盘点最热门的基因组测序新成果

The scientist杂志盘点了近期各大杂志上最热门的基因组测序成果,让我们看看科学家们又从测序中获得了什么新知识吧。 种属:家猫(Felis catus) 基因组:3.1 billion bp 家猫会患上白血病也会受到免疫缺陷病毒的感染。为了更好的理解相关疾病,一个跨国科研团队测序了三只家猫的基因组并且进行了注释。这项研究为人们提供了一个新的猫科基因组浏览器——Genome Annotation Resource Fields(GARfield),其中包括血细胞的甲基化模式,以及两万一千多个基因组注释。相关论文发表在八月五日的GigaScience杂志上。 Nova Southeastern大学的Stephen O’Brien等人使用三种不同的方法对三只家猫进行测序和分析。虽然此前人们发布过家猫的基因组,不过之前的鸟枪测序法覆盖度太低,这项研究有助于填补之前留下的缺口。此外,这项研究也有一些新发现,比如发现了新......阅读全文

新杀虫剂仍可毒害蜜蜂

  全球蜜蜂深陷困境,而很多科学家担心,一种常见农药要承担部分责任。如今,研究人员证实,一种被誉为潜在替代产品的化学物质产生了类似的有害影响,减少了大黄蜂群体中新蜂王和雄性蜜蜂的数量。此项发现或迫使农民寻求替代解决方案,以减少害虫造成的作物损失。  所谓的新烟碱类杀虫剂通过阻止害虫大脑中的受体(令其

蜜蜂能理解抽象数学概念“零”

  一个国际研究团队发现,蜜蜂可以理解“零”这个重要数学概念,与海豚、一些灵长类动物及学前儿童一样“聪明”。图片来源于网络  发表在最新一期美国《科学》杂志上的研究表明,蜜蜂尽管脑子不大,却能理解复杂、抽象的数学概念,这为开发更加简洁的人工智能算法提供了新思路。  论文通讯作者、澳大利亚皇家墨尔本理

Scientific-Reports:蜜蜂残翅病毒来源

近日,中国农业科学院蜜蜂研究所蜜蜂病虫害生物学创新团队,联合德国乌尔姆大学和英国埃克塞特大学相关人员,采用大尺度取样对我国22个省近200个蜂场的意大利蜜蜂和中华蜜蜂,进行了蜜蜂残翅病毒的流行、群体遗传和进化重构分析,厘清了我国蜜蜂残翅病毒的主要流行基因型和季节性变化特点。该研究有助于揭示蜜蜂残翅病

The-scientist:近期最受关注的基因组测序-TOP4

  The scientist杂志集中盘点了近期最受关注的一些基因组测序成果,中国学者的草鱼基因组测序格外引人注目。  种属:猛犸象(Mammuthus primigenius)  基因组:~4 billion bp  研究人员从距今四万多年的猛犸象残骸提取DNA, 测序并组装了迄今为止最完整的两个

基因组所人类基因组突变研究获进展

序列变异的周期性和与TCR相关联的突变   基因突变会导致人类疾病的产生,因此研究遗传变异的产生过程和那些能够引起疾病的突变对生命科学基础研究以及人类健康是十分关键和重要的。   近日,中国科学院北京基因组研究所于军研究员带领其研究团队,在有关人类基因组中以转录为中心的突变研究方面取得新进展

新成果打破中华蜜蜂种群的国际认知

  近日,中国农业科学院蜜蜂研究所蜜蜂遗传与育种创新团队针对中华蜜蜂群体基因组学开展了研究,系统揭示了中华蜜蜂的群体结构、进化与适应。相关研究成果在线发表在《分子生物与进化》上。  中华蜜蜂(以下简称中蜂)是我国重要的遗传资源,其分布广泛,涵盖多种气候区和地形。但目前群体多样性受到严重影响,亟待保护

大型基因组研究揭示失眠机理

  日前,对人类基因组进行的两项深入研究揭示,经常被归咎于压力或不良睡眠习惯的失眠症,可能与抑郁症、心脏病以及其他生理疾病的关系更加密切。  “这两项研究都做得非常出色。”美国宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院研究睡眠行为的心理学家Philip Gehrman表示。但是他强调,在将与失眠有关的基因联系转化

Nature最新基因组研究成果

  无论是接收礼物的圣诞袜,还是橱窗里的漂亮衣服,棉花的作用渗透在即将到来的这个节日的方方面面中,然而对于生物能源研究人员来说,棉花纤维成分比其颜色和质地更为重要。   由来自31个研究机构组成的一个国际研究小组近期完成了基因组最简单的棉花品种:Gossypium raimondii的详细图谱

中药基因组工程研究项目启动

    7月上旬,中药基因组工程科技大厦选址于长沙岳麓山大学城湘江风光带北端,与此配套的中药材基因库已在岳麓区观砂岭茶子山村动工建设,规划占地200亩,拟建成一个符合国际标准的中药材种植试验基地和湖南省珍稀植物药种资源保护与繁殖基地。这标志着中药基因组工程研究项目正式启动。      我省中医药

Nature发布基因组研究重要成果

  如果歌手Paul Simon给Richard Lenski长期进化实验(LTEE)中的细菌写首歌,那歌名可以是“这么多年以后仍然在改变。”  发表在8月1日《自然》(Nature)杂志上的研究论文中,这位密歇根州立大学的著名微生物学和分子遗传学教授与一个国际研究小组,利用先进的技术研究了数万代的

Science发表基因组研究重要成果

  科学家们日前发现,人类基因组的遗传学差异主要来自于拷贝数变异(CNV)。在此之前人们对CNV的了解并不多,因为CNV一直是基因组测序的一大挑战。  华盛顿大学的遗传学家Evan Eichler领导研究团队克服了这一困难。他们对来自全球125个族群的人进行了深度基因组测序,全面分析了基因组中的SN

研究解析野古草基因组

近日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心完成了禾本科C4植物野古草的全基因组测序、组装与注释,并结合单细胞角度揭示了其类花环状排列的特化C4细胞(DC细胞)的功能特性和分子特征,剖析了其独立发育和可塑性排布的机制。C4植物通过特化的叶片结构与CO2浓缩机制实现高效光合作用。在玉米的“花环状叶片结构”

Science发表基因组研究重要成果

  科学家们日前发现,人类基因组的遗传学差异主要来自于拷贝数变异(CNV)。在此之前人们对CNV的了解并不多,因为CNV一直是基因组测序的一大挑战。  华盛顿大学的遗传学家Evan Eichler领导研究团队克服了这一困难。他们对来自全球125个族群的人进行了深度基因组测序,全面分析了基因组中的SN

TheScientist:值得关注的基因组研究

  美国的《The Scientist》杂志是一本面向生命科学的学生、研究人员的杂志,与学术期刊不同的是,该杂志除了报道研究领域内的热点话题外,还深入研究人员所关心的其他话题,如怎样进行职业规划、怎样用高科技创业等。其背后有全世界最优秀的专家团队――F1000(Faculty1000)的支持。近

大型基因组研究揭示失眠机理

图片来源:DIMABERLIN  本报讯 日前,对人类基因组进行的两项深入研究揭示,经常被归咎于压力或不良睡眠习惯的失眠症,可能与抑郁症、心脏病以及其他生理疾病的关系更加密切。  “这两项研究都做得非常出色。”美国宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院研究睡眠行为的心理学家Philip Gehrman表示。但

全基因组研究解码口吃根源

  口吃跨越不同语言和血统,影响着全球约7000万人。过去,许多人认为口吃能够通过自主控制来改善。但数十年来的研究表明,口吃实际上是一种高度遗传的不可控疾病,其原因复杂且模糊。而一项7月28日发表于《自然-遗传学》上的研究让口吃的部分原因变得清晰。  研究人员利用基因检测服务公司23andMe的庞大

利用CRISPR研究基因组“暗物质”

  超过98%的人类基因组由非编码基因组成。这些非编码基因被称为基因组的“暗物质”,它们能调控编码基因的表达,从而影响人类健康和疾病进程。自从人类基因组序列被公开发表以来,科学家们努力解析基因中的功能元件,包括非编码调节区——参与转录调节的顺式调节区和非编码RNA(ncRNA)。转录因子在整个基因组

Nature:蜜蜂病原体可感染熊蜂

  将于2月20日刊登在《自然》杂志上的一份研究显示,导致蜜蜂大量死亡的病原体也可以感染熊蜂和其他传粉昆虫。该研究结果证明,新发传染病有机会从人工养殖场“溜到”野外。   蜜蜂是一种重要的传粉昆虫,可帮助人类采集花粉和花蜜,但新近出现的病原体已令全球蜜蜂数目大幅下降,养蜂业要通过更严格的管理才能保

醉龙模仿蜜蜂气味吸引传粉者

   一只正在死去的蜜蜂的气味或许没那么有吸引力,但最新研究表明,一种植物会利用它布下聪明的陷阱。  约5%的植物利用欺骗策略吸引传粉者,包括看上去像雌性蜜蜂以吸引热切的雄性传粉者的突变花朵。不过,看上去与众不同的降落伞状植物——醉龙将这一本领提升到更高层次。它会影响肖稗秆蝇属雌性苍蝇的行为。这种苍

蜜蜂采粉量与花粉味道有关

  植物和蜜蜂有着复杂的关系:它们需要蜜蜂传粉,但因为花粉的生成需要很多能量,因而又不能让蜜蜂采太多花粉。  7月12日发表于《生物学通信》的一项新研究表明,植物控制每只蜜蜂采多少花粉主要靠味觉。  研究人员呈现了6种熊蜂采集凤仙花属植物群落的过程,其花粉分别含有甜蔗糖、苦奎宁或是中性的纤维素。在5

加拿大拟发布蜜蜂行业安全标准

  2010年11月4日,渥太华消息,加拿大政府和加拿大蜜蜂协会(CHC)于近日宣布,正在寻求一项新的蜜蜂行业自愿性国家生物安全标准,这将有助于蜜蜂饲养者降低蜂群中的病虫害风险和疾病危害。  黄蜂、切叶蚁、蜜蜂饲养者在保证蜂群健康的同时将会有更密切的联系。该标准预计于2012年发布,提案将

罗马尼亚发生蜂房蜜蜂球菌疫情

  据世界动物卫生组织(OIE)消息,2019年6月24日,罗马尼亚国家卫生兽医食品安全局向OIE报告称,罗马尼亚发生蜂房蜜蜂球菌疫情(Melissococcus plutonius)。  本次疫情发生于雅洛米察县首府--斯洛博齐亚的一个养蜂场内,疫情在6月14日得到确认。疫情源头未知。  经临床与

基因组所肝癌全基因组合作研究取得新进展

  近日,由中国科学院北京基因组研究所所长吴仲义及其科学团队与国立台湾大学医学院陈定信院士、陈培哲院士共同合作开展的“肝癌癌症基因组合作研究”计划获最新进展,相关学术论文在在最新出版的PNAS杂志上发表。  “肝癌癌症基因组合作研究”计划于2009启动,作为基因组所一项长期的癌症基因

宏基因组研究新突破,复旦最新研究发Nature

近年来伪狂犬、猴痘等病毒从动物向人类外溢引发新发传染病甚至全球大流行的频率正在显著增加如何精准预测和预报动物源新发传染病是关系绿色健康养殖与公共卫生防控的重要科学问题复旦大学公共卫生学院粟硕教授团队与合作者运用前沿交叉研究方法揭示多种哺乳动物宏基因组数据中的病毒基因组组成、生态学特征与跨物种传播规律

“花开同时不同色”——《PNAS》破解花色差异基因

  在西班牙,一种名为金鱼草的迷人植物野蛮生长在马路街头,如果你沿着巴塞罗那向比利牛斯山脉行驶,花色艳丽的金鱼草(Antirrhinum majus)随你一路绽放,起初是洋红色的,接着是明黄色的,中间仅有2公里是两种颜色掺杂在一起的。  实际上,金鱼草杂交区非常稀少,世界上仅有少数已知地区长有这些混

研究发现人类合子基因组激活起始于父源基因组

  表观遗传修饰包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质可及性和染色质高级结构等,在基因的表达调控中发挥重要作用。人类精子和卵细胞的染色质表观修饰状态存在较大差异。在受精后的早期胚胎里,来自精子的父源染色质和来自卵细胞的母源染色质会经历剧烈的表观遗传修饰重编程,最终达到两者类似的模式。人类胚胎的合子基因

基因组所发布表观基因组关联研究开放平台EWAS-Open-Platform

  近日,由中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心(NGDC)开发的表观基因组关联研究资源开放平台EWAS Open Platform上线。相关研究成果以EWAS Open Platform: integrated data, knowledge and toolkit

国家基因库研发线粒体基因组重要新应用

  继启动万种动物线粒体基因组计划(MT10K, https://www.mt10k.org)之后,深圳国家基因库成功研发出一套应用线粒体基因组监测生物多样性的宏线粒体基因组重测序方法(mitochondrial metagenomics,以下简称“全线粒体混合多样性分析法”)。此方法高效、准确且可

基因组研究持续存在“欧洲偏向”

  科学家近日在《自然》杂志评论版块撰文表示,目前基因组学持续存在一种“欧洲偏向”,即大部分研究以欧洲群体为主,这导致其多样性严重不足。而正是历史、文化、科学和情理因素交织在一起,使基因组学研究维持了这种“尴尬的偏向”。全基因组关联研究(GWAS)扫描成千上万人的基因组,通过对大规模的群体DNA(脱

基因组研究持续存在“欧洲偏向”

   科学家近日在《自然》杂志评论版块撰文表示,目前基因组学持续存在一种“欧洲偏向”,即大部分研究以欧洲群体为主,这导致其多样性严重不足。而正是历史、文化、科学和情理因素交织在一起,使基因组学研究维持了这种“尴尬的偏向”。   全基因组关联研究(GWAS)扫描成千上万人的基因组,通过对大规模的群体D