科学家观察酶“编辑”DNA过程助力纠正遗传疾病

一个国际研究小组在了解酶如何“编辑”基因方面取得了重要进展:观察到了一类被称为CRISPR的酶绑定并改变DNA(脱氧核糖核酸)结构的过程。这项发表于5月27日(北京时间)美国《国家科学院学报》上的研究成果有望为纠正人类的遗传疾病铺平道路。 CRISPR意即“成簇的规律间隔的短回文重复”,在上世纪80年代才首次为人们所认知。到目前为止,已发现40%已测序细菌和90%已测序古细菌的基因组存在这种重复序列,而且细菌已开发出一套可以探测和切断外来DNA的免疫策略。其机理大致如此:CRISPR序列与很多病毒、噬菌体或者质粒的DNA序列同源,受到攻击的细菌会以相匹配的DNA为目标进行自然防御。它们所采用的手段,就是利用一种名为Cas9的内切酶,裂解外来DNA。 基因工程师们意识到,如果将细菌的CRISPR-Cas9系统插入其它生物体细胞,它们也能够对目标DNA进行切割。就在去年,这一革命性的基因编辑技术收获了一系列成果:多个研究团队......阅读全文

细菌的抗药性早有基因根源

抗生素作为药物问世还不到一百年,如今具有抗药性的“超级病菌”已让医学界头疼。的抗药性如何产生?加拿大研究人员最近报告说,他们从3万多年前的细菌DNA中分离出了抗药基因,首次通过严谨的实验表明,抗药性基因根植于细菌,甚至远早于人类发现抗生素。 加拿大麦克马斯特大学的研究人员从该国西北部的育空地区钻取沉

Cell子刊:揭秘细菌的耐受基因

  科学家们发现,细菌的一个基因能够关闭自身的蛋白合成进入休眠状态,以便逃过抗生素的攻击。文章发表在Cell旗下的Molecular Cell杂志上。   上世纪四十年代人们发现,一群细菌中总有那么一两个,能够在抗生素的攻击下生存下来,这一现象被称为细菌的耐药性。细菌耐药性依赖于细胞的休眠,这

细菌中制备基因组DNA实验

实验方法原理 提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS(十二烷基硫酸钠)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质,再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质,得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出。实验材料 细菌试剂、试剂盒 TE氯化铯溴化乙锭NaCl乙醇CTAB仪器、耗材 离心机摇床实验步骤 1

细菌基因组DNA提取方法综述

细菌基因组DNA的提取方法综述,提供了5种方法。 1 快速微量提取法A.取1.5ml菌体培养物于一灭菌Ep管中,12000rpm离心1min, 丢去上清夜,收集菌体。B.加入400ul裂解液(40mMTris-醋酸,20mM醋酸钠,1mMEDTA,1%SDS,pH7.8)混匀,置于37oC水浴1hr

冲激序列信号与阶跃序列信号各有什么特性

单位脉冲序列只在n=0 处有一个单位值1,其余点上皆为0;单位阶跃序列只有在n>=0时,才取非零值1,当n

设计引物用cds序列和cdna序列的区别

cDNA和mRNA的序列是互补的,如果用两个引物,最后的两条DNA序列分别对应于mRNA和cDNA中的一段。由于引物方向从5‘至3’,所以两个引物对应于mRNA和cDNA中相应序列即可。

Nature:-人类肠道细菌具有获得性细菌防御(AID)基因簇

  近日,美国华盛顿大学的科研人员在Nature上发表了题为“Human gut bacteria contain acquired interbacterial defence systems”的文章,发现肠道中的几种拟杆菌属(Bacteroidales sp.)的细菌具有基因簇防御功能,可以中和

昆明动物所发现白介素3基因序列变异影响人类大脑容量

  神经系统是人类区别于其他物种最显著的特征之一。相对于其他物种,人类的大脑高度发达,主要体现在全脑容量的变化。如人类的大脑容量是旧大陆猴-如猕猴脑容量的20.6倍,长臂猿的14.4倍,与人类亲缘关系最近的灵长类-黑猩猩的4.3倍。   近年来,基于核磁共振(MRI)脑影像学研

我国完成首部高原濒危物种全基因组序列图谱

  12月25日,由青海大学和深圳华大基因研究院共同发起并承担的藏羚羊基因组序列图谱在青海大学医学院宣告绘制完成,这是世界上第一部绘制完成的高原濒危物种全基因组序列图谱,也是中国科学家对全球基因组科学的又一重大贡献。   藏羚羊是我国青藏高原特有的物种,其生存环境高寒、缺氧,自然条件极为严酷。在喜

安捷伦最新推出百万特征序列格式的基因表达微阵列芯片

  2010 年 5 月 19 日,加利福尼亚州圣克拉拉市——安捷伦科技公司(纽约证交所:A) 今日发布了安捷伦 SurePrint G3 基因表达微阵列芯片,该产品在 1 英寸×3 英寸的单位标准芯片上提供的特征序列可多达一百万种,大幅提高了通量,有效节约了成本,并且具有独一无二

哈尔滨病毒基因序列确定为德尔塔-详细信息公开

  9月24日,哈尔滨市召开疫情防控新闻发布会。会上通报,9月23日0时-24时,哈尔滨市新增新冠肺炎确诊病例15例,均在巴彦县 。根据目前已检出病例基因测序情况看,显示为德尔塔毒株 ,相关流调溯源工作正在国家、省疾控专家指导下,紧张有序开展,如果有结果将及时向社会公布。  上述新增确诊病例均是在集

英国拟为癌症病人绘基因序列图以研发新药

  据英国路透社12月10日报道,英国拟为近10万癌症或其它罕见疾病的患者绘制基因序列图,以研发新的药物。   英国首相卡梅伦10日表示,他希望英国能够成为第一个将基因排序引入健康服务的国家。   据报道,卡梅伦政府计划在未来3至5年内投入1亿英镑(约合人民币10亿元)用于基因排序项目。绘制病人

首个亚洲人源基因检测序列标准物质完成研制

  6月,中国计量科学研究院和深圳华大基因研究院共同发布首个亚洲人源(炎黄一号)DNA序列标准物质(BW-5201)和大肠杆菌O157基因组DNA序列标准物质(BW-5202)。这是全球首次发布亚洲人源DNA和微生物基因组DNA序列标准物质,为基因检测产业评估测序和数据分析的准确性提供了参考标准。 

基因序列仪在感染性疾病诊断上的应用

测序技术可以精确的分析碱基序列,通过序列比对,对各种病原体直接进行鉴定、分型和溯源,明确某一感染性疾病对应病原体的基因序列,可以有针对性地用药和预防,提高用药的有效性和安全性。同时基因测序可以用于发现新型病原体,能更好地做好预防工作。

更改小白菜基因序列亩产可提高2000公斤

  “目前我们已经发现了小白菜中的分蘖基因,如果更改普通小白菜中的基因序列,让它们拥有分蘖基因的功能,亩产可达6000公斤,提高近2000公斤。”昨天,在南京农业大学召开的“百家名企进南农”活动中,该校园艺学院院长、博士生导师侯喜林向记者表示。   不结球白菜俗称青菜、小白菜,原产中国。2009年

科学家发现奇异基因序列或来自全新生物域

沃斯的“三域说”是目前生物分类界的主流学说。  “科学坏小子”文特尔(左)参与了这次的研究项目。  在过去的近300年中,生物分类法从两界、三界一直被扩充到六界三域,分类系统不断被改写。然而,演化树的改写可能还会继续下去。美国加州大学基因中心和文特尔研究所对海洋水样本中的DNA序列分

BZ010-水稻Cry1Ac-基因序列定性PCR-检测

  BZ010 -水稻Cry1Ac 基因序列定性PCR 检测试剂盒   包括100 个扩增反应所需的试剂   【试剂盒组成】   2 x 275 μl Cry1Ac 反应试剂 (Cry1Ac mastermix; -20oC 保存)   1 x 50 μl 阳性对照 (Positive co

新技术90分钟完成全基因组序列分析

  美国国家儿童医院(Nationwide Children's Hospital)的研发人员最近在Genome Biology上发布了一个自主开发的分析软件,表示这个软件使寻找全基因组致病变异从几周缩短到按几十个小时。  第一个人类基因组测序完成耗时大约13年,耗费30亿美元,而现在技术测序技术的

Nature-Methods:De-Novo基因组序列组装的新方法

  对于de novo人类基因组序列组装而言,短读长简直意味着不可能的任务。不过,加州大学旧金山分校、BioNano Genomics和10X Genomics的研究人员近日开发出一种新的组装方法,它将short-read测序与10X的linked-read测序相结合。这项成果于近日发表在《Natu

蔬菜中心:绘成世界首张西瓜基因组序列图谱

  我国是世界第一西瓜生产与消费大国,但是人们却始终未能从外到内了解它,直到2013年1月,国际学术顶级刊物《自然·遗传学》发表了世界首张西瓜基因组序列图谱(影响因子35.532),标志着人类成功破译了西瓜遗传“密码”。这项由蔬菜中心主任许勇的研究团队牵头进行的科研创新,为高效培育兼具优质、高产、抗

升级了!CRISPR可在不改变DNA序列情况下开关基因

  《细胞》杂志9日在线发表的一篇论文表示,美国怀特黑德研究所乔纳森·魏斯曼等人设计了一种名为CRISPRoff的新基因编辑技术,可以在不改变DNA序列的情况下使某些基因“沉默”,从而以高特异性控制基因表达。这种“升级版”的基因编辑技术为研究表观遗传机制、重大疾病治疗以及研发新冠病毒疫苗等提供了有力

蚜虫mtDNACOI/COII基因序列测定及系统发育分析

实验概要本研究通过分析三种蚜虫mtDNA COI/COII基因序列的进化,揭示了三种蚜虫与已知其它蚜虫的该段序列的进化关系。实验材料本研究中的蚜虫为桃蚜、豆蚜、棉蚜。桃蚜、豆蚜、棉蚜在实验室内分别用萝卜、菜豆、黄瓜进行饲养;各种群分别置于50X50X50的正方体铁架外罩100目双层沙网内,饲养条件为

中科院等完成橡胶草基因组序列解析

   中国科学院遗传与发育生物学研究所李家洋研究组与中国农业科学院、中国热带农业科学院等合作,在橡胶草基因组序列解析方面取得重要进展,标志着以橡胶草作为模式植物进行天然橡胶合成研究进入后基因组时代。研究成果近日在线发表在权威学术期刊《国家科学评论》(National Science Review)杂

Science:新研究揭示短串联重复序列如何影响基因表达

  几十年来,科学家们已经知道,“垃圾 DNA(junk DNA)”实际上起着至关重要的作用:尽管基因组中的蛋白编码基因提供了构建蛋白的蓝图,但是基因组中的一些非编码部分,包括以前被认为是 “垃圾DNA”的基因组区域,似乎可以提高或降低这些基因的表达。但人们一直不清楚某些非编码区域如何影响基因表达水

猴痘基因组研究公布:14种序列皆来源这里

  对来自正在进行的全球爆发的猴痘病毒 (MPXV) 基因组的分析发现,这些样本聚集在一起,表明它们的来源单一。  根据世界卫生组织的数据,从今年年初到 6 月中旬,已有 2100 多例经实验室确诊的猴痘病例,其中大部分是自 5 月初以来报告的。其中 80% 以上的病例出现在欧洲,12% 出现在美洲

蝴蝶兰光周期相关基因序列及其应用获发明ZL

  由中科院华南植物园张建霞、段俊等完成的“蝴蝶兰光周期相关基因PhalCOL的序列及其应用”于6月29日获国家发明ZL授权(ZL号:ZL 200910042303.9)。   蝴蝶兰是兰科植物中栽培最广泛、最受欢迎的种类之一,花形似蝴蝶,别致美丽、色彩艳丽,花期长达数月之久,观赏价

基因组学突破性成果:斑马鱼序列解析

  人类发育,生理功能及疾病发生的过程涉及到成千上万的基因和其变异体,但是大部分的基因和其变异体的功能依然是未知的。过去的20年里,斑马鱼逐渐成为研究人类基因功能的重要模式动物。在《自然》杂志网站发表的两篇文章里1,2,报道了斑马鱼参考基因组序列和完成超过10,000个蛋白编码基因的断裂性突变体的鉴

基因序列仪在遗传性疾病诊断上的应用

由于基因突变而导致的疾病具有遗传性和终身性的特点,一旦患上这种病,会给自身和整个家族带来痛苦。 通过对被检人员进行基因测序,查看基因突变情况,判断是否存在基因遗传病,或者推断后代患病的概率为婚育提供指导,减少遗传性疾病的发病率。

两斤DNA装下“全世界”-现代数据存储技术瞄准基因序列

  对于Nick Goldman来说,在DNA中编码数据的想法始于一个笑话。或许最多10年之后,没有人会再相信磁带储存。图片来源:Wes Fernandes  那是2011年2月16日,Glodman和一些生物信息学领域的朋友在德国汉堡聊天,话题是他们如何才能储存全世界涌来的基因组序列和其他数据洪流

PacBio构建目前最高质量的植物基因组参考序列

  来自中科院遗传与发育生物学研究所,四川农业大学的研究人员发表了题为“Sequencing and de novo assembly of a near complete indica rice genome”的文章,对一个籼稻基因组蜀恢498(R498)进行PacBio单分子测序,结合遗传图谱和