OxfordNanopore发布新产品PromethION
Oxford Nanopore似乎与ASHG（美国人类遗传学协会的年会）有着不解之缘。在ASHG 2012上，Oxford Nanopore展示了MinION的真机。在ASHG 2013上，它又宣布启动MinION的早期试用计划。而在今年的ASHG上，Oxford Nanopore揭开了其新产品PromethION的神秘面纱，并宣布了测序仪的一些更新。 PromethION是一款平板电脑大小的台式测序仪，不过要比iPad大一些。这款仪器维持了MinION的简单易用、软件直观和极少样品制备，能够带来低成本、可扩展且长读取的测序，适合那些对流程灵活性有着更好要求的用户。 纳米孔是以模块化的方式排列的，Oxford Nanopore称之为Nanopore cassettes。这些cassettes可根据需要来添加。你可以增加或减少流动槽的数量，而不需要让仪器满负荷地运作，以便维持每个样品的成本。 流动槽设计意味着只需要少量样......阅读全文
PNAS：新技术实现纳米孔内快速测序DNA
据《每日科学》近日报道，由美国华盛顿大学物理学家领导的研究小组设计了一种新技术，可在纳米孔内对DNA进行快速测序，而且价格比较便宜。新方法可为癌症、糖尿病或某些成瘾患者量身绘制个性化基因测序蓝图，提供更加高效的个体医疗。相关论文发表于美国《国家科学院院刊》（PNAS）。 论文主要作者
纳米孔测序首次实现1－Mb的读长
高通量测序的产量让人惊叹不已，但读长却屡屡遭人诟病。不过，从100 bp到1 kb，读长始终在进步。近日，测序界传来了一个激动人心的消息，澳大利亚Garvan研究所的研究人员利用Oxford Nanopore测序技术实现了> 1 Mb的读长，这堪称测序历史上的一个里程碑。 Kinghorn临床
牛津纳米孔测序将全面升级，回避IlluminaZL之战
一直以来，牛津纳米孔公司对其核心产品的微通道都持有保密态度，然而自测序巨头Illumina公司对其进行ZL诉讼之后，牛津纳米孔透露了其最新设备的驱动因子——细菌孔隙，似乎有意回避Illumina的ZL之战。 纳米孔测序被誉为是一个比传统测序更便携和实惠的技术，根据单核苷酸通过孔隙产生的电流变化
Nature－Methods：放在背包里的测序仪
人们盼星星、盼月亮，总算等到了纳米孔测序仪开放试用。如今，1000多个实验室测试了MinION测序仪，并发表了结果。他们在这一期的《Nature Methods》上介绍了他们的使用体会。而更多的产品也在开发之中。 纳米孔（nanopore）技术让核酸分子穿过直径只有几纳米的孔而确定其序列。这个
国内首个菊花脑基因组测序纳米孔测序再发高分论文
菊属植物种类繁多，又含多种栽培种，兼具观赏和药用价值，且染色体组结构从2n=18到8n=72之间，十分复杂，多年来难以攻破。 中药所所长陈士林研究员、副研究员宋驰博士等利用ONT平台解析了可能代表栽培菊属祖先基因组的二倍体菊花脑基因组，分析表明其演化受重复序列爆发和近期WGD事件的驱动，该基因
测序仪性能知多少
2015年二代测序走得更远。因为测序价格下降，技术的提高，测序读长增大，研究人员开始利用二代测序和配套设备来更好的评估长范围的基因组信息。 DeciBio最近的市场报告显示， NGS对应的市场已经达到$ 24亿。并预计2019年将增长至 $ 45亿。临床应用将成为推动这一增长的主要原因，包括单
测序仪性能知多少
2015年二代测序走得更远。因为测序价格下降，技术的提高，测序读长增大，研究人员开始利用二代测序和配套设备来更好的评估长范围的基因组信息。 DeciBio最近的市场报告显示， NGS对应的市场已经达到$ 24亿。并预计2019年将增长至 $ 45亿。临床应用将成为推动这一增长的主要原因，包括单
170万！复旦大学纳米孔测序仪招标项目
项目概况 复旦大学纳米孔测序仪 招标项目的潜在投标人应在复旦大学采购与招标管理系统（网址为：https://czzx.fudan.edu.cn）获取招标文件，并于2023年12月21日 09点30分（北京时间）前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号：1069-234Z20234618
美国批准“纳米孔测序”新冠检测试剂EUA
纽约 -美国食品药品监督管理局上周授予美国实验室公司紧急使用授权，用于基于纳米孔测序的检测SARS-CoV-2的试剂。 该试剂被称为Clear Dx SARS-CoV-2 WGS v3.0测试，使用牛津纳米孔技术的MinIon测序仪和Clear Labs Clear Dx自动样品制备和分析流
GEN：纳米孔测序——传染病诊断的新“前锋”
假设你是Doctors Without Borders组织中在西非工作的一名医生，一个发热、头疼、疲劳的小孩被带进你的诊所。根据当地的环境和季节，最可能被诊断出的就是疟疾或埃博拉。然而，这两种疾病都不能给病人一个积极的预后。埃博拉病毒能够快速传播给其他人，需要将患者尽快隔离。 这种情况下，确诊
纳米孔直接RNA和cDNA长读长测序概述
RNA测序已经在生物学和医学的各个领域取得了前所未有的发展。在包括癌症在内的诸多疾病中，转录异构体的表达和用途是健康组织和患病组织之间变异的重要来源。鉴定差异剪接的异构体和融合转录本，可以为疾病的诊断和治疗提供信息。RNA测序还有助于揭示从单细胞到整个组织的转录组动力学。同时，cDNA测序也极大
纳米孔直接RNA和cDNA长读长测序概述
RNA测序已经在生物学和医学的各个领域取得了前所未有的发展。在包括癌症在内的诸多疾病中，转录异构体的表达和用途是健康组织和患病组织之间变异的重要来源。鉴定差异剪接的异构体和融合转录本，可以为疾病的诊断和治疗提供信息。RNA测序还有助于揭示从单细胞到整个组织的转录组动力学。同时，cDNA测序也极大
带您了解第三代基因测序技术
高通量测序技术（也称为二代测序技术）迅猛发展，已逐步广泛应用于基因检测的多个方面的临床服务，其对于单核苷酸多态性和小于50bp的插入或缺失变异检测相对比较准确，但是大的结构变异检测却非常困难。另一类以不经过扩增的单分子测序和长读长为标志的DNA测序技术也随即问世，这类测序技术被称为第三代测序技术
全面解读第四代测序技术
纳米孔测序技术（又称第四代测序技术）是最近几年兴起的新一代测序技术。目前测序长度可以达到150kb。这项技术开始于90年代，经历了三个主要的技术革新：一、单分子DNA从纳米孔通过；二、纳米孔上的酶对于测序分子在单核苷酸精度的控制；三、单核苷酸的测序精度控制。目前市场上广泛接受的纳米孔测序平台是Oxf
牛津纳米孔收购加拿大Northern－Nanopore－扩张固态纳米孔领域
近日，牛津纳米孔技术公司（Oxford Nanopore）表示收购加拿大生物技术初创公司Northern Nanopore Instruments（NNi），这家公司开发了一种固态纳米孔制造技术。 本次收购没有披露财务条款。 据Oxford Nanopore介绍，NNi专门从事低成本、精确的
新型纳米孔器件有望用于表观遗传学快捷测序
新华社布鲁塞尔５月９日电（记者潘革平）比利时校际微电子中心（ＩＭＥＣ）９日发表公报说，该中心成功开发出一种能直接读取单分子ＤＮＡ（脱氧核糖核酸）碱基的新型光学纳米孔器件，有望用于遗传学研究快捷测序。 据介绍，新型器件结合了表面增强拉曼光谱和纳米孔流体技术，能以超高分辨率，实现无标记检测ＤＮ
科学家开发出高精度纳米孔蛋白测序法
长期以来，直接读取蛋白质的一级结构存在许多困难。科学家通常会根据基因序列和氨基酸密码子表来“破译”蛋白质的氨基酸序列。由于转录后修饰和翻译后修饰等生命活动的存在，氨基酸序列破译结果并非完全正确，甚至与真实序列有很大差异。近期，荷兰科学家开发出高精度纳米孔蛋白测序法，该技术能够读取蛋白质信息内容，
英一公司称研发出纳米孔基因测序技术
早上起来刷个牙，就能顺便检测自己有没有患癌症或者老年痴呆的危险。这种便利方式离我们不远了。英国一家公司首席技术官克莱夫·布朗24日在一次医学会议上说，借助纳米孔基因测序技术，有望很快实现测序仪微型化，从而使它们“无处不在”，持续监测我们的健康状况。 纳米孔基因测序技术采用微
新型纳米孔器件有望用于表观遗传学快捷测序
比利时校际微电子中心（ＩＭＥＣ）９日发表公报说，该中心成功开发出一种能直接读取单分子ＤＮＡ（脱氧核糖核酸）碱基的新型光学纳米孔器件，有望用于遗传学研究快捷测序。 据介绍，新型器件结合了表面增强拉曼光谱和纳米孔流体技术，能以超高分辨率，实现无标记检测ＤＮＡ中的遗传编码以及表观遗传变异。研究近期发
一种全新的高精度纳米孔蛋白测序法
长期以来，直接读取蛋白质的一级结构存在许多困难。科学家通常会根据基因序列和氨基酸密码子表来“破译”蛋白质的氨基酸序列。由于转录后修饰和翻译后修饰等生命活动的存在，氨基酸序列破译结果并非完全正确，甚至与真实序列有很大差异。近期，荷兰科学家开发出高精度纳米孔蛋白测序法，该技术能够读取蛋白质信息内容，
哪些因素影响纳米孔测序仪的重复性？
掌上测序仪好不好？用过才知道。最近，五个试用了Oxford Nanopore MinION测序仪的实验室评估了仪器的重复性，并在开发标准操作和参考数据。这些实验室属于MinION分析和参考联盟（MARC），该联盟由MinION早期试用计划的参与者组成。目前，第一阶段的结果已经发表在开放获取期刊
第三代高通量测序技术简介——纳米孔
第一代Sanger法为DNA测序打开了大门，但它高昂的费用限制了在大规模测序工程上的使用。当今发展迅猛的第二代高通量测序设备，包括Illumina的Solexa、Roche 454系列以及ABI的SOLiD系统等，使测序费用大幅降低到60-1美元/megabase。 它们共同的缺点是
科学家开发出高精度纳米孔蛋白测序法
长期以来，直接读取蛋白质的一级结构存在许多困难。科学家通常会根据基因序列和氨基酸密码子表来“破译”蛋白质的氨基酸序列。由于转录后修饰和翻译后修饰等生命活动的存在，氨基酸序列破译结果并非完全正确，甚至与真实序列有很大差异。近期，荷兰科学家开发出高精度纳米孔蛋白测序法，该技术能够读取蛋白质信息内容，
纳米孔测序联合光学测绘揭示转基因植物细节
索尔克的研究人员利用最新的DNA测序技术，在分子水平上研究植物插入新基因后会发生什么。 索尔克的研究人员绘制了具有最高分辨率的转基因植物系基因组和表观基因组图，为了精确地揭示插入一段外源DNA后，在分子水平上会发生什么。他们的研究结果发表在2019年1月15日的PLOS Genetics，阐明
Oxford－Nanopore携手BioMérieux合作开发进军传染病IVD检测领域
近日，Oxford Nanopore 公司和BioMérieux宣布合作开发传染病体外诊断（IVD）检测。本次交易的财务条款没有披露。 该公司表示，他们正在研究将纳米孔测序引入传染病诊断市场的机会，初步合作包括开发一种用于确定抗生素耐药性结核病的体外诊断测试。这是一种在正常无菌的临床样本中识别
首次！纳米孔测序让流感病毒终于“无所遁形”|－Nature
4月12日，这项研究的领导者、美国疾病控制和预防中心（CDC）的微生物学家John Barnes在给bioRxiv服务器（生命科学领域专有的预印本文献库）的预印本（a preprint posted）中介绍了这项工作，他说：“我们第一次可以真正开始观察基因组在其原始状态的本质，这确实开始开辟了很
2016国家自然科学基金：纳米孔测序技术
来自国家自然科学基金委员会的消息，8月17日国家自然科学基金委员会公布了2016年国家自然科学基金申请项目评审结果，其中面上项目16934项、重点项目612项、创新研究群体项目38项、优秀青年科学基金项目400项、青年科学基金项目16112项、地区科学基金项目2872项、海外及港澳学者合作研究基
拉曼光谱应用：新型光学纳米孔器件有望用于快捷测序
比利时校际微电子中心（IMEC）9日发表公报说，该中心成功开发出一种能直接读取单分子DNA（脱氧核糖核酸）碱基的新型光学纳米孔器件，有望用于遗传学研究快捷测序。 据介绍，新型器件结合了表面增强拉曼光谱和纳米孔流体技术，能以超高分辨率，实现无标记检测DNA中的遗传编码以及表观遗传变异。研究近期发
武大联合团队开发纳米孔靶向测序－快速“捕获”新冠病毒
武汉大学联合团队创新性开发了纳米孔靶向测序检测方法（NTS），能大幅提升病毒阳性检出率，并能实现当天同时检测新冠和其他10大类、40种常见呼吸道病毒并监测病毒突变。 3月7日，该团队在预印版平台medRxiv发表题为《纳米孔靶向测序精准全面检测新冠病毒以及其他呼吸道病毒》的研究论文。 既往
纳米孔测序重大升级，超高准确度，向临床诊断迈进！
近年来，第三代基因测序技术发展迅速，在基因组学研究以及临床疾病诊断领域备受青睐。该领域上游企业英国Oxford Nanopore Technologies（以下简称“ONT”）因其测序技术在样本处理以及成本等方面占据较大优势，而受到国内基因测序服务企业的钟爱。相较于二代测序，三代测序技术拥有单分子无