北京基因组所细菌陆生化研究取得阶段性成果

近日,中国科学院北京基因组研究所章张课题组对DnaE2酶的研究取得了新进展。该研究合理地解释了新基因产生和基因组进化对细菌环境适应性的影响,并进一步讨论了真核生物与陆生菌之间的共进化。研究成果在Nature子刊The ISME (International Society for Microbial Ecology) Journal上发表。 DnaE2酶是细菌复制酶DnaE1的一个同源蛋白,但研究发现该酶已经发生功能异化——主要参与易错修复而不是复制,而且被认为是造成细菌基因组GC 含量增加的主要原因。另外,有研究发现该酶还与部分细菌的耐药性有关,因此,近年来对DnaE2酶的功能及结构研究备受关注。 在该研究中,科研人员通过对菌群结构归类、进化分析及大规模宏基因组数据(metagenomics)筛选发现,DnaE2基因很可能在陆生菌(terrabacteria,最先开始陆生化的一类细菌)中最先出现,含有D......阅读全文

细菌中制备基因组DNA实验——氯化铯法

实验方法原理提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS(十二烷基硫酸钠)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质,再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质,得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出。实验材料细菌试剂、试剂盒溴化乙锭氯化铯丁醇仪器、耗材离心机巴斯吸管摇床实验步骤1.  培养100 ml

《自然》:由细菌制成的首个同步基因振荡器诞生

  可应用于环境感应器或药物输送系统   美国加州大学圣迭戈分校的杰夫·海斯第及其同事在最近出版的《自然》杂志上发表研究报告指出,他们通过合并群体效应制成了新型细菌振荡器。不过,该振动器不是典型的时钟,它既没有石英机芯,也没有旋转的秒针,它的“心脏”是一群经基因工程改造的菌群。   群体效应是一

常见细菌耐药性或给新基因疗法带来障碍

  根据一项即将发表于某同行评议期刊的新研究,一种在实验室中非常受欢迎的基因编辑疗法在用于人体时可能引发免疫反应。但目前尚无法确定这会对新基因疗法造成多严重的问题,相关基因疗法旨在阻止缺陷基因带来的疾病。  “最大的问题将会是:它在治疗上究竟会有何影响?”美国哈佛大学和加斯林糖尿病中心干细胞生物学家

中国新“超级细菌”基因追踪:能抗“最强抗生素”

  近日,一则关于“超级细菌”的新闻引起了人们的恐慌。据英国媒体报道,中国研究人员在从人体内采集的细菌中,发现了一种能对终极抗生素产生强耐药性的新基因。这种名为mcr-1的基因,被认为已经具有在细菌种群间传播和变化的高传染性,可能蔓延、威胁全球,而我国已有人曾受感染。  11月23日,其主要研究者中

水环境中耐药基因与细菌关系相关研究进展

  细菌的耐药基因是自然环境中新出现的一种潜在威胁。细菌获得耐药基因,将损坏抗生素治疗的效果。同时,耐药基因可通过水平基因转移(HGT)从一种细菌转移到另一种细菌。但是,目前水环境中耐药基因与细菌之间的相关关系尚不清楚。  中国科学院武汉植物园水生植物与流域生态重点实验室环境基因组学学科组张卫红等在

为何你容易长粉刺-丹麦发现引发粉刺细菌基因

  为什么有的人特别容易长粉刺?最近丹麦奥胡思大学的研究者报告称,他们发现了导致粉刺的皮肤细菌基因,并坚信为研发防治新药提供了新途径。  研究人员认为,细菌家族中的每个物种或一群物种,都有数百或数千个基因构成的基因子集。一些人面部的生理状态易于痤疮丙酸杆菌生长繁殖,此后该细菌的几个基因子集

水稻细菌性条斑病抗性基因的研究发现

  2021年6月7日,The Plant Journal在线发表了广西农业科学院水稻研究所邓国富和黄大辉研究员团队完成的题为“Bacterial Leaf Streak 1 encoding a mitogen-activated protein kinase confers the rice r

志留纪兰多维列世陆生植物微体化石研究新进展

  中奥陶世-志留纪早期是陆生植物关键性状起源与演化的重要时期。目前普遍接受的学术观点认为,陆生植物化石的最早证据可以追溯至中奥陶世大坪期-达瑞威尔期(ca.468-463Ma),以冈瓦纳大陆的二分体、四面体型四分体等隐孢子为代表;而在志留纪温洛克世申伍德期(ca.432Ma),出现了最早的陆生植物

我国学者阐述板块运动对陆生植物演化的驱动作用

  印度板块从冈瓦纳裂离并向北漂移、碰撞拼贴至欧亚大陆之上是地球晚中生代演化中的一个重要事件,它对现代欧亚大陆地质、地貌格局的形成具有决定性意义。关于这一板块漂移的证据过去多源自古地磁,古生物化石方面的研究少之又少。  最近,中国科学院南京地质古生物研究所李建国研究员团队根据陆生植物易受海洋地理隔离

陆生植物叶片水势一定比水生植物水势低吗?

  水势越低确实是越容易吸水,但是要是在各种植物之间比较,也是有差异的。   由水势的公式∮w=∮s+∮p+∮g+∮m(基质势)知,一般陆生植物的环境中,基质势的大小是不容忽略的,尤其是木本植物一般在比较干旱的地方生长,因此基质势的绝对值更大,水势更小,在水生植物中绝对值就要小得多了。

中国科学家破译巽他大陆生物地理格局差异之谜

  中科院西双版纳植物园7月23日证实,该园科研人员通过分析东南亚赤道附近植物区系,对巽他大陆地区生物地理格局研究取得新进展――科研人员推断巽他大陆中央的沙质海床土壤是扩散屏障,这也是世界上首次提出土壤是造成巽他大陆不同地区生物地理格局差异的原因。  科研人员表示,巽他大陆由不同年代的增生

揭秘!史上体型最大的陆生哺乳动物到底有多重

  巨犀,史上体型最大的陆生哺乳动物,约4000~2200万年前生活于欧亚大陆。它们的体型增长极快,留下了一个重要的演化之谜。  近日,中国科学院古脊椎动物与古人类研究所(以下简称古脊椎所)科研团队报道了宁夏回族自治区灵武市早渐新世晚期清水营组发现的准噶尔巨犀,并推算了包括其在内的多数巨犀的体重。相

蓝细菌属于细菌吗

蓝细菌是细菌。蓝细菌就是蓝藻,是细菌,细菌就是原核生物,没有成型的细胞核。蓝细菌是一类进化历史悠久、革兰氏染色阴性、无鞭毛、含叶绿素a,但不含叶绿体(区别于真核生物的藻类)、能进行产氧性光合作用的大型单细胞原核生物。特点:蓝细菌分布极广,普遍生长在淡水、海水和土壤中,并且在极端环境(如温泉、盐湖、贫

蓝细菌是细菌吗

是的,蓝细菌是一类特殊的细菌。它们被归类为细菌的一种,具有细胞结构、细胞壁和细胞质等细菌特征。蓝细菌得名于它们的蓝绿色色素,这种色素能够帮助它们进行光合作用。与其他细菌不同的是,蓝细菌具有一种特殊的细胞器——蓝细菌叶绿体,类似于植物的叶绿体,可以进行光合作用来合成有机物质。因此,蓝细菌既具备细菌的特

武汉植物园在植物适应水生环境基因分化研究中取得进展

  水生环境与陆生环境有巨大的差异,大部分陆生植物不能在水生环境完成正常的生长、繁殖,对其而言,适应水生环境是巨大的挑战。探讨植物适应水生环境的机制一直是植物学领域的研究热点之一。  毛茛属起源于约1800万年前,是植物界既有陆生又有典型沉水种类的最年轻类群之一,是研究植物适应水生环境的理想材料。在

研究发现现存陆地植物的共同祖先起源类群

  2019年11月14日,中国农科院深圳农业基因组研究所程时锋团队与德国科隆大学Michael Melkonian教授以及加拿大阿尔伯塔大学Gane Ka-Shu Wong教授合作在Cell杂志发表了题为“Genomes of Subaerial Zygnematophyceae Provide

科研人员解析晚更新世全球陆生脊椎动物种群历史动态时空格局

  气候变化和人类活动的双重胁迫正在导致野生动物种群数量持续衰退,这一现象已构成全球性生物多样性危机。基于基因组学的大数据分析,尤其是通过成对序列马尔可夫溯祖模型模拟历史有效种群大小(Ne),进而评估物种进化潜力与长期生存能力的方法,已成为解析历史种群波动的研究范式,在保护生物学领域具有理论价值与实

细菌

 细菌是一类细胞细而短(细胞直径约0.5μm,0.5-5μm)、结构简单、细胞壁坚韧以二等分裂方式繁殖和水生性较强的原核微生物,分布广泛。一、细菌的形态:  细菌的形态分:  球菌coccus:包括双球菌Diplococcus、链球菌Streptococcus、四联球菌Tetracoccus、八叠球

气候变冷让巨犀长成史上体型最大的陆生哺乳动物

科技日报记者 陆成宽 作为史上体型最大的陆生哺乳动物,巨犀虽然已经灭绝,但其在距今4200万-2200万年间体型不断增大、“吨位”越来越重的演化之谜,一直备受古生物学家关注。 《历史生物学》近日发表了一项关于巨犀化石的最新研究成果。通过对生活在距今约3000万年早渐新世晚期的准噶尔巨犀骨架进

科学家发现我国陆生脊椎动物多样性“博物馆”

第六次生物大灭绝是否已经开始未有定论,但生物多样性加速丧失是不争的事实。中科院院士、中科院动物研究所研究员魏辅文近日指出,在生物多样性保护中,相比物种多样性,遗传多样性容易被忽视,却非常关键。 历时两年,由魏辅文领衔的合作团队收集和整理了已发表的中国陆生脊椎动物的遗传多样性和系统发育多样性数据,

英研究人员发现肠道细菌改变人体基因的作用机理

   据英国生物技术及生命科学研究理事会(BBSRC)近日消息,来自剑桥附近的巴巴拉姆研究所(Babraham Institute)的研究人员与巴西和意大利研究人员合作,发现肠道内的细菌可以控制人体细胞中的基因信息。这项研究表明,来自细菌的化学信息可以改变人类基因组中关键化学标记物的位置。通过这种沟

PNAS:太空细菌发生基因改变-有助研制强力抗生素

美科学家在9月25日出版的《美国科学院院刊》(PNAS)上发表的一项研究成果表明,一种能引起食物中毒的沙门氏菌,在太空飞船零重力的情况下度过12天后,其毒性明显加剧了。科学家认为,这项研究将有助于发明出效果更好的抗生素。 2006年9月,美国亚利桑纳州立大学传染病中心的微生物学家谢丽尔·尼克森领导的

英研究人员发现肠道细菌改变人体基因的作用机理

  据英国生物技术及生命科学研究理事会(BBSRC)近日消息,来自剑桥附近的巴巴拉姆研究所(Babraham Institute)的研究人员与巴西和意大利研究人员合作,发现肠道内的细菌可以控制人体细胞中的基因信息。这项研究表明,来自细菌的化学信息可以改变人类基因组中关键化学标记物的位置。通过这种沟通

基因泰克达成10亿美元合作-从土壤细菌发现新药

  今日,致力于直接从土壤中微生物的DNA序列信息中鉴定和生产具有生物活性天然产品的医药开发公司Lodo Therapeutics宣布与罗氏集团成员基因泰克(Genentech)达成战略药物发现合作。   Lodo创立于2016年1月,专注于创造来自自然界的新型治疗药物,以惠及世界各地的患者。该公

基因泰克达成10亿美元合作-从土壤细菌发现新药

  今日,致力于直接从土壤中微生物的DNA序列信息中鉴定和生产具有生物活性天然产品的医药开发公司Lodo Therapeutics宣布与罗氏集团成员基因泰克(Genentech)达成战略药物发现合作。   Lodo创立于2016年1月,专注于创造来自自然界的新型治疗药物,以惠及世界各地的患者。该公

Nature子刊揭示基因改变肠道细菌,肥胖治疗或有新希望

  国家卫生研究院最新研究发现,倘若剔除小鼠体内的dusp6基因,将可改变体内肠道菌相,可达到抑制肥胖的效果,约可减少2成的体重及体脂肪,人体内也有dusp6基因,目前已掌握培养出具有抑制肥胖效果的肠道菌相的关键方法,正进一步筛选菌株进行测试,预计在1至2年内可以完成效果验证,约2至3年可应用在益生

-利用肠道细菌关闭生育基因可消灭传染寨卡病毒蚊虫

  英国斯旺西大学的研究团队找到了一种消灭传染疾病的蚊蝇和害虫的新方法——利用其肠道内的共生细菌充当“木马”,向控制生育的基因传递“关闭”信号,以此来减少蚊蝇和害虫的数量。针对两种有害昆虫的研究表明,一种害虫的生育率下降高达100%;另一种害虫的幼虫死亡率增加了60%。  据斯旺西大学官网报道,该团

研究证实细菌DNA可整合至人类基因组

  日前,马里兰大学医学院(University of Maryland School of Medicine)的科学家们找到了细菌基因可偶然性地整合至人类基因组中的强力证据。研究发现,大约 1/3 的健康基因组中含有细菌 DNA 序列,而癌细胞中则更高。从而证实了来自细菌的侧向基因转移(L

微生物所在人体肠道细菌耐药基因研究方面取得进展

  人体肠道中栖息着种类繁多的微生物,其数量超过人体自身细胞的10倍以上。这些微生物的基因组中(microbiome)蕴含大量的遗传信息,被称为是“人体的第二个基因组(the second genome of human body)”。人体肠道微生物对人体肠道内营养物质的代谢、人体自身的发育

细菌噬菌体细菌防御方法

  细菌防御噬菌体的主要方法是合成能够降解外来DNA的酶。这些酶被称为限制性内切酶,它们能够剪切噬菌体注入细菌细胞的病毒DNA。细菌还含有另一个防御系统,这一系统利用CRISPR序列来保留其过去曾经遇到过的病毒的基因组片段,从而使得它们能够通过RNA干扰的方式来阻断病毒的复制。这种遗传系统为细菌提供