天津工业生物所获得λ噬菌体基因表达的高分辨率图谱

λ-噬菌体作为一种被广泛研究的有机体,已经成为研究基因调控的最简单模式菌株。无论是基因表达的集中研究还是现代矩阵杂交技术的应用,都阐明了λ-噬菌体在生长过程中基因功能的复杂性。最近兴起了一种核糖体图谱新技术,通过捕捉细胞内核糖体的瞬间翻译位点来为大家提供更细致和精准的基因表达图谱。 近日,中科院天津工业生物技术研究所江会锋研究组运用核糖体图谱技术获得了λ-噬菌体基因表达的高分辨率图谱。该研究将核糖体图谱技术应用于λ-噬菌体的溶菌生长过程中,以获得λ-噬菌体蛋白表达图谱,从而来推断翻译的单一位点。 通过试验,研究组验证了已知的基因表达过程,但是发现还有很多复杂的翻译过程是不可预料的,同时还发现很多核糖体都存在于未知功能的开放阅读框(ORFs)中;此外,核糖体连接在一起后可以改变mRNA翻译其他信息的结构及有效性。研究认为,即便没有功能性多肽产生,功能性ORFs也可能在转录开始时被保留于基因组,因此,可以推......阅读全文

单倍体基因型的图谱计划介绍

  国际人类单倍型图谱计划(简称单倍型图谱计划)是由6个国家建立的研究联盟正在投入一项大规模的基因组学计划,旨在查明普通疾病背后隐藏的基因。经过国家公共机构与私营公司几个月的共同努力,美国国家卫生研究院(NIH)昨天宣布,已集资1亿美元用于在3年时间里构建一个所谓的单倍型(haplotype)图谱。

美基因图谱研究将癌症重新“归类”

  美国国家卫生研究院资助的科学家团队完成大规模癌症基因组图谱绘制,他们根据基因变异和表达的相似性,提出可以按照分子类型给癌症“归类”。研究人员认为,这将为癌症诊断和治疗提供新思路。5日发表在美国《细胞》杂志上的研究,对33种癌症、1万多个肿瘤病例的基因、表观遗传和蛋白质组学变化进行分析,确认约3

美基因图谱研究将癌症重新“归类”

  美国国家卫生研究院资助的科学家团队完成大规模癌症基因组图谱绘制,他们根据基因变异和表达的相似性,提出可以按照分子类型给癌症“归类”。研究人员认为,这将为癌症诊断和治疗提供新思路。  5日发表在美国《细胞》杂志上的研究,对33种癌症、1万多个肿瘤病例的基因、表观遗传和蛋白质组学变化进行分析,确认约

小须鲸全基因组图谱获破译

  11月25日,韩国海洋科学技术研究所、深圳华大基因研究院等宣布成功破译了小须鲸全基因组图谱,并对鲸类独特生理习性的遗传学机制进行了分析。相关成果在线发表于《自然—遗传学》杂志。 人们一直痴迷于海洋生物是如何演化为陆生生物的。鲸类的进化却反其道而行之,由陆生向水生演化,和陆生偶蹄动物如牛、猪等

棉花“甲基化基因图谱”首次绘成

  30日出版的《基因组生物学》杂志刊登了中美科学家合作的一项重要研究成果:他们首次绘制出棉花表观遗传基因的“甲基化基因图谱”,即野生棉和种植棉之间500多种表观遗传基因的差异,为生物技术公司通过表观修饰育种培育出高产优质棉花提供了重要线索。  几十年来,科学家们发现,许多动植物的表观特征,既可用基

美绘出DNA一修饰因子基因图谱

  据美国物理学家组织网7月21日报道,美国科学家已经首次绘制出了人体胚胎干细胞内一个名为5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)的修饰因子的全基因图谱。科学家们表示,5hmC在一些被打开或激活的基因内出现的频率非常高,最新研究将有助于癌症的控制。研究论文发表在最新一期《基因组生物学》杂志上。

中美科学家破解胎儿基因图谱

  正在发育的胎儿的完整基因组,潜藏在它妈妈的血液里,这给准父母提供了一种潜在的非入侵方法,来检测婴儿是否患有某种先天疾病。  用羊膜腔穿刺术和其它入侵式方法,采集正在发育中胎儿的DNA会增加流产的风险。科学家发现,母亲的血浆能提供婴儿DNA片段。在此基础上,Sequenom公司目前

玉米基因组更详细图谱出炉

  美国研究人员12日在《自然》杂志网络版上发表论文称,他们利用新一代测序技术对玉米自交系B73进行测序,得到了新的、更详细的基因组图谱。研究显示,玉米具有良好的表型可塑性,不同品系玉米的基因组差异明显。这意味着在全球气候环境变化不断加剧的情况下,玉米仍有巨大的发展空间。  玉米是生物学研究中的重要

单倍体基因型的图谱计划的意义

  HapMap还将产生截止2013年尚很难预料的知识上的进展。未来可以在患者的遗传构成的基础上实现个体化医疗,从而得到最好的效果并将副作用降至最低。与长寿和抗病能力有关的遗传变异将被确定,从而产生具有广泛益处的新疗法。对任何新知识而言,HapMap既带来新的挑战,又带来不可预料的空前的机遇。

卢煜明小组破解胎儿基因图谱

  据香港明报报道,一出《哈利波特——混血王子的背叛》,令香港中文大学化学病理学讲座教授及其研究小组,突破地从孕妇血浆中的DNA,破解到其胎儿基因图谱,日后医学界可用更安全的方法,凭抽血便可诊断胎儿是否带有多种严重遗传病,避免现行以针刺进子宫抽羊水或绒毛膜出现的1%流产风险,但此法的

单倍体基因型的图谱计划的目的

  项目的目标并不是直接确定与疾病相关的基因,而是通过确定单倍型,使单倍型图成为用于进行关联研究的一个工具。在关联研究中,研究人员将患者的单倍型与健康人(对照)的单倍型相比较。如果与对照相比,某一种单倍型在患者中经常出现,影响该疾病的基因可能就存在于这个单倍型内部或附近。  常见的疾病如癌症、中风、

铁树“开花”:苏铁喜获完整基因组图谱

苏铁基因组图谱研究由来自22个科研机构的65位科学家联合完成。  苏铁目系统发育树支持现存苏铁是在经历大量灭绝以后,几次辐射演化的后代。如今苏铁有2科10属。(刘阳供图)  也许你不熟悉苏铁类植物,但你一定听说过“铁树开花”这个成语,比喻事情很难实现。相传因受苏东坡青睐,铁树得名“苏铁”。作为现存最

恶性疟原虫的基因图谱的介绍

  一份由哈佛公共卫生学院(HarvardSchoolofPublicHealth)与麻省理工学院Broad研究所(BroadInstitute)所主导的跨国研究计划,将造成疟疾(Malaria)恶性疟原虫Plasmodiumfalciparum的基因序列,完整的解析出来,据相关领域的科学家表示,这

基因测序描绘个体化医疗产业图谱

  随着高通量测序技术的引入和“大数据”处理能力的提高,现代医学正在经历巨大的变革,由传统标准化医疗模式向个体化医疗模式转变。而人类基因组计划和DNA元素百科全书计划的完成及肿瘤基因图谱的绘制,也为“量体裁药”式的个体化医疗提供了有力工具,医学领域面临新的机遇。不过,业内人士表示,尽管市场空间可观,

玉米基因组更详细图谱出炉

  美国研究人员12日在《自然》杂志网络版上发表论文称,他们利用新一代测序技术对玉米自交系B73进行测序,得到了新的、更详细的基因组图谱。研究显示,玉米具有良好的表型可塑性,不同品系玉米的基因组差异明显。这意味着在全球气候环境变化不断加剧的情况下,玉米仍有巨大的发展空间。  玉米是生物学研究中的重要

Scientific-Reports:创建首个全面基因组图谱

  近日,澳大利亚加文医学研究所的研究人揭示身体不同部位脂肪积聚所造成的伤害的驱动因素。他们的一项新研究比较了皮肤下的脂肪细胞和腹部内的有害脂肪,创建了第一个全面的基因组图谱。该图谱揭示了在细胞发育早期独特的特征,不同类型的脂肪似乎“硬捆绑”(hard-wire)在一起。该研究发表于Scientif

老鼠基因组单体型图谱出炉

美国的研究人员希望通过对15只常用于生物医药研究的小鼠的DNA进行研究来帮助科研人员确定出与环境疾病敏感性相关的基因。目前这些数据被存放在了基因变异数据目录之下,即小鼠基因组单体型图谱(将染色体分隔成许多小的片段),从而帮助研究人员找出小鼠中影响健康和疾病的基因和遗传变异。这个单体型图谱公布在7月2

基因组物理图谱的主要构架途径

基因组物理图谱的构建不需要经过减数分裂的世代群体,可直接利用DNA分子分析,主要有以下三种构建途径:限制性酶图谱。利用限制性内切酶构建图谱,对于DNA分子长度在50kb以下的片段,一般没有什么困难。而对于大于50kb的DNA分子,可选用稀有切点的内切酶酶切DNA。(1)用识别较多核苷酸的内切酶,如N

概述RNA噬菌体的基因组结构和功能

  研究最清楚的大肠杆菌RNA噬菌体是MS2,R17,f2和Qβ。它们的基因组小,只有3600到4200个核苷酸,包含四个基因。MS2.R17和f2具有几乎一样的基因组结构。在四个基因中有两个基因编码噬菌体的结构蛋白:一个是A蛋白的基因,长1178个核苷酸。A蛋白(称为成熟蛋白)的功能是使噬菌体能识

前噬菌体介导耐药基因水平传播新机制

  前噬菌体(Prophages)在包括毒力因子在内的多种功能性状的转导中发挥重要作用,但在携带和传播抗微生物抗性基因(ARGs)方面仍存在争议。  2023年6月27日,南京农业大学动物医学院兽药残留与耐药性风险评估中心王丽平教授团队联合动物科技学院刘金鑫教授在 ISME Journal (IF=

λ噬菌体的局限性λ噬菌体

实验方法原理 本实验以含原λ噬菌体和缺陷噬菌体λdg的双重溶原菌gal+作为供体,经紫外线诱导后,获取能转导半乳糖发酵基因的高频转导噬菌体裂解液,然后让这些转导噬菌体将gal+基因转移到受体菌gal-中去。实验材料 供体菌 : Escherichia coli K12 F2 gal + (带有原噬菌

标记获救法方法介绍

这是一种结合物理图谱制作和遗传学分析的基因定位方法,它适用于病毒等基因组较小的生物。以大肠杆菌噬菌体ΦX174为例,把野生型噬菌体的双链复制型DNA分子用限制性内切酶HindⅡ切为13个片段,把每种片段和突变型 amg的DNA单链在使DNA分子变性并复性的条件下混合保温,然后用各个样品分别转化受体细

用标记获救法进行基因定位

标记获救法这是一种结合物理图谱制作和遗传学分析的基因定位方法,它适用于病毒等基因组较小的生物。以大肠杆菌噬菌体ΦX174为例,把野生型噬菌体的双链复制型DNA分子用限制性内切酶HindⅡ切为13个片段,把每种片段和突变型 amg的DNA单链在使DNA分子变性并复性的条件下混合保温,然后用各个样品分别

标记获救法进行基因定位的方法介绍

这是一种结合物理图谱制作和遗传学分析的基因定位方法,它适用于病毒等基因组较小的生物。以大肠杆菌噬菌体ΦX174为例,把野生型噬菌体的双链复制型DNA分子用限制性内切酶HindⅡ切为13个片段,把每种片段和突变型 amg的DNA单链在使DNA分子变性并复性的条件下混合保温,然后用各个样品分别转化受体细

荷兰榆树病致病真菌基因图谱绘制完成

  加拿大多伦多大学与病童医院研究所日前成功绘制出荷兰榆树病致病真菌基因图谱,研究论文在线刊登于《BMC基因组学》上。   荷兰榆树病起源于喜马拉雅山,19世纪末期从荷属东印度群岛传播到欧洲,第一次世界大战后不久便在荷兰出现。荷兰榆树病是北美最具破坏力的榆树病,一般大部分树木会在感染后两年内死亡。

乳腺癌细胞与基因关系图谱绘出

  英国研究人员日前在美国《基因组研究》杂志上报告说,他们绘制出可清晰展示乳腺癌细胞形态与基因之间关系的图谱,未来有望帮助医生更准确地选择治疗方案,提升治疗乳腺癌的效果。  英国癌症研究所的研究人员利用大数据技术,分析了大量图片展示的超过30万个乳腺癌细胞的细胞形态,以及超过2.8万个基因的数据,绘

印度绘制出结核杆菌基因组图谱

  印度科学与工业研究理事会会长布拉姆哈查里近日宣布,印度研究人员成功绘制出了结核杆菌的基因组图谱,这将有助于研发有效治疗结核病的新型药物。   综合当地媒体报道,来自印度全国的数百名研究人员参与绘制出了包含4000个基因的结核杆菌基因组图谱。   据悉,印度将在互联

草鱼全基因组序列图谱绘制完成

  近日,记者从中国科学院水生生物研究所获悉,该所鱼类功能基因组学学科组负责的草鱼全基因组序列图谱绘制完成。该成果由水生生物研究所、中国科学院国家基因研究中心和中山大学等机构合作完成,相关研究成果于5月4日在线发表于《自然—遗传学》杂志。  据该所研究员汪亚平介绍,该研究采用鸟枪法测序策略,分别对一

牡蛎全基因组序列图谱绘制完成

牡蛎基因组部分序列及其分析牡蛎基因组计划(OGP)团队成员在深圳华大基因研究院讨论项目中国科学院海洋研究所和深圳华大基因研究院签约仪式牡蛎是产量最大的海水养殖动物  牡蛎养殖  近日,牡蛎基因组计划(Oyster Genome Project,OGP)项目组宣布,

历经13年-小麦基因组图谱绘制完成

经过13年努力,来自20个国家73个研究机构的200多名科学家终于绘制完成完整的小麦基因组图谱。这项“里程碑”工作为培育产量更高、营养更丰富、气候适应性更强的小麦品种奠定基础。 国际小麦基因组测序协会16日在说,他们以一种叫做“中国春”的小麦遗传研究模式品种为材料,研究整合了21条小麦染色