美国立卫生研究院投巨资奖励大数据挖掘
ENIGMA项目将收集数千张大脑图像。 为了驯服生物实验室辛苦得出的数据洪流，美国国立卫生研究院（NIH）近日宣布，今年投资3200万美元设立一个奖项，以推动研究人员开发分析和使用生物学大数据库的方法。 该奖项出自NIH去年启动的大数据知识（BD2K）创新计划。NIH认为应当投入更多资源帮助使用不断增长的数据集——生物医学研究者积累的基因、蛋白质和患者档案等数据。例如，在一个“干生物学”项目中，研究人员将细胞基因表达的公共数据和患者档案混合在一起，预测现存药物的新用途。 BD2K奖项“将帮助我们克服最大化利用数据洪流面临的障碍，而且目前数据积累速度正在加速。”NIH院长Francis Collins在新闻发布会上说。他表示，这些奖金将资助开发计算工具、软件、标准和方法，用于分享和使用大数据集。 在未来4年里，11个卓越创新中心每年将收到200万~300万美元，开发从建模癌症细胞信号到整合移动传感器数据等各个方面所需......阅读全文
生物信息分析数据挖掘
DNA芯片技术能够在基因组水平分析基因表达，检测许多基因的转录水平及在不同条件下的基因转录变化，显示反映特征组织类型、发育阶段、环境条件应答、遗传改变的基因谱。基因芯片产生了海量的数据，仅仅进行差异表达分析还远远不够，如何管理分析这些数据、从中挖掘信息已经成为利用这一技术的新的难点。芯片数据大量出现
生物数据唤醒日常家居
谈到智能物体，多数的家居用品都相当地不够智能。它们蹲在固定位置，了无生气，跟主人毫无交流。但据亚力克斯·罗瑟拉和詹姆斯·克拉厄所言，即使是最不声不响的物体也能拥有神奇的互动性，而这只是个时间问题。这些设计师称，通过身体传达出的数据，家居用品将可以与我们进行互动。 在都柏林科学画廊生命记录展的
生物医疗大数据如何应用？
随着生物科技和医疗技术的迅猛发展、高通量手段的成熟，生物医疗行业的大数据急剧膨胀。然而，与其它行业的数据不同，生物医疗行业的数据呈现分散、破碎、低透明度、以及意义尚等解析等特征。不象其它行业，数据具有时效性以及数据很轻、易于解析；生物医疗行业的数据普遍很“重”、信息量超大、不同的解析策略可能得出
生物医学大数据亟待深挖利用
图片来源于网络 “我国是人类遗传资源大国，但不是强国，随着健康中国、大数据等国家重大战略的实施，迫切需要加强对人类遗传资源的深入研究和信息挖掘。” 10月10日，人类遗传资源开发创新研究高层论坛在京召开。中国生物技术发展中心主任张新民坦承，国家人类遗传资源管理和保护涉及生命伦理和国家安全，在资
大数据：生物医学变革新契机
“我国目前每年医疗费用总额超过2.4万亿元，如果按照麦肯锡报告的预测，我国医疗领域利用大数据每年将节省医疗费用近2000亿元。”军事医学科学院研究员朱云平在11月29日召开的“第五届重大疾病防治科技创新高峰论坛”上如是说。 大数据影响的深度和广度仍在不断扩张。对于生物医学来说，其发展过程中积淀
英国生物库数据开始对外开放
英国生物库数据于3月30日正式面向研究人员开放。通过这一数据库，全球的科学家都可以将近50万英国人的各种健康数据用于研究，这无疑对全球医学研究起到积极的推动作用。 英国生物库项目于2006年8月正式启动，旨在收集大量的生物样本和医学数据用于医学研究。数据收集目标为40岁到65岁的英国人，数
植物生物学研究数据库
实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant
世界微生物数据中心落户微生物所
在近日召开的第12届国际菌种保藏大会上，经过大会专家委员会评审并经世界菌种保藏联合会理事会审议通过，中国科学院微生物研究所在众多的竞争者中脱颖而出，成为世界微生物数据中心（World Data Center for Microorganisms, WDCM）新的主持单位。 W
微生物所发表中国微生物组数据平台
10月26日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心马俊才团队题为gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar
水德浮游生物大数据平台的使用与数据分析方法
水德浮游生物大数据平台 目前，绝大多数海洋和淡水生态领域的研究机构和业务监测单位，对浮游生物的研究手段还停留在人工镜检及手工测定的阶段，这样经常导致操作过程繁琐、工作量巨大、分析结果滞后，而且需要资深专业技术人员。此平台用于对浮游生物样品进行快速安全清洗、扫描成像、种类鉴定、数量统计、大小测量、生物
－生物医学基因大数据：现状与展望
生物医学大数据广泛涉及人类健康相关的各个领域：临床医疗、公共卫生、医药研发、医疗市场与费用、个体行为与情绪、人类遗传学与组学、社会人口学、环境、健康网络与媒体数据。 大数据(big data)是指由于容量太大和过于复杂，无法在一定时间内用常规软件对其内容进行抓取、管理、存储、检索、共享、传输和
JAMA：生物医学大数据缺失的环节
有人认为，大数据将有助于提高医疗保健行业的效率，促进在该行业推行问责制。然而到目前为止，其他行业在这方面要成功得多：通过对多种数据源进行大规模的整合和分析，获得了实用价值。那些成功行业弄明白了一个问题，那就是：当不同的数据集在具体某个人的层面上连接起来时，大数据就会产生变革性的价值。相比之下，生
生物大数据研讨会聚焦前沿问题
首届中国生物大数据统计方法研讨会近日在重庆举行。会议围绕大数据统计方法与传统统计方法的关系、生物大数据的特征与分类、生物医学大数据的功能与运用等前沿问题展开专题报告和自由研讨。 会议由中国卫生信息学会卫生统计理论与方法专业委员会主办，第三军医大学军事预防医学院承办，来自北京大学、重庆大学、中山
英国生物样本库发布大规模遗传数据
近日在线发表于《自然》的两篇论文集中介绍了英国生物样本库的遗传数据。两篇论文对整个数据集进行了详细描述，并对大脑遗传结构进行了深入研究。该数据集涵盖了约50万个个体的全基因组遗传数据、临床测量以及健康记录。 英国生物样本库包含50万年龄（招募时）在40~69岁之间英国人的遗传和临床数据，这些资
全球首个冰川微生物数据库
青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外，它是全球最大的冰川分布区，现有冰川2万条以上，面积超过2万平方公里，也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器，封存了不同历史时期的微生物。 现在，中国科学家构建的
中国生物技术发展中心调研生物大数据发展情况
为应对大数据时代带来的挑战，了解大数据技术发展态势以及对未来我国生物技术领域的科研能力、公共管理和产业竞争力方面的影响，探讨应对措施，生物中心肖诗鹰副主任于2014年5月6-7日带队到复旦大学、浙江大学进行了调研。 在复旦大学、浙江大学科研管理部门的支持配合下，召开了题为“大数据对我国生物
生物梅里埃收购Applied－Maths，增强生物数据处理能力
分析测试百科网讯 生物梅里埃于近日宣布收购Applied Maths，Applied Maths是一家专业为生物科技开发最先进的软件解决方案的公司，尤其擅长复杂数据的数据库存储、分析和解读。该公司成立于1992年，以其在信息学和生物学方面专业的综合知识而享誉全球。 随着新技
融智生物发布全球首个商用化生物组学微生物质谱数据库
近日，融智生物宣布建设完成基于全新生物组学理念的微生物质谱数据库。这是全球首次发布商品化生物组学微生物质谱数据库。 传统上，基于不同的细菌或真菌内蛋白组成分特别是核糖体蛋白有显著的差异，对核糖体蛋白组的质谱测试，可用于快速、高准确度鉴定微生物。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TO
简述邻氯苯甲酸的生物学数据
该物质对环境有危害，对水体和大气可造成污染，有机酸易在大气化学和大气物理变化中形成酸雨。因而当PH值降到 5以下时，会给动、植物造成严重危害，鱼的繁殖和发育会受到严重影响，流域土壤和水体底泥中的金属可被溶解进入水中毒害鱼类。水体酸化还会导致水生生物的组成结构发生变化，耐酸的藻类、真菌增多，而有根
科研数据难共享阻碍国内生物科技发展
上海生物信息技术研究中心主任李亦学的“科研数据共享之梦”已做了13年。但在近日举行的首届金桥产业技术创新会议上，当记者向他问及相关进展时，听到的却是一声叹息。 13年前，“大数据”尚未被任何字典收录，而今却被公认是全球生命科学研究的核心工具。李亦学告诉记者，科研数据难以共享已成为国内生命科
生物学家借助数据科学破解生命奥秘
自2000年人类基因组图谱绘制后，生物学研究迈入全新的“组学”时代，科学家们争先恐后地测序各种有机生物的基因组或蛋白质组。 现在，即使一些简单的实验都会产生大量数据，而从“背景噪音”中获得想要的结果则成为了一大挑战。美国趣味科学网站近日报道指出，计算机技术正帮助科学家们征服这些数据大山，甚至提
生物医药产业大数据应用概览
一、国家大数据战略 数据是国家基础性战略资源，是21世纪的“钻石矿”。党的十八届五中全会提出“实施国家大数据战略”，国务院印发《促进大数据发展行动纲要》、工信部印发《大数据产业发展规划（2016－2020年）》，全面推进大数据发展，加快建设数据强国。 2016年6月，国务院办公厅印发《国务院
各种模式生物必需基因在线数据库
Essential Genes are the genes that are indispensable to sustain cellular life. The functions encoded by essential genes are considered as a foundation
生物芯片实验信号检测及数据处理
芯片实验完成后，芯片就可以放人商品化的生物芯片扫描仪中进行扫描、识别、提取和分析(扫描仪的操作根据商家提供的具体操作执行)。扫描仪得到图像后，必须对数据进行提取，才能进行后续的数据分析。图像处理和数据分析是基因芯片研究的核心技术之一。对于SNP实验结果分析较简单，而对于基因表达谱研究、CGH分析及高
中国BIGD跻身国际生物组学数据库
测序技术的发展将生命科学领域带入组学时代，海量的数据产出成为常态。组学是将基因、蛋白及代谢物等生物分子以整体为单位进行系统性的研究，基因组学、蛋白质组学和代谢物组学等相应产生。相较于此前以个体为单位的研究，组学最主要的特征就是大数据。随着组学数据的产出，搭建组学数据库，实现海量信息的存储、整合及
美推出生物医学数据管理战略
组织良好、安全高效运营的数据资源对于现代科学研究至关重要。4日，美国国立卫生研究院（NIH）发布了其第一个数据科学管理战略——《NIH数据科学战略计划》，为推动生物医学数据科学管理现代化制定路线图。NIH希望通过最大程度地提高其所资助研究生成的医学数据的利用价值，更好地推动美国生物医学研究。
刘伟：生物多样性数据共享现状和建议
数据共享对于科学发展和大科学研究模式至关重要，也是各国政府部门科学决策的重要基础，备受关注。 在信息时代的背景下，生物多样性领域面临的一个重要挑战是如何有效地共享及整合生物多样性数据。 生物多样性数据共享的重要性至少体现在三个方面：一是拓展生物多样性相关领域研究的深度和广度需要数据共享；二是
我国微生物大数据平台建设获进展
近日，中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心团队题为World Data Centre for Microorganisms: an information infrastructure to explore and utilize preserved microbia
首个国际ISO微生物数据标准正式发布
微生物资源是国家的重要战略资源，微生物数据资源则是微生物资源共享和开发的关键环节，数据资源的丰富性、准确性和共享水平，决定着微生物学领域研究和应用的综合能力。 2020年11月9日，国际标准化组织生物技术委员会（ISO/TC 276）正式发布微生物资源中心数据管理和数据发布标准（ISO 217
刘伟：生物多样性数据共享现状和建议
数据共享对于科学发展和大科学研究模式至关重要，也是各国政府部门科学决策的重要基础，备受关注。 在信息时代的背景下，生物多样性领域面临的一个重要挑战是如何有效地共享及整合生物多样性数据。 生物多样性数据共享的重要性至少体现在三个方面：一是拓展生物多样性相关领域研究的深度和广度需要数据共享；二是