NucleicAcidsResearch发布最全面的microRNA数据库

基因是蛋白质的蓝图,而microRNA可以帮助细胞决定是否要根据这些蓝图制造蛋白。研究者们常常会面临这样的问题:某个与疾病有关的基因受到哪些microRNA的调控?或者,患者体内发现的某种microRNA负责调控什么基因?这些问题的答案,可以帮助医生和研究者们操纵机体中的致病蛋白水平(尤其是癌症)。 日前,美国科罗拉多大学癌症中心在Nucleic Acids Research杂志上发布了一个被称为multiMiR的数据库,这个目前最全面的数据库广泛收集了microRNA及其作用靶标的信息。 “数据库multiMiR可以让研究者们有效搜索,与疾病有关的microRNA-基因配对关系,”文章的一位资深作者,科罗拉多大学的副教授Katerina Kechris介绍道。 除了为人们展示microRNA与其作用靶标之间的关系,该数据库还涵盖了能够影响microRNA的已知药物,列出了与microRNA有关的各种疾病。 “现在,......阅读全文

国际人类基因变异组项目设立中国区建立20种疾病数据库

  国际人类基因变异组项目(HVP)26日在京为该项目的中国区工作委员会授牌。作为国际人类基因变异组项目的核心成员,中国将在未来5年进行约20种重要疾病的变异基因数据收集、建立分病种数据库,为健康指导提供精准医学指标。  国际人类基因变异组项目是一个由联合国教科文组织支持、来自全球81个国家的成员共

陈赛娟:重大疾病专病数据库势在必行!

当前,医学科技和信息技术的飞速发展,使诊疗数据和病理及影像等数据,正在以惊人的速度增长。此外,包括基因组、表观组、蛋白组和代谢组在内的组学技术发展,也促使生物医学领域快速进入“大数据”时代。 “当今世界正处于以海量数据为基础的循证医学时代。”全国政协委员、中国工程院院士、上海交通大学转化医学研究

各种模式生物必需基因在线数据库

Essential Genes are the genes that are indispensable to sustain cellular life. The functions encoded by essential genes are considered as a foundation

全球最大癌症基因数据库发布

  美国国家癌症研究所(NCI)科学家发布了有史以来规模最大的癌症相关基因变异数据库,为研究者们提供了迄今为止最全面的方式,搞清楚如何将治疗药物靶向疾病。   周一NCI在一份声明中称,基于基因组学研究的新数据库,将对全球开放获取,预计将有助于研究人员加快新药的开发,同时能够更

基因组所完成开发RiceWiki数据库

  近日,中国科学院北京基因组研究所章张研究员课题组与北京理工大学、中国林业科学研究院及华中农业大学合作开发完成RiceWiki数据库。该数据库是基于维基百科的水稻基因信息平台,是可编辑且内容公开的公众注释系统。研究成果在Nucleic Acids Research杂志发表。   水稻是人类重

加拿大推出危害识别参考数据库-预防食源性疾病

  据加拿大食品检验署消息,2014年2月7日,加拿大卫生部宣布推出在线危害识别参考数据库(RDHI),以帮助食品行业识别和处理食品安全危害。   食品行业可使用该工具搜素生产和加工中的食品相关危害,指导食品行业制定更精确、有效、统一的食品安全规程和预防控制计划,如HACCP.该数数据库并未得到官

助力研究脑疾病-中国科研人员建立了海马“数据库”

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517144.shtm中新网上海2月2日电(记者 郑莹莹)海马脑区(又称:海马)是脑科学研究当中最受关注的脑区之一。在人类大脑中,这个脑区外形酷似海洋生物海马,因而被称为海马脑区。海马神经环路的异常和病变是

助力研究脑疾病-中国科研人员建立了海马“数据库”

  海马脑区(又称:海马)是脑科学研究当中最受关注的脑区之一。在人类大脑中,这个脑区外形酷似海洋生物海马,因而被称为海马脑区。海马神经环路的异常和病变是癫痫、帕金森症、老年痴呆症等脑疾病的重要原因之一。  中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心徐春研究组领衔的联合研究团队于北京时间2月2日在《科学》

科学家构建首个油菜基因转录数据库

  近日,中国农业科学院油料作物研究所油料作物基因组学与抗病性改良创新团队破译了油菜基因组的全转录信息密码,构建了油菜十万余个基因的转录全景图,使得油菜基因功能研究第一次有了标准的可参考的基因转录数据库,将有力支撑油菜功能基因的相关研究。该项研究成果在线发表在《植物学报(The Plant Jour

全球药典草药基因组数据库已上线

  近期,中国中医科学院中药研究所团队建立了全球药典基因组数据库(GPGD)。该数据库是全球首个针对药典收载草药物种的大型基因组学数据库。相关研究成果发表在《Science China-Life Sciences》杂志,标题为“Global Pharmacopoeia Genome Database

基因序列排序与整理、数据库比对与意义

由于定序系统的定序方法都是将体细胞内的基因序列打断成很多段落后,再利用DNA扩增的方式原理,在扩增的同时借由侦测萤光的方式(将不同碱基原料接上萤光讯号,只要这有接讯号的碱基被合成了,即会发出不同强度的萤光讯号)即能得到大量的片段式基因序列。经数字化后的基因序列需经整理将每段落的头尾相接成一个完整的基

众包个体基因数据库缓慢发展

Yaniv Erlich   计算遗传学家Yaniv Erlich因其建立了世界最大“家谱”而引人注目。而目前,他的DNA.land又引发新一轮个体基因数据库“众包热潮”。  早在2013 年,Erlich 团队就发表了一篇论文,介绍了如何利用公共资源,通过交叉比对的方法确定遗传学研究参与者的个人身

大型衰老相关基因表达谱数据库建成

  英国《自然·通讯》杂志30日发表的一项研究称,包括人类在内的4个物种的大型衰老相关基因表达谱数据库建成。德国科学家团队分析数据后发现,衰老相关基因的表达变化与退行性慢性病相关基因的表达变化轨迹一致,但与癌症的相反。  对衰老及衰老相关疾病的研究,一直是人类医学的难题。但随着“衰老基因”的确定,衰

科学家搭建草莓基因组数据库

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓为蔷薇科草莓属,因芳香多汁、营养丰富受到喜爱,在全国各地均可种植。栽培草莓为异源多倍体,基因组复杂,杂合度高。 2019年,《自然—遗传学》发表了利用三代测序数据组装的高

基因检测解码“生命说明书”-全球竞跑基因数据库

  随着华大基因上市临近,基因检测概念再度被关注。  华大基因CEO尹烨曾在公开场合介绍,给基因学家一滴血,能查到生育、肿瘤、感染,从三检合一到N检合一,液体活检可以做更多的事情。  相比于传统的影像学检测手段只能检测出已经发生且长成一定大小的异物,基因检测技术的优势在于,在更早的发病初始期,从分子

北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0

  中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese

北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0

  中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese

解码“基因宝藏”:最全海洋微生物基因数据库出炉

9月4日晚,华大生命科学研究院(简称“华大”)联合山东大学、英国东安格利亚大学、中国海洋大学、厦门大学、丹麦哥本哈根大学等机构,在《自然》上发表研究成果。他们通过对目前已公开的海洋微生物宏基因组数据进行分析和深度挖掘,构建了迄今为止最完整的海洋微生物基因数据库,并从中发现了大量具有应用潜力的基因资源

慎用基因检测预知疾病

花万元左右做个基因检测就可以预知自己是否易得某些疾病,这个高新医疗技术对许多人无疑是个好消息。但是,北京大学第一医院临床遗传中心主任朱平教授却再三表示,采用基因检测预知疾病一定要持审慎的态度。 朱平教授说,疾病是内因+外因的结果。"内因"就是体内的基因,"外因"就是生活习惯、生活方式。有些疾病与单个

北京基因组所开发系列特色科学数据库

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志在线发表,并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas

SNP基因分型(SNP-genotyping)的几个常用数据库

做SNP genotyping应该常看的几个database:1. NCBI dbSNP从这里出发可以连到下面几个网站。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=snp2. International HapMap ProjectThe Int

北京基因组所开发系列特色科学数据库

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志在线发表,并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas

澳将用基因测序技术诊断罕见基因疾病

  澳大利亚加文医学研究所27日宣布,全澳罕见病患者现在可以通过全基因测序技术获得更准确的诊断。澳大利亚也成为继美国后第二个向公众提供该项测试的国家。  全基因测序技术可以将罕见病的确诊几率提高三倍。这项前沿技术现在已经走出实验室,应用于遗传病检测。加文研究所主任、约翰·马蒂克教授认为,这项技术的普

基因检测能检测那些疾病

  1.恶性肿瘤疾病31种 :肺癌、胃癌、急性淋巴细胞白血病、慢性淋巴细胞白血病、直肠癌、喉癌、食管癌、鼻咽癌、膀胱癌、前列腺癌、乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、子宫肌瘤、原发性肝癌、胰腺癌、甲状腺癌、脑膜瘤、口腔癌、皮肤黑色素瘤、神经母细胞瘤、神经胶质瘤、多发性骨髓瘤、皮肤鳞状细胞癌、脑动脉瘤、肾癌、睾丸

基因检测能预测疾病吗?

  基因检测可以预测某些疾病的风险,但并不能完全预测一个人是否会患上某种疾病。  基因检测可以通过分析个体的基因组信息,检测其中是否存在某些与疾病相关的基因突变或变异。如果某个人携带了与某种疾病相关的基因突变或变异,那么他/她患上该疾病的风险就会增加。  但是,许多疾病的发生是由多种因素共同作用的结

基因“剪刀”可用于诊断疾病

  CRISPR / Cas技术不仅可以改变基因:根据弗莱堡大学的一项研究,通过使用所谓的基因剪刀,可以更好地诊断癌症等疾病。  在这项研究中,研究人员介绍了一种微流控芯片,该芯片可识别RNA的小片段,从而比目前可用的技术更快,更准确地指示特定类型的癌症。该结果最近发表在科学杂志“ Advanced

哪些疾病可做基因检测?

基因检测,就是在分子水平上解读不同的疾病,并对病人及易患者给予更好更早的诊断、治疗和预防。那么,目前究竟哪些疾病能够进行基因诊断?浙江大学遗传与基因组医学中心主任、长期从事基因诊断研究的留美博士祁鸣介绍,可以进行基因检测的疾病涉及行为疾病、癌症、结缔组织疾病、内分泌疾病、泌尿生殖系统疾病、免疫系统疾

谷歌致力于基因数据市场,整合Tute-Genomics基因数据库

  谷歌希望凭借人类基因组云端服务Google Genomics在基因组研究市场占有一席之地,如今,公司正忙于用最好的工具来填满这个工具箱。   Google Genomics是谷歌2013年推出的一项云端服务,帮助大学实验室和医院等机构将患者或科研对象的生物基因储存到云端上,推进人类基因组信息的存

北京基因组所构建完成质体基因组结构变异数据库

  多相催化是实现高效定向化学转化的关键技术,其中的一个重要基础科学问题是如何通过精确设计和调控催化活性位结构及所在环境,从而强化其定向催化功能并创造新型高效催化剂。近日,中国科学技术大学熊宇杰教授课题组和江俊教授课题组继在电催化体系中提出表面极化概念后,再次通过与黄伟新教授课题组合作,证实界面极化

基于同源基因簇的水稻泛基因组综合数据库建成

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498300.shtm近日,华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室教授张建伟课题组联合国内外高校与科研机构在《自然—通讯》与《分子植物》连续发表两篇研究论文。这两项工作以代表亚洲稻群体结构的