DNA甲基化：癌症共有的“指纹”
8月26日在线发表在Genome Medicine上的一篇文章中，研究人员说他们发现了多种癌症中都存在的普遍特异性变化，DNA甲基化标记，它们帮助控制基因的开、关以及最终细胞的行为。这种DNA上可逆的化学标记就是表观遗传学。 约翰霍普金斯医学院的Andrew Feinberg教授是医学、分子生物学、遗传学、肿瘤学以及生物统计学领域的专家，他说：“与正常细胞相比，肿瘤细胞中DNA甲基化模式更加不同。”他和Rafael Irizarry主导整个研究，Rafael Irizarry是哈佛大学和 Dana-Farber 癌症研究所的生物静力学教授。Feinberg说：“这些变化在肿瘤形成的很早期就发生了，我们认为甲基化能够让肿瘤细胞适应环境中的变化并且快速开关基因来达到增殖的目的。” Feinberg和约翰霍普金斯医学院肿瘤学教授Bert Vogelstein一起，首次于1983年确定了一些癌症中的异常甲基化......阅读全文
甲基化测序能否突破肿瘤难关？WGBS、杂交捕获了解一下？
DNA甲基化是哺乳动物中研究最为深入的表观遗传修饰之一。正常细胞中，DNA 甲基化有效的调控基因表达水平。某些抑癌基因的失活是由于启动子区域的高甲基化，大量实验研究表明，在多种类型癌症中，DNA甲基化导致了大范围的基因沉默。除了启动子区域和DNA重复序列中的甲基化水平改变外，甲基化还与非编码RN
Cancer－Cell专题：癌症表观遗传学
癌症中的基因调控与反调控一直是人们关注的热点，现在这一领域已经取得了很大的进展。Cell旗下的Cancer Cell杂志本月特别推出专题，推荐了四篇有代表性的癌症表观遗传学文章。 Vulnerabilities of Mutant SWI/SNF Complexes in Cancer 癌症
Nature－Genetics－揭示eccDNA功能—驱动神经母细胞瘤基因组重排
在刚刚过去不到一个月的时间，染色体外环状DNA（eccDNA）重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊，这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖，吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增，极大地促进肿瘤
云序高分文章利器：ctDNA（羟）甲基化测序案例分享
新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA（羟）甲基化测序 cfDNA（Cell free DNA）是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段，是一种新型的分子标记物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指来源于肿瘤细胞的cfDNA，是液体活检主
单细胞测序新技术：同时分析单个细胞的转录组和甲基...
单细胞测序新技术：同时分析单个细胞的转录组和甲基化组 单细胞转录组和甲基化组分析已经成为了单细胞研究的强大工具。然而，由于细胞之间存在较大的差异，又不能同时检测一个细胞的转录组和甲基化组，在单细胞中揭示DNA甲基化与基因表达的直接关联还比较困难。 近日，加州大学范国平教授和同济大学薛志刚教授
吸烟会在DNA上留下永久的印记，同时改变7千多个基因！
很多人都明白吸烟的危害，其中癌症、心脏病、中风都与吸烟有关系，特别是肺癌。吸烟能够增加5倍到10倍肺癌发生的风险。 但是你不知道的是即使在戒烟后，仍可能会提高患病的风险。 吸烟会改变DNA 美国国家环境健康科学研究所斯蒂芬·伦敦Stephanie London博士通过实验证明，吸烟会造成
北大、首都医科大联合开发癌症检测新技术
来自北京大学、首都医科大学的研究人员报告称，他们开发出了一种称作为MCTA-Seq（methylatedCpGtandemsamplificationandsequencing）的新方法，可在全基因组范围检测肝癌循环游离DNA中的超甲基化CpG岛。这一重要的研究成果发布在10月30日的《细胞研究
染色质，解锁癌症表观遗传学的钥匙
表观遗传学指基因序列不变化的前提下，基因表达发生了可遗传的变化，包括DNA甲基化、染色质改型、基因沉默、RNA编辑、组蛋白修饰（甲基化、乙酰化、磷酸化等）等。其中，染色质改型调控基因表达的过程，涉及多种导致DNA和组蛋白组成变化、染色质构象变化的蛋白质。 众多研究已经证明，染色体畸变和染色质异
microRNA的肿瘤抑制因子角色
美国南加州大学的研究人员报道说，一种新的方法通过活化癌细胞基因组中保护性的microRNA的表达，从而使致癌基因的表达水平显著降低。这篇发表在6月的Cancer Cell杂志上的文章证明已知能调节基因表达的制剂还能够影响调节性的RNA。这种调节性的RNA即为microRNA，它能充当正常细胞中的肿瘤
检测癌细胞的全新技术问世
根据英国《自然·通讯》杂志5日发表的医学研究报告，一项能在10分钟内完成的癌细胞检测技术问世。这项检测通过识别癌细胞和健康细胞之间的DNA（脱氧核糖核酸）差异，快速完成初步诊断。 甲基基团附着到DNA上的过程被称为甲基化，这一过程受到遗传操控。DNA甲基化作为DNA化学修饰的一种形式，能够在不
科学家实现单细胞水平甲基化和去甲基化调控
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507595.shtm
Cell子刊颠覆经典教条，癌症表观遗传有新说
由澳大利亚Garvan医学研究所Susan Clark教授领导的一个研究小组在新研究中揭示：前列腺癌中基因组的大片区域(约达到2%)受到了表观遗传调控激活。这一成果发表在12月13日的《癌细胞》(Cancer cell)杂志上。 激活区域包含许多前列腺癌特异基因，例如前列腺癌最常见
全球癌症基因组图谱计划又一研究突破
最近，发表在国际杂志the New England Journal of Medicine上的一篇研究论文中，来自从事癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas）研究计划的科学家通过进行研究，对第二种常见类型的肾癌的两种类型进行了分子特性的分析，并且对这种常见类型的肾癌进行了
北大、首都医科大联合开发癌症检测新技术
来自北京大学、首都医科大学的研究人员报告称，他们开发出了一种称作为MCTA-Seq（methylated CpG tandems amplification and sequencing）的新方法，可在全基因组范围检测肝癌循环游离DNA中的超甲基化CpG岛。这一重要的研究成果发布在10月30日的
基因解码：量身订做癌症治疗
癌症长年高居国人10大死因之首，然而现在即使是晚期癌症，随着致癌途径的基因不断被解码，肿瘤科专家指出，未来每个癌症患者可以找到更符合自己的标靶药，让癌症治疗朝向量身订做。 抗癌除了透过手术除恶务尽，随着找到癌细胞的特殊生长因子、特殊蛋白、阻断肿瘤血管生成等标靶，让无法手术的患者，若带有这些特殊
科研人员揭示三维培养细胞辐射抗性内在机理
中科院近代物理研究所科研人员揭示了具有更接近人体生理特性的三维培养细胞辐射抗性内在机理，为临床癌症放射治疗提供了新的理论依据和治疗靶点。相关成果日前发表于《肿瘤靶向》。 论文第一作者、该所在读博士潘冬介绍，三维培养是一种基于基质胶为支架的新型细胞培养模式，在生命现象与药物效应测试研究中的应用日
PNAS：免疫细胞基因编辑给癌症和艾滋病带来希望
人类中的很多突变都与基因突变相关。例如，白化病是因为酪氨酸酶基因上的点突变导致酪氨酸酶功能异常，从而导致了黑色素合成障碍。还有一些病症涉及到多种基因突变导致的功能障碍。如果能够使用某种精确的基因编辑方法，修补这些基因突变，从理论上讲，就可以一定程度缓解病情。而人类T细胞的基因突变导致其功能异常，
CRISPR基因编辑技术改良机体白细胞如何有效抵御癌症
日前在美国，研究人员首次利用基因编辑工具来治疗3名晚期癌症患者，同时1期临床试验结果显现出了很大的希望，截止到目前为止，治疗似乎是安全的，而且有更多的结果有望很快发布。为了开发出了一种安全高效的癌症治疗方法，来自宾夕法尼亚大学等机构的科学家们通过研究开发出了一种先进的免疫疗法，在治疗过程中，研究
肿瘤早筛领域新突破！抽血可检测早期胃癌
近日，中国科学院合肥物质科学研究院肿瘤医院研究员王宏志、聂金福、洪波课题组与山西省肿瘤医院生物样本库团队在肿瘤早筛领域取得新进展，开发了基于血液循环肿瘤DNA（ctDNA）甲基化和人工智能识别技术的胃癌早期无创检测技术。相关研究成果日前在线发表于《癌症科学》。聂金福向《中国科学报》介绍，“这项研究强
肿瘤早筛领域新突破！抽血可检测早期胃癌
近日，中国科学院合肥肿瘤医院研究员王宏志、聂金福、洪波课题组与山西省肿瘤医院生物样本库团队在肿瘤早筛领域取得新进展，开发了基于血液循环肿瘤DNA（ctDNA）甲基化和人工智能识别技术的胃癌早期无创检测技术。相关研究成果日前在线发表于《癌症科学》。聂金福向《中国科学报》介绍，“这项研究强调了ctDNA
检测癌细胞的全新技术问世
根据英国《自然·通讯》杂志5日发表的医学研究报告，一项能在10分钟内完成的癌细胞检测技术问世。这项检测通过识别癌细胞和健康细胞之间的DNA（脱氧核糖核酸）差异，快速完成初步诊断。甲基基团附着到DNA上的过程被称为甲基化，这一过程受到遗传操控。DNA甲基化作为DNA化学修饰的一种形式，能够在不改变DN
人类基因组DNA甲基化数据分析
近期来自电子科技大学，清华大学等处的研究人员从CpG岛等基本定义出发，阐述了高通量DNA甲基化的检测技术以及针对芯片技术与下一代测序技术的低水平数据处理方法，并重点对比了基于机器学习理论对CpG位点及CpG岛甲基化水平的预测算法，以及所利用的特征对预测效果的影响与发展趋势。 DNA甲基化是表观
林东昕：DNA甲基化是癌症早筛指标“潜力股”
“新冠疫情早期，我们就研发出了核酸检测试剂，可以确定谁被感染、谁需要隔离和治疗。但遗憾的是，人类有很多种严重疾病，例如癌症，目前为止还没有出现像新冠核酸检测这样简单的方法，甄别谁容易得或者要得癌症。”中国工程院院士、中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院病因及癌变研究室主任林东昕说。 据林东昕介绍
一种新的血液检测方法，可以检测多种癌症
一项新血液测试的试验表明，一种正在开发的新血液测试能够以较高的准确性筛查多种类型的癌症。丹娜-法伯癌症研究所的研究人员近日在2019年欧洲肿瘤医学协会(ESMO)大会上展示了这项多中心试验的结果。 这项测试由GRAIL公司开发，使用下一代测序技术探测DNA中微小的化学标记(甲基化)，这些标记会
新“分子时钟”预测癌症更近一步
日前，中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所与英国伦敦大学学院的研究人员在《基因组生物学》杂志上合作发表的一项最新研究成果表明，生命周期中细胞分裂导致的DNA分子变异积累可被用于癌症发生风险的预测。 组织细胞的分裂速度与该组织的癌症发生风险高度相关。研究人员利用计算建模方法设计了一个“分
NIH－340万美元资助癌症基因组图谱研究计划
美国国立卫生研究院于当地时间7月2日宣布，决定对八个单位（或个人）进行为期两年、总值340万美元的资助，以支持癌症基因组图谱研究计划（Cancer Genome Atlas pilot program）。 癌症基因组图谱计划是美国国立癌症研究所和美国国家人类基因组研究的合作项目，于2005年晚期，
甲基化的基因组直接测序法
基因组直接测序法是过去一直沿用的DNA甲基化的研究方法，用Maxam—Gilbert化学裂解法对基因组DNA进行处理，并以连接介导的PCR来放大信号强度，然后进行序列分析。此法是基于5mC在标准的Maxam—Gilbert胞嘧啶化学裂解反应中不被裂解，故5mC可通过在测序胶上缺少对应于胞嘧啶降解
在基因组范围定位DNA甲基化
DNA甲基化在哺乳动物基因表达中扮演了重要角色。尽管通过线粒体遗传且随时间稳定，但是细胞分化、疾病或环境影响都会改变DNA甲基化的模式。近年来，科学家们开发出多种新方法，试图在基因组范围定位DNA甲基化。 尽管从理论上来说，全基因组亚硫酸氢盐测序能让研究人员全面观察甲基化组，但它还是面临技
揭示DNA甲基化与基因沉默的关系
DNA 甲基化与真核基因和转座子的转录抑制有关，但基因沉默的下游机制在很大程度上是未知的。 2021年6月3日，加州大学洛杉矶分校Steven E. Jacobsen团队在Science 在线发表题为“MBD5 and MBD6 couple DNA methylation to gene s
一滴血测16部位肿瘤，让父爱常伴身旁
他，用坚实的肩膀支撑，让你感觉温暖、安心；他，用默默的承受坚守，让你知道他是家的脊梁；他，用满脸皱纹承载时光的沧桑，让你对未来的生活充满希望，他，就是父亲……可能因为六月的阳光犹如父爱，无声却炽热，所以每年六月的第三个周日被定为父亲节。在我们眼中，父亲是坚强的代名词，可是正坚强，他对小伤小痛很少