盘点最热门的基因组测序新成果
The scientist杂志盘点了近期各大杂志上最热门的基因组测序成果,让我们看看科学家们又从测序中获得了什么新知识吧。 种属:家猫(Felis catus) 基因组:3.1 billion bp 家猫会患上白血病也会受到免疫缺陷病毒的感染。为了更好的理解相关疾病,一个跨国科研团队测序了三只家猫的基因组并且进行了注释。这项研究为人们提供了一个新的猫科基因组浏览器——Genome Annotation Resource Fields(GARfield),其中包括血细胞的甲基化模式,以及两万一千多个基因组注释。相关论文发表在八月五日的GigaScience杂志上。 Nova Southeastern大学的Stephen O’Brien等人使用三种不同的方法对三只家猫进行测序和分析。虽然此前人们发布过家猫的基因组,不过之前的鸟枪测序法覆盖度太低,这项研究有助于填补之前留下的缺口。此外,这项研究也有一些新发现,比如发现了新......阅读全文
茄子基因组研究迈入高清时代
10月31日,由广西农业科学院蔬菜研究所研究员王益奎领衔的研究团队,于生物学论文预印本服务器BioRxiv在线发布了染色体级别的高质量茄子基因组序列。该团队采用PacBio测序技术,结合Dovetail Hi-C建库技术与HiRise组装算法,获得了目前连续性最好的茄科作物基因组,标志着茄子基
基因组研究持续存在“欧洲偏向”
科学家近日在《自然》杂志评论版块撰文表示,目前基因组学持续存在一种“欧洲偏向”,即大部分研究以欧洲群体为主,这导致其多样性严重不足。而正是历史、文化、科学和情理因素交织在一起,使基因组学研究维持了这种“尴尬的偏向”。 全基因组关联研究(GWAS)扫描成千上万人的基因组,通过对大规模的群体D
表观基因组学研究指南(三)
今年九月,对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份,因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在 Nature,Genome Biology,Genome Research等杂志上公布了三十多份论文,还有在Science,Cell,以及the Journal
近期最受关注的基因组测序研究
想象一下有人递给你一杯奶昔,要你鉴别出里面所有的东西。或许你能够辨别出有一点点的草莓或是酸奶的味道。但总体上它的味道就像是无法分辨的成分构成的混成品。 现在再想象一下,这杯奶昔是由来自大脑的2万个碾碎了的细胞所组成。你可以通过测试来确定样本中有什么分子,这就是科学家们现在所做的事情。这当然会提
《Nature-Genetics》:癌症的基因组结构研究
癌症的基因组结构研究发表《Nature Genetics》 B细胞通过一系列精心控制的染色体重排和“良好”突变产生抗体,这些突变使细胞能够产生大量不同的抗体。“尽管变化对产生大量多样的抗体至关重要,但仍有可能发生‘坏’突变并导致B细胞源性癌症,”研究负责人、哥伦比亚大学内科医师和外科医生学院微
研究发现全新全基因组组装方法
十年前,Illumina基因组测序技术进入市场时,前所未有的庞大数据量淘汰了较早开发的测序分析工具。 历史总是重演。如今,第三代测序技术已经达到低成本群体测序规模的临界点。 英国时间12月9日,《自然—方法学》在线发表了第一个能够跟上基因组测序产生速度的组装算法。 这篇论文只有两位作者,
基因组研究显示:猪与人“如此相似”
通过迄今为止规模最大的猪基因组研究,科学家发现猪拥有很强的适应能力,容易被食物诱惑和驯化,这些特征都与人类非常相似。而且,猪具有与人类相同的与很多人类疾病有关的基因和蛋白质变异。这一成果近日刊登在了《自然》杂志上。 在奥威尔的经典小说《动物庄园》中,猪和人类几乎一模一样。根据上述研究,《动
“863”肿瘤全基因组研究获进展
7月14日,“十一五”国家“863”重大专项“食管癌全基因组关联分析和药物基因组学研究”和“肺癌全基因组关联分析和药物基因组学研究”成果汇报会在京召开。 日前,遗传学权威期刊《自然—遗传学》刊登了我国科学家食道癌和肺癌研究的重要进展。由中国医学科学院肿瘤研究所分子肿瘤学国家重点实验室教授林东昕
蓝藻和叶绿体基因组的比较研究
原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。蓝藻基因组的作图和测
蓝藻和叶绿体基因组的比较研究
蓝藻和叶绿体基因组的比较研究原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模
-Nature:基因组研究探秘膀胱癌
日前,来自癌症基因组图谱研究网络(The Cancer Genome Atlas Research Network, TCGA)的研究人员在《自然》杂志上报告称,他们确定了一种主要的膀胱癌形式的新潜在治疗靶点,其中包括疾病中遭到破坏的一些重要基因和信号通路。 此外,他们还发现,在分子水
作物基因组学研究进展
摘要:农作物基因组学研究的发展,对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展,已经实现对重要农作物,如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序,在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了2017年度主要农作物基因组
Nature发布轮虫基因组研究新成果
有一群动物放弃了性,但却在进化过程中生成了460多种物种。本周的《自然》(Nature)杂志上发表了一篇关于蛭形轮虫(bdelloid rotifer)全基因组的研究论文,为揭示这一进化机制减少了些许神秘。 Woods Hole海洋生物学实验室(MBL)David Mark Wel
基因组学:-跨越癌症研究国界
1982年11月,在尼日利亚海军医院外足球场上踢球的一名军官,突然摔倒死亡。这名男子被带到急诊室时,当时还是一个新人的 Olufunmilayo Funmi Olopade医生正在值班。“我们搞不明白为什么他死亡,这让我感到震惊,从那时开始我意识到,我需要做更多的工作来理解和帮助人们。”Ol
最大规模肾癌基因组研究
肾癌起源于肾小管上皮细胞,是泌尿系统常见恶性肿瘤之一,发病率占全身恶性肿瘤的3%。肾癌的化疗效果并不理想,肾切除手术被认为是最有效果的治疗途径。近50年来肾癌的发病率和死亡率在持续上升,但人们还不太清楚肾癌的发病原因。 贝勒医学院的副教授Dr. Chad Creighton领导研究团队深入分析
茄子基因组研究迈入高清时代
10月31日,由广西农业科学院蔬菜研究所研究员王益奎领衔的研究团队,于生物学论文预印本服务器BioRxiv在线发布了染色体级别的高质量茄子基因组序列。该团队采用PacBio测序技术,结合Dovetail Hi-C建库技术与HiRise组装算法,获得了目前连续性最好的茄科作物基因组,标志着茄子基因
表观基因组学研究指南(一)
今年九月,对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份,因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在Nature,Genome Biology,Genome Research等杂志上公布了三十多份论文,还有在Science,Cell,以及the Journal of Bi
蓝藻和叶绿体基因组的比较研究
原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。 蓝藻基因组的
蓝藻和叶绿体基因组的比较研究
原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。 蓝藻基因组的
蓝藻和叶绿体基因组的比较研究
原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。蓝藻基因组的作图和测
国家基因库研发线粒体基因组重要新应用
继启动万种动物线粒体基因组计划(MT10K, https://www.mt10k.org)之后,深圳国家基因库成功研发出一套应用线粒体基因组监测生物多样性的宏线粒体基因组重测序方法(mitochondrial metagenomics,以下简称“全线粒体混合多样性分析法”)。此方法高效、准确且可
别再强迫蜜蜂集群!集群不为保温,只会散热
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/515152.shtm
新烟碱类杀虫剂会“误伤”蜜蜂
人工合成的烟碱(尼古丁)衍生物对害虫具有较强的杀灭作用,被称为新烟碱类杀虫剂,目前已广泛应用于农业。但近年来不断有研究发现,新烟碱类杀虫剂可能“误伤”蜜蜂等授粉类昆虫。德国一项新研究又为此增加了新证据:这类杀虫剂会减少蜂王浆中的乙酰胆碱,从而妨碍幼蜂生长发育。 德国美因茨大学和法兰克福大学的研
恐惧和食物质量影响蜜蜂采食行为
近日,中科院西双版纳热带植物园谭垦博士领导的研究团队发现,蜜蜂群体和个体依据捕食风险(恐惧)和食物质量,表现出不同的采食行为。相关研究成果发表在《公共科学图书馆·综合》上。 对传粉昆虫而言,恐惧能使传粉者避开危险的采食环境,从而干扰植物传粉,影响植物的适合度。然而在有多种捕食者存在和不同食
蜜蜂竟能侦测天敌黑尾胡蜂报警信号?
在自然界中,捕食者与猎物之间的追逐与躲避,不仅是一场生死的较量,更是自然选择压力下的生存智慧。在这场无休止的“战争”中,隐藏着一种特殊的“语言”——化学报警信号。 黑尾胡蜂是一种主要分布于亚洲东南部的昆虫,也是世界上体型最大的胡蜂之一。雌蜂的毒针长达8毫米,与毒针相连的毒腺中储藏了大量毒素。这些毒
“快乐因子”减少,蜜蜂也会“失魂落魄”
昆虫与脊椎动物的大脑存在巨大的解剖学差距,它们也能拥有喜怒哀乐的情绪吗? 最近,中国科学院西双版纳热带植物园谭垦研究员团队与美国加州大学圣迭戈分校教授James Nieh在《当代生物学》发表的一项研究成果显示,在面对巨大的捕食危险时,蜜蜂会警惕、恐惧、厌恶,因为大脑中的“快乐因子”多巴胺急速下
俄杜马下令彻查蜜蜂大规模死亡原因
据俄联邦自然资源、财产和土地关系委员会新闻中心16日消息:近日,该部门就当前蜜蜂大规模死亡问题举行了专家会议,来自国内不同地区的养蜂者及农民代表出席了此次活动。 该部门负责人指出:今年入夏起来,俄罗斯境内许多地区出现了蜜蜂大规模死亡的案例: 分析认为:造成该悲剧的原因是农业生产者严重违反农药
《蜂箱》国标启动:小蜜蜂将有“标配公寓”
蜂箱是蜜蜂养殖的基础工具。我国蜂箱生产量年均300多万套,需求量巨大,然而目前我国蜂机具生产存在标准不规范、不健全、不统一的现实问题。时至今日,我国尚没有《蜂箱》国家标准。7月5日,中国农业科学院蜜蜂研究所在江西上饶组织召开《蜂箱》国家标准制定行业意见征集暨启动会。来自蜜蜂所、浙江大学、中国热带农业
微流控电阻抗技术检测蜜蜂孢子
倘若地球上的蜜蜂消失了,人类或要消失?这句话不是小编说的,是下图这个老头儿说的。小编也绝没有要危言耸听的意思。这个老头儿在他的绝密手记上是这么说的:人类有可能在2060年灭绝;倘若地球上的蜜蜂全部消失了,人类或许也要消失了,甚至有可能只剩下不到4年的时间。好吧,说什么我都不相信他说的2060年人类就
揭秘蜜蜂蜇刺如何结团抵御胡蜂
胡蜂是蜜蜂的捕食者,作为长期协同进化的结果,东方蜜蜂会利用结团产热(heat-balling)的方式抵御并杀死胡蜂。结团是一种巧妙的防御策略,东方蜜蜂比胡蜂具有更高的致死温度,在结团过程中,几十甚至上百只蜜蜂把胡蜂围在中间,利用球心高温使其死亡。目前,研究已知蜜蜂在结团时通过产热、增加二氧化碳浓