《自然》:管轶等对新流感起源的基因组学研究

H1N1流感病毒由2种猪流感病毒的基因重组而形成 据生物通报道,香港大学医学院、爱丁堡大学、亚利桑那大学以及牛津大学合作的新型流感研究成果Origins and evolutionary genomics of the 2009 swine-origin H1N1 influenza A epidemic,发表在最新的《自然》在线版上,文章通讯作者是权威流感专家管轶教授。 管轶教授等人主要从基因组学上研究最新H1N1流感的源头和该病毒的进化历程。研究发现,H1N1流感病毒由2种猪流感病毒的基因重组而形成,并且这2种猪流感病毒在猪群间流行了至少10年。 这一结果也粉碎了坊间流传的“新病毒由实验室泄露出去”的流言。 文章还指出,由于流感病毒的重组变异能力强,监控猪群的流感疫情具有十分重要的意义。本次的大流行,就是由于没有对猪群间的流感病毒进行系统的监控,导致该病毒一直存在且有机会不停演变。 因此,系......阅读全文

家犬基因组学研究获新进展

  科学界对于家犬的起源和驯化一直争议不断。近日,中科院院士张亚平带领团队发现,家犬中亚起源的假说与基于全基因组重测序数据分析的家犬东亚南部起源模式相冲突。相关成果日前在线发表于美国《国家科学院院刊》。  2015年,美国学者Shannon等人通过分析大量的家犬群体全基因组DNA芯片数据,提出了家犬

Illumina传奇(二):基因组学领域的巨无霸

Illumina的圣地亚哥总部与硅谷的科技园有些相似。走廊上非常明亮,即使是雾天也不例外,空间宽敞可以供员工们工作、喝咖啡和自助用餐,不过食物并不是免费的,这在一定程度上证明了资源被有效利用。高层管理人员与其他人一起在隔间工作,没有专门的办公室。在deSouza担任CEO的第一周,他将行政楼层的隔间

协同创新驱动农业基因组学发展

   “作为生物技术领域最基础的学科,农业基因组学研究不仅需要国内外科学家同行的协同创新,更需要与生物技术产业发展需求无缝衔接,才能发挥出农业基因组学的最大潜能。基于这种认识,在国家农业科技创新联盟的框架下,建立农业基因组学的协同创新联盟就显得十分迫切。”中国农科院科技局局长梅旭荣表示。  7月24

研究指出基因组学引领生物育种变革

  记者从近日举行的第五届国际农业基因组会议暨深圳国际食品谷研讨会上获悉,现代农业研究已迈入生物组学大数据时代,特别是基因组学及其衍生技术在生物育种中发挥着重要的引领作用。  基因组学是对生物体所有基因进行集体表征、定量研究及不同基因组比较研究的一门交叉生物学学科。基因组学主要研究基因组的结构、功能

安捷伦科技发布基因组学站式网站

  2010年4月19日,北京 – 安捷伦科技公司(NYSE:A)日前发布了一个全新的的动态基因组学网站,genomics.agilent.com。   此网站将是所有基因组学资源的一站式供应点。用户可在其中找到众多组织有序、易于查找的信息,从最新的科学进展到最热门的产品一应俱全。此网站以一体化网

遗传学大牛Science发现基因组新奥秘

  来自斯坦福大学,霍德华休斯医学院的一组研究人员发现,当基因组中相似的基因不断“弹出来”的时候,通常这些基因会丢失,但如果能被留下来(也就成为了多余基因),就会由于一个基因发生一次表达消减这一理论,而在哺乳动物中受到保护。  这一研究成果公布在5月20日的Science杂志上。文章的通讯作者是斯坦

于军:基因组学的未解之谜

  DNA测序技术使我们几乎可以肆无忌惮地获取任何物种和其群体的遗传信息。我们同时也要思考:生物学,尤其是基因组学,还有哪些未解之谜?   “人类基因组计划”开启了诸多前所未有的新学科分支(基因组学、生物信息学、蛋白质组学等),推动了科学研究的平台化和规模化,比如高性能计算和规模化生物学数据获取。

解决基因组学重要挑战的新工具

  单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术,可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多,但是,仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列,从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前,去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列,还是一个手动和耗时的过程,为了去除污染

解决基因组学重要挑战的新工具

  单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术,可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多,但是,仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列,从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前,去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列,还是一个手动和耗时的过程,为了去除污染

美国推动基因组学转向临床医学

  美国政府将用数亿美元积极推动基因组学向临床医学的转化,探索基因组学的新前沿。12月6日,国立卫生研究院(NIH)所属国家人类基因组研究所宣布一项为期4年、资助经费4.16亿美元的新计划经费实施方案,促进该所旗舰项目“大规模基因组测序计划”。该项目致力于探索罕见遗传疾病的起因、加速基因组

Neogen农业基因组学解决方案(一)

纽勤农业基因组学: 增强全球食品安全纽勤的子公司GeneSeek 是全球领先的农业基因组学实验室,自1998 年起便开始提供全面的兽医和农业基因组学诊断解决方案。在农产品生产商需要就畜群作出决定时,GeneSeek 可为其提供必要的信息,进而为农场内的食品安全问题提供基因组学解决方案。GeneS

杂交稻基因组学研究获进展

  中科院上海生科院植物生理生态研究所韩斌院士课题组联合中国水稻所杨仕华等团队,在杂交稻基因组学及杂种优势遗传机制研究中获重要进展,2月5日,相关成果在线发表于《自然—通讯》杂志。  据介绍,杂交水稻育种技术的成功是我国近几十年来取得的一项重要科技成就。伴随着汕优63、两优培九等一大批高产杂交稻品种

肠道宏基因组学及代谢组学标志物或可诊断早期结直肠癌

  在大多数散发性结直肠癌病例中,肿瘤的发生是一个多阶段的过程,包括基因组的改变和形态学的改变。近年来,越来越多的证据显示,人类肠道微生物组与结直肠癌的发生具有一定的关联,更多的科学研究试图从粪便中分析肠道菌群的特点,以期找到有关肠道微生物与结直肠癌的线索。今年4月,两个科学团队在Nature Me

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?       代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

蛋白组学应用前沿:肝脏疾病研究进入后基因组时代

蛋白组学应用前沿:肝脏疾病研究进入后基因组时代

基因组所等RNA甲基化表观转录组学研究获进展

  2014年1月,中国科学院北京基因组研究所基因组变异与精准生物医学实验室“百人计划”研究员杨运桂研究组,与中国科学院动物研究所“百人计划”研究员刘峰研究组合作开展的“m6A甲基转移酶复合物鉴定”研究,发现了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)

Nature子刊:禽流感的基因组结构原来是这样的……

  说起流感人们都不会感到陌生,流感家族有四大分支,分别是甲型流感、乙型流感、丙型流感、丁型流感。其中排行老大的甲型流感最为凶险。被甲型流感病毒感染后人们会出现高热、咳嗽、流涕等症状,同时还伴有严重的心、肾器官衰竭。  甲型流感病毒亚型还有一个为大众所熟悉的名字——禽流感病毒。可怕的是,它的传染能力

Illumina副总裁:基因组学如何影响肿瘤学未来的发展?

  专访Illumina肿瘤业务营销副总裁John Leite  基因组学正在改变肿瘤研究,其最终目标是推进癌症的诊断、治疗、监控及最终的筛查方式。Illumina的肿瘤业务营销副总裁John Leite介绍了这一领域的最新进展,以及随着今天的研究转化为临床,他对未来的期望。  基因组学如何影响肿瘤

基因组学:将数字信息转化为生物学功能

优势 ·      同时检测克隆和定量荧光标记---使用表现型筛选克隆   ·      从加样、涂布到挑取完全自动化工作流程   ·      从样品涂布到挑取、复制和重排记录并追踪样品数据   ·      每天准确挑取超过30000个筛选到的克隆,效率>98%   美国能源部联合基因组研究所(

PNAS打开基因组生物学的黑盒子

  最近,美国佛罗里达州立大学、贝勒医学院和哈佛大学-麻省理工学院Broad研究所的科学家们,开辟了人类遗传学中一个鲜为人知的领域。相关研究结果发表在7月18日的《PNAS》杂志。  在这项研究中,研究人员表明,一条不活跃的X染色体上的一段不寻常的DNA重复序列,实际上对于这种女性特有的遗传现象的整

英国成立功能基因组学实验室

  近日,英国科研与创新署(UKRI)宣布,医学研究理事会(MRC)、剑桥大学米尔纳治疗研究所(MTI)等联合成立功能基因组学实验室,作为英国卓越研究中心和国家资源中心,汇集英国生命健康领域学术界、产业界优势和专业知识,加速新药物和诊断方法的研究发现,巩固英国在全球基因组学方面的领先地位。  该实验

谢晓亮:当单分子遇上基因组学

  当单分子遇上基因组学,它们会擦出什么样的火花?著名华人学者谢晓亮(Sunney Xie)博士围绕这个话题,在《美国医学会杂志》(JAMA)上发表了文章。谢博士现任哈佛大学化学及化学生物学系教授,也任北京大学生物动态成像中心主任。  谢博士写道,单分子成像和操作的进步导致了单分子生物学的出现。由于

基因组学结合传统育种获得优质主食作物

   “我喜欢这个。”Ismail Rabbi边说边将手掌放在木薯上,就像父母在夸赞自己心爱的孩子,他羞涩地笑了。“它们看上去没什么了不起的——并不高。”Rabbi说,“但它克服了我们设置的所有障碍。”  Rabbi是尼日利亚伊巴丹国际热带农业研究所(IITA)的遗传学家。他和同事正在开展一项改良木

《PLoS生物学》:乳齿象线粒体基因组测定完成

这的确有些不可思议。德国科学家利用一颗远古牙齿化石,成功确定了乳齿象完整的线粒体基因组,这也是迄今为止科学家得到的最古老的线粒体基因组。该研究成果有望加深科学家对于象类分化的理解。相关论文发表在的7月24日的《PLoS生物学》上。 2800万年前出现的乳齿象是现代大象的近亲,它们大约有3米高,有和猛

美X大奖基因组学挑战赛流产

图片来源:美国国家人类基因组研究所   美国X大奖基金会宣布废止其备受瞩目的奖金为1000万美元的基因组学挑战赛。报名截止时,该比赛仅吸引了两组竞争者参加。不过发言人表示,取消竞赛的决定与参赛人数无关。   7年前,阿康基因组学X大奖高调设立。该奖项旨在通过提供1000万美元奖金,推动医学基因组

草莓基因组研究取得成果-|《自然遗传学》

  《自然-遗传学》本周在线发表的一篇论文Origin and evolution of the octoploid strawberry genome报告了一个几近完整的草莓参照基因组。该基因组为了解这一广受欢迎的水果的起源和演化历史提供了新见解。八倍体草莓的演化史。Edger et al.  八

最热门基因组遗传学新闻一览

  本周包括苹果,IBM等在内的著名企业宣布了各自在生命科学领域研究的最新消息。  苹果推出ResearchKit  首先苹果Apple公司继新的数据共享平台 ResearchKit 首次亮相之后,将开始手机用户的遗传信息。据MIT Technology Review报道,“鼓励iPhone用户将其