外显子测序发现新的渐冻人基因
最近,由美国马萨诸塞大学医学院(UMMS)John Landers博士带领的一个国际科学家小组,利用一种创新的外显子组测序策略发现,TUBA4A——编码Tubulin Alpha 4A蛋白质的基因,与家族性肌萎缩性侧索硬化症(ALS,一种致命的神经系统疾病,也被称为葛雷克氏症)有关。相关研究结果发表在2014年10月22日的国际权威学术期刊《神经元》(Neuron)。 外显子组测序与全基因组测序形成对照,只测定基因组中的蛋白质编码基因,可能是确定致病基因突变一种有效而经济合算的策略。然而,外显子组测序的应用可能是有限的,因为所有人都携带许多罕见遗传变异,这些遗传变异并不引起疾病,无非是正常的遗传背景噪声。分离致病遗传变异,需要来自受影响家庭中多个人的DNA才能够成功。对于迟发性疾病如ALS,在一个单独家庭中找到足够的患者进行测序,往往是不可能的。 为了克服这一限制,Landers和他的同事,在363名家族性ALS患者中,......阅读全文
晚期肿瘤患者可免费测序基因
对于肿瘤,除了传统诊疗方法外,未来还可对患者的基因进行测序,找出容易引发肿瘤的变异基因,再针对该基因选择对应的靶向药物。4月20日,“MATCH中国·测序中心”三方联合实验室在中山大学附属第一医院(以下简称“中山一院”)正式挂牌。该院将借助美国国家癌症研究所NCI-MATCH计划,开展大规模的高
晚期肿瘤患者可免费测序基因
对于肿瘤,除了传统诊疗方法外,未来还可对患者的基因进行测序,找出容易引发肿瘤的变异基因,再针对该基因选择对应的靶向药物。4月20日,“MATCH中国·测序中心”三方联合实验室在中山大学附属第一医院(以下简称“中山一院”)正式挂牌。该院将借助美国国家癌症研究所NCI-MATCH计划,开展大规模的高
基因测序揭示小麦驯化关键基因突变
野生小麦的麦粒成熟时,穗轴变脆,容易碎裂,有助于在风力作用下把麦粒散播出去、繁殖下一代。但这对人类采集麦粒非常不方便,带有使穗轴不变脆的“硬轴”基因突变的小麦受到青睐,并逐渐被人类驯化。现在经过驯化的小麦品种都有硬轴,穗轴在收割时仍保持完整。 以色列特拉维夫大学、澳大利亚悉尼大学等多家机构科研
基因测序揭示小麦驯化的关键基因突变
从野草到人类主粮之一,小麦在被驯化的过程中发生了巨大变化。一个国际科研小组对野生小麦进行基因测序,发现了控制穗轴易碎性的两组基因,它们在小麦驯化过程中起着关键作用。这一发现有助于培育更好的小麦品种。 位于今天中东地区被称作“新月沃地”的区域,是小麦的起源地。大约1万年前,这里的居民开始种植小麦
全基因组测序揭示肝癌相关基因突变
由亚洲癌症研究组织(ACRG)、深圳华大基因研究院等多家单位合作完成的与肝细胞癌相关的基因突变研究成果于2013年6月20日在《基因组研究》(Genome Research)杂志上发表。这是继2012年3月份在《自然-遗传学》上发表的乙肝病毒整合机制研究之后,该研究团队在肝癌研究中所取得的又
突变耳聋患者迎来基因治疗新时代
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511460.shtm10月27日,复旦大学附属眼耳鼻喉科医院(上海市五官科医院)耳鼻喉科研究院副院长、遗传性耳聋诊治中心主任舒易来受邀在第30届欧洲基因和细胞治疗学会(ESGCT)年会发言,向全球同道分
患者对临床基因测序有效性的评估
前言:基因测序的有效性是有目共睹的,尽管会影响诊断和治疗。从医学专家的角度来看,临床基因测序不仅可以得出关于基因的结果,还可以指导患者治疗。临床医生根据基因测序中发生的变化可得出患者的健康状态。而关于“它真正有效吗?”这一问题,意味着其能否正确指导治疗,或者提供正确的诊断信息?然而,比如健康经济专家
大豆突变体基因定位测序方法的改良
随着新一代测序技术的发展和全基因组测序(Whole Genome Sequencing, WGS)成本的不断下降,基于WGS的分离群体分组分析(Bulk Segregation Analysis,BSA)已经成为快速定位候选基因的常规工具,但已报道的方法依然有待完善。例如,依赖于自交系杂交的QT
证实基因组测序成功鉴定癌症相关突变
最近,UT西南医学中心的癌症研究人员表明,全基因组测序可以用来确定患者遗传性癌症的风险,这可能会促进癌症的预防、诊断和护理。 这项研究首次采用全基因组测序来评估258名癌症患者的基因组,以提高癌症诱发突变的诊断能力。相关研究结果发表在12月份的国际期刊《EBioMedicine》。 UT西南
泛生子为EGFR突变患者提供免费基因检测
随着医学的进步,肺癌的治疗从传统病理分型指导的放化疗模式,逐渐转变为分子分型指导的靶向治疗模式。为了贯彻落实“健康中国2030”计划精神,辅助临床医生对肺癌诊疗方案的制定,实现诊疗规范化,最新版《新型抗肿瘤药物临床应用指导原则(2020版)》提出,抗肿瘤药物的使用不仅要依据病理诊断的结果,更要遵
EBioMedicine:全基因组测序高效识别癌症相关基因突变
UT西南医学中心癌症研究人员已经证明,全基因组测序可用于识别癌症的遗传性风险,其可以潜在地改善癌症的预防,诊断和治疗。 这是首次研究使用了全基因组测序以评估一系列258癌症患者的基因组,诊断其癌症倾向性突变情况。这项研究发表在杂志EBioMedicine上。全基因组测序是新的基因工具,能够确定
Cancer:1527例患者“揭秘”基因测序如何帮助癌症治疗?
精准医学、基因测序,如今它们已经不是什么新鲜的词汇,但在各大学术会议与产业大会中,它们依旧是蔚然成风,受到科研以及企业家们的追捧。去年奥巴马提出了精准医学概念,现如今,关于精准医疗的期刊论文以及学术报告已有无数篇问世,而且这个势头仍在增长。今天,我们来讲述Cancer杂志上的一篇研究,他们揭示了
Nature-Gen:外显子测序发现肺癌新突变基因
最近,来自美国几所主要大学和俄罗斯ITMO大学的研究人员,在肺癌细胞中发现了一些新的驱动突变(driver mutations),可能用于基因靶向治疗和免疫治疗。相关研究结果发表在最新一期的《Nature Genetics》杂志。 在超过1000名肺癌或鳞状细胞癌患者中,研究者对他们的肿瘤外显
测序仪巨头推出AI算法,预测致病基因突变
ChatGPT等大模型点燃人工智能新一轮热潮之际,另一种累积数百万年的天书般“语言”也在试图用该技术获得最新解码。近日,全球基因测序仪龙头因美纳(Illumina)宣布推出全新的人工智能算法PrimateAI-3D,以求更准确地预测患者致病基因突变。据美国国家卫生研究院发布的数据,每年生成的基因组数
外显子测序发现早期胚胎致死基因突变
King Faisal Specialist医院和Fowzan Alkuraya研究中心的团队对辣子两个怀孕有苦难的家庭女性进行了同和性作图和外显子测序,这些女性即使进行体外受精,怀孕也十分困难。研究人员本周在《Genome Biology》上报道了他们的结果,他们发现,TLE6中的突变似乎在早
300多种肿瘤-晚期癌症患者测序突变数据库发表的启示
5月8日,Nature Medicine杂志发表一篇重量级文章,纪念斯隆-凯特琳癌症研究中心(MSKCC) 的科学家采用MSK-IMPACT方法,开展了一个大规模、前瞻性的临床测序研究。他们对上万名晚期癌症患者,接近300多种肿瘤进行了基因测序,同时收集了这些肿瘤病人的临床注释、病理等方面的信息
Nature最新成果:外显子测序找到罕见基因突变
来自Broad研究所、麻省总医院等知名生物医学研究机构的研究人员发现了一种称为APOA5的基因发生罕见突变,会增加个体早期心脏病发作的风险。这些突变能令APOA5 基因失去作用,同时增加血液中的甘油三酯含量。 这一新发现与近期其它遗传方面的成果,尤其是APOC3 保护性基因突变(降低甘油三酯水
Nature子刊:基因测序计划发现致命儿童脑瘤相关突变
目前,美国St. Jude儿童医院-华盛顿大学儿科癌症基因组计划已经确定了小儿脑瘤(称为高级别胶质瘤,HGGs)中的新基因突变,这种疾病最常发生在年幼患者身上。 这些结果来自于为确定引起这些致命肿瘤的遗传失误而进行的全方位研究。结果提供了迫切需要的药物开发线索,尤其是靶定潜在基因突变的
基因测序提示:狗的基因突变与人类神经管缺陷相关
来自加利福尼亚大学的研究者们首次在狗身上发现了与人类神经管缺陷相关的基因突变。 据《PLOS Genetics》报道:研究人员发现了与人类神经管缺陷相关的具有潜在风险的突变基因,神经管缺陷在全球每年影响300,000多个新生儿。神经管缺陷包括无脑和脊柱裂,都是由于脊柱和颅骨的不完全闭合
有望利用ABE治疗单基因突变肝病患者
可编程CRISPR-Cas核酸酶通过在目标位置使双链DNA断裂来实现基因组编辑,但在有丝分裂后的细胞中十分低效。而碱基编辑器是最近开发的基因组工程工具,能在转换率低的组织中进行精确有效的编辑。 对于碱基编辑的临床应用,其主要的局限性在于产生潜在的非靶突变。非靶突变可以是单导向RNA (sgRN
基因测序
基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理。基因测序技术能锁定个人病变基因,提前预防和治疗。基因测序相关产品和技术已由实验室研究演变到临床使用,可以说基因测序技术,是下一个改变世界的技术
基因测序
第1代测序技术——荧光标记的Sanger法 在第一台全自动测序仪出现之前,使用最为广泛的测序方法就是 Sanger 在 20 世纪 70 年代中期发明的末端终止法测序技术。 Sanger 也因此获得 1980年的诺贝尔化学奖。 他的发明第一次为科研人员开启了深入研究生命遗传密码的大门。G1.1
Nature:全基因组测序重新定义癌症之王基因组突变蓝图
近日,一项发表于国际著名杂志Nature上的研究论文中,来自英国和澳大利亚的研究人员对100位胰腺癌患者癌症组织的基因组进行了深入分析,结果发现了4种不同的亚型,这或许可以帮助后期开发治疗胰腺癌患者的新型疗法。文章中研究人员利用全基因组测序技术揭示了肿瘤基因组结构性改变的光谱模式,该技术可以帮助
香港基因组计划将启动,测序2万名患者
根据香港食物及卫生局近日提交的一份文件,香港计划对2万名患者(在某些情况下包括家属)的基因组进行测序和分析,作为香港基因组计划(Hong Kong Genome Project,简称HKGP)的一部分。 根据香港食物及卫生局近日提交的一份文件,香港计划对2万名患者(在某些情况下包括家属)的基因
乳腺癌的8年数据,基因测序受患者青睐
随着基因测序技术的发展,成本不断降低,活跃在市场上的乳腺癌基因测序产品也越来越多。然而,患者对乳腺癌BRCA测序持何态度?BRCA基因测序是否对患者的治疗决策有影响?2016年2月11日,《JAMA Oncology》杂志报道了年轻乳腺癌患者BRCA基因检测的调查报告,经调查发现,近年来乳腺癌年
测序技术发现先天性肾脏和尿道缺陷的突变基因
据《New England Journal of Medicine》报道:来自哥伦比亚大学医学中心的研究员和合作者们发现了导致先天性肾脏和尿道畸形的突变基因。先天性肾脏和尿道缺陷是常见的出生缺陷,也是引起儿童肾脏衰竭的最常见原因。这是第一次报道了一个特定的基因突变与尿道畸形相关。 由A
64%中国癌症患者有可用药的潜在临床基因突变
论文截图研究人员在分析数据(受访者供图)近日,《自然-通讯》刊发了一项由中山大学孙逸仙纪念医院王铭辉教授团队联合多家医院及至本医疗针对亚洲癌症人群基因组特征的研究成果。该成果从基因层面将中国人群与西方人群突变特征的异同进行了系统分析和全面对比,全面阐述了东西方癌症患者的不同临床基因组特征,是截止目前
Nature子刊:对年轻癌症患者进行全基因组测序势在必行
相关研究最近以“Clinical cancer genomic profiling by three-platform sequencing of whole genome, whole exome and transcriptome”为题发表在《Nature Communications》杂志
对环境致癌物进行全基因组测序-揭示突变特征
对人类肿瘤进行全基因组测序(whole-genome-sequencing, WGS)可显示出独特的突变模式,这些突变模式有助于揭示癌症的病因。 在一项新的研究中,来自英国剑桥大学、伦敦国王学院和韦尔科姆基金会桑格研究所的研究人员对324种暴露于79种已知或潜在的环境致癌物的人诱导性多能干细胞
最精准基因测序:原来健康人也普遍存在癌症相关突变
二代测序(NGS)技术在基因测序深度和测序精度方面突飞猛进,为精准医学的发展提供了重要的工具支持。2012年,美国华盛顿大学的研究人员开发了一种新型的基因测序技术,该技术被命名为[Duplex sequencing](暂译为双重测序)。顾名思义,双重测序就是对DNA的双链分别进行独立的标记和测序