清华大学3月连续发文破译“组蛋白密码”识别新机制

清华大学医学院基础医学系和结构生物学中心李海涛课题组日前在国际权威学术期刊《自然》(Nature, 2014年3月2日)和《基因与发育》(Genes & Dev,2014年3月3日)在线发表两篇论文,从结构生物学角度解析组蛋白甲基化修饰识别新机制,进一步揭开错综复杂的表观遗传调控(epigenetic regulation)的神秘面纱。 何谓组蛋白密码? 组蛋白在翻译后的修饰中会发生改变,从而提供一种识别的标志,为其它蛋白与DNA的结合产生协同或拮抗效应,它是一种动态转录调控成分,称为组蛋白密码(Histone code)。 组蛋白修饰类型 真核生物基因表达调控不仅依赖于特定的DNA 序列元件,而且还受到特定组蛋白翻译后修饰的精密调节。目前鉴定出的组蛋白修饰化学类型已超过25种,包括甲基化,酰......阅读全文

研究揭示SHL蛋白对抑制和活性组蛋白修饰的识别机制

  6月21日,《自然-通讯》(Nature Communications)杂志在线发表了中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所植物逆境生物学研究中心植物分子遗传国家重点实验室杜嘉木研究组和威斯康辛大学麦迪逊分校钟雪花研究组合作完成的题为Dual recognition of H3K4m

研究揭示SHL蛋白对抑制和活性组蛋白修饰的识别机制

  6月21日,《自然-通讯》(Nature Communications)杂志在线发表了中国科学院分子植物卓越创新中心/植物生理生态研究所植物逆境生物学研究中心植物分子遗传国家重点实验室杜嘉木研究组和威斯康辛大学麦迪逊分校钟雪花研究组合作完成的题为Dual recognition of H3K4m

组蛋白修饰的意义

通过影响组蛋白与DNA双链的亲和性,从而改变染色质的疏松或凝集状态,或通过转录因子与结构基因启动子的亲和性来发挥基因调控作用。这些修饰之间存在协同和级联效应,更为灵活地影响染色质的结构与功能,通过多种修饰方式的组合发挥其调控功能。

生物物理所等在组蛋白甲基化修饰识别方面取得新进展

  10月17日,《美国国家科学院院刊》(Proceedings of the National Academy of Sciences)在线发表了生物大分子国家重点实验室许瑞明、饶子和课题组和北京生命科学研究所(NIBS)朱冰课题组合作的最新研究成果Distinct mode of

缺血修饰白蛋白(IMA)简述

心肌缺血心肌缺血是指心脏的血液灌注减少,导致心脏的供氧减少,心肌能量代谢不正常,不能支持心脏正常工作的一种病理状态。血压降低、主动脉供血减少、冠状动脉阻塞,可直接导致心脏供血减少;心瓣膜病、血粘度变化、心肌本身病变也会使心脏供血减少。另外,心脏氧需求量增加,则引起心脏相对缺血。资料显示,冠心病是引起

识别蛋白的定义和概念

结合素(卵结合蛋白,bindin),可识别特异的糖基序列,与卵细胞膜上的精子受体结合,以保证精卵识别的种特异性。这种受体的结合,基于精子与卵细胞二者质膜的接触。但研究表明,当第一枚精子穿过卵细胞外的放射冠时,卵细胞会产生一系列反应,以阻止其他精子进入放射冠,这就是透明带反应。 透明带反应说明精卵质膜

简述组蛋白修饰的基本作用

  组蛋白修饰的基本作用:Mi22NHRD 由核心(HDAC1、HDAC2、RBA P46ö;RBA P48) + M i2、M TA 1ö;M TA 2、MBD3 组成,其中MBD3 含有MBD 样序列,与甲基化DNA 有低亲和力,分析发现MBD3 与甲基化有关的氨基酸被置换,由此

发现胆固醇共价修饰新蛋白

    日前,由武汉大学教授宋保亮和华东师范大学副教授仇文卫合作的最新研究成果在线发表于《分子细胞》。这是继第一个胆固醇修饰蛋白hedgehog发现20年后,科学家找到的又一共价修饰蛋白,颠覆了长久以来认为hedgehog是唯一被胆固醇修饰蛋白的认识,并发现胆固醇除了导致心脑血管疾病外,还在发育过程

蛋白质的泛素化修饰

蛋白质的泛素化修饰主要发生在赖氨酸残基的侧链,且通常是多聚化 (多泛素化) 过程。被多泛素化修饰的蛋白质会被蛋白酶体(proteasome)识别进而被降解。三种关键的酶共同介导了这一多泛素化过程, 包括泛素活化酶 E1 (ubiquitin activating enzyme),泛素结合酶 E2 (

关于组蛋白修饰的形式介绍

  在哺乳动物基因组中,组蛋白则可以有很多修饰形式.。一个核小体由两个H2A,两个H2B,两个H3,两个H4组成的八聚体和147bp缠绕在外面的DNA组成. 组成核小体的组蛋白的核心部分状态大致是均一的,游离在外的N-端则可以受到各种各样的修饰,包括组蛋白末端的乙酰化,甲基化,磷酸化,泛素化,ADP

蛋白质修饰与肿瘤研究

  蛋白质的修饰这一领域已成为全球生物医学界关注的焦点。除了一些传统的磷酸化和泛素化,硝基化、乙酰化、SUMO化引发关注外,还有一些修饰策略,如PEG化修饰、脂质体化、糖基化,这些复杂的调控作用在众多慢性疾病(退行性疾病、代谢性疾病、肿瘤、心血管、内分泌等)以及一些炎症等中都起到关键调控作用。通过对

关于组蛋白修饰的作用介绍

  最新研究结果显示:球形组蛋白修饰模式可预测低分级前列腺癌的复发危险。结果发表在《自然》杂志上。该研究第一作者加利福尼亚大学的Siavash K. Kurdistani表示:这种修饰模式最终可作为前列腺或其他类型癌症的预后或诊断指标,也可作为预测何种患者会对一类组蛋白去乙酰酶抑制剂新药产生反应的指

表观遗传之组蛋白修饰—组蛋白乙酰化

大家好,我又来啦~~今天给大家放送的是表观遗传之组蛋白修饰相关的内容噢,组蛋白修饰也是一个比较复杂的过程,今天呢,我们就给大家讲讲组蛋白乙酰化及相关的产品。 一 组蛋白修饰 真核生物染色质的基本结构单位是核小体,它由约 146 bp DNA 缠绕组蛋白八聚体组成,其中组蛋白八聚体包含 2 (H2

研究揭示m6A修饰调控天然免疫识别新机制

  6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是mRNA中含量最丰富的甲基化修饰形式之一,由甲基转移酶复合物METTL3/METTL14/WTAP等催化形成。病毒RNA中m6A修饰是否影响宿主对病毒的天然免疫识别及分子机制有待进一步研究。  3月11日,中国科学院生物物理所研究员

蛋白质修饰研究现状与未来

  蛋白质的修饰与降解,和生命活动以及各种人类疾病密切相关,这一领域已成为全球生物医学界关注的焦点。蛋白质的糖基化修饰、磷酸化修饰、乙酰化修饰、泛素化修饰、亚硝基化修饰等,是蛋白在生物代谢过程中的重要装备,对研究疾病具有重要意义。蛋白质的正确的修饰对于蛋白降解也非常重要,从而保证生命活动的正常循环。

异源蛋白表达的处理和修饰

  真核mRNA在离开细胞核进而在胞浆的核糖体上被翻译前需要特异的处理和修饰。这些过程包括去除内含子、5'端甲基化帽子形成和3'端加poly-A。内含子去除需要5'剪切位点、G75/G100U100A65AG65U保守序列、3'剪切位点、富含密啶NC66A100G10

:“蛋白修饰和降解”领域有很多惊喜

  邱小波教授是“蛋白质修饰和降解”领域的杰出学者,曾先后获得国家杰出青年基金、国家人事部高层次留学人才基金,并入围“百千万人才工程”国家级人选。在接受生物探索采访时,他强调道:“蛋白质是生命活动的主要执行者,其修饰和降解关联所有的生命活动,是生命医学研究领域的一个永恒主题。”   1改变方向:从

研究发现全新蛋白质修饰类型

  细胞代谢为生命过程提供能量。同时,代谢物可共价修饰蛋白质来发挥信号传导功能。虽然许多代谢物在代谢通路中的作用广为人知,但它们介导细胞信号调控的功能有待探索。酮体(包括丙酮、乙酰乙酸和β-羟基丁酸)为脂质代谢产物。在葡萄糖缺乏的状态下,肝脏产生的酮体可用作多种组织的替代能源,且与多种病理生理状态密

与组蛋白修饰相关因子介绍TAF

rna聚合酶ii启动转录需要70多种多肽的活性。协调这些活动的蛋白质是基础转录因子tfiid,它与核心启动子结合以正确定位聚合酶,充当组装其余转录复合物的支架,并充当调控信号的通道。tfiid由tata结合蛋白(tbp)和一组进化上保守的蛋白质(tbp相关因子或taf)组成。tafs可能参与基础转录

蛋白琥珀酰修饰通路研究获突破

  近日,中科院上海药物所化学蛋白质组学研究中心与美国芝加哥大学、密歇根大学在一项合作研究中,首次在哺乳动物细胞中对去乙酰化调控酶Sirt5调控的琥珀酰底物进行了系统的蛋白质组学研究,在779个蛋白上鉴定出2500多个琥珀酰位点,并研究揭示了蛋白琥珀酰修饰具有广泛调节细胞代谢的作用,同时也提示此修饰

简述蛋白质的修饰与加工

  包括糖基化、羟基化、酰基化、二硫键形成等,其中最主要的是糖基化,几乎所有内质网上合成的蛋白质最终被糖基化。糖基化的作用是: ①使蛋白质能够抵抗消化酶的作用;②赋予蛋白质传导信号的功能;③某些蛋白只有在糖基化之后才能正确折叠。  糖基一般连接在4种氨基酸上,分为2种:  O-连接的糖基化(O-li

蛋白质PEG化修饰与纯化

聚乙二醇具有较广的分子量分布,随着平均分子量的不同,性质也产生差异,当分子量小于1000Da时,聚乙二醇是无色无臭粘稠的液体,高分子量的聚乙二醇则是蜡状白色固体,固体聚乙二醇的熔点正比于分子量,逐渐接近67℃的极限。毒性随分子量的增加而减少,小于400Da的 PEG在体内会经乙醇脱氢酶降解成有毒的代

组蛋白的合成修饰的相关介绍

  这是形成组蛋白各组分微不均一性的主要原因。修饰的方式有:  ①乙酰化。有两种:  一种是H1、H2A、H4组蛋白的氨基末端乙酰化,形成α-乙酰丝氨酸,组蛋白在细胞质内合成后输入细胞核之前发生这一修饰。  另一种是在H2A、H2B、H3、H4的氨基末端区域的某些专一位置形成N6-乙酰赖氨酸。  ②

人γ分泌酶识别淀粉样蛋白前体蛋白

阿尔茨海默病(AD)的标志是AD患者脑中存在淀粉样蛋白斑。淀粉样斑块的主要成分是源自淀粉样蛋白前体蛋白(APP)的β-淀粉样肽(Aβ)。I型跨膜蛋白APP首先被α-或β-分泌酶切割,分别产生83或99个残基的跨膜片段(APP-C83或APP-C99)。然后APP-C99通过其内肽酶活性被γ-分泌酶切

组蛋白修饰基因通路MEN1基因

这个基因编码脑膜,一种与多发性内分泌肿瘤1型综合征相关的假定的肿瘤抑制因子。体外研究表明,脑膜定位于细胞核,具有两种功能性核定位信号,并通过JUND抑制转录激活,但这种蛋白的功能尚不清楚。在Northern blots上检测到两条信息,但未对较大的信息进行描述。选择性剪接导致多个转录变体。

组蛋白修饰基因通路HDAC1基因

多亚基复合物催化的组蛋白乙酰化和脱乙酰化在调节真核基因表达中起关键作用。 该基因编码的蛋白质属于组蛋白脱乙酰基酶/ acuc / apha家族,是组蛋白脱乙酰基酶复合物的组成部分。 它还与视网膜母细胞瘤肿瘤抑制蛋白相互作用,这种复合物是控制细胞增殖和分化的关键因素。 它与转移相关蛋白2一起使p53脱

组蛋白修饰基因通路BRD4基因

该基因编码的蛋白质与小鼠蛋白MCAP(有丝分裂过程中与染色体相关)和人类Ring3蛋白(丝氨酸/苏氨酸激酶)同源。每一种蛋白质都包含两个溴域,一个保守的序列基序,可能参与染色质靶向。该基因被认为是T(15;19)易位的19号染色体靶基因(q13;p13.1),它定义了年轻人的上呼吸道癌。已经描述了两

组蛋白修饰基因通路HDAC2基因

该基因产物属于组蛋白脱乙酰基酶家族。组蛋白脱乙酰基酶通过形成大的多蛋白复合物起作用,并负责核心组蛋白(H2A、H2B、H3和H4)N端赖氨酸残基的脱乙酰化。这种蛋白通过与许多不同的蛋白质结合形成转录抑制复合物,包括哺乳动物锌指转录因子YY1。因此,它在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着重要作用。

组蛋白甲基化修饰研究再获突破

  日前,复旦大学徐彦辉课题组在组蛋白甲基化修饰研究领域获得新进展,相关成果发布在《分子细胞》上,该项研究得到了国家自然科学基金面上项目的资助。  组蛋白甲基化修饰是一种非常重要的表观遗传修饰,参与调节异染色质形成、X染色体失活、基因印记及DNA的损伤修复等多种生命过程。关于组蛋白去甲基化酶的研究是

组蛋白修饰基因通路KMT2A基因

该基因编码一个转录辅激活子,在早期发育和造血过程中起到调节基因表达的重要作用。编码蛋白包含多个保守功能域。其中一个域,即集合域,负责其组蛋白H3赖氨酸4(H3K4)甲基转移酶活性,介导与表观遗传转录激活相关的染色质修饰。这种蛋白由酶Taspase 1加工成两个片段,MLL-C和MLL-N。这些片段重