Science：宏基因组学测序技术
宏基因组学技术(Metagenomic approaches)正快速拓宽我们对微生物代谢能力(microbial metabolic potential)的认识。 长期以来，对微生物(microorganism)功能开展的研究主要依赖的都是以在实验室里培养的单一物种(individual specie)为对象获得的研究成果。大约在10年前，科研人员们开始获得自然环境中存在的、非人工培养的细菌或古细菌(archaea)的基因组草图，这些基因组数据为科研人员们了解这些微生物在自然环境中的作用打开了一条新的渠道。这就是所谓的宏基因组学(metagenomics)技术，该技术的发展现在已经可以做到从多个不同的环境样本中快速、准确地获得环境微生物的基因组序列。这些成果有可能会彻底颠覆我们对生命之树结构，以及各个物种代谢能力的理解和认识。生物信息学的飞速发展也提供了另外一种便利，由于能够全面了解遗传信息和数据，所以能够快速......阅读全文
多序列比的概念
把两个以上字符序列对齐，逐列比较其字符的异同，使得每一列的字符尽可能一致，以发现其共同的结构特征的方法称为多序列比对。多序列比对问题是双序列比对问题的推广。
间插序列的定义
中文名称间插序列英文名称intervening sequence;IVS定 义基因间或基因内的非编码序列。应用学科遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
间插序列的定义
中文名称间插序列英文名称intervening sequence;IVS定 义基因间或基因内的非编码序列。应用学科遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
匹配序列的结构特点
中文名称匹配序列英文名称matched sequence定 义在序列排比中，两条多核苷酸链或两条多肽链上彼此相同的核苷酸或氨基酸序列。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
核酸序列的检索实验
实验方法原理掌握核酸序列检索的操作方法；熟悉GenBank数据库序列格式及其主要字段的含义；了解EMBL数据库序列格式及其主要字段的含义；熟悉GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存；实验材料电脑仪器、耗材笔记本笔实验步骤1. 使用Entrez信息查询系统检索核酸序列BC0608
重复[DNA]序列的概念
中文名称重复[DNA]序列英文名称repetitive [DNA] sequence定 义DNA分子中重复出现的核苷酸序列。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
序列捕获之新品荟萃
2009年，基因组定向捕获工具的出现，让外显子组的捕获成为可能。科学家们普遍认为外显子组测序比全基因组测序更有优势，特别是对罕见的单基因疾病。不仅仅是费用更低，数据的阐释也更为简单。因此，外显子组测序也在2010年被《Science》杂志评为年度十大突破。 数百篇已发表的文章，也证实了外显
表达序列标签的方法
首先从样品组织中提取mRNA，在逆转录酶的作用下用oligo（dT）作为引物进行RT-PCR合成cDNA，再选择合适的载体构建cDNA 文库，对各菌株加以整理，将每一个菌株的插入片段根据载体多克隆位点设计引物进行两端一次性自动化测序，这就是EST序列的产生过程。
表达序列标签的应用
EST作为表达基因所在区域的分子标签因编码DNA序列高度保守而具有自身的特殊性质，与来自非表达序列的标记（如AFLP、RAPD、SSR 等）相比更可能穿越家系与种的限制，因此EST标记在亲缘关系较远的物种间比较基因组连锁图和比较质量性状信息是特别有用。同样，对于一个DNA序列缺乏的目标物种，来源于其
长读长－读序列
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454746.shtm 赵方庆（左二）与团队成员（左一侯玲玲、右二张金阳、右一左振强）查看测序数据情况。课题组供图 实际上，核糖核酸（RNA）不总是“一条线”，这种遗传信息载体
DNA序列家族的概念
中文名称DNA序列家族英文名称DNA sequence family;sequence family定 义DNA分子变性后可复性形成稳定的碱基配对双链分子的一组序列。序列之间有很高的同源性。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
简述回文序列的释义
如果一个（单链）核苷酸的序列和它的反向互补链的序列一样，那么这个核苷酸序列就是回文序列。回文序列结构不仅在DNA中存在，在RNA中也常因碱基的互补而常出现类似的结构，有利于稳定RNA的结构和行使功能。回文序列也经常出现在组成蛋白质的肽序列中，但它们在蛋白质功能中的作用尚不清楚。 短的回文结构可
简单重复序列的概念
简单重复序列（Simple Sequence Repeat，简称SSR），是指重复单位长度和碱基组成基本一致，只 有少数基因出现微小的差异的一类短串联重复序列。
表达序列标签的作用
⑴ 用于构建基因组的遗传图谱与物理图谱；⑵ 作为探针用于放射性杂交；⑶ 用于定位克隆；⑷ 借以寻找新的基因；⑸ 作为分子标记；⑹ 用于研究生物群体多态性；⑺ 用于研究基因的功能；⑻ 有助于药物的开发、品种的改良；⑼ 促进基因芯片的发展等方面。正是因为EST 表现出了这些巨大潜能，使其得到了充分的利用
SD序列的形成过程
在原核生物中，起始密码子的选择取决于核糖体的小亚基与mRNA模板之间的相互作用。30S亚基与处于紧靠正确起始密码子上游的富含嘌呤的mRNA模板结合，这个区称为SD序列（Shine—Dalgarno sequence），它与16S rRNA 3'端的一个富含嘧啶区互补。在起始复合物形成过程中，
停止转移序列的定义
停止转移序列（stop transfer sequence），肽链上的一段特殊序列，与内质网膜的亲合力很高，能阻止肽链继续进入内质网腔，使其成为跨膜蛋白质。
DNA自动序列测定试验
[实验原理]DNA 测序（DNA sequencing）是对DNA 分子的一级结构的分析。其基本原理是DNA 的复制反应体系中需要存在DNA 聚合酶、DNA 模板、寡核苷酸引物和dNTP，引物和模板退火形成双链后，DNA 聚合酶在引物的引导下在模板链上沿3’→5’的方向移动，dNTP 按照碱
质粒维持序列的定义
中文名称质粒维持序列英文名称plasmid maintenance sequence定 义存在于重组质粒中的、与保持其在宿主中稳定复制有关的序列。如乳酸菌质粒pGT232的一段由双链复制起点和编码复制起始蛋白repA的基因所组成的1.7 kb的序列。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与
低度重复序列的概念
低度重复序列在单倍体基因组中只出现一次或数次，因而复性速度很慢。单拷贝顺序在基因组中占50-80%，如人基因组中，大约有60-65%的顺序属于这一类。单拷贝顺序中储存了巨大的遗传信息，编码各种不同功能的蛋白质。尚不清楚单拷贝基因的确切数字，但是是有其在单拷贝顺序中只有一小部份用来编码各种蛋白质，其他
SD序列的形成过程
在原核生物中，起始密码子的选择取决于核糖体的小亚基与mRNA模板之间的相互作用。30S亚基与处于紧靠正确起始密码子上游的富含嘌呤的mRNA模板结合，这个区称为SD序列（Shine—Dalgarno sequence），它与16S rRNA 3'端的一个富含嘧啶区互补。在起始复合物形成过程中，
常用的βactin－引物序列
human actin f ctc cat cct ggc ctc gct gt human actin r gct gtc acc ttc acc gtt cc product size:268 rabbit actin r agt gcg acg tgg aca tcc g rabbit act
细胞化学词汇互补序列
中文名称：互补序列英文名称：complementary sequence定 义：在双链核酸中，一条多核苷酸链可与另一条多核苷酸链互补的那部分序列。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
简述SD序列的作用
SD序列的作用是与16S rRNA的3'端上一段富含嘧啶的序列结合,小亚基16S rRNA的3'端的这个小片段就被称为反SD序列。当mRNA中的SD序列于16S rRNA上的反SD序列结合后,就指示了下游的AUG,即是蛋白质合成的起始密码子。
串联重复[序列]的定义
中文名称串联重复[序列]英文名称tandem repeat定 义首尾相连的重复序列。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
信号锚定序列的概念
中文名称信号锚定序列英文名称signal-anchor sequence定 义穿膜蛋白中的一种独特的信号序列，其作用是将这些蛋白质锚定在脂双层膜上。有两种类型。Ⅰ型序列介导穿膜蛋白的N端域移位，Ⅱ型则介导其余部分的移位。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），信号转导（二级学科）
RGD序列的结构特点
RGD序列由精氨酸、甘氨酸和天冬氨酸组成，存在于多种细胞外基质中，可与11种整合素特异性结合，能有效地促进细胞对生物材料的粘附。
Alu重复序列的概念
中文名称Alu重复序列英文名称Alu repetitive sequence;Alu family定 义哺乳动物和人基因组中的一种中等重复序列，因该序列中有限制性内切酶Alu的切点而得名。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
什么是标准核酸序列？
标准核酸序列系指供药品标准中要求的种属源性鉴别或鉴定的核酸序列,其具有确定的碱基排列顺序,是实施核酸检测的基础,用于药品检验、药品质量控制中涉及的动物、植物、微生物以及重组生物制品的种属鉴别或鉴定。
细胞化学词汇SD序列
中文名称：SD序列外文名称：Shine-Dalgarno sequence定 义：Shine-Dalgarno （SD）是细菌和古细菌中信使RNA中核糖体结合位点序列。通常位于翻译起始密码子AUG上游约8~10个碱基位置。SD序列帮助招募核糖体RNA，并将核糖体比对并结合到信使RNA（m
反向重复[序列]的定义
存在于双链核酸分子中排列顺序方向相反的一段核苷酸序列。