NatureMethods：新方法测定基因组中的足印
科学家们发明一种新方法，可以在活体中测量蛋白质在整个线虫基因组中的占有量，新成果发表在日前在线出版的《自然·方法学》期刊上。新技术将提供基因被调控的新细节。 这种方法背后的思想很简单：捆绑着蛋白质的基因组DNA被脱氧核糖核酸屏蔽，脱氧核糖核酸是一种消化DNA的酶，产生出一个完整无缺的DNA片断。在所对应的捆绑区域，这个DNA片断就是蛋白质的足印。这个足印的序列提示出蛋白质的捆绑序列，因此常用于鉴别调控蛋白质。 应用脱氧核糖核酸酶Ⅰ大规模平行测序技术，John Stamatoyannopoulos和同事将这种方法放大，应用于基因组水平。他们系统化地绘制了线虫基因组中的所有足印，并用新的蛋白质模型对这些数据进行分析。结果，他们绘制出在整个线虫DNA中的所有调控蛋白质的复杂地图。 新技术可应用于所有基因组已被测出的有机体，也有助于科学家们深入了解基因组调控的详细方式。......阅读全文
Science:新方法在活细胞中改变基因组
来自MIT Broad研究所和Rockefeller大学的研究者发展了一种新的方法，能够在活细胞内精确地增减基因，从而操作基因组。研究人员称，这项技术可以提供一种简单易行，并且相对低价的方法来从事各项研究，包括设计能够产生生物能源的有机体，设计动物模型来研究人类疾病，发展新的治疗方法等。
英开发出简化的基因组测序新方法
据物理学家组织网12月12日(北京时间)报道，英国研究人员简化了基因组测序的标准流程，首次无需进行文库制备便完成了DNA(脱氧核糖核酸)单分子测序，而且新方法只要很少量的DNA就能获得序列数据，用量可低至不到1纳克(10亿分之一克)，仅为常规测序方法的500分之一到600分之一。 文库制备
定位全基因组范围DNA修复的新方法
北卡罗来纳大学的研究人员近日开发出一种全基因组范围的测序分析，可定位DNA切除修复。这种被称为切除修复测序（XR-seq）的方法发表在新一期的《Genes & Development》杂志上。 这项研究的通讯作者是北卡罗来纳大学医学院生物化学及生物物理系的Aziz Sancar以及芝加哥大学人
中国科学家找到离子液体结构测定新方法
日前，中科院上海应用物理研究所研究员徐洪杰、吴国忠联合小组合作，经过两年多在日本(KEK)、北京(BSRF)和合肥(NSRL)同步辐射光源的尝试，成功利用同步辐射的X射线精细结构分析(XAFS)方法对室温下离子液体的原子内部精细结构进行了测定。 研究组选择由ZnCl2(氯化锌)和氯化胆碱(
玉米容重器在新方法中测定结果差异
玉米的完整度、饱满度以及颗粒的均匀度等等都是其质量评价的重要指标和参考参数，而玉米容重器的测定值在一定程度上也能对以上的参数做出直观的反应，其实以上都是对玉米营养价值评价的重要反应。通常情况下对于相同品种的的玉米玉米容重器的测定值越大，相应地，玉米所含有的影响成分也越多。 过
Nature子刊：测定改性蛋白质的新方法
最近，瑞士的研究人员开发出一种新方法，来测量结构发生改变的蛋白质。这有望使研究人员开发出新的诊断工具，对神经退行性疾病进行早期识别和发现。相关研究结果发表在最近的《Nature Biotechnology》杂志。 细胞通过各种各样的方式调节蛋白质的功能，包括通过修改蛋白质的结构。蛋白质可在一瞬
基因测定方法同线法
同线法表2如果一个细胞得到或丢失一条染色体则将同时得到或失去这条染色体上的全部基因。如果其中某些基因是已知的，而另一连锁关系未知的基因恰恰和上述基因同时得到或失去，便可以判定后一基因和前一基因属于同一连锁群（表2)。这一原理曾广泛应用于人的基因定位。仙台病毒或聚乙二醇能促使人的体细胞和啮齿类动物的体
两种新方法能增强基因编辑精准度
美国科学家发现，较短的向导核糖核酸和Cas9核酸内切酶二聚体均能提高基因编辑技术精准度，可对基因组进行更加准确的编辑和修饰。相关结果近期发表于《人类基因疗法》杂志上。 多种细菌和古细菌中存在很多成簇的、规律间隔的短回文重复核糖核酸序列（CRISPR）和CRISPR相关基因（Cas genes
建立分析致死基因在不同组织中功能新方法
中科院生化与细胞研究所李劲松研究组和中科院神经科学研究所于翔研究组合作， 一步获得了Tet3基因敲除的健康嵌合小鼠，并对Tet3基因敲除后大脑皮层发育以及皮层和海马神经元的突触传递进行了探究。相关研究成果日前发表于《细胞研究》。 Tet3是DNA双加氧酶Tet蛋白家族的一个重要成员，参与DNA
基于深度学习的全基因组选择新方法诞生
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物》（Mole
点亮基因组——基于CRISPR/Cas9的新方法
自从2012年CRISPR/Cas9（通常被称为基因组编辑工具）问世以来，该系统在科学界一直受到关注，许多科学家发现了它的不同应用。来自Leibniz研究所植物遗传学和作物植物研究的科学家们最近发现了一种新型RNA引导核酸内切酶原位标记（RNA-guided endonuclease -in
PNAS、Nature共造基因测序新方法，不“放过”任何碱基
日前，来自哥伦比亚大学、哈弗大学及美国国家标准技术局的研究人员报道了使用蛋白纳米孔阵列实现了单碱基分辨率的实时单分子电子DNA测序，相关结果以《Real-Time Single Molecule Electronic DNA Sequencing by Synthesis Using Polym
Nature－Methods：De－Novo基因组序列组装的新方法
对于de novo人类基因组序列组装而言，短读长简直意味着不可能的任务。不过，加州大学旧金山分校、BioNano Genomics和10X Genomics的研究人员近日开发出一种新的组装方法，它将short-read测序与10X的linked-read测序相结合。这项成果于近日发表在《Natu
Nat－Genet：新方法揭示基因“增强子”的工作机理
来自日本理化研究所（RIKEN）综合医学科学中心和肿瘤分子研究所(IFOM)的研究人员与京都大学、卡罗林斯卡研究所和DNAFORM的合作者一起开发出了一种被称为NET-CAGE的新技术，揭示了基因组中被称为增强子的非编码基因的结构，增强子可以激活特定基因的功能。基因组的这些部分曾经被认为是不重要
Clinical－Genomics融资1500万助肿瘤基因检测新方法开发
精准医疗的兴起，让科学家们对基因诊断在肿瘤治疗中的应用又有了新的认识。如何能够通过基因诊断预测癌症风险以及个性化设计治疗方案已经成为肿瘤治疗领域的重点。因此，基因诊断已经成为生物医药产业中发展最为迅速的领域之一。最近，基因诊断公司Clinical Genomics就宣布融资1500万美元涉足液体
常兴研究组发现RNA剪接基因编辑的新方法
2018年10月5日，国际知名学术期刊《分子细胞》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院（营养与健康研究院）常兴研究组题为“Genetic modulation of RNA splicing with a CRISPR-guided cytidine deaminase”的最新研究成果。证明可
Nature－Methods－可在体内大规模研究基因互作新方法
肿瘤转移是一个复杂的过程，受到多基因的调控，也是实体瘤患者死亡的主要原因之一【1】。目前系统性理解影响肿瘤转移的基因间相互作用仍是一个挑战。相比于Cas9系统，CRISPR-Cas12a（Cpf1）不需要tracrRNA（trans-activating CRISPR RNA），可同时在多位点进
JRSI：科学家提出生育能力测定新方法
图片来源：medicalxpress.com 2016年10月17日 讯 /生物谷BIOON/ --数学中的集合行为为研究者们提供了一种新技术来帮助选出最好的精子用作人工授精过程中，在人工授精研究领域中，我们都知道最佳活性的精子样本就意味着精子的游动速度较强，当前精子活性的分级在1-5之间，但这是
Cancer－Dis：白血病治疗新方法让癌基因变“乏力”
2016年10月15日/生物谷BIOON/--一些基因的重新激活会导致造血干细胞发生异常自我更新从而发生白血病，这些与自我更新有关的基因发生异常激活可能由DNA包装过程中的一些结构性修饰引起。最近一项研究发现有两种染色质调节因子能够介导这些表观遗传修饰的变化，并且白血病细胞非常依赖这两种因子。
华南植物园发现植物原位转基因替换新方法
为了解决在培育复合性状转基因作物中分散的转基因位点增多给育种工作带来的困难，中国科学院华南植物园科研人员在2014年发现一种利用Bxb1和Cre重组酶进行转基因定点整合的方法。该方法可使新的性状基因插入到已有的转基因位点上，保证所有的转基因能“打包”式地传递给后代 (Hou et al., 20
新方法|用RNA寻找罕见遗传病基因触发器
大约有一半罕见遗传病患者的致病基因仍未找到。其中一个原因是由于人类基因信息量巨大。针对这一问题，信息学和医学领域科学家们联手寻找解决方案。由慕尼黑工业大学和Helmholtz 慕尼黑中心组成的研究小组已开发出一种能显著提高搜索成功率的新方法。不只着眼于DNA，新方法的寻找策略还包括RNA筛查。
超声基因治疗：治疗心脏病和癌症的新方法
近期，美国国家科学院院刊刊登文章指出，结合超声能量和超声微泡在细胞上打孔可能成为与心血管疾病和癌症作斗争的新工具。匹兹堡大学的研究人员称这种基因治疗方法为声孔效应疗法。小编对相关信息进行了整理编译。 简单的来，我们将超声触发细胞膜破裂的生物物理机制称为声孔效应。关于声控效应的研究主要与超声微泡
“唤醒”沉默的基因－新方法揭秘微生物“生命暗物质”
微生物具有合成多种天然产物的能力。但在微生物合成天然产物时，大量合成基因仍处于“沉默”状态。它们的产物被称为微生物“生命暗物质”。如何有效激活并挖掘这些“生命暗物质”？近日，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所（以下简称深圳先进院合成所）研究员罗小舟，与美国加州大学伯克利分校教授杰·基斯林及
基因组精确注释新方法：增强子鉴定新技术
近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所动物功能基因组学创新团队研发出增强子鉴定新技术。该技术与传统技术相比，平均分辨率提高了约10倍，为基因组的精确注释提供了新方法。相关研究成果发表在《核酸研究》（Nucleic Acids Research）上。 增强子是一种基因组非编码区的顺式调控元件，
完美基因编辑:－新方法可消除CRISPRCas的脱靶效应
前段时间，麻省理工的研究人员发现基因编辑工具CRISPR-Cas系统具有脱靶效应。近日，这个研究小组的负责人张峰教授表示，他们已经找到了影响CRISPR-Cas系统精确度的关键因素，这一发现将使该系统在人类细胞中的应用更安全。目前，这一研究发表在Nature Biotechnology上。
油菜甘蓝的基因编辑新方法打破对遗传转化的依赖
5月27日，中国农业科学院油料作物研究所油料作物逆境生物学和抗性改良团队，联合成都市农林科学院相关团队，建立了一种应用于油菜和甘蓝的新型基因编辑方法。该方法打破了油菜和甘蓝的基因编辑技术对遗传转化的依赖，直接通过授粉的方式对油菜和甘蓝的基因进行编辑，获得了不含转基因元件的突变材料，为高产、优质、
基因测定方法连锁群法
利用近着丝粒距离基因的定位法 如果某一染色体上有一个离着丝粒距离较近的已知基因，另外有一个基因同样离着丝粒很近，可是不知道它是否属于同一染色体。把这样两个突变型品系进行杂交，如果这两个基因属于同一染色体，它们之间的重组频率不应超过两者的着丝粒距离之和；如果它们不属于同一染色体，那么它们的重组频率应
基因测定的方法同线法
同线法如果一个细胞得到或丢失一条染色体则将同时得到或失去这条染色体上的全部基因。如果其中某些基因是已知的，而另一连锁关系未知的基因恰恰和上述基因同时得到或失去，便可以判定后一基因和前一基因属于同一连锁群（表2)。这一原理曾广泛应用于人的基因定位。仙台病毒或聚乙二醇能促使人的体细胞和啮齿类动物的体细胞
基因测定方法假连锁法
相互易位杂合体只有在减数分裂过程中通过交互离开所形成的平衡配子才能够存活，并使非同源染色体上的基因显示假连锁现象（见染色体畸变)。所以把带有属于已知染色体的标记基因的相互易位品系作为测交品系和一个突变型品系杂交，如果发现这一突变基因经常和标记基因的野生型等位基因相连锁，就可以判定突变基因一定在相互易
二硫代氨基甲酸酯农药测定有了新方法
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/511096.shtm