宁波大学SciRep解析癌相关ceRNAs
来自宁波大学医学院的研究人员,针对胃癌中长链非编码RNA（lncRNAs）相关的竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)展开了调查，研究结果发布在8月15日的《Scientific Reports》杂志上。 宁波大学医学院的郭俊明（Junming Guo）教授是这篇论文的通讯作者。郭教授的主要研究方向是肿瘤分子诊断、非编码RNA与肿瘤。 MicroRNAs (miRNAs)在基因表达调控中发挥着重要的作用。每个miRNAs或许都可以抑制多达数百种的转录物，而每一种转录物或许也是多个miRNAs的靶标。它们的调控网络参与了包括发育、癌发生和肿瘤转移等各种生物学过程。 数年前Salmena和同事们提出了一种ceRNA假说。这一假说描述了由miRNAs介导的一个复杂的转录后调控网络：通过共享一个或多个 miRNA反应元件(MREs),一些蛋白质编码RNAs和非编码RNAs竞争结合miR......阅读全文
RNA的转录与逆转录相关介绍
转录是以DNA为模板合成RNA的过程，经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中，再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的，以RNA分子中的一条链为模板，在逆转录酶的作用下，以四种脱氧核苷酸为原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
转录组测序和全转录组测序的区别
全转录组广义上是指细胞在特定状态下所能转录出来的 所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA 。借助高通量测序技术，可以全面获取样本中转录产物信息，结合竞争性内源RNA ( ceRNA)机制， 进行联合分析，深入挖掘转录水平调控网络。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有
转录组测序与转录表达谱测序的异同
转录组测序可以得到特定条件下所有mRNA转录本的丰度信息，从而发现新的转录本和可变剪接体基因表达谱(gene expression profile)：指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA测序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群体组成,从而描绘该特
DELLAICE1ABI5转录复合物－调控植物ABA激素信号转导
种子萌发是开花植物生活史中的一个关键阶段，受到植物体内多种信号物质和外界环境因子的精密调控。植物种子只有在适宜的环境条件下萌发，才有可能发育成正常的植株。各种不利环境因子可诱导植物合成脱落酸激素（Abscisic acid，ABA），从而抑制种子萌发和萌发后生长发育。前人研究表明，ABI5转录因
3D转录组图谱阐释造血干细胞和微环境细胞间的调控网络
血液系统中贮藏着一种具有自我更新、分化成各种血细胞潜能的成体干细胞，称为造血干细胞，它能够维持机体长久造血和组织稳态1。造血干细胞移植是恶性血癌的有效治疗手段，但干细胞来源不足成为限制该治疗广泛应用的瓶颈。因此，造血干细胞的发育，尤其是造血干细胞扩增的研究备受关注。然而，现在的研究主要集中在特定
我国学者发现转录因子Sox2可与RNA结合调控体细胞重编程
国际学术期刊Nucleic Acids Research（《核酸研究》）在线发表了中国科学院广州生物医药与健康研究院鲍习琛课题组、香港大学Ralf Jauch课题组和中山大学医学院（深圳）侯琳琳团队共同合作的成果“Concurrent binding to DNA and RNA facilit
GLI1的结构特点和作用
这个基因编码一个锌指蛋白Kruppel家族的成员。编码的转录因子被声波刺猬信号转导级联激活并调节干细胞增殖。这种蛋白的活性和核定位在抑制环中被p53负调控。已发现编码该基因不同亚型的多种转录变体。
hog信号通路的相关基因介绍GLI1基因
这个基因编码一个锌指蛋白Kruppel家族的成员。编码的转录因子被声波刺猬信号转导级联激活并调节干细胞增殖。这种蛋白的活性和核定位在抑制环中被p53负调控。已发现编码该基因不同亚型的多种转录变体。
Cell－亮点|－反义lncRNA如何调控基因的表达？
反义lncRNA（antisense lncRNA）是指由基因（通常是蛋白编码基因）的反义链转录，并与该基因的mRNA存在序列重叠的RNA分子。随着对非编码RNA研究的深入，研究发现约70%的基因均有反义lncRNA【1】。更为重要的是，反义lncRNA往往与其正义链基因的表达存在相关性，提示反
真核生物基因表达调控有哪些环节
可分为三种主要途径环节：1、遗传调控（转录因子与靶标基因的直接相互作用）；2、调控转录因子与转录机制相互作用，3、表观遗传调控（影响转录的DNA结构的非序列变化）。转录调控通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合位点，具
如何揭开长非编码RNA的神秘面纱
长非编码RNA(lncRNA)长达两百个核苷酸以上的转录本，但并不编码任何蛋白质。尽管如此，长非编码RNA在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性，说明lncRNA的调控具有重要的生物学意义。细胞中绝大多数lncRNA(也称lincRNA)位于细胞核，它们对应的DNA区域有的与蛋白编码基因重叠，
关于反式作用因子的作用介绍
反式作用因子（trans-actingfactor）通过以下不同的途经发挥调控作用：蛋白质和DNA相互作用；蛋白质和配基结合；蛋白质之间的相互作用以及蛋白质的修饰。参与基因表达调控的因子,它们与特异的靶基因的顺式元件结合起作用。编码反式作用因子的基因与被反式作用因子调控的靶序列（基因）不在同一染
ERF基因的结构特点和生理作用
ets2是一种转录因子和原癌基因，参与端粒酶的发育、凋亡和调控。该基因编码的蛋白与ets2启动子结合，是ets2转录的一个强抑制因子。已经发现了编码两种不同亚型的转录变体。
长链非编码RNA:－从科研到临床（一）
概述长链非编码RNA (LncRNA)是一类真核生物中长度大于200 nt的非编码RNA分子；根据其与邻近基因的位置可以分为反义lncRNA、增强子lncRNA、基因间lncRNA、双向lncRNA、和内含子lncRNA；它具有多种作用机制，比如在细胞核中作为分子支架、协助可变剪接、调节染色体结
研究揭示OsKANADI1调控水稻外稃形态建成的作用机制
颖壳是禾本科植物特有的花器官，可保护内部花器官免受病虫等侵害，为种子发育提供营养，且能决定种子大小。作为重要的侧生器官，颖壳背腹轴极性建立对其发育和功能至关重要。已有研究表明，转录因子、microRNA和tasiRNA作为背腹轴决定因子在极性建立中发挥重要的调控作用，而不同的背腹轴决定因子之间的
2014年8月28日Nature杂志精选
封面故事： 想与做背后的神经活动 在对神经活动的新模式多大程度上通过学习可以产生所做的一项研究中， Aaron Batista及同事对恒河猴利用运动皮层中不同活动模式学习如何控制电脑光标时的神经网络重新组织进行了分析。一些新的神经活动模式比其他的更容易产生(相应于更容易学会的任务)，这些可从实
与结直肠癌相关的基因突变类型NR2F2基因
这个基因编码一个核受体类固醇甲状腺激素超家族成员。编码蛋白是一种参与许多不同基因调控的配体诱导转录因子。交替剪接导致多个转录变体。
NR2F2基因的结构特点和作用
这个基因编码一个核受体类固醇甲状腺激素超家族成员。编码蛋白是一种参与许多不同基因调控的配体诱导转录因子。交替剪接导致多个转录变体。
关于艾滋病毒的编码基因的介绍
病毒基因组是两条相同的正链RNA，每条RNA长约9.2-9.8kb。两端是长末端重复序列（long terminal repeats, LTR），含顺式调控序列，控制前病毒的表达。已证明在LTR有启动子和增强子并含负调控区。LTR之间的序列编码了至少9个蛋白，可分为三类：结构蛋白、调控蛋白、辅助
HDAC8基因的结构特点和生理作用
组蛋白在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着关键作用。组蛋白乙酰化/去乙酰化改变染色体结构并影响转录因子对dna的获取。该基因编码的蛋白质属于组蛋白脱乙酰酶家族的Ⅰ类。它催化组蛋白n末端末端末端末端赖氨酸残基的脱乙酰化，并抑制具有转录共抑制因子的大型多蛋白复合物中的转录。已发现该基因编码不同亚型的
中国科学院植物研究所等揭示叶绿体中转录暂停现象
转录调控是基因表达过程中的基础机制。在转录过程中，RNA聚合酶会在一些因子的调控下暂时停止转录，而在条件具备情况下继续进行转录延伸。这一类精细调控现象被称为“转录暂停”。转录暂停已经发现40多年，但是最近才发现植物中也具有转录暂停现象。然而，植物中尚未发现转录暂停因子，叶绿体中是否存在转录暂停现
Cell子刊：超保守lncRNA的重要功能
谈到遗传物质，我们往往指的是从父母那儿继承到的DNA（脱氧核糖核酸）。这些DNA会转录成为RNA，进而指导各种蛋白质的合成，例如血红蛋白或胰岛素。除了这些RNA之外，细胞中还存在着大量神秘的非编码RNA。 MicroRNA是最广为人知的一种非编码RNA，这种微小的分子控制着众多基因的启动和关闭
关于p53基因的结构及表达介绍
P53基因在人类、猴、鸡和鼠等动物中相继发现后，对其进行了基因定位，人类 P53基因定位于17P13，鼠P53定位于11号染色体，并在14号染色体上发现无功能的假基因，进化程度迥异的动物中，P53有异常相似的基因结构，约20Kb长，都由11个 外显子和10个内含子组成，第1个外显子不编码，外显子
p53基因的结构及表达
P53基因在人类、猴、鸡和鼠等动物中相继发现后，对其进行了基因定位，人类 P53基因定位于17P13，鼠P53定位于11号染色体，并在14号染色体上发现无功能的假基因，进化程度迥异的动物中，P53有异常相似的基因结构，约20Kb长，都由11个 外显子和10个内含子组成，第1个外显子不编码，外显子2、
HDAC7基因的结构特点及主要作用
组蛋白在转录调控、细胞周期进展和发育事件中起着关键作用。组蛋白乙酰化/去乙酰化改变染色体结构并影响转录因子对dna的获取。该基因编码的蛋白质与组蛋白脱乙酰酶家族成员具有序列同源性。该基因与小鼠hdac7基因同源，其蛋白通过转录辅压子smrt介导抑制作用。另外，已经发现该基因编码不同亚型的剪接转录变体
华裔学者Nature综述：lncRNA的独特之美
几乎整个人类基因组都会转录成RNA，但只有一部分RNA被用于蛋白质生产。科学家们逐渐意识到，非编码RNA并不是基因组中的垃圾序列，而是许多基础生命过程的核心，有着广泛的生物学功能。然而，大多数RNA（非编码转录组）的功能还是未知的，长非编码RNA就是其中之一。 长非编码RNA（lnc
皮肤干细胞的细胞内调控
转录因子Tcf/Lef家族的调控 在胚胎早期发育中，上皮干细胞的发育受联合转录因子编码调控。最典型的转录因子是Tcf/Lef家族，它对上皮干细胞的增殖分化起着非常重要的作用。Tef/kf家族是Wnt信号通路的中间介质，当细胞内黏附因子β-catenin堆积时，可激活其介导的转录，促进细胞增殖；而当β
陈润生院士、赵春华教授Cell子刊解析长链非编码RNA
来自中科院生物物理研究所、中国医学科学院的研究人员证实，长链非编码RNA ADINR通过在转录水平上激活C/EBPα调控了脂肪生成。这项研究发布在10月15日的《Stem Cell Reports》杂志上。 中科院生物物理研究所的陈润生（Runsheng Chen）院士和中国医学科学院的赵春华
PNAS揭示基因组的“标点符号”
基因组不仅是蛋白质合成的蓝图，还含有控制蛋白表达的调控指令。正因为存在这样的调控，机体内才能形成不同类型的细胞和组织。美国国家科学院院刊PNAS杂志最近发表的一项研究表明，一些关键的调控程序编码在所谓的“垃圾DNA”中。 98%的人类基因组并不编码蛋白，这些非编码序列一度被认为是垃圾DNA。许
PHF6基因的结构特点和主要作用
该基因是植物同源结构域（phd）样指（phf）家族的成员。它编码一种蛋白，具有两个PhD型锌指结构域，表明在转录调控中可能起作用，定位于核仁。影响该基因编码区或转录片段剪接的突变与borjeson-forssman-lehmann综合征（bfls）有关，bfls是一种以认知功能障碍、癫痫、性腺功能减