NatStructMolBiol:冷冻电镜技术揭示RNA降解新通路

2013年12月15日,清华大学生命科学学院王宏伟教授课题组在《Nature》子刊《Nature Structural and Molecular Biology》在线发表题为“Visualization of Distinct Substrate Recruitment Pathways in the Yeast Exosome by EM”的研究论文,报道了不同RNA底物在蛋白复合物Exosome中的不同降解通路及结构调节机制。 在中心法则中,RNA由DNA转录而成,并经过复杂的转录后加工,成为成熟的多种RNA。细胞中的RNA质量控制,在细胞基因表达及调控的多个过程中发挥着不可缺少的作用,对细胞的发生、生长、分裂、分化、死亡等过程都具有重要意义。目前对细胞中的RNA质量控制,尤其是对RNA分子被降解的决定因素知之甚少。真核生物细胞中有多种识别及调控RNA降解的蛋白质大分子及其复合物,其中, Exosom......阅读全文

底物浓度对酶促反应速度的影响

  在生化反应中,若酶的浓度为定值,底物的起始浓度较低时,酶促反应速度与底物浓度成正比,即随底物浓度的增加而增加。当所有的酶与底物结合生成中间产物后,即使在增加底物浓度,中间产物浓度也不会增加,酶促反应速度也不增加。  还可以得出,在底物浓度相同条件下,酶促反应速度与酶的初始浓度成正比。酶的初始浓度

胰岛素受体底物的生物学作用

其家族已发现有4个成员IRS-1~IRS-4,在组织分布、亚细胞定位、发育过程的表达时序、与胰岛素的结合以及与含SH2蛋白质的相互作用方面有所差异。在胰岛素信号转导系统中是关键的中介分子;在胰岛素受体与细胞内含有SH2结构域信号分子的复杂网络之间起锚定蛋白的作用,参与多种激素、细胞因子的信号转导,并

碱性磷酸酶(AP)的色原底物

在ELISA测定中,碱性磷酸酶的色原底物最常用的是对硝基苯磷酸盐(p-nitropheny|phosate,)。在碱性磷酸酶的作用下生成对硝基酚(),其在入=405 nm处有最大吸收。由于碱性条件下的光吸收增强,并可使碱性磷酸酶失活,因而可使用碳酸钠作为终止剂。二乙醇胺缓冲液中不能有单乙醇胺,因为单

用-PCR-分析连接反应的底物和产物

试剂、试剂盒 ddH2OVent 缓冲液Vent DNA 聚合酶dNTP引物质粒 DNA仪器、耗材 琼脂糖凝胶电泳所需的试剂和设备热循环仪实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂ddH2O2. 酶和酶缓冲液10X Vent 缓冲液Vent DNA 聚合酶3. 核酸和寡核苷酸dNTP,各 20 mm

酶免疫技术常用的底物知识点小结

  1.HRP的底物  作为供氢体的底物化合物较多,常用的有以下几种:  (1)邻苯二胺(OPD):OPD被认为是HRP最为敏感的色原底物之一。0PD在HRP的作用下显橙黄色,加强酸如硫酸或盐酸终止反应后呈棕黄色,最大吸收峰在492nm波长。OPD是ELISA中应用最早的底物,但其应用液稳定性差,易

用-PCR-分析连接反应的底物和产物

            试剂、试剂盒 ddH2O Vent 缓冲液 Vent DNA 聚合酶 dNTP 引物 质粒 DNA

酶免疫技术常用的底物知识点小结

1.HRP的底物 作为供氢体的底物化合物较多,常用的有以下几种:(1)邻苯二胺(OPD):OPD被认为是HRP最为敏感的色原底物之一。0PD在HRP的作用下显橙黄色,加强酸如硫酸或盐酸终止反应后呈棕黄色,最大吸收峰在492nm波长。OPD是ELISA中应用最早的底物,但其应用液稳定性差,易变色,需新

用-PCR-分析连接反应的底物和产物

由 PCR 产生的合成 DNA 文库,可以经过酶切消化,连接到线性化的表达载体系统上。在这里所列的方案中,文库的 5’(NotⅠ)和 3'(ClaⅠ) 末端是不同的酶切位点,也用同样的酶切位点克隆进载体。可以用 PCR 分析线性化反应和连接反应的效率。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版)

cell:胰岛素受体底物对营养平衡作用

(封面图片:肝脏特异性基因Irs1、Irs2双敲除的基因分析。背景为热图,基因表达数据用点表示,红、黄、蓝色点分别表示高、中、低值。左侧为对照小鼠,右侧为基因敲除后的小鼠,后者表现出发育延迟。图片提供:Dong等)  在肝脏中,胰岛素受体底物(insulin receptor substrat

消化道脂肪酶底物特异性

Ewa RogalskaS等(1990)研究了猪胰脂肪脂肪酶、兔胃脂肪酶和人胃脂肪酶对化学结构类似、但在同一甘油三酯分子中立体结构不同的酯键的立体选择性,结果表明两种胃脂肪酶对sn-3位具有立体选择性。如果由对映体过量百分率表示的话,人和兔胃脂肪酶对三辛酸甘油酯和三油精分别是54%、70%和74%、

酶免疫技术常用的底物知识点小结

  1.HRP的底物  作为供氢体的底物化合物较多,常用的有以下几种:  (1)邻苯二胺(OPD):OPD被认为是HRP最为敏感的色原底物之一。0PD在HRP的作用下显橙黄色,加强酸如硫酸或盐酸终止反应后呈棕黄色,最大吸收峰在492nm波长。OPD是ELISA中应用最早的底物,但其应用液稳定性差,易

凝血分析仪检测方法之底物显色法

  底物显色法(生物化学法)  底物显色法是通过测定产色底物的吸光度变化来推测所测物质的含量和活性的,该方法又可称为生物化学法。其原理是通过人工合成与天然凝血因子有相似的一段氨基酸排列顺序、并含有特定作用位点的小肽,并将可水解产色的化学基因与作用位点的氨基酸相连。测定时由于凝血因子具有蛋白水解酶的活

酶与底物反应产生产物的过程

S(底物)→P(产物)这个反应之所以能够进行,是因为有相当部分的S分子已被激活成为活化(过渡态)分子,活化分子越多,反应速度越快。在特定温度时,化学反应的活化能是使1摩尔物质的全部分子成为活化分子所需的能量(千卡)。酶(E)的作用是:与S暂时结合形成一个新化合物ES,ES的活化状态(过渡态)比无催化

如何靶向降解促癌症蛋白?

  癌症研究越来越关注于靶向作用引发疾病蛋白的疗法开发,其中研究者们对发生早期降解的蛋白进行了标记,近日发表于国际杂志Nature上的研究论文中,来自瑞士巴塞尔弗雷德里希米歇尔研究所的科学家就揭示了特殊化合物如何拦截遍在蛋白连接酶来靶向作用特殊的蛋白进行降解,该机制或为靶向降解特殊的癌症蛋白提供思路

发现降解尿酸的肠菌!

  夏天到了,大家的啤酒烤串捞汁小海鲜都安排上了吗?奇点糕每次看这类美食电子榨菜时,弹幕都会飘过“痛风套餐!”嗯……大家的健康意识都很高嘛!  啤酒、海鲜和动物内脏等食物富含嘌呤,而一些嘌呤,例如黄嘌呤、次黄嘌呤和嘌呤的最终代谢产物尿酸都被认为是尿毒症毒素(肾功能受损患者无法正常代谢掉的废物)[1]

细胞化学词汇mRNA降解途径

中文名称:mRNA降解途径外文名称:mRNA degradation定       义:mRNA 降解途径是在真核细胞中调节基因表达的一个重要步骤。涉及到许多细胞内因子和复合物, 如Dcp1p、Pat1p、Rap55和staufen等.同时, 也有报导认为, 细胞质处理小体是体内mRNA 降解的主要

分离度下降解决对策

1.色谱柱被污染;2.固定相被破坏(柱流失);3. 进样失败,检查泄露;4.检查温度的适应性,检查衬管;5.样品浓度过高,稀释,减少进样量,用高分流比。

利用生态能高效降解污水

  污水处理设备占地面积大,处理成本难以承受等,使一些城镇污水处理厂成为“污染集中排放源”。不过,采用中科未来生物科技研究院有限公司、无锡禾木源环保科技有限公司自主研发的“ARES生态能污水处理技术系统”,可使污水处理吨直接运营成本降低50%以上,节约传统工艺容积30%,处理效率可提高50%,较好解

真核mRNA的降解过程

真核细胞的翻译和mRNA衰变之间存在着平衡。正在被翻译的mRNA被核糖体,真核起始因子eIF-4E和eIF-4G以及poly(A)结合蛋白结合,不能接触外泌体复合物,mRNA得到保护。mRNA的poly(A)尾巴被特异性外切核酸酶缩短,该核酸外切酶通过RNA上的顺式调节序列和反式作用RNA结合蛋白的

RNA提取时RNA降解原因

1 ) 新鲜细胞: 裂解液的量不足,使得裂解不充分。 2 ) 新鲜组织: 某些含有内源性核酸酶的样品,很难避免RNA酶的降解,建议采用的方法为在液氮条件下将组织研碎,并且,匀浆时采用更多的裂解液。 3 ) 冷冻样品: 样品取材后应该迅速置于液氮中冷冻存放,然后转移到-70℃冰箱存

可生物降解的COD

废水中以强氧化剂测定的COD并不一定能全部为微生物降解,在厌氧条件下能够被厌氧菌消耗的COD称作“可生物降解的COD(Biodegradable COD)”,即CODBD。这是指在厌氧过程中能够作为底物被细菌加以利用的COD,因此也可以称作“底物COD”(SubstrateCOD)。在全部COD中,

膜蛋白在室温多久降解

该膜蛋白容易降解。一般放置10天左右就降解50%以上、各种层析柱均没有获得好的分离效果、离子交换、分子筛、疏水柱都没有取得明显的分离效果。

关于药物分析降解实验心得

今天我们说说5种条件下的降解实验及深入的讨论降解实验,是否可以参照破坏试验?破坏试验的目的是什么?实验条件的设置要注意什么?等等问题。 降解实验也就是通过高温、酸、碱、氧化等实验条件对其产品进行产物降解,也属于破坏性实验,主要看都能产生哪些杂质。 1、酸降解试 一般选择0.1N的盐酸,在

泛素化降解机制是什么

泛素化降解机制是腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)通过磷酸化增加内质网锚定蛋白Insig的活性,进而抑制肝脏脂质合成的功能,揭示了蛋白质翻译后修饰通过泛素化降解途径调节脂肪酸合成的新机制。李于团队发现新型代谢因子CREBZF能够感应胰岛素信号,通过抑制Insig的转录水平,使胰岛素发挥促进肝脏脂质合成的

尿纤维蛋白降解产物

尿纤维蛋白降解产物阳性意味着肾脏内有凝血和纤溶现象,提示有炎症病变。非炎性疾病大多阴性。原发性肾小球肾病通常为阴性,慢性肾炎多为阳性。尿纤维蛋白降解产物含量增加反映了肾功能损害程度。在医学`教育网搜集整理慢性肾炎的治疗过程中,临床症状缓解,肾功能恢复,尿纤维蛋白降解产物含量逐渐降低或转阴;阳性者表明

海水降解塑料研发,任重道远

   当前,塑料污染已经成为地球上直逼气候变化的另一重大威胁,因为它正在急剧而不可逆地污染每一种自然系统,并危及越来越多的生物。海洋也是如此。  海洋塑料垃圾污染有多严重?据统计,全球每年塑料废弃物超过3000万吨,其中有超过800万吨的塑料垃圾被直接丢弃或从陆地通过河道、风力最终进入海洋。目前,几

苯酚降解基因的研究现状

  苯酚的降解基因通常成簇排列,位于大质粒上或染色体上。在好氧菌中,苯酚羟化酶基因是降解苯 酚的关键基因,编码苯酚降解途径的第一个酶,负责 将苯酚转化为邻苯二酚;将邻苯二酚开环裂解为三 羧酸(TCA)产物,是由邻位和间位酶负责的。邻苯二 酚的进一步降解具有不同的途径和酶系统:邻苯二 酚 2,3-双加

使用厌氧膨胀污泥颗粒床可对难降解有毒物质的高效降解

  使用厌氧膨胀污泥颗粒床可以对难降解有毒物质的高效降解   采用厌氧技术处理不同温度的工业废水已成趋势,但由于许多工业废水中1有一些难降解、有毒或可通过各种方式影响生物处理系统的物质。   最终造成系统处理效率低甚至失败。已有许多有关厌氧、好氧生物技术能降解多种毒性和难降解物质的报道,但有一点值得

上海药物所合成可用于肿瘤特异性蛋白降解的降解剂

蛋白质降解靶向嵌合体( proteolysis targeting chimeras,PROTACs)可高效降解蛋白质从而实现多种疾病治疗,受到了科研人员广泛关注。尽管前景看好,传统PROTAC小分子的药代动力学行为并不理想,并且缺乏肿瘤特异性。其持续保持的高效催化降解特性会不可控降解正常组织部位P

不可降解成为历史,完全能降解的保鲜膜终于来啦

  现代生活几乎离不开各式的保鲜膜。  这种便捷的塑料产品,包裹在我们的水果、蔬菜、肉类和海鲜上,它们通过隔绝氧气的方法,延长食材的鲜嫩时间。而在冰箱里,它们能有效的阻隔气体分子的扩散,从而保证箱内环境的清新。  遗憾的是,如此方便的保鲜膜,却被称为上个世纪最差的发明之一。  在白色污染日益严重的今