北京基因组所细菌陆生化研究取得阶段性成果
近日，中国科学院北京基因组研究所章张课题组对DnaE2酶的研究取得了新进展。该研究合理地解释了新基因产生和基因组进化对细菌环境适应性的影响，并进一步讨论了真核生物与陆生菌之间的共进化。研究成果在Nature子刊The ISME (International Society for Microbial Ecology) Journal上发表。 DnaE2酶是细菌复制酶DnaE1的一个同源蛋白，但研究发现该酶已经发生功能异化——主要参与易错修复而不是复制，而且被认为是造成细菌基因组GC 含量增加的主要原因。另外，有研究发现该酶还与部分细菌的耐药性有关，因此，近年来对DnaE2酶的功能及结构研究备受关注。 在该研究中，科研人员通过对菌群结构归类、进化分析及大规模宏基因组数据(metagenomics)筛选发现，DnaE2基因很可能在陆生菌(terrabacteria，最先开始陆生化的一类细菌)中最先出现，含有D......阅读全文
稻子为何能陆生？进化分蘖调控机制是关键
记者从云南大学获悉，该校农学院胡凤益研究员及其合作团队近日成功揭示了陆稻在陆生适应性进化中的分蘖调控作用机制。《自然》子刊《自然·通讯》在线发表了这一成果。 植物株型对作物产量具有重要作用，许多禾本科作物的驯化历史都经历了共有、平行的株型变化模式，即具有分蘖减少的转变。例如，玉米、高梁、小麦、
版纳园研究揭示影响陆生植物叶片养分的因素
陆地生态系统的功能和生物地球化学循环与叶片元素含量紧密相关，因此认识影响叶片元素含量的生物、生态因子对于模拟生态系统的生产力、养分流及其对全球变化的响应具有重要意义。 中科院西双版纳热带植物园生理生态研究组的张石宝、曹坤芳等研究人员在生物地理学顶尖期刊Global Ecolo
细菌中制备基因组DNA实验——小量制备
真核生物的一切有核细胞（包括培养细胞）都能用来制备基因组 DNA。真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内，因此，制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离，又要保持DNA分子的完整。实验方法原理提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液
细菌利用基因开关来防御金属带来的死亡
格里菲斯大学的研究人员在一种常见细菌中发现了一种基因开关，这种基因开关有助于防御人体的自然免疫系统。格里菲斯大学药学院的Matthew Sullivan博士和Kelvin Goh博士研究了B族链球菌对锌和铜金属的反应，并发现了细菌能够抵抗金属压力的多种方式。沙利文博士说:“我们观察到B组链球菌的基因
人体肠道细菌基因组集研究成果
2019年2月5日上午，深圳华大团队在国际知名学术期刊自然旗下子刊自然生物技术上发表了关于人体肠道细菌基因组集（Culturable GenomeReference, CGR）研究成果。该研究提供了1500多条高质量的人体肠道细菌基因组，为肠道微生物组研究提供了大量全新的参考基因组数据，同时
科学家揭示超级细菌产生耐药基因原因
[提要] 自然界(非临床环境)中本来就存在大量的“天然耐药基因”，而人类对抗生素的滥用如同“筛选压力”，选择并进化这些整合有“耐药基因”的病菌，使得后者最终成为人类的噩梦――临床上的“耐药菌”。 自然界(非临床环境)中本来就存在大量的“天然耐药基因”，而人类对抗生素的滥用如同“筛选压力
科学家合成“最小”细菌－仅有473个基因
当谈到基因组的大小时，一种被称为衣笠草的罕见日本植物无疑是当下的重量级冠军——其脱氧核糖核酸（DNA）数量是人类的50倍。而在天平的另一端，一个新的轻量级纪录保持者如今诞生在美国加利福尼亚州的一个培养皿中。在3月25日出版的《科学》杂志中，由基因组测序先驱Craig Venter率领的研究人员报
研究发现进化分蘖调控机制是稻子陆生的关键
记者从云南大学获悉，该校农学院胡凤益研究员及其合作团队近日成功揭示了陆稻在陆生适应性进化中的分蘖调控作用机制。《自然》子刊《自然·通讯》在线发表了这一成果。 植物株型对作物产量具有重要作用，许多禾本科作物的驯化历史都经历了共有、平行的株型变化模式，即具有分蘖减少的转变。例如，玉米、高梁、小麦、
科学家发现水藻“上岸”因有基因基础
一个国际科研团队新近绘制出一种淡水藻类的基因组图谱，发现其中有些特征与陆生植物相似，可能正是类似的基因最终使水生植物得以进化成陆生植物。 最早的植物和动物都生活在水里。大约5亿年前，第一批植物在陆地上扎根，使地球面貌发生巨大变化，并为动物上岸打下基础。 目前学术界一般认为，陆生植物起源于绿藻
Cell丨程时锋团队揭示现存陆地植物的共同祖先起源类群
光合真核生命起源于大约15亿年前的海洋，繁盛于有光和水的地方；大约5-6亿年前，发生了绿藻陆地化事件，祖先绿色植物开始了从简单到复杂、从水生向陆地的迈进。植物陆地化是一个漫长而复杂的演化过程，在潮起潮落、沧海桑田的跌宕变迁中，一些地理生境出现周期性干涸的现象，如形成小水坑、河床、近海泥沼等，开始
科学家发现水藻“上岸”因有基因基础
一个国际科研团队新近绘制出一种淡水藻类的基因组图谱，发现其中有些特征与陆生植物相似，可能正是类似的基因最终使水生植物得以进化成陆生植物。 最早的植物和动物都生活在水里。大约5亿年前，第一批植物在陆地上扎根，使地球面貌发生巨大变化，并为动物上岸打下基础。 目前学术界一般认为，陆生植物起源于绿藻
英专家称“超级细菌”基因强悍－难治但易防
“超级细菌”近来引发全球关注，英国因其科研人员主导相关研究和国内病例数量较多而成为这一事件的焦点。记者就此采访了英国加的夫大学的马克·托尔曼博士。他指出，“超级细菌”的超强抗药性来源于一个强悍基因，虽抗药性超强，但致病性却并不一定强。对个人而言，多洗手，注意饮食卫生是目前简单有效的预防
基于SHERLOCK的基因工具快速而全面地口腔细菌
由于一种使用SHERLOCK（CRISPR的进化版）检测唾液中细菌的新型工具，这在未来可能可以帮助人们在检查后很快带着关于口腔健康的更全面信息离开牙医。这种精确的工具比现有的方法要快得多，并可能导致口腔和其他疾病的早期检测和治疗。 来自马萨诸塞州福斯研究所的研究人员调整了基于基因编辑的CRIS
细菌基因组DNA提取试剂使用说明（二）
三.组织或液体样品中细菌DNA提取该方案适合于从各种组织、血液、分泌液等液体样品中提取基因组DNA和寄生的细菌DNA。纯化的DNA可直接用于各种细菌的检测。若需从粪便样品中提取细菌DNA，我们推荐使用DePure Stool DNA Kit，若需要从土壤样品中提取细菌DNA，推荐使用DePure
王友绍团队发现浮游细菌基因转移因子
近日，中科院南海海洋所研究员王友绍团队在南海北部首次发现浮游细菌的基因转移因子。相关成果发表在《公共科学图书馆·综合》上。 基因转移因子广泛存在于海洋细菌基因组上，可传递抗光合基因、固碳基因和硫还原基因等。目前，对海洋细菌基因转移因子研究尚处于起步阶段。 基因转移因子是一种由细菌释放的、形态
使用基因测试可精确区分病毒和细菌感染
美国杜克大学医学院的研究人员近日研发出一种基因测试方式，可以准确区分病毒或细菌感染，从而有助于减少不必要的抗生素过量服用以及进而出现的细菌耐药性等问题。 杜克大学医学院的研究人员通过血液基因测试，成功区分了人类呼吸系统疾病的病毒和细菌感染，准确率可达90%以上。 这种测试可以检测出患
《科学》：细菌能将基因转移到复杂有机体
细菌等微生物之间的横向基因转移（lateral gene transfer）现象频繁发生，这对于它们的进化发展至关重要。美国科学家最新研究发现，细菌也能将基因转移到复杂有机体中去。这将促使科学家重新思考种间基因转移在进化中的作用，也使得遗传学家今后在为新基因组排序时，不得不采用新的方法以过滤掉细菌基
细菌基因组DNA提取试剂使用说明（一）
细菌基因组DNA提取试剂使用说明书◆ 产品说明基于硅胶柱纯化方式。试剂中的溶菌酶消化去除细菌的细胞壁，革兰氏阳性细菌还可加入玻璃珠涡旋破壁，在裂解液和蛋白酶作用下裂解消化，DNA释放到裂解液中。加入乙醇后，转移至吸附柱中过滤，DNA被吸附至吸附柱的膜上，而蛋白质则被去除。吸附柱经Buffer G
细菌基因组DNA快速提取试剂使用说明
细菌基因组DNA快速提取试剂◆ 产品说明核酸抽取系列是检测试剂配套使用的DNA/RNA提取系列产品。本产品为细菌基因组DNA快速提取试剂，采用独特的溶解系统，可快速地从样品中制备DNA。提取过程中无需使用有毒的酚氯仿，也无需进行耗时的醇类沉淀，整个过程只需10-15分钟。◆ 产品组成 071011M
方法二：细菌基因组DNA的微量提取法
本方法通过SDS裂解细胞，蛋白酶降解蛋白，CTAB去除多糖成分一：仪器：同方法一 二：试剂：TE、TAE缓冲液；10%SDS；５ＭNaCL；20mg/ml蛋白酶Ｋ；CTAB/NaCL溶液(10% CTAB，0.7M NaCL 4.1gNaCL 溶于80ml水中，缓慢加入10gCTAB，加热溶解)；
长读测序发现高达20％的果蝇基因来自细菌
科学家芭芭拉·麦克林托克在20世纪40年代首次发现了“跳跃基因”，即那些可以在其他物种基因组内移动或转移到其他物种基因组中的基因。然而，研究人员继续发现它们在进化和健康中的重要性。在UMSOM和IGS的微生物学和免疫学教授Julie Dunning Hotopp博士的带领下，IGS的研究人员使用了新
基因组所程时锋团队揭示植物祖先成功登陆的分子机制！
2019年11月14日，Cell杂志在线发表了来自中国农业科学院基因组所合成生物学中心程时锋团队联合德国、加拿大、俄罗斯与深圳华大基因等团队题为“Genomes of subaerial zygnematophyceae provide insights into land plant evol
《供港澳食用陆生动物检验检疫管理办法》实施
海关总署公告2024年第149号（关于实施《供港澳食用陆生动物检验检疫管理办法》相关事宜的公告） 公告〔2024〕149号 根据《供港澳食用陆生动物检验检疫管理办法》（海关总署令第266号）有关要求，现将《供港澳活猪饲养场应具备的条件》等有关检验检疫要求（详见附件1—9）予以公布。 本公告
我国学者攻破高质量角苔参考基因组
苔藓类包括苔、藓和角苔三大分支，是现存最早的陆生植物，代表了植物演化过程中从水生到陆生的过渡类群。长久以来关于早期陆地植物的起源与植物登陆一直存在诸多争论和未解之谜。近年来，人们利用组学数据将早期陆地植物的系统位置争论聚焦到了角苔类上。角苔类以其难解的系统位置、衍生与原始兼具的形态特征、与细菌和
小须鲸全基因组图谱获破译
11月25日，韩国海洋科学技术研究所、深圳华大基因研究院等宣布成功破译了小须鲸全基因组图谱，并对鲸类独特生理习性的遗传学机制进行了分析。相关成果在线发表于《自然—遗传学》杂志。 人们一直痴迷于海洋生物是如何演化为陆生生物的。鲸类的进化却反其道而行之，由陆生向水生演化，和陆生偶蹄动物如牛、猪等
《基因组生物学》：一种超级细菌的基因组测序完成
最近，英国桑格研究所（Wellcome Trust Sanger Institute）和布里斯托尔大学的研究者们共同完成了一种名为Steno的超级细菌的基因测序工作，研究结果显示，这是一种具有显著抗药性的生物体。对这种细菌基因组的了解将有助于研究者们发现如何应对这种具有独特抗药性的生物体。这一研究论
关于萤光素酶的生物发光介绍
生物发光现象是在生物体内，由于生命过程的变化，化学反应将化学能转化为光能而发光的现象。生物发光在英语中名为bioluminescence，该词为合成词，是由希腊语中代表生命的bios与拉丁语中意为光的lumen组合而成。大部分发光与三磷酸腺苷（ATP）有关，发光的化学反应不限于在细胞内外发生。对
Genome－Res：全基因组测序追踪耐药细菌传播机制
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）是一种常见的引发院内感染的致病菌，其也是资源不足医院感染的一大负担，此前当资源较好的临床机构运用全基因组测序来追踪MRSA的扩散时，针对有限的感染控制的传播动力学常常并不清楚，近日，来自剑桥大学的研究人员就利用全基因组测序的技术揭示了高传播率的资源受限医院中M
南海海洋所发现浮游细菌基因转移因子
基因转移因子（Gene Transfer Agent, GTA）广泛存在于海洋细菌基因组上，可传递抗光合基因、固碳基因和硫还原基因等，对海洋细菌GTA研究尚处于起步阶段。近日获悉，中国科学院南海海洋研究所王友绍团队在南海北部首次发现浮游细菌的GTA，相关成果发表在Plos One (2014,
细菌中制备基因组DNA实验——氯化铯法
实验方法原理提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质，再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质，得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出。实验材料细菌试剂、试剂盒溴化乙锭氯化铯丁醇仪器、耗材离心机巴斯吸管摇床实验步骤1. 培养100 ml