专访汪洋:具有抑癌作用的“电影剪辑大师”
人类基因组中大约有25,000个基因,这个数字不大,甚至和小小的果蝇基因数目相同,那区别于其它动物的人类智能,还有“千人千面”的多种族多面孔,又是如何而来呢?科学家告诉我们其中的一个重要原因就在于人类基因组DNA序列能以不同的方式拼接在一起,创建各种信使RNA,从而产生了人类需要的许多不同蛋白质,这就像是一个“电影剪辑大师”,选择性地将电影场景片段拼接在一起,创造出大片来。 但是这个“电影剪辑大师”有时也会出现问题,一旦发生突变或缺失,对我们人体的健康就会产生重大的影响,比如引发诸如强制性肌营养不良,还有癌症之类的疾病。 近期来自大连医科大学、美国北卡罗莱纳大学的研究人员就发现了这样一个关键的“剪辑大师”――RBM4, 与正常组织相比,癌组织(包括肺癌和乳腺癌)中的RBM4表达量明显下降。也就是说RBM4需要保持合适的数量,保证基因被正确剪接,才能确保癌症不会发生发展。这一研究成果公布在著名的癌症研究期刊《Cance......阅读全文
选择性剪接
中文名选择性剪接外文名alternative splicing别 名可变剪接作 用mRNA前体加工特 点表达水平的不同而导致不同的表型定义选择性剪接(也叫可变剪接)是指从一个mRNA前体中通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点组合)产生不同的mRNA剪接异构体的过程,使得最终的蛋白
致癌新机制:“选择性剪接”
由于正常细胞周期基本机制(如复制、DNA修复和细胞死亡)遭到破坏,在世界范围内,癌症已成为死亡的主要原因之一。 在基因组测序技术的帮助下,如今的生物医学研究人员已经可以鉴定不同肿瘤患者体内的常见遗传突变。 通常情况,人们认为只有DNA突变会导致癌症。9月21日《Cell Reports》杂志
中科院Cell子刊发布选择性剪接研究新发现
来自中科院上海生命科学研究院营养科学研究所的研究人员证实,SRSF10通过调控选择性剪接在成肌细胞分化及葡萄糖生成中起重要作用。这一研究发现发布在11月11日的《Cell Reports》杂志上。 领导这一研究的是中科院上海生命科学研究院营养科学研究所代谢性疾病的基因表达调控研究组组长冯英(Y
营养所揭示SRSF10调控mRNA选择性剪接的新机制
1月18日,Nucleic Acids Research在线发表了中科院上海生命科学研究院营养科学研究所研究员冯英组的最新研究进展:Transcriptome analysis of alternative splicing events regulated by SRSF10 reve
Nature子刊:深度学习预测传统RNASeq无法检测的选择性剪接
项目负责人Yi Xing博士是CHOP计算和基因组医学中心主任,本周他与博士生Zijun Zhang和Zhicheng Pan在《Nature Methods》报道了这款DARTS的框架。DARTS,又称为深度学习加强的RNA-seq转录剪接分析(Deep-learning Augmented
原代肿瘤细胞选择性培养:汇合饲养层肿瘤细胞筛选实验
实验方法原理在指数生长中期,用丝裂霉素C处理饲养层细胞,将细胞培养形成汇合的单层。通过胶原蛋白酶消化从活检标本分离肿瘤细胞,或者用胰蛋白酶消化从原代培养物获得肿瘤细胞,然后将肿瘤细胞接种到汇合的单层上(图24.1)。上皮性肿瘤细胞可以在3周至3个月内形成克隆。纤维肉瘤和神经胶质瘤并不总是形成克隆,而
原代肿瘤细胞的选择性培养:汇合饲养层肿瘤细胞筛选...
原代肿瘤细胞的选择性培养:汇合饲养层肿瘤细胞筛选实验饲养层技术取决于通过其他接触抑制细胞形成的单层预防成纤维细胞的过度生长。 饲养层技术并不能选择性抑制正常上皮细胞, W为正常表皮细胞和正常乳腺上皮都能在 汇合的伺养层上形成克隆。然而,神经胶质瘤研究的结果表明,在同种饲养层上选择培养等同的正常细胞是
原代肿瘤细胞的选择性培养:汇合饲养层肿瘤细胞筛选
实验方法原理 在指数生长中期,用丝裂霉素C处理饲养层细胞,将细胞培养形成汇合的单层。通过胶原蛋白酶消化从活检标本分离肿瘤细胞,或者用胰蛋白酶消化从原代培养物获得肿瘤细胞,然后将肿瘤细胞接种到汇合的单层上(图24.1)。上皮性肿瘤细胞可以在3
自剪接
自剪接(self-splicing)出现在稀少的内含子组成核酸酶,核酸酶在只有RNA的情况下代替了剪接体的功能。自剪接的内含子有两种,称为I型及Ⅱ型。I型及Ⅱ型内含子以与剪接体类似的方式进行剪接,但不需要任何蛋白质。这种相似性使人相信这些内含子与剪接体在演化过程上有着关连。自剪接亦可能是非常古老,且
RNA-剪接
中文名称RNA 剪接英文名称RNA splicing定 义在真核细胞核中从RNA初始转录物切除内含子,连接外显子形成成熟的mRNA的过程。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)
异常剪接
中文名异常剪接定 义指对序列库中异常剪接mRNA的鉴定和分析隶属领域生物领域主要功能处理多顺反子性转录单元,调控转录效率和mRNA的稳定性,同时可以增加产物蛋白的多样性
以毒攻毒——利用腺病毒选择性杀伤肿瘤细胞
IDIBAPS生物医学研究所和IRB Barcelona的生物医疗研究所的科学家们领导一个研究项目,他们利用一个新测量对病毒进行基因改造,让它们选择性地攻击肿瘤细胞,放过健康组织。 传统的肿瘤治疗手段因为欠缺细胞选择特异性,通常会造成一些不良的副作用。杜绝这些状况是非常重要的(病没治好,人先被
肿瘤选择性肺转移炎症机制获揭示
中国医学科学院院长曹雪涛院士研究小组,发现肿瘤细胞为何选择性转移至肺部的新型免疫炎性分子机制,为阻断肿瘤肺转移提供了新思路。《癌细胞》近日发表了该最新研究结果并对此工作专门配发了评论。 目前认为,在肿瘤转移之前,原发灶肿瘤能通过向血液释放一些可溶性因子,募集骨髓细胞到即将转移的远端靶器官,营造
剪接位点
中文名称剪接位点英文名称splicing site;splice site定 义剪接体可识别的RNA前体中内含子和外显子连接边界的序列和接头位点。根据位置不同可以分为供体和接纳体剪接位点。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
剪接体
剪接体(英文:spliceosome)定义:由核小RNA(snRNA,U1、U2、U4、U5、U6等)和蛋白质因子(约100多种)动态组成、识别RNA前体的剪接位点并催化剪接反应的核糖核蛋白复合体。只与SMT蛋白理解与糖性一致。
广州生物院肿瘤miRNA选择性治疗研究获进展
近期,国际学术期刊《癌基因》(Oncogene)发表了中国科学院广州生物医药与健康研究院张必良实验组的研究成果Selective killing of lung cancer cells by miRNA-506 molecule through inhibiting NF-κB p65 to
简述第Ⅳ类内含子的剪接tRNA的剪接
酵母基因组共有约400个tRNA基因,含有内含子的基因仅占十分之一。内含子的长度从14到46个碱基对不等,它们之间并无保守序列,切除内含子的酶识别仅是共同的二级结构,而不是共同的序列。通常内含子插入到靠近反密码子处,与反密码子碱基配对,未成熟tRNA的反密码子环不存在,而是以插入的内含子所构成的
调控NMD因子UPF3A的选择性剪接在结直肠癌中的重要功能
4月11日,国际学术期刊International Journal of Cancer 在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所冯英组的最新研究进展“U2-related proteins CHERP and SR140 contribute to colorectal tumorigenesi
蓝光和环境温度通过CRY2CIS1调控RNA选择性剪接及开花时间
11月18日,《自然-通讯》(Nature Communications)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心刘宏涛研究组撰写的题为CRY2 interacts with CIS1 to regulate thermosensory flowering via FLM alternati
关于RNA剪接第Ⅱ类内含子的自我剪接介绍
第Ⅱ类内含子,其5’剪接点和3’剪接点的序列多为…外显子…↓GUGCG…内含子…嘧啶碱AU↓…外显子…,除了剪接点序列特征之外,在离3’剪接点上游6-12bp有一段比较保守的序列,一致序列为CUCAC,在这一保守序列A的两侧各有一段3~5核苷酸的短序列能与上游方向的核苷酸互补,而A总是不包含在这
前剪接体和剪接体的分离及分析实验
剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体(RNP),它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成,在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理剪接体是由 RNA 和蛋白质
关于第Ⅲ类内含子的剪接hnRNA的剪接的介绍
核基因hnRNA内含子的剪接点序列为…外显子…↓GU…内含子…AG↓…外显子…,这就是普遍适用的所谓Breathnach-Chambon规则(GU-AG规则)(GU-AG rule),此规律不适合于线粒体和叶绿体的内含子,也不适合于tRNA和某些编码rRNA的核结构基因,酵母的分支位点序列是高度
前剪接体和剪接体的分离及分析实验
实验方法原理 剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体(RNP),它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成,在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。
第1类内含子自我剪接rRNA的自我剪接介绍
第1类内含子,其5’剪接点和3’剪接点的序列绝大部分为…外显子…U↓…内含子…G↓…外显子…,除了剪接点序列特征之外,第1类内含子还具有比较保守的4种10一12核苷酸的序列,分别以5’-P-Q-R-S-3’表示,P、Q、R、S的一致序列。序列能与Q序列互补,R序列能与S序列互补,形成一个所谓中部
前剪接体和剪接体的分离及分析实验
实验方法原理 剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体(RNP),它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成,在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。实验材料 PIP 10 载体核苷酸焦磷酸酶RNasinT7 RNA 聚合酶
专访汪洋:具有抑癌作用的“电影剪辑大师”
人类基因组中大约有25,000个基因,这个数字不大,甚至和小小的果蝇基因数目相同,那区别于其它动物的人类智能,还有“千人千面”的多种族多面孔,又是如何而来呢?科学家告诉我们其中的一个重要原因就在于人类基因组DNA序列能以不同的方式拼接在一起,创建各种信使RNA,从而产生了人类需要的许多不同蛋白质
研究发现全新自主产权抗肿瘤选择性抑制剂
近日,西安交通大学药学院李义平教授团队和美国佛罗里达大学药学院李成龙教授开展国际合作,针对磷脂酰肌醇-3-激酶α(PI3Kα)选择性抑制剂的发现,历经十年,在设计合成的600多个6H-苯并[c]苯并吡喃母核化合物中,发现了全新结构、具有完全自主知识产权的PI3Kα选择性抑制剂,编号为XJTU-L45
组织选择性如何作用于肿瘤抑制基因BAP1
众所周知,肿瘤抑制基因的丧失导致一小部分癌症出现在特定组织中。但是为什么仅是那些组织? 由肿瘤抑制基因发生突变引起的恶性肿瘤具有不明原因的组织倾向性。比如,一种称为BAP1的肿瘤抑制基因编码组蛋白H2A的去泛素化酶,但是生殖细胞中的BAP1突变主要与葡萄膜黑色素瘤和间皮瘤存在关联。 在一项新
关于RNA剪接的简介
大多数脊椎动物基因的编码序列,无论是编码多肽的基因还是编码除mRNA以外的RNA分子的基因,都是由非编码的间隔序列(内含子)分隔为各个外显子部分。这些基因的外显子和内含子都转录在一条初级RNA转录分子中,接下来,此初级RNA转录分子要经过RNA剪接,此过程包括一系列的加工反应:RNA的内含子部分
概述RNA剪接的类型
RNA剪接及其机制的研究,不仅解决了不连续基因“连续”转录产物的问题,而且对于了解不连续基因的起源乃至整个生命起源与进化等问题,均产生极大的推动作用,另外,由此发现了核酸分子的催化功能,进一步拓宽了对于酶的认识。不连续基因中的介入序列称为内含子;被内含子隔开的基因序列称为外显子(exon)。一个