PNAS揭示基因组的“标点符号”

基因组不仅是蛋白质合成的蓝图,还含有控制蛋白表达的调控指令。正因为存在这样的调控,机体内才能形成不同类型的细胞和组织。美国国家科学院院刊PNAS杂志最近发表的一项研究表明,一些关键的调控程序编码在所谓的“垃圾DNA”中。 98%的人类基因组并不编码蛋白,这些非编码序列一度被认为是垃圾DNA。许多垃圾DNA来自于反转录转座子元件(RTE),是在漫长的进化中累积起来的。RTE能够在基因组中移动并自我拷贝,但似乎并没有起到什么有益功能,因此也被称为“基因组寄生虫”。不过近年来人们发现,RTE其实能够编码重要功能,而且它们的活性与基因组调控有关。RTE已经与干细胞功能、组织分化、癌症发展、衰老和老年病关联起来。 MIR(Mammalian-wide Interspersed Repeats)是一类特殊的RTE,这项研究为人们揭示了MIR在基因组调控程序中起到的重要作用。研究人员发现,MIR可以作为“边界元件”,调控附近的基因活性......阅读全文

研究发现基因调控水稻细胞死亡新机制

近日,中国水稻研究所(以下简称水稻所)种质创新课题组研究发现病斑突变体基因ELL1通过影响叶绿体的发育来调控水稻中活性氧的稳态,进而触发由活性氧介导的细胞死亡。该项研究丰富了对植物中细胞程序性死亡产生与活性氧稳态之间联系的理解。相关研究成果在线发表在《植物学报》上。 水稻所副研究员任德勇介绍,细

基因调控的研究方法

  筛选突变型   这是在原核生物中广泛应用的方法,例如在乳糖操纵子的研究中筛选失去了基因调控能力的组成型,包括调节基因发生突变和操纵基因发生突变的突变型,以及筛选即使有乳糖或其他诱导物存在的情况下仍然不能合成β-半乳糖苷酶的超阻遏型等等。  激素诱导   在高等的真核生物中,除了离体培养的体细胞以

细胞化学基础植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

专家指南:如何研究基因调控(一)

随着基因组学研究的深入,人们已经不再满足于了解基因的功能,而是对基因调控表现出愈加浓厚的兴趣。现在,我们知道,DNA甲基化和组蛋白修饰可调控基因,microRNA和非编码RNA也可以。基因调控的研究工具也越来越多,包括RNA-seq、ChIP-seq、ChIP-chip等。究竟该采用哪种方法来测定m

专家指南:如何研究基因调控(三)

  Q5:在定位蛋白-DNA相互作用时,为降低DNA污染和片段化所引起的假阳性,同时也避免太严格的数据过滤所引起的假阴性,您的主要方法是什么?   Marc Facciotti(加州大学戴维斯分校):   首先,从微生物的角度来看,我们选择对天然表达的转录因子开展ChIP实验。我们认为,这能够将

关于基因调控的研究方法介绍

  1、筛选突变型  这是在原核生物中广泛应用的方法,例如在乳糖操纵子的研究中筛选失去了基因调控能力的组成型,包括调节基因发生突变和操纵基因发生突变的突变型,以及筛选即使有乳糖或其他诱导物存在的情况下仍然不能合成β-半乳糖糖苷酶的超阻遏型等等。  2、激素诱导  在高等的真核生物中,除了离体培养的体

植物激素调控基因研究获进展

  中科院上海药物研究所徐华强与中科院遗传与发育生物学研究所李家洋、美国温安洛研究所Karsten Melcher等合作,在植物中发现了一个与人体中特定信号机制非常相似的重要的分子机制,该机制与人类早期胚胎发育和癌症等疾病有着密切联系。相关研究日前在线发表于《科学进展》。  植物中复杂的分子网络调控

研究发现调控细胞分裂素合成的水稻增产重要基因

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505661.shtm7月27日,《自然—遗传学》杂志在线发表了华中农业大学教授邢永忠课题组(水稻产量生物学实验室)的研究论文。该研究挖掘到一个水稻的重要增产基因GY3,该基因通过调控细胞分裂素的合成,可显

Nature:研究发现调控心脏细胞再生的特异基因Meis1

  日前,德克萨斯大学西南医学中心的研究人员发现了一个心脏损伤后调控其再生能力的特异基因。过去,人们并不知道这一称作Meis1的基因能够在心脏中发挥功能。新研究发现对于预防心力衰竭具有重要的意义。相关论文在线发表在《自然》(Nature)杂志上。   研究人员表示,婴儿出生后不久,就在心肌细胞停止

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

  叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

  叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转

干细胞研究泰斗发国内期刊论文-解析基因调控新技术

  据最新公布的SCI影响因子,中科院主办的《Cell Research》杂志从去年的8.19跃升至10.526,实现了10的突破。这份期刊主要收纳细胞生物学等领域前沿科学研究成果,近期干细胞研究领域的权威人物Rudolf Jaenisch教授带领研究组,在这一期刊上发表了关于一种新基因调控

干细胞分化调控研究获进展

         近日来自美国乔治亚大学的一项新研究首次绘制出了一幅蓝图,揭示了干细胞是如何连接到一起对不断受到的外部信号分子做出响应的。这一研究发现使多年来自世界各地实验室相互矛盾的实验结果趋于一致,并使科学家们获得了精确调控干细胞发育或分化为特异细胞类型的能力。                

研究揭示免疫细胞“去向”调控机制

  中科院上海生物化学与细胞生物学研究所陈剑峰研究组在最新的一项研究中,揭示了决定免疫细胞去向的一种全新机制。6月19日,相关研究成果在线发表于《发育细胞》。  免疫系统是人体内的一套奇妙的保护系统。它不但负责抵御外界细菌、微生物、病毒等的入侵,还负责清除体内衰老、损伤、死亡以及发生癌变的自身细胞。

华人教授:细胞基因表达调控新见解

  最近,康奈尔大学的研究人员,通过在纳米级的精密度上追踪蛋白质在活细胞中的运动,对细胞调节其基因表达的方式,获得了新的认识。  每个活细胞里的DNA都包含着“基因蓝图”,指导细胞制造所需要的蛋白质。当需要一种特定的蛋白质时,一个调节蛋白会结合到DNA链上适当的位置,从而导致相邻的基因被“表达”而制

PNAS:基因调控网络建模研究获进展

  近日,国际学术期刊《美国科学院院刊》(PNAS)在线发表了由中国科学院数学与系统科学研究院和美国斯坦福大学、清华大学等单位的科研人员合作的基因调控网络建模的研究成果,提出了利用匹配的基因表达和染色质可及性数据刻画顺式调控元件和反式调控元件相互作用的数学模型,将基因调控网络的建模研究从编码基因推进

中国科大基因转录调控研究取得进展

  近日,中国科学技术大学生命科学学院教授单革实验室研究发现,秀丽线虫中两个高度保守的转录因子UNC-30和UNC-55,共调控包括cAMP通路、微小RNA(microRNA)和长链非编码RNA(lncRNA)等在内的数以千计的靶基因的表达,从而调控D型运动神经元的发育和可塑性。研究论文近日发表在《

研究团队在干细胞基因组稳定性调控机制研究中取得进展

  干细胞是机体发育和组织稳态维持的基础,基因组稳定是干细胞干性维持和再生医学应用的前提。研究干细胞如何维持基因组稳定,有助于推动干细胞的安全应用和理解相关发育疾病的致病机理。中国科学院昆明动物研究所研究员郑萍团队长期关注干细胞维持基因组稳定性的独特机制。前期工作中,该研究团队鉴定胚胎干细胞基因组稳

研究人员绘制人类海马体发育的细胞图谱和基因调控网络

  1月16日,《自然》(Nature)在线发表了题为Decoding the development of the human hippocampus 的研究论文。该工作系统阐明了人海马体胚胎发育过程中的基因表达调控网络和细胞命运决定因子,绘制了高精度发育细胞图谱,解析了海马发育过程中的不同细胞类

生化与细胞所雄激素受体对附睾基因表达调控研究获进展

  10月13日,内分泌领域权威期刊Molecular Endocrinology杂志在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所张永莲研究组取得的最新研究成果:雄激素受体在小鼠附睾基因组结合位点的鉴定。   附睾结构和功能的维持以及基因表达均高度依赖于雄激素,雄激素的作用是由雄激

蜕皮激素调控诱导细胞基因表达实验

            实验材料 带有荧光素酶报道基因并受蜕皮激素诱导表达的质粒 带有感兴趣的基因并受蜕皮激素诱导表达的质粒 pVgRXR 培养的哺乳动物细胞

蜕皮激素调控诱导细胞基因表达实验

下面的方案是从蜕皮激素诱导的哺乳动物表达系统(Invitrogen 公司)附带的方案修改而来。Stratagene 公司也出售相似的系统。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W.拉塞尔。实验材料带有荧光素酶报道基因并受蜕皮激素诱导表达的质粒带有感兴趣的基因并

肿瘤抑制基因如何参与细胞周期调控?

肿瘤抑制基因主要通过以下几种方式参与细胞周期的调控:p53 基因:当细胞受到 DNA 损伤等应激时,p53 基因被激活。激活的 p53 可以诱导细胞周期停滞,使细胞有时间修复损伤的 DNA。它通过促进 p21 基因的表达,p21 蛋白能与细胞周期蛋白 - CDK 复合物结合并抑制其活性,从而阻止细胞

蜕皮激素调控诱导细胞基因表达实验

实验材料 带有荧光素酶报道基因并受蜕皮激素诱导表达的质粒带有感兴趣的基因并受蜕皮激素诱导表达的质粒pVgRXR培养的哺乳动物细胞试剂、试剂盒 新霉素松甾酮 AZeocin培养液实验步骤 材料缓冲液和溶液贮存液稀释到适当浓度。新霉素松甾酮 A蜕皮激素的另一种类似物是 muristerone A(Sig

调控细胞数目的调控细胞数目

发育中的组织和器官主要依赖于细胞分裂和PCD之间的动态平衡以维持适当的细胞数目。大多数的器官,例如神经细胞、免疫系统和生殖系统均借助于PCD清除过度生成的细胞。在女性体内,借助PCD可清除掉近80%的卵母细胞。在哺乳动物中枢神经系统超过一半的神经元通过PCD清除。对有限存活信号的竞争确保了组织中不同

研究发现调控黄瓜低温高产的关键基因

近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所葫芦科蔬菜遗传育种创新团队发现调控黄瓜耐低温性和雌花形成的“枢纽”基因,首次阐明其协同驯化的分子机制,发掘出优异等位基因,为黄瓜耐低温高产分子育种提供重要理论依据和技术支撑。相关研究成果发表在《植物生物技术杂志》(Plant Biotechnology Journa

研究发现调控日本血吸虫生殖发育基因

  3月20日,记者从复旦大学获悉,该校生命科学学院胡薇团队,绘制了日本血吸虫从合抱至性成熟产卵过程的动态表达谱,解析了整个发育过程的基因表达特征和分子事件,发现了雌虫与雄虫在合抱后的发育过程中功能分化明显,到成熟阶段达到完美的功能互补,并鉴定了调控雄虫合抱的芳香族氨基酸脱羧酶及控制雌虫生殖系统发育