基因组研究持续存在“欧洲偏向”
科学家近日在《自然》杂志评论版块撰文表示,目前基因组学持续存在一种“欧洲偏向”,即大部分研究以欧洲群体为主,这导致其多样性严重不足。而正是历史、文化、科学和情理因素交织在一起,使基因组学研究维持了这种“尴尬的偏向”。全基因组关联研究(GWAS)扫描成千上万人的基因组,通过对大规模的群体DNA(脱氧核糖核酸)样本进行全基因组高密度遗传标记分型,以寻找与疾病性状相关的遗传变异。这一研究被认为具有多中心、大样本、反复验证的特点,其使对遗传病的发病预测不再停留在传统因素分析的层面上。 但在2009年,一项调查显示,96%的全基因组关联研究参与者为欧洲血统。美国华盛顿大学研究人员艾利斯·波普乔伊和斯蒂芬尼·富勒通评论称,自那之后,全基因组关联研究中非欧洲血统的样本比例上升至将近20%,主要因为在亚洲开展的关于当地血统群体的研究有所增加。然而,非洲血统、拉美血统、拉美西班牙裔和原住民,在全基因组关联研究中所占的比例几乎没有任何变化。 ......阅读全文
北京基因组研究所Plant-cell基因组研究新成果
来自中科院北京基因组研究所、荷兰瓦赫宁根大学和中科院/马普学会等10多家机构的研究人员组成的一个研究小组,通过测序及分析醉蝶花(Tarenaya hassleriana)的基因组提供了关于十字花科植物繁殖性状和基因组进化的新认识。相关研究发表在植物学权威期刊The Plant Cell杂志上
GenomeResearch发表基因组研究新发现基因组
多伦多大学的科学家们发现,作为基因组看门人的C2H2-锌指蛋白(C2H2-ZF)实际上肩负着更加多样化的职责。这项发表在Genome Research杂志上的研究,有助于我们更准确地解读个人基因组。C2H2-ZF有大约七百个成员,是规模最大的一种人类蛋白。然而,人们对这些蛋白一直知之甚少。C2H2-
CRISPR大规模基因组研究
来自杜克大学的研究人员设计出了一种能快速,方便有效靶向人类基因组任何基因的新方法,这种新工具建立在一种来自细菌的RNA引导酶的基础上,即CRISPR-Cas RNA引导性核酸酶(RNA-guided nucleases,RGNs)。 这一研究成果公布在7月25日Nature Met
Nature发布基因组研究指南
测序人类全基因组比以往任何时候变得更快速、更便宜,使得比较患者与无特定疾病人群基因组一类的研究激增。临床医生和从事某种疾病遗传贡献研究的研究人员往往会遇到一些似乎与疾病相关的变异,但却发现另外一些携带相同突变的人群并不罹患这种疾病或影响程度较轻。 医生要怎样找到真正引起疾病的遗传变化?发表
The-Scientist:最热门基因组研究
The Scientist杂志是由科学信息研究所(ISI,现为汤姆森路透科技集团)的创始人Eugene Garfield于1986年创办的一份双周刊报纸,后又转变为一本每月出版的杂志,同时伴有每日更新的在线新闻。主要刊登生命科学相关信息,并帮助科学家分析研究的,以协助决策影响他们的
The-Scientist:最热门基因组研究
The Scientist杂志是由科学信息研究所(ISI,现为汤姆森路透科技集团)的创始人Eugene Garfield于1986年创办的一份双周刊报纸,后又转变为一本每月出版的杂志,同时伴有每日更新的在线新闻。主要刊登生命科学相关信息,并帮助科学家分析研究的,以协助决策影响他们的工作生活。
The-Scientist:最热门基因组研究
The Scientist杂志是由科学信息研究所(ISI,现为汤姆森路透科技集团)的创始人Eugene Garfield于1986年创办的一份双周刊报纸,后又转变为一本每月出版的杂志,同时伴有每日更新的在线新闻。主要刊登生命科学相关信息,并帮助科学家分析研究的,以协助决策影响他们的工作生活。
进击的古基因组研究
今年5月,《科学》在线发表了一项中国科学院古脊椎动物与古人类研究所(以下简称古脊椎所)领衔的关于华夏族群探源的突破性研究成果,它揭开了有关中国南北方史前人群格局及迁移与混合这一重大学术问题上的若干谜团;两个月后,该团队又发布最新发现:通过古基因组研究最新发现距今约1.1万年的中国南方未知现代人群
《基因组研究》:首张猫基因组草图绘就
猫是研究人类失明和艾滋病模型之一,因此测序结果大有用处 一只名为“肉桂”(Cinnamon)的4岁雌性阿比西尼亚猫有幸成为第一只完成基因组测序草图的猫。它也因此加入了包括狗、小鼠、大鼠以及黑猩猩等在内的基因组“俱乐部”。相关论文11月1日在线发表于《基因组研究》(Genome Research)杂
基因组所人类基因组突变研究获进展
序列变异的周期性和与TCR相关联的突变 基因突变会导致人类疾病的产生,因此研究遗传变异的产生过程和那些能够引起疾病的突变对生命科学基础研究以及人类健康是十分关键和重要的。 近日,中国科学院北京基因组研究所于军研究员带领其研究团队,在有关人类基因组中以转录为中心的突变研究方面取得新进展
大型基因组研究揭示失眠机理
日前,对人类基因组进行的两项深入研究揭示,经常被归咎于压力或不良睡眠习惯的失眠症,可能与抑郁症、心脏病以及其他生理疾病的关系更加密切。 “这两项研究都做得非常出色。”美国宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院研究睡眠行为的心理学家Philip Gehrman表示。但是他强调,在将与失眠有关的基因联系转化
Nature最新基因组研究成果
无论是接收礼物的圣诞袜,还是橱窗里的漂亮衣服,棉花的作用渗透在即将到来的这个节日的方方面面中,然而对于生物能源研究人员来说,棉花纤维成分比其颜色和质地更为重要。 由来自31个研究机构组成的一个国际研究小组近期完成了基因组最简单的棉花品种:Gossypium raimondii的详细图谱
中药基因组工程研究项目启动
7月上旬,中药基因组工程科技大厦选址于长沙岳麓山大学城湘江风光带北端,与此配套的中药材基因库已在岳麓区观砂岭茶子山村动工建设,规划占地200亩,拟建成一个符合国际标准的中药材种植试验基地和湖南省珍稀植物药种资源保护与繁殖基地。这标志着中药基因组工程研究项目正式启动。 我省中医药
Nature发布基因组研究重要成果
如果歌手Paul Simon给Richard Lenski长期进化实验(LTEE)中的细菌写首歌,那歌名可以是“这么多年以后仍然在改变。” 发表在8月1日《自然》(Nature)杂志上的研究论文中,这位密歇根州立大学的著名微生物学和分子遗传学教授与一个国际研究小组,利用先进的技术研究了数万代的
Science发表基因组研究重要成果
科学家们日前发现,人类基因组的遗传学差异主要来自于拷贝数变异(CNV)。在此之前人们对CNV的了解并不多,因为CNV一直是基因组测序的一大挑战。 华盛顿大学的遗传学家Evan Eichler领导研究团队克服了这一困难。他们对来自全球125个族群的人进行了深度基因组测序,全面分析了基因组中的SN
研究解析野古草基因组
近日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心完成了禾本科C4植物野古草的全基因组测序、组装与注释,并结合单细胞角度揭示了其类花环状排列的特化C4细胞(DC细胞)的功能特性和分子特征,剖析了其独立发育和可塑性排布的机制。C4植物通过特化的叶片结构与CO2浓缩机制实现高效光合作用。在玉米的“花环状叶片结构”
Science发表基因组研究重要成果
科学家们日前发现,人类基因组的遗传学差异主要来自于拷贝数变异(CNV)。在此之前人们对CNV的了解并不多,因为CNV一直是基因组测序的一大挑战。 华盛顿大学的遗传学家Evan Eichler领导研究团队克服了这一困难。他们对来自全球125个族群的人进行了深度基因组测序,全面分析了基因组中的SN
大型基因组研究揭示失眠机理
图片来源:DIMABERLIN 本报讯 日前,对人类基因组进行的两项深入研究揭示,经常被归咎于压力或不良睡眠习惯的失眠症,可能与抑郁症、心脏病以及其他生理疾病的关系更加密切。 “这两项研究都做得非常出色。”美国宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院研究睡眠行为的心理学家Philip Gehrman表示。但
全基因组研究解码口吃根源
口吃跨越不同语言和血统,影响着全球约7000万人。过去,许多人认为口吃能够通过自主控制来改善。但数十年来的研究表明,口吃实际上是一种高度遗传的不可控疾病,其原因复杂且模糊。而一项7月28日发表于《自然-遗传学》上的研究让口吃的部分原因变得清晰。 研究人员利用基因检测服务公司23andMe的庞大
利用CRISPR研究基因组“暗物质”
超过98%的人类基因组由非编码基因组成。这些非编码基因被称为基因组的“暗物质”,它们能调控编码基因的表达,从而影响人类健康和疾病进程。自从人类基因组序列被公开发表以来,科学家们努力解析基因中的功能元件,包括非编码调节区——参与转录调节的顺式调节区和非编码RNA(ncRNA)。转录因子在整个基因组
TheScientist:值得关注的基因组研究
美国的《The Scientist》杂志是一本面向生命科学的学生、研究人员的杂志,与学术期刊不同的是,该杂志除了报道研究领域内的热点话题外,还深入研究人员所关心的其他话题,如怎样进行职业规划、怎样用高科技创业等。其背后有全世界最优秀的专家团队――F1000(Faculty1000)的支持。近
基因组所肝癌全基因组合作研究取得新进展
近日,由中国科学院北京基因组研究所所长吴仲义及其科学团队与国立台湾大学医学院陈定信院士、陈培哲院士共同合作开展的“肝癌癌症基因组合作研究”计划获最新进展,相关学术论文在在最新出版的PNAS杂志上发表。 “肝癌癌症基因组合作研究”计划于2009启动,作为基因组所一项长期的癌症基因
宏基因组研究新突破,复旦最新研究发Nature
近年来伪狂犬、猴痘等病毒从动物向人类外溢引发新发传染病甚至全球大流行的频率正在显著增加如何精准预测和预报动物源新发传染病是关系绿色健康养殖与公共卫生防控的重要科学问题复旦大学公共卫生学院粟硕教授团队与合作者运用前沿交叉研究方法揭示多种哺乳动物宏基因组数据中的病毒基因组组成、生态学特征与跨物种传播规律
研究发现人类合子基因组激活起始于父源基因组
表观遗传修饰包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质可及性和染色质高级结构等,在基因的表达调控中发挥重要作用。人类精子和卵细胞的染色质表观修饰状态存在较大差异。在受精后的早期胚胎里,来自精子的父源染色质和来自卵细胞的母源染色质会经历剧烈的表观遗传修饰重编程,最终达到两者类似的模式。人类胚胎的合子基因
基因组所发布表观基因组关联研究开放平台EWAS-Open-Platform
近日,由中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心(NGDC)开发的表观基因组关联研究资源开放平台EWAS Open Platform上线。相关研究成果以EWAS Open Platform: integrated data, knowledge and toolkit
基因组研究持续存在“欧洲偏向”
科学家近日在《自然》杂志评论版块撰文表示,目前基因组学持续存在一种“欧洲偏向”,即大部分研究以欧洲群体为主,这导致其多样性严重不足。而正是历史、文化、科学和情理因素交织在一起,使基因组学研究维持了这种“尴尬的偏向”。全基因组关联研究(GWAS)扫描成千上万人的基因组,通过对大规模的群体DNA(脱
基因组研究持续存在“欧洲偏向”
科学家近日在《自然》杂志评论版块撰文表示,目前基因组学持续存在一种“欧洲偏向”,即大部分研究以欧洲群体为主,这导致其多样性严重不足。而正是历史、文化、科学和情理因素交织在一起,使基因组学研究维持了这种“尴尬的偏向”。 全基因组关联研究(GWAS)扫描成千上万人的基因组,通过对大规模的群体D
研究人员绘出苹果基因组草图
一个国际科研小组8月29日在英国《自然—遗传学》(Nature Genetics)杂志上报告说,他们绘出了苹果的基因组草图,这将有助于从基因水平上分析苹果性状,培育更多苹果新品种。 意大利、美国、新西兰等国研究人员报告说,他们绘出的是广受人们喜爱的“金冠苹果”的基因组草图。结果
茄子基因组研究迈入高清时代
10月31日,由广西农业科学院蔬菜研究所研究员王益奎领衔的研究团队,于生物学论文预印本服务器BioRxiv在线发布了染色体级别的高质量茄子基因组序列。该团队采用PacBio测序技术,结合Dovetail Hi-C建库技术与HiRise组装算法,获得了目前连续性最好的茄科作物基因组,标志着茄子基
基因组研究持续存在“欧洲偏向”
科学家近日在《自然》杂志评论版块撰文表示,目前基因组学持续存在一种“欧洲偏向”,即大部分研究以欧洲群体为主,这导致其多样性严重不足。而正是历史、文化、科学和情理因素交织在一起,使基因组学研究维持了这种“尴尬的偏向”。 全基因组关联研究(GWAS)扫描成千上万人的基因组,通过对大规模的群体D