研究提出基于基因组浅层测序的维管植物物种鉴定新方案

标准DNA条形码凭借通用引物适配性强和测序成本低等优势,广泛应用于生物多样性保护与溯源等领域。针对近缘种、杂交频繁及近期辐射演化的复杂类群,标准DNA条形码因序列变异度有限,分辨率不足,难以满足精准鉴定的需求。尽管基因组浅层测序获取质体全基因组(超级条形码)的策略提升了部分困难类群的鉴别率,但质体基因组的单亲遗传特性使其在杂交渐渗类群分析中存在局限。 近日,中国科学院昆明植物研究所等团队在维管植物物种鉴定领域取得进展。该研究系统评估了基因组浅层测序数据,特别是基于k-mer分析在维管植物物种鉴定中的应用潜力,提出了一套可推广的标准分析流程。 研究选取石松类、蕨类、裸子植物和被子植物代表性类群,覆盖32属、475种共1969份样本进行系统分析。结果表明,标准条形码仅能区分约49.3%的物种,组装质体全基因组可将鉴别率提升至57.6%。进一步应用浅层测序数据的k-mer分析,物种鉴别率显著提高至66.8%,较标准条形码整体提......阅读全文

研究提出基于基因组浅层测序的维管植物物种鉴定新方案

  标准DNA条形码凭借通用引物适配性强和测序成本低等优势,广泛应用于生物多样性保护与溯源等领域。针对近缘种、杂交频繁及近期辐射演化的复杂类群,标准DNA条形码因序列变异度有限,分辨率不足,难以满足精准鉴定的需求。尽管基因组浅层测序获取质体全基因组(超级条形码)的策略提升了部分困难类群的鉴别率,但质

植物所揭示维管植物迄今最早的异源多倍化事件

杂交是植物界中普遍存在的现象,也是物种多样化的重要驱动因素。通常,研究人员利用不同基因树之间系统发生关系的冲突来推测杂交事件。杂交、基因渐渗、基因复制和丢失、不完全谱系分选以及进化率变异等因素可能导致系统发生关系冲突。随着时间的积累,基因突变和重组等事件会稀释和改变杂交后代中来自亲本的遗传印记。因此

向维管植物请教,如何制备高性能多孔膜

高渗透选择性和耐久性的膜适合大规模分离应用。然而,目前大多数使用非溶剂诱导相分离(NIPS)制备的膜,都存在低渗透性和高污染倾向,这是因为在膜的合理设计和实用优化方法方面仍存在巨大挑战。近日,东华大学化学化工与生物工程学院教授武培怡、副教授吴慧青团队受维管植物网络结构的启发,通过一种简单而稳健的策略

我国学者首次估出中国维管植物数量

  中国地大物博,是世界上生物多样性最丰富的5个国家之一。“中国植物志”记载了分布于我国的31362种维管植物(包括蕨类和种子植物),但到底还有多少种维管植物有待发现一直是一个谜。最近,中山大学何芳良教授和硕士生吕牧羊的一项研究首次估算出中国总共约有36500种维管植物(最多不超过39200种),该

武汉植物园完成东非火山埃尔贡山的维管植物编目

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498460.shtm   埃尔贡山是东非最古老的火山之一,位于肯尼亚和乌干达的交界处,最高点海拔4321米。埃尔贡山具有独特的生态系统,其植物多样性高,并拥有非洲大陆植物区系中的稀有和特有物种,长期以来

生物物种鉴定、发育阶段鉴定并定量?

      如果说人类对地球的了解还只是皮毛阶段,相信很多人都不服气,但是,人类至今连哺乳动物这一类最容易统计的生物都没有完全搞清楚种数,可想而知对其他生物的了解程度能有多深了。形态学鉴定物种在微小生物、未知生物方面越来越吃力,分子生物学方法正在不断改善和弥补形态学的缺陷。      一篇通讯作者为

蕨类植物鉴定实验——蕨类植物鉴定

实验材料石松标本卷柏(或中华卷柏)腊叶标本石松茎横切片石松卷柏抱子叶穗纵切片问荆(或节节草)新鲜叶片(或腊叶标本)蕨腊叶标本蕨地下茎横切片蕨孢子囊群水封 片(或永久封片)蕨原叶体装片常见蕨类植物的标本仪器、耗材显微镜解剖镜放大镜镊子解剖针载玻片盖玻片培养皿滴瓶实验步骤(一)石松亚门 Lycophyt

裸子植物鉴定实验_松科鉴定

实验材料苏铁带球果新鲜材料、苏铁大抱了叶新鲜叶片(或腊叶标本)、银杏腊叶标木(或新鲜叶片)银杏种子纵切片油松新鲜材料(或腊叶标本)油松叶横切片、侧柏新鲜材料(或腊叶标本)试剂、试剂盒乙酸洋红仪器、耗材显微镜镊子解剖针载玻片盖玻片滴管培养皿吸水纸实验步骤(三)松科 Pinaeeae油松 ( 图 2-2

蕨类植物鉴定实验——其他常见蕨类植物鉴定

实验材料石松标本卷柏(或中华卷柏)腊叶标本石松茎横切片石松卷柏孢子叶穗纵切片问荆(或节节草)新鲜叶片(或腊叶标本)蕨腊叶标本蕨地下茎横切片蕨孢子囊群水封 片(或永久封片)蕨原叶体装片常见蕨类植物的标本仪器、耗材显微镜镊子解剖针载玻片盖玻片滴管培养皿吸水纸实验步骤(四)其他常见蕨类植物的观察另外观察槐

裸子植物鉴定实验_其他常见裸子植物的观察鉴定

实验材料华山松等试剂、试剂盒乙酸洋红仪器、耗材显微镜镊子解剖针载玻片盖玻片滴管培养皿吸水纸实验步骤观察华山松、青海云杉、刺柏、杜松,圆柏,叉子圆柏等植物。

裸子植物鉴定实验_柏科鉴定

实验材料苏铁带球果新鲜材料、苏铁大抱了叶新鲜叶片(或腊叶标本)、银杏腊叶标木(或新鲜叶片)银杏种子纵切片油松新鲜材料(或腊叶标本)油松叶横切片、侧柏新鲜材料(或腊叶标本)试剂、试剂盒乙酸洋红仪器、耗材显微镜镊子解剖针载玻片盖玻片滴管培养皿吸水纸实验步骤柏科Cupressaeeae侧柏,如图取侧柏新鲜

裸子植物鉴定实验_银杏科鉴定

实验材料苏铁带球果新鲜材料、苏铁大抱了叶新鲜叶片(或腊叶标本)、银杏腊叶标木(或新鲜叶片)银杏种子纵切片油松新鲜材料(或腊叶标本)油松叶横切片、侧柏新鲜材料(或腊叶标本)试剂、试剂盒乙酸洋红仪器、耗材显微镜镊子解剖针载玻片盖玻片滴管培养皿吸水纸实验步骤(二)银杏科 Ginkgoaceae银杏 ( 图

裸子植物鉴定实验_苏铁科鉴定

实验材料苏铁带球果新鲜材料、苏铁大抱了叶新鲜叶片(或腊叶标本)、银杏腊叶标木(或新鲜叶片)银杏种子纵切片油松新鲜材料(或腊叶标本)油松叶横切片、侧柏新鲜材料(或腊叶标本)试剂、试剂盒乙酸洋红仪器、耗材显微镜镊子解剖针载玻片盖玻片滴管培养皿吸水纸实验步骤苏铁科cycadaceae苏铁为常绿乔木,茎短不

转录、降解组技术对毛白杨次生维管系统再生microRNA的鉴定

  木材的形成是一个复杂的发展过程,主要由转录网络调控。microRNA (miRNA)通过mRNA降解和翻译抑制,调节植物生长发育过程中靶基因的表达。  这项研究中,中国林业科学院卢孟柱课题组使用小RNA测序和降解组测序技术,研究不同剥皮时间后,毛白杨miRNAs参与SVS再生的表达情况。实验中取

DNA物种鉴定试剂盒介绍

产品上新 DNA多通道肉源物种鉴别试剂盒,3中检测数量,针对鉴定原肉和加工食品,同时鉴定五种动物样本的DNA(猪肉、狗肉、家鼠肉、田鼠肉等)。   优势特点 分析快速,整个测试时长不超过3个小时; 一份试剂可同时鉴定5-9种物种; DNA检测限为pg级别;

裸子植物鉴定实验

实验材料:苏铁带球果新鲜材料、苏铁大抱了叶新鲜叶片(或腊叶标本)、银杏腊叶标木(或新鲜叶片)                                                                银杏种子纵切片                                

种子植物鉴定实验

实验方法原理植物分类主要是根据桢物各部分形态特征来进行的,在鉴定一种植物时,首先要对该种植物进行全面细致的分析观察,并作好描述记录,以利鉴定工作进行。实验材料植物材料仪器、耗材放大镜实验步骤(一)一般被子植物分析观察的内容1 生活型:是乔木、灌木、草本(一年生、二钉生或多年生),还是藤本(木质或草质

植物细胞死活鉴定

1、 用质壁分离法鉴定细胞死活 (1) 原理 活细胞与死细胞在性质上有许多差别,特别是透性的变化最为明显,活细胞的原生质具有分别透性;而死细胞则为通透性。分别透性是质壁分离的先决条件,因此能发生质壁分离的细胞就表示是活的,不能发生质壁分离的则说明是死的。 (2) 仪器药品及材料 洋葱及其它植物  材

种子植物鉴定实验

实验方法原理植物分类主要是根据桢物各部分形态特征来进行的,在鉴定一种植物时,首先要对该种植物进行全面细致的分析观察,并作好描述记录,以利鉴定工作进行。实验材料植物材料                                                          仪器、耗材放大镜

种子植物鉴定实验

实验方法原理 植物分类主要是根据桢物各部分形态特征来进行的,在鉴定一种植物时,首先要对该种植物进行全面细致的分析观察,并作好描述记录,以利鉴定工作进行。实验材料 植物材料仪器、耗材 放大镜实验步骤 (一)一般被子植物分析观察的内容1 生活型:是乔木、灌木、草本(一年生、二钉生或多年生),还是藤本(木

《世界维管植物新分类群2022年度报告》发表

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/514851.shtm

中国科学家绘制全球首张维管植物整合细胞图谱

  中国科学院分子植物科学卓越创新中心研究员王佳伟团队,绘制了世界上首张维管植物整合细胞图谱,并通过系统鉴定维管植物各类细胞的底层基因,突破了基因高效挖掘的瓶颈,为植物发育生物学研究提供了一个全新的研究范式。相关研究8月18日发表于《细胞》。  得益于双子叶模式植物拟南芥和单子叶模式植物水稻的遗传学

蕨类植物鉴定实验

实验方法原理 实验材料 石松标本卷柏(或中华卷柏)腊叶标本石松茎横切片石松卷柏抱子叶穗纵切片问荆(或节节草)新鲜叶片(或腊叶标本)蕨腊叶标本蕨地下茎横切片蕨孢子囊群水封 片(或永久封片)蕨原叶体装片常见蕨类植物的标本仪器、耗材 显微镜解剖镜放大镜镊子解剖针载玻片盖玻片培养皿滴瓶实验步骤 (一)石松亚

植物抗寒性鉴定

我国植物种类繁多,分布区域广,在晚秋和早春时期发生的冻害和冷害两种低温危害,常常给越冬作物和果木造成严重伤害。冻害由0℃以下低温造成,冷害由0℃以上低温引起,冷害对植物的伤害程度,除取决于低温外,还取决于低温维持时间的长短。植物抗寒性的强弱决定其生长季节,因此蔬菜作物利用抗寒品种,可以将露地栽培提前

蕨类植物鉴定实验

实验材料:石松标本                                                                  卷柏(或中华卷柏)腊叶标本                                                              

植物抗逆性的鉴定实验

实验方法原理 当植物组织受干旱或其它不良条件如高温、低温等影响时,常能伤害原生质体的结构而引起透性增大,结果细胞内含物将有不同程度的外渗,使外渗液的电导度增大,用电导仪即可明显地测定出来,透性变化愈大,表示受伤愈重、抗性愈弱。实验步骤 一、材料与设备1. 植物材料:小麦、玉米或其它作物叶片。2.

植物抗旱性鉴定

水分亏缺是一种最普遍的影响植物生产力的环境胁迫,尽管蔬菜作物一般都在水源充足的地区栽培,但是通常蔬菜需水量大,而且几乎整个生育期对水分的要求都比较多;而果树大多栽培于丘陵、土地,更易受到水分亏缺的影响。因此深入研究植物的抗旱性,进行抗旱育种显得特别重要。抗旱育种的成败在很大程度上取决于拥有抗性资源的

植物抗逆性的鉴定实验

实验方法原理:当植物组织受干旱或其它不良条件如高温、低温等影响时,常能伤害原生质体的结构而引起透性增大,结果细胞内含物将有不同程度的外渗,使外渗液的电导度增大,用电导仪即可明显地测定出来,透性变化愈大,表示受伤愈重、抗性愈弱。实验步骤:一、材料与设备1. 植物材料:小麦、玉米或其它作物叶片。2.

广东河源发现植物新物种

从广东紫金白溪省级自然保护区获悉,保护区科研人员发现一堇菜科植物新物种,命名为河源堇菜。该学术成果日前在国际学术期刊《北欧植物学杂志》发表。  广东紫金白溪省级自然保护区管理处副主任、高级工程师叶钦良是河源堇菜发现人之一。据他介绍,2021年2月,保护区科研团队和中山大学科研团队在广东省河源市紫金县

关于类囊体的植物种类介绍

  1、基粒类囊体  许多类囊体像圆盘一样叠在一起,称为叶绿体基粒,组成基粒的类囊体,叫做基粒类囊体,构成内膜系统的基粒片层(grana lamella)。基粒直径约0.25~0.8μm,由10~100个类囊体组成。每个叶绿体中约有40~60个基粒。  2、基质类囊体  贯穿在两个或两个以上基粒之间