Science:宏基因组学测序技术
宏基因组学技术(Metagenomic approaches)正快速拓宽我们对微生物代谢能力(microbial metabolic potential)的认识。 长期以来,对微生物(microorganism)功能开展的研究主要依赖的都是以在实验室里培养的单一物种(individual specie)为对象获得的研究成果。大约在10年前,科研人员们开始获得自然环境中存在的、非人工培养的细菌或古细菌(archaea)的基因组草图,这些基因组数据为科研人员们了解这些微生物在自然环境中的作用打开了一条新的渠道。这就是所谓的宏基因组学(metagenomics)技术,该技术的发展现在已经可以做到从多个不同的环境样本中快速、准确地获得环境微生物的基因组序列。这些成果有可能会彻底颠覆我们对生命之树结构,以及各个物种代谢能力的理解和认识。生物信息学的飞速发展也提供了另外一种便利,由于能够全面了解遗传信息和数据,所以能够快速......阅读全文
SD序列的翻译影响
一般来说,mRNA与核糖体的结合程度越强,翻译的起始效率就越大,而这种结合程度主要取决于SD序列与16S rRNA的碱基互补性,其中以GGAG 4个碱基序列尤为重要。其中,大肠杆菌的SD序列为AGGAGGU。对多数基因而言,这4个碱基中任何一个换成C或T,均会导致翻译效率大幅度降低。SD序列与起
端粒DNA-序列的概念
端粒DNA 序列(telomere DNA sequence,TEL)端粒的功能是与端粒酶结合,完成染色体末端复制。端粒酶以其自身的RNA 为模板,在染色体端部添加上端粒的重复序列。作为模板的RNA 比较短,含有1.5 个端粒重复单元。端粒结构还能防止染色体融合及降解。端粒是保护DNA分子中的基因的
常用的βactin-引物序列
human actin f ctc cat cct ggc ctc gct gt human actin r gct gtc acc ttc acc gtt cc product size:268 rabbit actin r agt gcg acg tgg aca tcc g rabbit act
中度重复序列的概念
中度重复序列(moderately repetitive sequence )一般是非编码序列,有十个到几百个拷贝,如 rRNA基因和 tRNA 基因等。这类重复序列的平均长度大约为 300bp ,往往构成序列家族,常以回文序列形式出现在基因组的许多位置上,有些同单一序列间隔排列。大部分中度重复序列
常用的βactin-引物序列
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信号锚定序列的概念
中文名称信号锚定序列英文名称signal-anchor sequence定 义穿膜蛋白中的一种独特的信号序列,其作用是将这些蛋白质锚定在脂双层膜上。有两种类型。Ⅰ型序列介导穿膜蛋白的N端域移位,Ⅱ型则介导其余部分的移位。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),信号转导(二级学科)
高度重复序列的概念
高度重复序列是一组基因序列,在基因组中重复频率高,可达百万(10^6)以上,因此复性速度很快。在基因组中所占比例随种属而异,约占10-60%,在人基因组中约占20%。
Alu重复序列的概念
中文名称Alu重复序列英文名称Alu repetitive sequence;Alu family定 义哺乳动物和人基因组中的一种中等重复序列,因该序列中有限制性内切酶Alu的切点而得名。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
简述SD序列的作用
SD序列的作用是与16S rRNA的3'端上一段富含嘧啶的序列结合,小亚基16S rRNA的3'端的这个小片段就被称为反SD序列。当mRNA中的SD序列于16S rRNA上的反SD序列结合后,就指示了下游的AUG,即是蛋白质合成的起始密码子。
获取时间序列图像
获取时间序列图像 共聚焦显微镜的"Time-Series"功能,可以自动在实验者规定的时间内按照设定的时间间隔获取图像。只需设定所需的时间间隔以及所需图像数量,开启“Start T”功能键,即可进行实验。“Time-Series"功能大大减轻了实验者的劳动强度,对于荧光漂白恢复和钙离子成像等实验非
转基因技术的技术优势
1)减轻病虫害危害,改善农业生态环境。全球转基因技术的研发与应用表明,抗虫和抗除草剂等转基因作物的种植不仅在提高农作物产量方面成效显著,而且在改善农业生态环境方面也显示出巨大优势。培育抗病虫、抗除草剂、抗旱、耐盐碱、养分高效利用等转基因新品种,将显著减少农药、化肥和水的使用,有利于缓解环境污染,改善
基因免疫技术的技术优势
一种理想的疫苗应具备安全、价廉、性质稳定,最好单次注射即能诱生抗多种病原体的保护性免疫等特点。迄今,还未有一种已应用于人体的疫苗能同时具备上述优点。当前的疫苗可分成两大类,即复制型疫苗和非复制型病毒疫苗。复制型疫苗主要包括减毒疫苗和可表达靶抗原的复制型重组疫苗;而非复制型疫苗则包括灭活疫苗、纯化抗原
基因转移技术的技术方法介绍
基因转移是用物理的、化学的或生物学的方法将目的基因导入受体细胞并使之表达的一种技术。
转基因技术的技术优势
转基因技术被称为“人类历史上应用最为迅速的重大技术之一”。转基因技术与传统育种技术有两点不同:第一,传统技术一般只能在生物种内个体上实现基因转移,而转基因技术不受生物体间亲缘关系的限制,可打破不同物种间天然杂交的屏障,扩大可利用基因的范围;第二,传统的杂交和选择技术一般是在生物个体水平上进行,操作对
转基因技术的具体技术应用
转基因技术已广泛应用于医药、工业、农业、环保等领域。医学医学中转基因技术的应用范围很广。动物转基因技术可以创造诊断和治疗人类疾病的动物模型,可克服单纯依靠自然突变体的局限。转基因技术还应用于蛋白质多肽药物的生产,如生产胰岛素、干扰素、免疫球蛋白、促红细胞生成素、尿激酶、人血红蛋白、人表皮生长因子、粒
节育技术新突破:-基因编辑技术可控制精基因产生
密歇根州立大学(MSU)的科学家们取得了一项重大发现, 可有效推进男性节育的发展。 在动物科学助理教授陈晨(Chen Chen)领导下,密歇根州立大学的研究人员使用一种新型基因编辑技术,发现可以阻断控制雄性老鼠产生精子的基因,促使老鼠不孕。这一研究成果目前发表在《自然通讯》杂志上。同为哺乳
基因编辑技术较转基因技术相比的优势有哪些
第一,基因编辑技术比转基因技术更加精准。转基因技术转入基因带有盲目性,整个位点带有随机性。而基因编辑技术能精准编辑。第二,转基因是在生物体内引入外源的,生物体本身不存在的DNA片段。且可能引入其他非必须片段。转基因存在争论。而基因编辑技术针对该生物本身的基因组进行编辑,通常包括基因敲除,基因中单或多
基因编辑技术较转基因技术相比的优势有哪些
第一,基因编辑技术比转基因技术更加精准。转基因技术转入基因带有盲目性,整个位点带有随机性。而基因编辑技术能精准编辑。第二,转基因是在生物体内引入外源的,生物体本身不存在的DNA片段。且可能引入其他非必须片段。转基因存在争论。而基因编辑技术针对该生物本身的基因组进行编辑,通常包括基因敲除,基因中单或多
基因编辑技术较转基因技术相比的优势有哪些
第一,基因编辑技术比转基因技术更加精准。转基因技术转入基因带有盲目性,整个位点带有随机性。而基因编辑技术能精准编辑。第二,转基因是在生物体内引入外源的,生物体本身不存在的DNA片段。且可能引入其他非必须片段。转基因存在争论。而基因编辑技术针对该生物本身的基因组进行编辑,通常包括基因敲除,基因中单或多
南京农业大学Nature子刊发布新基因组序列草图
由来自南京农业大学、德克萨斯大学奥斯汀分校的科学家们组成的一个国际研究小组,绘制出了一张最精确的美国棉花序列草图,并将很快构建出更为详细的、操控这一复杂棉花基因组的图谱。他们的研究发现有可能帮助培育出在质量上可媲美豪华埃及棉(Egyptian cotton)的廉价美国棉花,并帮助开发出一些减少杀
Nature子刊:从基因组序列快速发现新药的突破性方法
在一项寻找新药的研究中,美国Scripps研究所(TSRI)佛罗里达所区的科学家们开发出一种突破性方法,能够从基因组序列中设计新的候选药物。作为原理验证,他们发现了一种高效的化合物,能够导致癌细胞攻击自己而死。 TSRI的副教授Matthew Disney博士指导了这项研究,他说:“这
Nature子刊:用于百万级生物样本库的基因组序列分析工具
人类的疾病易感性和生理特征等常见性状的差异,往往由DNA序列变化造成,这些DNA片段缺失、增加、异位等变化被统称为遗传变异。全基因组关联研究(Genome-Wide Association Study,GWAS)是通过比对大量人群的遗传信息,利用统计学检测遗传变异和性状之间关联性的方法。西湖大学
蚜虫mtDNA12S/16SrRNA基因序列测定及系统发育分析
实验概要线粒体DNA在分子进化中具有许多独特的优越性,mtDNA己成为研究生物(主要是动物)进化的重要材料。本研究所利用的mtDNA基因序列包括12SrRNA,16SrRNA以及12SrRNA和16SrRNA之间的序列,通过分析三种蚜虫mtDNA 12S/16SrRNA基因序列的进化,不仅揭示了
科学家利用基因组序列设计新药--精确性瞄准致癌RNA
报道,来自美国弗罗里达大学斯克里普斯研究所(TSRI)的科学家称,他们开发出一种很有潜力的通用方法,可通过基因组序列来设计新药,并利用这种方法识别出一种高效化合物,其能让癌细胞攻击自身并最终死亡。相关论文在线发表于2月9日的《自然·化学生物学》。 “这还是第一次只凭借一个RNA序列,就理性
生物物理所揭示基因组重复序列Alu调控转录新机制
7月12日,中国科学院生物物理研究所薛愿超团队在《自然》(Nature)上,在线发表了题为Complementary Alu sequences mediate enhancer-promoter selectivity的研究论文。 转录调控在维持细胞功能和正常发育过程中起着关键作用。其中,增
基因组内简单重复序列在对虾适应性进化中的作用
近日,由中国科学院海洋研究所李富花课题组主导完成的科研论文Simple sequence repeats drive genome plasticity and promote adaptive evolution in penaeid shrimp,在Communications Biolog
基因组所开发出编码蛋白质DNA序列并行比对工具ParaAT
中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员,带领其团队成功开发出“编码蛋白质DNA序列并行比对工具—ParaAT(Parallel Alignment and back-Translation)”。该研究成果发表在Biochemical and Biop
海洋所科研人员绘制完成牡蛎全基因组序列图谱
近日,牡蛎基因组计划(Oyster Genome Project,OGP)项目组宣布,历时两年的牡蛎基因组序列图谱终于绘制完成。这是世界上第一张养殖贝类的全基因组序列图谱,标志着基于短序列的高杂合度基因组拼接和组装技术获得了重大突破。据悉,目前的基因组图谱已达到国际领先的基因组图
我国绘制完成世界首个蒙古族人全基因组序列图谱
我国科学家绘制完成了全世界首个蒙古族人全基因组序列图谱。这是记者12月18日在内蒙古自治区呼和浩特市召开的“世界首例蒙古族人全基因组序列图谱绘制完成成果发布会”上获得的消息。 据项目总负责人、内蒙古农业大学生命科学学院动物生物技术重点实验室主任周欢敏介绍,这一研究成果是我国科学家首次独立完
揭示基因“无用”序列稳定染色质三维结构及细胞稳态机制
人类基因组中的非编码序列在多种生物学过程中发挥着至关重要的作用,如非编码RNA、启动子、增强子和转座子等。作为在基因组中占比约98%的非编码区域,仍有大量是功能未知的,这些曾被认为是基因组中“垃圾”的区域,已被逐渐证实存在重要功能。基因组的三维结构会影响基因的转录调控或其他细胞生命活动,然而,除