DNA甲基化：癌症共有的“指纹”
8月26日在线发表在Genome Medicine上的一篇文章中，研究人员说他们发现了多种癌症中都存在的普遍特异性变化，DNA甲基化标记，它们帮助控制基因的开、关以及最终细胞的行为。这种DNA上可逆的化学标记就是表观遗传学。 约翰霍普金斯医学院的Andrew Feinberg教授是医学、分子生物学、遗传学、肿瘤学以及生物统计学领域的专家，他说：“与正常细胞相比，肿瘤细胞中DNA甲基化模式更加不同。”他和Rafael Irizarry主导整个研究，Rafael Irizarry是哈佛大学和 Dana-Farber 癌症研究所的生物静力学教授。Feinberg说：“这些变化在肿瘤形成的很早期就发生了，我们认为甲基化能够让肿瘤细胞适应环境中的变化并且快速开关基因来达到增殖的目的。” Feinberg和约翰霍普金斯医学院肿瘤学教授Bert Vogelstein一起，首次于1983年确定了一些癌症中的异常甲基化......阅读全文
张康等团队报道：DNA甲基化分析有助于癌症诊断
“以康复和生存为目的的最优癌症治疗策略选择，很大程度取决于特定癌症类型或癌症亚型确诊，”加州大学圣地亚哥分校基因组医学研究所张康教授说。“微创活检对癌症科学和医学研究具有重大意义，因此DNA甲基化标记可能是一种更有效的新方法。” 附着在DNA上的甲基基团包括1个碳原子和3个氢原子。DNA甲基化
PNAS发布人类胎盘甲基化组
甲基化是控制基因表达的关键表观遗传学修饰。加州大学Davis分校和加拿大英属哥伦比亚大学的研究人员对胎盘进行研究，揭示了人类胎盘的甲基化组，文章发表在本周的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。他们发现，37%的胎盘基因组具有低甲基化区域(部分甲基化区域PMD)，这与大多数人体组织不同，在大多数人体
PNAS发布人类胎盘甲基化组
甲基化是控制基因表达的关键表观遗传学修饰。加州大学Davis分校和加拿大英属哥伦比亚大学的研究人员对胎盘进行研究，揭示了人类胎盘的甲基化组，文章发表在本周的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。他们发现，37%的胎盘基因组具有低甲基化区域(部分甲基化区域PMD)，这与大多数人体组织不同，在大多数人体
中科院Cell发表表观遗传突破性发现
来自中科院北京基因研究所的研究人员在斑马鱼实验中证实，早期胚胎过程中维持了精子而非卵母细胞的DNA甲基化组(Methylome)。这一突破性的研究发现以封面文章形式发表在5月9日的《细胞》(Cell)杂志上。 来自中科院北京基因研究所的刘江(Jiang Liu)博士和慈维敏(Weimin
甲基乙二醛：一种新型的DNA甲基化上游调节因子
甲基乙二酮（MG）是一种高反应性的二羰基分子。在糖酵解癌症细胞中，MG主要由磷酸二羟丙酮和3-磷酸甘油醛沿糖酵化途径的自发转化形成。细胞MG浓度显著受乙二醛酶系统的解毒活性调节，乙二醛蛋白酶1（GLO1）是限速酶。代谢重编程和DNA超甲基化异常相互独立地在癌症中进行了广泛的研究。然而，迄今为止，
云序高分文章利器：ctDNA（羟）甲基化测序案例分享
新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA（羟）甲基化测序 cfDNA（Cell free DNA）是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段，是一种新型的分子标记物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指来源于肿瘤细胞的cfDNA，是液体活检主
MGMT烷基化剂的结构和作用
烷基化剂是一种有效的致癌物，可导致细胞死亡、突变和癌症。该基因编码的蛋白质是一种DNA修复蛋白，参与细胞抵御烷基化剂的诱变和毒性。这种蛋白催化甲基从O（6）-烷基鸟嘌呤和DNA的其他甲基化部分转移到它自己的分子，从而修复毒性损伤。基因启动子甲基化与多种癌症类型有关，包括结直肠癌、肺癌、淋巴瘤和胶质母
精氨酸甲基化调控细胞凋亡研究
遗传与发育生物学研究所杨崇林实验室以秀丽线虫为模式，探索蛋白质精氨酸甲基化这一重要的蛋白质翻译后修饰方式在调控DNA损伤诱导的细胞凋亡方面的作用机制。 通过研究发现哺乳动物II型蛋白质精氨酸甲基转移酶PRMT5在线虫中的同源物，即线虫的PRMT-5，参与调控DNA损伤引起的细胞凋亡。在prmt-5基
表观遗传学和人类疾病
上个世纪50年代初，Watson和Crick建立了DNA分子结构模型，极大程度地促进了生命科学的发展。自此遗传学便成为现代医学研究领域中一个重要的分支。人类已经认识到基因突变可以导致疾病的发生，如慢性进行性舞蹈病(Huntington's chorea, Hc)和囊性纤维化等。近年来
ctDNA与癌症早筛，这项新突破是否会带来颠覆？
ctDNA已被证明与肿瘤实时变化密切相关，已被用于评估耐药性、监测治疗反应等。近年来，利用ctDNA液体活检来早期诊断癌症的研究热度不断攀升，成果也越来越显著。今天我们要分享的是近期刊登在《 Nature Genetics》杂志上的癌症早期筛查新突破。 ctDNA液体活检与甲基化检测全新组合
甲基化试验有助于区分原发肿瘤类型
未知性癌症（CUP）在转移性肿瘤患者中占比10%，然而这些癌症的原发肿瘤位置通常无法确定。由于无法分辨究竟是哪种肿瘤类型，这些患者的生存率很低。 “传统方法只能鉴定30%不明病灶的转移性肿瘤的原发肿瘤位置，一些分子生物学方法可以提高这一比例，但往往造价昂贵，并且，所使用的RNA样本比较脆弱容易
Nature：细胞程序可控癌症干细胞
近日，来自怀特黑德研究所的研究人员在国际杂志Nature上刊登了他们的最新研究成果，研究者表示，在乳腺癌中，癌症干细胞和正常干细胞往往来自不同的细胞类型，但二者却利用不同但非常相关的干细胞程序，两种干细胞程序间的差异或许可以帮助研究者后期开发新型的癌症治疗手段。 致命性肿瘤起始细胞的“种子”会
癌症细胞可被健康细胞“围猎”至死
英国研究人员首次发现，有两个基因在人体自身细胞抗击癌症细胞的过程中发挥着重要作用。发表在7月13日《公共科学图书馆·生物学》期刊网络版上的此项发现，将可能导致出现全新的癌症研究概念，那就是未来的癌症疗法将通过使人体自身的健康细胞“装备更为精良”来攻击癌细胞。 由英国伦敦大学
美国研究：乳汁细胞基因异常或与乳腺癌风险相关
美国研究人员4日发表研究报告说，妇女乳汁细胞中的特定基因变化可能与患乳腺癌风险相关。 马萨诸塞大学的研究人员在佛罗里达州举行的美国癌症研究协会年会上说，他们对271位哺乳妇女的乳汁细胞进行了研究。目前的研究结果发现，如果乳汁细胞中特定基因的甲基化水平异常升高，妇女患
全基因组测序解读重要甲基化机制
DNA看起来只是AGTC四种碱基的简单排列，可一旦它与组蛋白包装形成染色质，情况就复杂得多了。组蛋白主要有四种，分别是H2A、H2B、H3和H4。这些组蛋白要么令DNA盘绕起来保持沉默，要么将DNA解开允许基因表达。组蛋白上的化学修饰(如甲基化)，能够影响它对基因的控制。 H3K4me3是
ctDNA（羟）甲基化测序案例分享（二）
案例解析案例1：ctDNA甲基化可作为肝癌诊断和进程的分子标志物原文：Circulating tumour DNA methylation markers for diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma期刊：Nature Materia
识别DNA差异－10分钟完成癌细胞检测
近日，澳大利亚研究人员提出一项能在10分钟内完成的癌细胞检测。这项检测通过识别癌细胞和健康细胞之间的DNA差异，可快速完成初步诊断。图片来源于网络 甲基基团附着到DNA上的过程（被称为甲基化）受到遗传操控。在所有“成熟”的人类细胞中，DNA都携带这些修饰。癌细胞与健康细胞的基因组信息具有显著差
美国女院士表观遗传学新成果
TET（ten-eleven translocation）蛋白是生物体内存在的一种α-酮戊二酸（α-KG）和Fe2+依赖的双加氧酶，是DNA去甲基化过程中的一种重要的酶，对于维持干细胞的多能性有重要作用。多年来，科学家了解到，TET蛋白家族有肿瘤抑制因子的作用，但是，它们是如何抑制失控的癌细胞增
癌症基因疗法亮点频现－用好基因修复坏基因
当前，探索各种有效而实用的抗癌方法已成为研究人员和临床医生研究的重点，同时也成为患者关注的焦点。毫无疑问，2010年的癌症治疗在基因疗法方面出现了一些亮点，如果假以时日，基因疗法将成为癌症治疗的实用技术。 核糖核酸干扰显神威 癌症的基因疗法有很多，其中有一种更显示了独特的魅力，这就是
8月22日－Nature杂志生物学精选
封面故事：人类基因组动态甲基化图 该图所示为人类基因组的动态甲基化情况：图上x轴(左边)相应于在24种人类细胞和组织类型中所观察到的最大甲基化变化，y轴是平均总甲基化，z轴是CpG二核苷酸的密度。胞嘧啶的甲基化(通常发生在CpG上)是基因表达的表观调控的一个常见特征。大多数细胞类型都有相对
ctDNA甲基化检测在肿瘤诊疗中的价值
循环肿瘤DNA（circulating tumor DNA，ctDNA）来源于肿瘤细胞的凋亡、坏死或分泌产生的DNA片段，是循环游离DNA（circulatingcell-free DNA，cfDNA）的一部分。健康人群中大部分cfDNA的长度在70~200 bp，但肿瘤患者的ctDNA长度
华人研究组Nature解析“从头开始的DNA甲基化”
加州大学河滨分校的一个研究小组解析了在DNA甲基化过程中起关键作用的一种酶的晶体结构，这对于了解“从头开始的DNA甲基化”具有重要的意义。 这一研究成果公布在2月7日的Nature杂志上。由加州大学河滨分校的宋继奎（Jikui Song，音译），以及王钢（Gang Greg Wang，音译）领
Science：重要的癌症基因开关
来自瑞典Karolinska研究所和芬兰赫尔辛基大学的科学家们证实了一些调控基因表达的“开关”在癌症的形成中起重大作用。在发表于《科学》(Science)杂志上的这项研究中，他们研究了一个基因区域，该区域包含了某个与结直肠癌和前列腺癌风险增高相关的特异单核苷酸变异，发现移除这一区域可显著抵制肿瘤
癌症基因检测“揭示家族性”
科学家们已经发现了为什么一些家族会患许多不同类型的癌症，这要得益于基因检测。在对1,100例罹患罕见癌症（也称为肉瘤）患者的检测中发现，半数以上患者具有增加癌症风险的先天性基因突变。这项发表在柳叶刀《》肿瘤学》杂志上的研究称，遗传性突变可能成为癌症治疗新靶点。可以为那些易患癌症家庭提供筛查和建
最全面的癌症基因普查
图片来源于网络 该“癌症基因普查”描述了所有与致命癌症密切相关的基因，以及这些基因在各种疾病中的功能，形成了超过700个基因的资源目录，帮助科学家了解癌症原因，找到药物靶点和设计治疗方案。为改善个体化医学铺平了道路，建立了针对特定遗传功能或突变的抗癌药物合集。 癌症是一种遗传性疾病，DNA突变会
Nature揭示新型癌症致病基因
来自英国癌症研究中心(Cancer Research UK)的科学家们在小鼠中发现了一个防止卵巢癌的新基因，如果其发生缺陷就可以提高形成这一疾病的机会。这项研究发表在9月4日的《自然》(Nature)杂志上。 这一称作为HELQ的基因，可帮助修复细胞增殖时DNA复制过程中所发生的所有的
eLife：lncRNA调控癌症关键基因
Salk研究所的科学家们发现，一种长非编码RNA(lncRNA)是癌症发展过程中的一个关键基因开关。这项研究于四月二十九日发表在eLife杂志上，为相关癌症的治疗提供了一条新的途径。 研究人员将这种lncRNA命名为PACER(p50-associated COX-2 extragenic
NatureGenetics揭示儿童癌症致病基因
来自约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心和费城儿童医院(CHOP)的科学家们在对74个儿童神经母细胞瘤进行全基因组测序后，发现ARID1A和ARID1B两个基因发生改变的患儿相比无此基因改变的患儿生存期缩短了四分之三。这一发现有可能最终导致早期确认患有侵袭性神经母细胞瘤的儿童，他们或许需要接受其
JBC：验血可检测癌症基因
Texas大学MD Anderson癌症中心的科学家们发现，癌细胞释放到血液中的胞外体(Exosome)，包含了癌细胞的整个遗传学蓝图。这一基因组数据可以用于检测癌症相关的突变，帮助医生尽早诊断癌症，以便对患者进行有效治疗。文章发表在本期的Journal of Biological Ch
基因疗法，治好“不可治愈”癌症
近日，英国研究者采用一种基因疗法，成功治愈了一个患有耐药性白血病的一岁女孩，成为免疫细胞疗法治愈“不可治愈”的癌症的全球首个案例。 该患儿名为Layla Richards，在位于伦敦中心的大奥蒙德街医院（Great Ormond Street Hospital）接受治疗，该