NatureMethods:新方法测定基因组中的足印

科学家们发明一种新方法,可以在活体中测量蛋白质在整个线虫基因组中的占有量,新成果发表在日前在线出版的《自然·方法学》期刊上。新技术将提供基因被调控的新细节。 这种方法背后的思想很简单:捆绑着蛋白质的基因组DNA被脱氧核糖核酸屏蔽,脱氧核糖核酸是一种消化DNA的酶,产生出一个完整无缺的DNA片断。在所对应的捆绑区域,这个DNA片断就是蛋白质的足印。这个足印的序列提示出蛋白质的捆绑序列,因此常用于鉴别调控蛋白质。 应用脱氧核糖核酸酶Ⅰ大规模平行测序技术,John Stamatoyannopoulos和同事将这种方法放大,应用于基因组水平。他们系统化地绘制了线虫基因组中的所有足印,并用新的蛋白质模型对这些数据进行分析。结果,他们绘制出在整个线虫DNA中的所有调控蛋白质的复杂地图。 新技术可应用于所有基因组已被测出的有机体,也有助于科学家们深入了解基因组调控的详细方式。......阅读全文

新方法可在大量细胞内自动测定基因表达

  《自然—方法学》报道了一种可在数千个人体细胞中自动测量基因表达的方法。该方法使单分子荧光原位杂交技术(smFISH)成倍放大,并能确定细胞内RNA转录发生的位置,为了解RNA转录的生物功能提供了重要线索    通过将目标与荧光探针相结合,smFISH可用于检测细胞内的特定RNA序列,但要将每个R

Nature-Methods:新方法测定基因组中的足印

  科学家们发明一种新方法,可以在活体中测量蛋白质在整个线虫基因组中的占有量,新成果发表在日前在线出版的《自然·方法学》期刊上。新技术将提供基因被调控的新细节。   这种方法背后的思想很简单:捆绑着蛋白质的基因组DNA被脱氧核糖核酸屏蔽,脱氧核糖核酸是一种消化DNA的酶,产生出一个完整无缺的DNA

新方法让“沉默”基因“说话”

基因的调控和表达对人类健康至关重要。越来越多证据表明,lncRNAs基因不仅参与脑发育、神经元分化等,而且与神经系统损伤后的修复过程有关。深入研究lncRNAs,对治疗神经系统疾病具有重要意义。 研究人员通常使用活细胞内编码基因的标记技术,将荧光蛋白精确插入蛋白编码框研究基因的功能,但该方法往往

体内系统转基因新方法

中文摘要:      蛋白质分子间相互作用与识别是21世纪生命科学研究的前沿和热点. 分子对接方法是研究这一课题有效的计算机模拟手段. 通常,蛋白质-蛋白质分子对接包括四个阶段:搜索受体与配体分子间的结合模式,过滤对接结构以排除不合理的结合模式,优化结构,用精细的打分函数评价、排序对接模式并挑选近天

大麦蛋白含量测定新方法

 麦芽大麦的蛋白质含量很重要,因为它影响到麦芽酿造、酿造和终产品。凯氏定氮法是一种基于传统湿化学的大麦蛋白质测定方法。经典凯氏定氮法的替代方法是杜马斯燃烧技术,创新的干化学,易于使用和高度准确。这两种技术都被批准用于测定大麦中的氮和蛋白质含量。      这两种技术都保证了优良的重复性,低RSD值就

新方法使“基因剪刀”更易使用

  一个国际科研团队设计出一种运用“基因剪刀”的新方法,可快捷高效地对大肠杆菌等常用科研生物进行基因编辑,降低基因研究的技术门槛。   近来兴起的“基因剪刀”技术能让研究人员像在电脑上编辑文档一样,精确查找某个基因在基因组中的位置,进行删除或修改。目前主流的“基因剪刀”是CRISPR技术,相

新方法使“基因剪刀”更易使用

  一个国际科研团队设计出一种运用“基因剪刀”的新方法,可快捷高效地对大肠杆菌等常用科研生物进行基因编辑,降低基因研究的技术门槛。   近来兴起的“基因剪刀”技术能让研究人员像在电脑上编辑文档一样,精确查找某个基因在基因组中的位置,进行删除或修改。目前主流的“基因剪刀”是CRISPR技术,相

新方法使“基因剪刀”更易使用

  一个国际科研团队设计出一种运用“基因剪刀”的新方法,可快捷高效地对大肠杆菌等常用科研生物进行基因编辑,降低基因研究的技术门槛。   近来兴起的“基因剪刀”技术能让研究人员像在电脑上编辑文档一样,精确查找某个基因在基因组中的位置,进行删除或修改。目前主流的“基因剪刀”是CRISPR技术,相

新方法使“基因剪刀”更易使用

  一个国际科研团队设计出一种运用“基因剪刀”的新方法,可快捷高效地对大肠杆菌等常用科研生物进行基因编辑,降低基因研究的技术门槛。相关论文日前发表于《自然—通讯》杂志。图片来源于网络  近来兴起的“基因剪刀”技术能让研究人员像在电脑上编辑文档一样,精确查找某个基因在基因组中的位置,进行删除或修改。目

简化人类细胞基因编辑的新方法

  用RNA指导的CRISPR-Cas9系统的动物和植物基因组工程,正在改变着生物学。与其他基因工程工具相比,这种技术更容易使用,并且更有效,因此,在其发现后的短短几年内,就已经被广泛应用于世界各地的实验室,也成为编辑人类多能干细胞、人类胚胎干细胞基因组最常用的技术。1月6日,Cell子刊《Cell

评估混合人群祖先基因的新方法

最近的基因分型技术给理解复杂疾病等相关问题带来了空前的机遇。进行这项研究的最大障碍是潜在的亚群之间能产生假象联系。之前的研究大都采用基因分型、平行比较对照和病例组的基因频率等方法。这种方法很难观察到人群原始的基因结构。 加州大学和卡耐基-梅隆大学的科学家们开发出了一个新的研究混合人群中当地祖先(LA

肾癌基因提供肾脏再生新方法

       4月13日外媒报道,据波士顿儿童医院研究表明,近三分之一的肾母细胞瘤病例(一种儿科肾癌症)都与一种叫Lin28的基因有关。研究人员发现,表达Lin28基因的小鼠的肾脏上会长出肾母细胞瘤,撤销Lin28的表达情况会有所好转。这一发现表明:阻碍或停止该基因有可能治疗儿童肾母细胞瘤。小鼠模型

基因分型的新方法被研发

    廉价的基因分型方法对现代基因组学至关重要。在最新这篇论文中,研究人员报道了QUILT,它使用低覆盖率的全基因组序列数据执行二倍体基因型填充。QUILT采用吉布斯采样将读数划分为母本和父本集,并使用大型参考面板促进快速单倍体填充。  研究人员证明了这种划分在许多兆碱基上是准确的,能够实现接近理

面筋测定仪对湿面筋测定的新方法

  面粉的品质优劣有多项指标,其中湿面筋的含量就一项重要的指标,在这方面的研究方法,传统的主要是手工洗涤法,费工费时。在生产生活水平不断提高的今天,仪器测定方法是势必代替了手工方法的。面筋测定仪是一种近年来国际上开始投人使用的面粉检验仪器,它仿照人手指的功能顺序进行搅拌成面团后再冲洗淀粉,然后用离心

土壤金属含量测定新方法:微波消解

微波消解技术已广泛应用于生物、地质、冶金、煤炭、医药、食品等领域的样品处理过程中。1、土壤的微波消解 土壤是农业生产重要的自然资源,是植物生长发育吸收水分和矿物质养分的载体。随着人类对重金 属的开采、冶炼和加工活动的日益增多,土壤污染不断加重。重金属对土壤的污染,会影响植物的生长 发育,

新方法可无损破译基因表观遗传密码

  美国宾夕法尼亚大学研究人员开发出一种破译DNA表观遗传密码的新方法,利用DNA脱氨酶进行基因测序。他们8日在《自然·生物技术》杂志上发表论文称,新测序方法克服了沿用数十年的亚硫酸氢盐测序法的局限,将有助于更深入理解肿瘤生成等复杂生物过程。  表观遗传指的是在基因核苷酸序列不发生改变的情况下,基因

新方法让西红柿基因工程研究加速

  西红柿对于植物研究来说已经是一个理想的模型物种了,但是美国博伊斯汤普森植物研究所(BTI)的科学家们将修改基因所需时间减少了6周,这使它们更有用。  为寻求西红柿和其他农作物更加多产,BTI助理教授Joyce Van Eck和博士后科学家Sarika Gupta开发了一种更好的方法来“转化”西红

北京生科院提出编码基因重建的新方法

  2016年11月,国际学术期刊《基因组生物学》(Genome Biology)在线发表了中国科学院北京生命科学研究院计算基因组学实验室研究员赵方庆团队题为A novel codon-based de Bruijn graph algorithm for gene construction fro

《癌症基因治疗》-李明远小组-siRNA基因治疗新方法

来自四川大学华西医学中心微生物学教研室,成都生物制品研究所(Institute of Chengdu Biological Products)的研究人员通过构建质粒pAd-hTR证明了hTR siRNA在HeLa细胞系中有效和特异的端粒酶的敲除,从而指出了这种siRNA表达重组腺病毒系统在癌症基因治

新方法可更精确测定木制文物年代

  据日本媒体近日报道,日本科学家开发的一种新方法能精确测定遗址或文物所使用木材的年龄。这种方法不分树种,只需少量木材样本,就能精确到以年为单位,测定耗时短,成本低廉。   新检测法利用了木材纤维素中的氧同位素比率受当年降水量影响的现象。自然界的氧有三种稳定的同位素——氧16、氧17和氧18,其中

rapid-CS-cube:新方法测定碳硫

  德国Elementar公司推出的rapid CS cube,是最新型的快速碳硫分析仪,可分析煤、化学品、土壤/废弃物等环境样品中的碳和硫。相比于传统的、把样品放入坩埚入炉燃烧的碳硫分析仪,新型的rapid CS cube把样品包裹入锡舟中。这种方式使样品可以很容易地通过样品进料器把样品送入垂直燃

美找到追踪基因源头新方法-有望让所有基因“认祖归宗”

美国科学家近日在《自然》网站上发表文章称:由美国麻省理工学院和哈佛大学Broad研究院科学家组成的研究团队找到一种新方法,能让来自不同基因组的所有基因追根寻源,找到“祖先”。该方法首先用在真菌的17个物种上。该方法也可以解释为什么新基因突然冒出,它们怎样存活等。 研究团队的伊兰·万普斯科和同事发明了

美药管局批准血型基因检测新方法

  基因检测是通过血液、其他体液或细胞对DNA进行检测的技术,是取被检测者脱落的口腔黏膜细胞或其他组织细胞,扩增其基因信息后,通过特定设备对被检测者细胞中的DNA分子信息作检测,预知身体患疾病的风险,分析它所含有的各种基因情况,从而使人们能了解自己的基因信息,从而通过改善自己的生活环境和生活习惯,避

美药管局批准血型基因检测新方法

美国食品和药物管理局近日批准一种基因检测方法,可更容易、精确地确定献血者和受血者在ABO血型外的其他稀有血型,从而保证输血安全。  目前发现的人类血型系统有35个,既包括传统的ABO系统,也包括稀有的Rh、孟买、P、Kell与MNS等血型系统。  美药管局说,有些人的血型属于稀有血型,特别是镰状细胞

美药管局批准血型基因检测新方法

  美国食品和药物管理局近日批准一种基因检测方法,可更容易、精确地确定献血者和受血者在ABO血型外的其他稀有血型,从而保证输血安全。  目前发现的人类血型系统有35个,既包括传统的ABO系统,也包括稀有的Rh、孟买、P、Kell与MNS等血型系统。  美药管局称,有些人的血型属于稀有血型,特别是镰状

Nature子刊报道预防转基因逃逸新方法

  这种方法被称为“合成不相容”,可使人工物种成为真正的独立物种,无法与野生或驯化亲属杂交生成可存活后代。  合成不相容在根除或控制入侵物种、作物害虫、病媒昆虫、转基因物种逃逸等方面具有极广泛的用途。  这项技术使用了一种名为“可编程转录因子”的新分子工具,它可以控制体内特定基因的开合。如果转基因物

新方法打破基因编辑技术对遗传转化依赖

近日,中国农业科学院油料作物研究所油料作物逆境生物学和抗性改良团队联合成都市农林科学院相关团队,建立了一种新型的基因编辑方法。该方法打破了基因编辑技术对遗传转化的依赖,直接通过授粉的方式对油菜和甘蓝的基因进行基因编辑,获得了不含转基因元件的突变材料。相关研究成果发表于《植物生物技术杂志》。 油菜

新方法:超低细胞数表观基因组研究

  日本九州大学和东京理工学院的科学家们研发了一种使用非常少量的细胞,范围从100到1000的细胞,来分析DNA-蛋白质相互作用的新技术。他们的方法可以捕获前所未有的细胞内表观遗传组信息,该技术奖促进生物标记的发现并为精准医学开辟新道路。  这项被称为染色质整合标记测序(Chromatin Inte

PNAS:发现测定DNA构象变化的新方法

  中国科学院生态环境研究中心环境化学与生态毒理国家重点实验室汪海林研究员与加拿大阿尔伯塔大学Chris Le和Michael Weinfeld教授合作发现一种测定DNA构象变化的新方法,并以此为基础,揭示了一种DNA修复机制。该研究成果的详细论文发表在2009年6月15日出版的美国《国家科学院院刊

Science:新方法在活细胞中改变基因组

  来自MIT Broad研究所和Rockefeller大学的研究者发展了一种新的方法,能够在活细胞内精确地增减基因,从而操作基因组。研究人员称,这项技术可以提供一种简单易行,并且相对低价的方法来从事各项研究,包括设计能够产生生物能源的有机体,设计动物模型来研究人类疾病,发展新的治疗方法等。