NatureMethods：放在背包里的测序仪
人们盼星星、盼月亮，总算等到了纳米孔测序仪开放试用。如今，1000多个实验室测试了MinION测序仪，并发表了结果。他们在这一期的《Nature Methods》上介绍了他们的使用体会。而更多的产品也在开发之中。 纳米孔（nanopore）技术让核酸分子穿过直径只有几纳米的孔而确定其序列。这个孔可能是蛋白质，如嵌在聚合物膜中的α-溶血素，也可能是固体材料中形成的孔，如氮化硅。在膜上施加电压，形成离子电流和电泳力，拉动DNA穿过这个孔。这时，它会带来序列特异的电流波动。这种方法也能用来分析RNA和蛋白质。 纳米孔测序仪可处理长度在10,000,-50,000 bp的DNA片段，未来甚至达到100,000 bp。这些长读取让研究人员能更快地组装成完整或近乎完整的序列。不过，纳米孔测序仪目前仍存在大量的挑战，包括需要更高的准确性，需要更高的通量，也需要更多的数据分析软件。 考虑到它的体积小巧，这种测序仪很适合检测环境中的病原......阅读全文
基因测序为你揭开埃博拉病毒的秘密
2014年6月，西非埃博拉病毒爆发初期，一组研究人员以空前的规模和速度迅速破译了这一致命病毒的基因组。他们的发现揭开了病毒扩散过程中大量的关键性问题，包括病毒只通过人与人相互接触的方式传播并通过大量传播产生新变异。 虽然目前公共卫生官员们相信病毒最危险的阶段已经过去，事实上一切还尚未结束，先前
－英公开埃博拉病毒基因测序数据
一个英国科研团队成功完成了对埃博拉病毒的基因测序，并已将数据在网上公开发布，免费提供给全球科研人员使用。这有助于各国研发更高效的治疗药物和疫苗。 剑桥大学３日发布公告称，２０１４年埃博拉疫情在西非暴发后，来自该校及英国多个科研机构的研究人员开始在塞拉利昂采集病毒样本，并利用美国一家公司开发的新
埃博拉病毒专家呼吁欧洲组建反埃博拉病毒军队
据法新社12月26日报道，一个研究埃博拉病毒的微生物学家称，如果欧洲不像美国那样把病毒当成“国家安全问题”来重视，那么欧洲会很容易被病毒攻击。 伦敦卫生及热带医学学院主任彼特•皮奥特称(Peter Piot)：“我们没有重视病毒，而我们的不重视导致我们变得很脆弱。”在英国《独立日报》的采访中
详解牛津纳米孔测序仪
牛津纳米孔测序仪在美国人类遗传学学会年会上公布技术参数 2014年的ASHG年会于10月18日开始在圣地亚哥举行，有幸亲眼目睹了牛津纳米孔公司MinIon的现场演示，技术之创新，令人震惊!21日下午，牛津纳米孔公司特地在旁边的Hardrockho举行了一个小型的封闭式的技术说明会，讲解了纳米孔的
详解牛津纳米孔测序仪
2014年的ASHG年会于10月18日开始在圣地亚哥举行，有幸亲眼目睹了牛津纳米孔公司MinIon的现场演示，技术之创新，令人震惊!21日下午，牛津纳米孔公司特地在旁边的Hardrockho举行了一个小型的封闭式的技术说明会，讲解了纳米孔的测试结果。 尺寸 MinION的尺寸之小，大大出乎我的
埃博拉基因测序难为“无米之炊”
随着埃博拉病毒横扫西非，科学家缺乏重要基因数据来解答引发众多担忧的猜测：这种病毒会变得更具传染性和更致命吗？它会发生变化，让其逃避诊断测试或疫苗吗？非洲和欧洲实验室的冰箱里存放着取自埃博拉患者的数千份血液样本，但它们并未被使用，且少数几个获得新基因数据的研究小组并未公开信息。 研究人员渴望近
深度测序揭示埃博拉病毒何以产生多样性
最近，研究人员发现，RNA编辑会导致埃博拉病毒的mRNA多样性，但是这对病毒来说意味着什么呢？了解更多…… 来自西奈山伊坎医学院、加尔维斯顿国家实验室和J. Craig Venter研究所的研究人员发现，线状病毒——包括埃博拉病毒和马尔堡病毒，在感染期间，会产生比以前预计的范围更广的基因产物。
埃博拉病毒致病机理
埃博拉病毒粒子的直径为80纳米，长度为970纳米，属丝状病毒科。较长的奇形怪状的病毒粒子相关结构可呈分枝状或盘绕状，长达10微米。来自扎伊尔、象牙海岸和苏丹的埃波拉毒株其抗原性和生物学特性不同。第4个埃博拉毒株(Reston)能引起人以外的灵长目动物致命性的出血性疾病；文献报导有极少数人感染此病
简述埃博拉病毒特征
埃博拉病毒粒子外观呈线状，直径为80nm，长度为970nm，属丝状病毒科埃博拉病毒属。较长的奇形怪状的病毒粒子相关结构可呈分枝状或盘绕状，长达10um。来自扎伊尔、象牙海岸和苏丹的埃博拉毒株其抗原性和生物学特性不同。第4个埃博拉毒株（Reston）能引起人以外的灵长目动物致命性的出血性疾病；也有
GEN：纳米孔测序——传染病诊断的新“前锋”
假设你是Doctors Without Borders组织中在西非工作的一名医生，一个发热、头疼、疲劳的小孩被带进你的诊所。根据当地的环境和季节，最可能被诊断出的就是疟疾或埃博拉。然而，这两种疾病都不能给病人一个积极的预后。埃博拉病毒能够快速传播给其他人，需要将患者尽快隔离。 这种情况下，确诊
纳米孔测序技术
测序长度和准确率的快速提升使得纳米孔测序有望颠覆DNA测序市场。纽约威尔康奈尔医学院的计算生物学家Christopher Mason喜欢在会议上表演一个“绝活”：他和同事先从志愿者手机上收集DNA样本，然后就能在一个小时内现场进行谱系分析，甚至叙述志愿者一天的生活细节。“我们能从留在手机上的DNA信
Nature：实时、便携式基因组测序
埃博拉病毒（EBOV）感染人类会引起致命的出血热，发病率和病死率极高。2014年这种病毒在西非造成了严重的疫情，死亡人数已经超过11,000人。今年一月份，就在人们以为这场疫情正式结束之际，塞拉利昂又出现了新的病例。 本期Nature杂志发表的一项新研究展示了便携式基因组测序仪在这次疫情中起到
塞拉利昂再现埃博拉病毒
在世界卫生组织（WHO）于1月14日宣布西非埃博拉疫情结束的同时，该组织警告称，在某些情况下，这种病毒很可能会卷土重来。而这正是塞拉利昂发生的事情——就在WHO的这一声明发布后几个小时，又有一名埃博拉感染者在该国死亡。 塞拉利昂卫生官员向记者介绍说，一名22岁的女性在接近几内亚边境的Baomo
埃博拉病毒为何难“破”
西非地区的埃博拉疫情引起全球关注。但其实，人类早在1976年就发现了埃博拉病毒。近40年过去了，科学家为何仍未研发出针对这一致命病毒的特效药物或疫苗？破解埃博拉到底难在哪里？ 首先要从埃博拉病毒说起。这种病毒很难对付，对实验室中的培育环境要求极高。相关实验必须在高安全防护措施的实验室
Science及Nature共述：口袋里的DNA测序仪，可实时诊断
纳米孔测序的想法起始于25年前， 2012年5月4日《Science》首次报道了Oxford Nanopore公司研制的纳米孔测序仪样机——MinION，用于破译病毒DNA。然而MinION的发展历程并不那么顺利，英国牛津大学基因组学中心基因组学家Rory Bowden说，“众所周知，在每次读取
－Oxford－Nanopore：纳米孔测序仪开放试用
在上个月的美国人类遗传学协会年会上，英国Oxford Nanopore Technologies公司宣布将启动MinION测序仪的试用计划。这次，它果然没有食言。MinION试用计划于11月25日启动，将延续到2014年初，具体截止日期未定。 根据这项试用计划，参与者须支付1,000美
纳米孔测序仪真机现身ASHG
英国Oxford Nanopore Technologies公司在年初的基因组生物学技术进展年会(AGBT)上发布了一款便携式的基因组测序仪MinION，性能强劲，价格给力，引发市场轰动。然而，大半年过去了，纳米孔测序仪却迟迟不见踪影，连更早发布的GridION也未上市。于是，生物界开始议论
Nature－Methods：纳米孔测序仪潜力无限
来自英国Oxford Nanopore公司的MinION是第一台商业化的纳米孔测序仪。它在带来无限希望的同时，也承受着高错误率的质疑。英国伯明翰大学的Nicholas J. Loman和爱丁堡大学的Mick Watson在最新一期的《Nature Methods》上撰文，称新开发的工具让纳米孔测
蝙蝠或是对抗埃博拉病毒关键
澳大利亚联邦科学与工业研究院的科学家研究称，蝙蝠的免疫系统可能是人类对抗埃博拉病毒奥秘所在。 埃博拉病毒的起源目前还无法完全确定，但大部分科学家认为非洲果蝠(African fruit bats)可能是其起源之一。 澳大利亚联邦科学与工业研究院(CSIRO)的米歇尔·贝克博士说，蝙蝠身上载有
新法可快速检测埃博拉病毒
科技日报北京9月30日电(记者刘岁晗)美国研究人员近日完成的一项原则证明性研究称，基于DNA排序的实时血液检测，可迅速对埃博拉出血热、基孔肯雅热等危重传染病进行诊断。研究人员表示这项检测未来有望用于实验场地和医疗设施缺乏的地区。大多数商用或科研用基因诊断是以特定的病原体为目标。但美国加州大学旧金山分
关于埃博拉病毒的发现介绍
埃博拉病毒 Zaire Ebola virus 令世界谈之色变的埃博拉病毒（Ebola virus）源于非洲的扎伊尔，其名称就是根据扎伊尔境内的一条小河而命名。1976年首次暴发就多走了270人的生命，不过当时无人知晓是何种病毒。此后，这种神秘的病毒先后出现在加蓬、苏丹、象牙海岸甚至英国。第二次
埃博拉病毒抗体被成功分离
近日，记者从清华大学获悉，该校医学院张林琦教授研究组与呼吸疾病国家重点实验室陈凌教授课题组合作，成功分离出三株具高中和能力的埃博拉病毒抗体。相关论文发表在近日出版的英国《自然》杂志旗下《科学报告》上。 5月20日，张林琦接受科技日报记者采访时表示：“我们判断抗体是否有效，有两种方式——体外实
埃博拉病毒疫苗的相关介绍
2003年11月，美国科学家已经研制出预防致命的埃博拉病毒的实验疫苗，一名志愿者接受了这种疫苗的注射。 埃博拉病毒感染者死亡率很高，美国当局唯恐它被用作恐怖分子的生化武器，所以加紧了疫苗的研制。美国国家过敏与感染疾病研究院（简称NIAID）疫苗研究中心的科研人员2003年在贝塞斯达市的研究中心
Cell：埃博拉病毒的全面进攻
埃博拉病毒能引发一种严重的出血热综合症，导致人类和灵长类动物迅速致命。在今年2月从西非国家几内亚开始的新一轮埃博拉疫情呈现出加速蔓延之势，迄今为止这一疾病已经夺去超过4500个生命，令人感觉几近失控。 近期Cell杂志以“Camouflage and Misdirection: The Fu
便携式基因组测序装置可快速检测埃博拉病毒
[导读] 本周出版的英国《自然》杂志上发表的一项传染病学研究论文,描述了一个可以被装入行李箱并运输到现场使用的埃博拉病毒基因组测序监测系统,这个系统在收集样本后24小时内就可以得出结果。 该便携式基因组测序装置可插入笔记本电脑USB接口 科技日报北京2月4日电 （记者张梦然）本周出版的英
iPhone供电的纳米孔测序仪有望上市
Oxford Nanopore的用户组会议于上周四在伦敦召开。媒体并没有被邀请，不过一些用户和博主已经在Twitter上透露了最新消息。Oxford Nanopore正在开发一款智能手机供电的纳米孔测序仪以及一款低成本的文库制备系统。 Oxford Nanopore的用户组会议于上周四在伦敦召
2013值得关注的技术：纳米孔测序仪
《Nature Methods》杂志将2012年度技术授予了定向蛋白质组学(targeted proteomics)。同时，杂志还介绍了2013年值得关注的技术，包括纳米孔测序仪(Disruptive nanopores)、微生物组功能研究(Probing microbiome func
纳米孔测序仪为何迟迟不见踪影？
今年2月，英国Oxford Nanopore Technologies公司(以下简称Oxford)宣布推出一款便携式的基因组测序仪MinION，约摸只有U盘大小，价格低于900美元，立即引发市场轰动。同时，该公司另一测序平台GridION有望在15分钟内完成人类基因组测序，费用约为1,500
Nature－Methods：放在背包里的测序仪
人们盼星星、盼月亮，总算等到了纳米孔测序仪开放试用。如今，1000多个实验室测试了MinION测序仪，并发表了结果。他们在这一期的《Nature Methods》上介绍了他们的使用体会。而更多的产品也在开发之中。 纳米孔（nanopore）技术让核酸分子穿过直径只有几纳米的孔而确定其序列。这个
纳米孔测序仪首次于失重环境下完成测序实验
科学家们在失重环境下进行实验，首次证实掌上测序仪MinION可以在太空中使用。 Johns Hopkins大学的遗传学家Andrew Feinberg和Lindsay Rizzardi登上了NASA的低重力飞机，在模拟的失重环境下完成了遗传学实验。“我非常享受这种体验，感觉就像置身天堂，”Fe