中国科大攻克复杂肿瘤全基因组异常的检测难题
中国科学技术大学信息科学与技术学院副教授李骜研究组以原创性论文（Original paper）的形式，在Bioinformatics上在线发表了最新研究成果。论文的第一作者是博士生余振华。 基因组异常是多种恶性肿瘤的标志性特征，在肿瘤发病机理、临床诊断和治疗等研究中具有极为重要的作用。传统的肿瘤基因组异常检测技术存在着通量低、分辨率差等问题，随着近年来大规模平行测序实验技术的快速兴起，新一代测序凭借其在通量和分辨率方面的独特优势，目前已经成为癌症基因组学研究中最流行的实验手段。但由于肿瘤本身的复杂性，从新一代测序数据中准确检测基因组异常仍面临着正常细胞掺杂和污染、肿瘤基因组非整倍体性等棘手问题。 该研究组提出一种基于全局参数化隐Markov模型的新算法，通过期望最大化方法对模型进行训练和参数估计，从而有效解决了利用新一代测序技术检测复杂肿瘤全基因组异常的国际性难题。 审稿人认为，该算法具有令人关注的特性并为解决......阅读全文
研究人员开发神经密度可视化技术
近日，中国科学院自动化研究所分子影像团队联合华科大同济医学院附属同济医院教授王良团队开发了一种前列腺癌神经密度可视化技术，实现了活体评估前列腺癌的神经密度，并可通过纳米颗粒负载神经功能阻断药物，抑制前列腺癌进展。该研究为临床前列腺癌神经的成像和治疗提供了潜在的依据，相关成果已发表在Science
商丘师范学院实现β淀粉样蛋白可视化测定
商丘师范学院生物分子识别与传感重点实验室周艳丽博士日前在阿尔茨海默氏症早期诊断方面取得新进展，实现了快速、高效β-淀粉样蛋白检测，相关成果发表于《微尺度》杂志。 阿尔茨海默氏症是老年痴呆症中最常见的类型，并且是一种发病率几乎与年龄成对数关系的进行性神经退化疾病。随着中国人口老龄化加速发展，阿尔
教你巧用IGV轻松实现基因组的可视化
Itegrative Genomics Viewer (IGV)是由Broad研究院的研究人员开发的一款功能强大的综合性基因组学可视化工具，借助于此工具，从事生物信息的科研工作者就可以轻松的分析查看多种基因组数据。除了直观的查看序列信息及遗传密码中的序列变化或突变外，还可以查看拷贝数变化、染
可视化3D肿瘤栓塞模型助力肝癌化疗栓塞
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495505.shtm
Echo－Revolve显微镜在病毒可视化研究的应用
病毒性疾病不仅严重危害人类健康，而且其爆发还会造成社会恐慌并导致一系列的损失，比如此次的新型冠状肺炎疫情。除了尽快研发出抗病毒药物之外，抗击新冠肺炎的重要一步就是对携带病毒患者的确诊以及及时的隔离治疗，这是预防和控制病毒性疾病传播的基础。目前主要的确诊方法是基于病毒核酸检测和病人临床表现，但是在样本
新成像平台改进细胞结构3D可视化精度
美国莱斯大学团队开发了一种名为单目标倾斜光片3D（soTILT3D）的创新成像平台，在超分辨率显微镜领域取得重大突破。soTILT3D结合了倾斜光片技术、纳米打印微流体系统以及先进计算方法，具备强大的全细胞、多目标成像能力，能改进当前的细胞结构3D可视化精度。该成果发表在最新一期《自然·通讯》杂志上
可视化超声波检漏仪的相关原理介绍
可视化超声波检漏仪是一种在移百动扫查过程中,传感器检测到泄漏信号后； 将它们转换成人耳可以听到的音频信号，并在彩色液晶大屏幕上同时显示出来。 原理： 超声技术与人类感觉不到的声波有关。人类的平均听觉限度是16,500Hz。尽管有些高人能听到21,000Hz。 超
高通量表型分析平台可视化评估大麦病害程度
背景表型是新植物栽培品种发展的瓶颈，该研究引入了一种新的高光谱表型分析系统，此系统将冠层测量的高通量与高空间分辨率和可控测量环境的优势相结合。此外，测量的大麦生长在大容器（称为Mini-Plots）中，这使得植物能够在温室实验中形成田间表型，从而不受容器尺寸的影响。结果在接种白粉病后30天，通过Sp
清华大学食品药品安全－可视化传播基地启动
6月20日，清华大学食品药品安全可视化传播基地正式启动。这是国家食品药品监督管理总局与清华大学的一次战略合作。在大数据全媒体的互联时代里，食品药品安全的新闻宣传工作要大力加强科学性和亲和力，用群众易于接受的方式，讲群众想听的故事，让群众产生共鸣。国家食药监总局副局长尹力指出，“成立基地的目的在于
生科院提出环形RNA内部序列结构可视化新方法
1月18日，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队于Bioinformatics 杂志上在线刊发了题为Visualization of circular RNAs and their internal splicing events from transcriptomic data 的研究。该研
“纳米人工红细胞”可视化精准治疗癌症获新突破
近日，中国科学院深圳先进技术研究院研究员蔡林涛领衔的纳米医学研究小组，通过构建仿生的“纳米人工红细胞（NanoARC）”携带血红蛋白、氧和光敏剂穿透进入到肿瘤内部，突破了肿瘤缺氧微环境和氧供应不足对光动力治疗的障碍；激光照射产生细胞致死的单线态氧和高价铁-血红蛋白，实现了肿瘤的高效治疗。相关成果
“可视化”人工神经网络揭示细胞内部活动
英国《自然·方法》杂志日前在线发表的一篇论文称，美国科学家创建了一种“可视化”人工神经网络，这是全新的、过程可获取的深度学习计算机算法，能够揭示细胞的内部活动。其有能力帮助人们更好地理解此前未知的基因学和生理学背后的机制。 人工智能（AI）已可以执行多种通常需要人类完成的复杂任务，比如面部识别
健康人颈部神经的三维数字可视化模型
颈部神经三维数字可视化模型模型图。图中可显示颈丛、迷走神经、喉上与喉返神经、甲状腺、颈动脉、颈静脉、甲状腺上下动脉的整体形态(正面观) 研究表明，高分辨率的多层X射线电子计算机断层与3.0T超导核磁共振断层影像能够获得较为完整、连续的二维原始数据。许多研究三维重建神经模型均取材于 “可视人
革新显微技术实现细胞内多分子同步可视化
一个细胞内生活着数百万相互作用的分子，观察细胞器、蛋白质和其他亚细胞成分需要超分辨率显微镜，但科学家目前一次只能看到少数不同分子。美国耶鲁大学科学家开发出一种新显微镜技术FLASH-PAINT，能够观察到无限数量的不同分子，为观察单个细胞的内部情况提供了全新方法。相关研究论文发表在新一期《细胞》杂志
智能所等发展出痕量二氧化氮高选择性可视化检测新方法
在国家自然科学基金委海外合作项目“大气污染物氮氧化物和二氧化硫的高选择性可视化检测方法研究”和中科院“百人计划”的支持下，中科院合肥物质科学研究院智能机械研究所王素华、新加坡国立大学黄德建和北卡罗来纳大学Leaf Huang科研团队协同合作，在大气污染物分析检测领域取得重要进展，发展了大气中
新污染物检测特色分析技术——红外拉曼显微镜助力微塑料化学成像可视化分析
微塑料微塑料是指直径小于5mm的塑料碎片和颗粒。近年来，以微塑料为代表的新型污染物受到的关注度持续提升，已经有大量研究报道，微塑料对海洋生态以及生物和人类健康存在持久的、确定和不确定的危害。随着微塑料污染关注度的提升和其生态效应研究的深入，也对其研究手段也提出了更高的需求。化学成像是将具有空间分辨能
可视化深度学习揭示基因如何影响细胞特征－－生物医药
美国研究人员开发出一种过程可获取的深度学习计算机新算法，能够揭示细胞的内部活动。相关论文3月6日在线发表于《自然—方法》。 人工智能可以执行多种通常需要人类完成的复杂任务，比如面部识别、语言翻译和玩游戏。深度学习网络也称人工神经网络，它们越来越多地被用于生物数据分析自动化。 深度学习
跨尺度生态格局动态可视化分析方法获发明专利
近日，由中国科学院华南植物园工程师徐洲锋等科研人员完成的“生态格局分析可视化方法、系统、设备及介质”获国家发明专利授权。 该发明公开了一种使用多层次结构化地理网格系统对大规模空间数据、算力单元和算法模块进行分层分块组织同构的方法，新方法可以综合利用人眼的视觉交互特点、多层次结构化地理网格单元的
美国学者：可视化深度学习揭示基因如何影响细胞特征
美国研究人员开发出一种过程可获取的深度学习计算机新算法，能够揭示细胞的内部活动。相关论文3月6日在线发表于《自然—方法》。图片来源于网络 人工智能可以执行多种通常需要人类完成的复杂任务，比如面部识别、语言翻译和玩游戏。深度学习网络也称人工神经网络，它们越来越多地被用于生物数据分析自动化。 深
基于探针结构精细调控实现高氯酸盐可视化传感
高氯酸盐具有强氧化性和高稳定性，是广泛应用于固体推进剂、军工生产、航天器材、烟花爆竹等领域的重要含能材料之一。据美国爆炸数据中心统计，以高氯酸盐/氯酸盐作为原料直接或间接参与的爆炸案达全球爆炸案总量的63.4%。因此，开展对痕量高氯酸盐固体的高灵敏、准确的现场检测对保障国家公共安全具有重要的现实意义
我国医学检验首个推广行业规范可视化教材项目启动
原标题：规范临床微生物标本采集 助力抗菌药物合理应用由国家卫生计生委合理用药专家委员会、北京协和医学院及中国药师协会联合主办，辉瑞中国提供支持的“临床微生物标本采集标准操作程序（SOP）可视化教材编写”项目（以下简称“项目”）启动仪式在北京举行。该项目将对临床常见感染部位标本采集标准操作程序进行视频
城市环境所设计出多功能可视化纳米药物载体
纳米药物载体能够在体内便利地传输，实现药物靶向投递，从而为癌症等疾病的治疗开辟了新途径。然而，由于体内条件复杂多变，传统的纳米药物载体进入体内后，输送路线很难被检测，而且药物在体内的分布、释放及其靶向效果也难以及时评判。研发可视化功能的药物载体对于肿瘤等疾病的诊断及其治疗具有重要意义。 中国科
东京大学研发出将关节、肌肉活动可视化的系统
据NHK电视台报道，日本东京大学的研究小组此前开发出一种新系统，可通过远程连接电脑的相机，将进行简单运动之人的关节、肌肉动作立体可视化，今后有望在体育运动和康复训练领域进行广泛应用。 为了提高运动员的竞技能力，通过影像分析关节和肌肉的活动的“动作捕捉”技术较为普遍
Waters中标分子可视化质谱成像定量分析系统
一、项目编号：0701-244106140558（招标文件编号：0701-244106140558）二、项目名称：中国疾控中心环境所环境与人群健康重点实验室平台建设项目三、中标（成交）信息供应商名称：国药（上海）医疗器械实业有限公司供应商地址：中国（上海）自由贸易试验区正定路530号A5库区三层2号
蒋长龙团队：荧光非侵入式可视化监测方面取得进展
近期，中国科学院合肥物质科学研究院固体物理研究所研究员蒋长龙团队在荧光非侵入式可视化监测方面取得进展。研究团队利用铕-镝金属有机框架（Eu-Dy MOF）凝胶构建了一种非侵入式可穿戴眼贴荧光传感器，并将其与智能手机的颜色识别功能相结合，实现对泪液中关键标志物溶菌酶的分析和监测。 溶菌酶因优异的
智能所研制出超敏感半定量荧光可视化试纸
近期，智能所张忠平特聘研究员领导的研究团队在纳米荧光试纸的制备原理与可视化检测方法的研究中取得重要进展，成功制备了剂量敏感的颜色连续演变荧光试纸，获得了类似经典pH试纸的定性定量可视化效果，并成功将其应用于环境中砷离子[As(III)]的检测。相关成果发表在分析领域重要期刊美国化学会Analyt
单细胞数据降维可视化最新工具UMAP的介绍
高通量单细胞组学数据的一个显著性特点就是数据量大，一次能反映的细胞数量多。因此，通过降维和可视化去展示细胞数据特征是一个非常重要的工作。翻开各类发表的单细胞组学文章，不管是CNS的还是其他，几乎所有的结果中，映入眼帘的第一张图片通常是数据结果的降维图形化展示。 图1 PBMC细胞单细胞转
跨尺度生态格局动态可视化分析方法获发明专利
近日，由中国科学院华南植物园工程师徐洲锋等科研人员完成的“生态格局分析可视化方法、系统、设备及介质”获国家发明专利授权。该发明公开了一种使用多层次结构化地理网格系统对大规模空间数据、算力单元和算法模块进行分层分块组织同构的方法，新方法可以综合利用人眼的视觉交互特点、多层次结构化地理网格单元的数学嵌套
Nature－Methods：这个蛋白－能可视化活细胞发育周期的“盲区”
G1期（first gap）：从有丝分裂到DNA复制前的一段时期，又称合成前期，此期主要合成RNA和核糖体。该期特点是物质代谢活跃，迅速合成RNA和蛋白质，细胞体积显著增大。这一期的主要意义在于为下阶段S期的DNA复制作好物质和能量的准备。 S期（synthesis）：即DNA合成期，在此期，
单细胞数据降维可视化最新工具UMAP的介绍
高通量单细胞组学数据的一个显著性特点就是数据量大，一次能反映的细胞数量多。因此，通过降维和可视化去展示细胞数据特征是一个非常重要的工作。翻开各类发表的单细胞组学文章，不管是CNS的还是其他，几乎所有的结果中，映入眼帘的第一张图片通常是数据结果的降维图形化展示。图1 PBMC细胞单细胞转录组数据展示