适应高海拔环境的基因组进化机制。相关研究成果发表于Horticulture Research。高山生态系统由于其极端的环境、丰富的生物多样性、及对气候变化的高度敏
老鼠基因组单体型图谱出炉
美国的研究人员希望通过对15只常用于生物医药研究的小鼠的DNA进行研究来帮助科研人员确定出与环境疾病敏感性相关的基因。目前这些数据被存放在了基因变异数据目录之下，即小鼠基因组单体型图谱（将染色体分隔成许多小的片段），从而帮助研究人员找出小鼠中影响健康和疾病的基因和遗传变异。这个单体型图谱公布在7月2
国外研究揭示伯格曼法则背后的遗传机制
一项由加拿大不列颠哥伦比亚大学、美国康奈尔大学、沃希托浸会大学、阿拉斯加大学联合完成的研究，通过对北美歌雀基因组测序，揭示了在其身上观察到的显著体型变化的遗传基础。研究结果发表在《自然通讯》上。 根据伯格曼法则，恒温动物在纬度或海拔更高的环境中，为适应气候环境，体型往往会更大。该研究旨在分析伯
国外研究揭示伯格曼法则背后的遗传机制
一项由加拿大不列颠哥伦比亚大学、美国康奈尔大学、沃希托浸会大学、阿拉斯加大学联合完成的研究，通过对北美歌雀基因组测序，揭示了在其身上观察到的显著体型变化的遗传基础。研究结果发表在《自然通讯》上。 根据伯格曼法则，恒温动物在纬度或海拔更高的环境中，为适应气候环境，体型往往会更大。该研究旨在分析伯
国外研究揭示伯格曼法则背后的遗传机制
一项由加拿大不列颠哥伦比亚大学、美国康奈尔大学、沃希托浸会大学、阿拉斯加大学联合完成的研究，通过对北美歌雀基因组测序，揭示了在其身上观察到的显著体型变化的遗传基础。研究结果发表在《自然通讯》上。 根据伯格曼法则，恒温动物在纬度或海拔更高的环境中，为适应气候环境，体型往往会更大。该研究旨在分析伯
大白鲨如何获得抗癌能力的？全基因组破译发现进化机制
一个国际科研团队破解了大白鲨的全基因组，发现这种处于海洋食物链顶端的大型脊椎动物在进化过程中产生的基因序列变化使它获得了一种抗癌能力，其寿命可长达70岁。 领衔该研究的美国诺瓦东南大学和康奈尔大学研究人员18日在美国《国家科学院学报》上发表论文说，大白鲨体型庞大，身长5到6米，体重可超3吨，寿
真骨鱼类全基因组加倍后重复基因进化研究引起关注
基因和基因组加倍在进化过程中起了重要作用。1970年，Ohno提出脊椎动物进化早期的两次基因组加倍导致了脊椎动物基因组大小和复杂性的增加，同时也为脊椎动物的进化多样性提供了基础。大量的比较基因组学研究显示，真骨鱼类还经历了第三次基因组加倍，这一加倍被称为鱼类特有的基因组加倍。然而，在物种形成过程
重要疫源动物的起源、扩散和适应性进化研究中获进展
第四纪晚期以来，大型哺乳动物的灭绝和种群衰减重塑了全球生态系统，那么谁是如此重大环境变化中的最大受益者呢？已有研究表明，与大型哺乳动物的命运不同，啮齿类、兔形类、蝙蝠类和食虫类等中小型哺乳动物类群的灭绝风险较低——预测显示，未来50年内，啮齿类动物的多样性会持续增加。然而，啮齿类动物是哺乳动物中
首个深海水虱基因组破译
深海水虱体型巨大化和营养高效利用相关通路 海洋所供图 不同生态位等足类体型结构特征 海洋所供图 近日，中科院海洋研究所研究员李富花和李新正课题组合作破译了国际上首个深海甲壳动物——深海水虱（Bathynomus jamesi）的基因组，并揭示了深海水虱体型巨大化和深海寡营养环境
病毒所蝙蝠飞行和免疫适应进化基因组学获进展
近期，由5个国家9个实验室组成的联合研究团队解析了2种蝙蝠的全基因组序列。这2种蝙蝠分别来自澳大利亚的大蝙蝠狐蝠(Pteropus.alecto)和中国的小蝙蝠大卫鼠耳蝠(Myotis.davidii)。分析结果提供了蝙蝠飞行、免疫系统及其它独特生物学特性的适应性进化的生物信息学证据。相关成果发
研究揭示植物基因组倍性变化和适应性进化机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518047.shtm
研究揭示植物基因组倍性变化和适应性进化机制
日，中山大学生命科学学院教授施苏华、副教授何子文团队以红树植物杯萼海桑所在支系为对象，全面分析基因组进化轨迹，探索倍性变化（多倍化-重二倍化过程）在基因组进化中的作用，研究全球气候变化背景下的植物适应性进化机制。相关成果发表于《自然-通讯》。 该研究基于高质量的基因组数据，使用共线性分析、非同
全钒液流电池单元系统模块验收
6月9日，由大连融科储能技术发展有限公司与中科院大连化物所合作开发的具有自主知识产权的500kW/1MWh全钒液流电池单元系统模块，顺利通过了由业主单位辽宁电力经济开发有限公司组织的出厂验收。500kW/1MWh单元系统模块作为兆瓦级储能系统可调度的基本单元，采用自主开发的第二代 25kW电
什么是基因组进化？
基因组不仅仅是生物体基因的总和，基因组还含有其它可以考虑特定基因及其产物的特征。复制在基因组的塑造过程中起了重要作用。复制的范围包括短串联重复序列的延伸、基因簇的复制、整个染色体甚至整个基因组的复制。这种复制可能是创造遗传新性状的基础。
基因组的进化特征
基因组不仅仅是生物体基因的总和，基因组还含有其它可以考虑特定基因及其产物的特征。复制在基因组的塑造过程中起了重要作用。复制的范围包括短串联重复序列的延伸、基因簇的复制、整个染色体甚至整个基因组的复制。这种复制可能是创造遗传新性状的基础。
武汉植物园在猕猴桃局部适应性的进化机制研究中获进展
全球气候变化对地球生态系统产生了深远影响。为响应气候变化，较多动植物可能发生向高纬度和高海拔地区迁移，原有的生态位可能逐渐丧失，最终可能引发物种的灭绝。同时，在长期的进化历程中，生物逐渐适应外界环境气候变化，形成了特有的对环境气候变化的响应和适应机制。在全球气候变化的背景下，研究经济植物对气候变