2014年富兰克林奖揭晓蛋白质数据库主任Berman博士获奖
2014年3月10日，Bioinformatics.org主席Jeff Bizzaro宣布，来自罗格斯大学,新泽西州州立大学Helen M. Berman博士获得2014年“本杰明•富兰克林奖”，以表彰其在生命科学领域数据共享所做的努力。 自2002年以来，本杰明•富兰克林奖在生命科学领域成立一个开放存取数据库Bioinformatics.org，这个数据库专为生命科学领域的研究者提供开放获取的材料和方法。 Berman是该奖项的第13位获奖者，她花费近50年的时间来管理Protein Data Bank。 作为结构生物信息学研究合作实验室(Research Collaboratory for Structural Bioinformatics ，RCSB)的主任，Berman 1998年接手管理PDB数据库，......阅读全文
siRNA数据库与设计工具
siRNA DatabaseSearchable database of Silencer ™ Validated and Pre-designed siRNAs to >34,000 human, mouse, and rat targets. All siRNAs in the database
北京正在建罕见病数据库
今日，2014第三届中国罕见病高峰论坛在京举办。北京医学会罕见病分会副主任王琳在论坛中透露，北京正在建立罕见病病例登记系统和病人数据库，尝试单病种追踪调研和罕见病诊治地图的设置。 王琳介绍，中国目前所应用的罕见病相关数据都是基于欧盟、美国等地所提供的资料。“而国内到现在也没有对本国进行过罕见病
国内首个向量数据库标准发布
11月15日，中国信通院联合腾讯云计算（北京）有限责任公司、中移（苏州）软件技术有限公司等多家企业共同编制的、国内首个向量数据库标准正式发布，将为我国向量数据库研发、测试及选型提供重要参考，推动我国人工智能产业高质量发展。 向量数据能够从多个维度记录事物特征，是人工智能时代的基础数据形式。人工
生命科学国外重要数据库
EMBL数据库结构EMBL数据库的基本单位也是序列条目，包括核甘酸碱基排列顺序和注释两部分。序列条目由字段组成，每个字段由标识字起始，后面为该字段的具体说明。有些字段又分若干次子字段，以次标识字或特性表说明符开始，最后以双斜杠“//”作本序列条目结束标记。条目的关键字包括ID（序列名称），DE（序列
盐湖资源环境信息数据库建成
日前，中国科学院青海盐湖研究所在科技部基础专项、中科院“百人计划”等项目的支持下，立足柴达木盆地盐湖资源优势，历时6年建成的盐湖资源与环境科学基础数据共享数据库正式通过科技部验收。这标志着目前我国数据量最大的盐湖资源与环境科学基础数据共享系统正式建成，并对基于科学数据的盐湖资源合理利用、长远决策
植物生物学研究数据库
实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant
美国CDC将建炭疽杆菌公共数据库
日前，美国疾病预防控制中心（CDC）表示，将在亚特兰大建立一个有关炭疽杆菌的公共数据库。CDC称，已经在寻找可以建立这一公共数据库的承包商。 这一举动源于6月份在亚特兰大实验室发生的炭疽杆菌事件。由于实验室部分研究人员，在让炭疽杆菌失去活性时未遵守适当程序，便将可能含有活菌样本转移到安
天津建成食品污染物数据库
日前从天津市卫生计生委、市卫生监督所获悉，为了扩大食品污染物及有害因素监测覆盖面，实现对食源性疾病的主动监测，该市食品安全风险监测区域已覆盖全市16个区县，食源性疾病监测哨点医院已由18家增加到33家，并已形成了市食品污染物数据库。 根据目前在食品安全领域担负的职责，该市卫生计生部门规划建立了
首个免疫衰老多组学数据库设立
记者12月17日从中国科学院基因组所（国家生物信息中心）了解到，该所研究员张维绮团队、鲍一明团队与中国科学院动物研究所研究员刘光慧、曲静研究组合作，建立了免疫衰老领域首个多组学数据库Immunosenescence Inventory，旨在为整合和分析与免疫衰老相关数据提供一体化平台。随着全球人口老
我国首个寻亲DNA数据库在京建立
科技日报消息，我国第一个专门面向失散人员的寻亲DNA数据库日前在京宣告建立。据数据库建设方中科院北京华大方瑞司法物证鉴定中心的有关负责人介绍，通过该库，寻亲工作将变得方便快捷。同时，该库将免费为我国失散人群提供寻亲帮助，包括港澳台地区。 据悉，该库的第一批样本检测用试剂已经得到了美国
Nature：癌症数据库ClinVar打破Myriad垄断
去年，美国最高法院判定Myriad Genetics持有的BRCA1和BRCA2 DNA序列测试ZL无效，美国最高法院判定也意味着未来美国国内的癌症检查价格将变得更加便宜、普遍。 BRCA1基因的发现和致病相关性是Mary-Claire King博士在1990年发现，尽管当时她的研
英特尔将建帕金森患者数据库
帕金森症的患者通常都会被要求尽可能细致地做好自己的病情记录，以便于医生判断病情的进展。但不少患者都抱怨，我虽然正视自己的病情，但帕金森病并不是我生活的全部啊，按医生要求那样的忠实完整记录自己的病情？说起来容易做起来难！ 好消息是，现在的病情监测可以很容易了。拜可穿戴技术所赐，帕金森病患者运
全球最大自闭症数据库上线
总部位于美国纽约的Simons基金会日前宣布，全球最大的自闭症数据库（SSC）正式上线并向全球科学家开放。目前已有来自美国、加拿大、中国、法国、冰岛、澳大利亚、爱尔兰、巴西和卡塔尔等17国家相关机构的自闭症研究人员，通过云端查询等方式使用了这一数据库。 SSC包含近2600个家庭的基因组序列数
全球最大地震数据库建成
国际地震学中心绘制的2万次地震数据集。 2004年苏门答腊岛地震、2008年中国汶川地震、2010年海地地震、2011年日本地震，在每次灾难中，故事都是相同的：一场地震在毫无征兆的情况下发生，夺走成千上万条生命，并且摧毁了像沙子城堡一样的建筑。 地球科学家依然无法预测一场大地震
建立临床数据库的好处有哪些？
建立临床数据库具有以下诸多好处： 1. 提高医疗质量：通过对大量病例数据的分析，可以发现治疗过程中的优势和不足，从而优化治疗方案，提高医疗效果和患者的预后。 2. 支持临床研究：为医学研究提供丰富的数据资源，有助于发现疾病的发病机制、危险因素和新的治疗靶点，推动医学科学的发展。 3. 促进个性
全球首个冰川微生物数据库
青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外，它是全球最大的冰川分布区，现有冰川2万条以上，面积超过2万平方公里，也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器，封存了不同历史时期的微生物。 现在，中国科学家构建的
美国CDC将建炭疽杆菌公共数据库
日前，美国疾病预防控制中心（CDC）表示，将在亚特兰大建立一个有关炭疽杆菌的公共数据库。CDC称，已经在寻找可以建立这一公共数据库的承包商。 这一举动源于6月份在亚特兰大实验室发生的炭疽杆菌事件。由于实验室部分研究人员，在让炭疽杆菌失去活性时未遵守适当程序，便将可能含有活菌样本转移到安全措施
代谢组学常使用的数据库
代谢组主要是对小分子代谢物（一般50-1500 Da）进行高通量定性和定量分析，代谢组分析产生了大量的生物信息数据。代谢组数据库的开发对于归纳总结这些大数据，方便后续的代谢组学数据分析，揭示隐藏在大数据背后的生物学机理具有十分重要的作用。 目前常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD
TPC：中国数据库性能破世界纪录
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/497431.shtm
学术数据库免费时代何时来临
“北大买不起知网，研究者看不起论文”，逐年上涨的论文数据库使用费令学术界叫苦不迭。26日是第16个世界知识产权日，让我们探讨一下如何在保护知识产权的同时，解决商业数据库“坐地起价”之怪现状。 学术资源的“商业化” 本月初，北京大学官网发布了通知，称因中国数据库商涨价过高，图书馆将停用“中国知
全球首个活人脑细胞数据库公布
据美国《科学》杂志在线版29日消息称，艾伦脑科学研究所日前公布了全球首个活人大脑细胞数据库，该数据库信息可公开获取。在人类理解大脑的道路上，这一成就为科学家提供了深入探究人脑的重要资源，同时以前所未有的独特性，帮助医学界确定健康与患病大脑之间的不同。 2002年，微软公司共同创始人之一保罗·艾
上海有机所推出含氟试剂数据库
有机氟化合物由于独特的理化和生物性能，在医药、农药、先进材料等领域发挥作用。含氟试剂是发展有机氟化合物合成方法的基础，也是氟化学领域发展的基石。然而，含氟试剂的结构、性质、功能等信息分散于文献中，不便于合成化学家查找和使用。因此，亟需专业平台来全面了解和积累含氟试剂的结构、性质、功能等信息。近日
中国BIGD跻身国际生物组学数据库
测序技术的发展将生命科学领域带入组学时代，海量的数据产出成为常态。组学是将基因、蛋白及代谢物等生物分子以整体为单位进行系统性的研究，基因组学、蛋白质组学和代谢物组学等相应产生。相较于此前以个体为单位的研究，组学最主要的特征就是大数据。随着组学数据的产出，搭建组学数据库，实现海量信息的存储、整合及
上海有机所推出含氟试剂数据库
有机氟化合物由于独特的理化和生物性能，在医药、农药、先进材料等领域发挥作用。含氟试剂是发展有机氟化合物合成方法的基础，也是氟化学领域发展的基石。然而，含氟试剂的结构、性质、功能等信息分散于文献中，不便于合成化学家查找和使用。因此，亟需专业平台来全面了解和积累含氟试剂的结构、性质、功能等信息。近日，中
化学键能数据库iBonD在京发布
3月15日，清华大学基础分子科学中心和南开大学元素有机化学国家重点实验室程津培教授研究组在京发布了国际上首个涵盖全面、数据可靠、使用快捷方便、专业权威的网络版化学键能数据库iBonD1.0版。 键能是化学领域中最基础参数之一，因该参数直接反映出化合物的稳定性以及判断化学反应是否能发生，从而成为
天津工生所举行TotalPatentZL数据库培训
为提高TotalPatent数据库在科研中的实际使用效果，7月13日，中科院天津工业生物技术研究所信息资源中心特邀LexisNexis北方区培训讲师岳亭为职工和研究生进行TotalPatent数据库培训。 岳亭介绍了TotalPatent数据库的内容、功能及检索方法，从
中国盐湖资源与环境科学数据库建成
9日，中国科学院青海盐湖研究所历时6年建成的中国盐湖资源与环境科学数据库通过科技部验收，这也是中国唯一数据量最大的盐湖资源与环境科学基础数据共享系统。 盐湖资源是中国西部地区特色资源之一，也是中国具有相对国际优势的无机矿产资源，其中的钾、锂、硼、铷、铯等资源
英政府设数据库保留无罪者DNA
据《自然》网站报道，今年早些时候，英国政府曾计划将无罪的普通人的DNA保留在其大型公安数据库中，一时间引起舆论纷纷。欧洲人权法庭后来裁决，无罪者的DNA不应该被保留。 近日据英国媒体报道，从一些泄露出来的电子邮件得知，英国政府仍然决定保留无罪者的DNA，但时间不是之前所称的12年，而是6年
武汉将建温室气体排放因子数据库
武汉碳减排协会今天发布消息称，作为国家确定的7个碳排放权交易试点之一的武汉碳交易系统今年内将全面上线。 武汉碳减排协会会长程致舜说，交易系统技术层面的准备已经完成，不同物品在各环节的碳排放量都可以清楚地查询到。 据介绍，根据与法国波尔多市签署的友城合作协议，一个中法温室气体排放试点评
“中国科学引文数据库”将面向全球推出
中国科学院国家科学图书馆近日与美国汤姆森科技信息集团共同宣布，将联手向全球推出“中国科学引文数据库”（CSCD），该数据库将依托ISI Web of Knowledge平台，让全世界更多的科研人员了解中国的科研发展及动态。 “中国科学引文数据库”由中国科学院历时20年组织研发，作为国内首个引文数据库