昆明动物所等开发完成犬类SNP数据库DoGSD
家犬作为人类生活和工作中的伙伴，其进化研究一直是遗传学研究中的一个热点。然而目前使用的家犬参考SNP数据集，不仅数量少，采样地不够广泛，而且测序覆盖度差异大，SNP数据主要只来源于两个品种的两个犬只，并不利于家犬的群体遗传研究。 目前，二代测序产生了大量高质量的家犬和其祖先物种灰狼的全基因数据。为了弥补参考SNP数据集的不足及满足大数据复用的需求，在中国科学院昆明动物研究所张亚平院士和王国栋博士的指导下，云南大学白冰博士联合中国科学院北京基因组研究所赵文明老师和唐碧霞博士，建立了第一个犬类SNP数据库——DoGSD。该数据库中包含了参考SNP数据集，69个家犬及8个灰狼的全基因组SNP数据, 所包含的SNP数量是原参考数据集的7倍。DoGSD弥补了原数据集采样地少，覆盖度差异大的问题，并且第一次在SNP数据集加入了中国土狗的数据。DoGSD为用户提供了友好的检索、查询及下载页面, 其中的同义/非同义SNP检索页面，比较查询......阅读全文
家犬基因组学研究获新进展
科学界对于家犬的起源和驯化一直争议不断。近日，中科院院士张亚平带领团队发现，家犬中亚起源的假说与基于全基因组重测序数据分析的家犬东亚南部起源模式相冲突。相关成果日前在线发表于美国《国家科学院院刊》。 2015年，美国学者Shannon等人通过分析大量的家犬群体全基因组DNA芯片数据，提出了家犬
昆明动物所在家犬行为相关基因研究中取得进展
马里努阿犬是一种高兴奋型工作犬，在局促环境中常表现出转圈行为。其中表现一定转圈行为的个体较无转圈行为个体具有更高的兴奋性和工作欲望，较极度转圈个体具有更好的行为控制力。值得注意的极度转圈行为已经被定义为强迫症，且之前的研究已经发现了一些与之相关的一些基因，神经钙粘蛋白基因（Cadherin 2：
昆明动物所家犬嗅觉受体基因研究取得新进展
家犬作为人类最亲密的朋友，在人类历史上一直扮演者重要的作用。更重要的是，家犬是人类最早驯化的家养动物，由于其经过了驯化和品种培育两个重要的群体历史阶段，并且在家养哺乳动物中形成了最具多样性的品种，因此家犬一直是研究人工选择和自然选择的重要模式生物。中国最为家犬的驯化地，不仅遗传多样
基因平衡选择影响家犬毛色
近日从中科院昆明动物研究所获悉，中科院院士张亚平课题组的王国栋博士和公安部昆明警犬基地程鲁光合作，对昆明犬毛色人工选择开展研究，揭示了平衡选择是品种化过程中的一种重要驱动力，为家犬人工选择提供了新的思路和线索。该研究日前在线发表于国际刊物《公共科学图书馆·综合》(PLOS ONE)。
野狮可感染家犬病毒
犬瘟热是一种致命病毒性疾病，主要存在于犬类中，但也会感染其他哺乳动物。该病毒曾在上世纪90年代中期因为首次从家犬转移到坦桑尼亚塞伦盖蒂野生狮子身上而成为新闻，此次事件曾导致该类猫科动物新宿主死亡率达到30%。 为了保护狮子，科学家启动了一项为犬类注射疫苗抵抗该病毒的运动，科技博客网The Ve
研究揭示从郊狼到北美土著家犬的古老渐渗
犬类生殖器传染性肿瘤（CTVT）是一种可以在犬科动物中传染生存的肿瘤，作为最初患瘤个体（CTVTfounder）的活化石，其基因组记录了一只古代犬科动物的遗传信息。近10年来，科学家们反复讨论了CTVT的起源和肿瘤进化过程。目前，通过对全球范围的现代家犬和部分古代家犬化石的全基因组测序，CTVT
研究揭示结构变异和新基因在家犬驯化中的作用
近日，中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室、动物进化与遗传前沿交叉卓越创新中心张亚平团队与中国农业科学院农业基因组研究所开展合作，第一次系统地构建了家犬在驯化中的结构变异（Structural Variations）图谱、探讨了新基因在驯化中的作用、并指出了大尺度基因组变异在驯化
家犬摇尾有何运动特征？研究称对人越熟悉越偏右
中新网北京7月23日电 (记者 孙自法)狗摇尾巴有何运动特征？偏左还是偏右？中国科学院(中科院)合作团队最新完成的一项研究发现，与每个人都有独特的步态相类似，人类最忠实的朋友——家犬也有着独特而稳定的摇尾特征：它们尾巴摇摆的左右偏侧化与其与人的熟悉程度有关，对人越熟悉越偏右。这项研究由中科院遗传与发
研究揭示家犬同人类近万年来的共迁移历史
家犬是人类第一个驯化的动物，考古证据表明至少一万年前欧亚大陆多处均出现了犬的身影，其起源、扩散以及与人类迁徙的互动关系等科学问题对于理解动物驯化和人类文明传播都至关重要，因此长期受到学界的关注。早期基因组研究表明，家犬早在两万年前就已出现了血统分化并于欧亚大陆广泛扩散，但这些扩散是否与特定人类文化群
昆明动物所等揭示家犬适应欧洲牛奶饮食的遗传机制
家犬大约在1万五千年前到4万年前从欧亚大陆的灰狼驯化而来，现已遍布世界大部分有人类居住的地方。家犬与人类生活在相同的环境中，在很多方面存在趋同进化，家犬对环境的适应性进化遗传机制一直是进化生物学家的研究热点。经历长时间的人工选择和自然选择，欧亚大陆家犬分成欧洲家犬和东南亚两个群体，其背后的遗传机
“大灰狼”如何变家犬？“狗狗祖先”DNA来揭秘
作为家犬的唯一野生祖先，灰狼的相关研究对理解家犬起源具有重要的作用。为探究东亚灰狼遗传演化历史及其与家犬的联系，中国科学院古脊椎动物与古人类研究所联合西北大学等单位开展了中国古代灰狼群体母系遗传研究。5月29日，相关研究成果发表于《整合动物学》。 在这项研究中，研究人员成功获取了来自中国北方的
昆明动物所揭示非洲家犬复杂的源流历史
近日，《遗传学和基因组学杂志》（Journal of Genetics and Genomics）发表了中国科学院昆明动物研究所张亚平课题组题为A Cryptic Mitochondrial DNA Link between North European and West African Dog
昆明动物所等开发完成犬类SNP数据库DoGSD
家犬作为人类生活和工作中的伙伴，其进化研究一直是遗传学研究中的一个热点。然而目前使用的家犬参考SNP数据集，不仅数量少，采样地不够广泛，而且测序覆盖度差异大，SNP数据主要只来源于两个品种的两个犬只，并不利于家犬的群体遗传研究。 目前，二代测序产生了大量高质量的家犬和其祖先物种灰狼的全基因数据
基因组所与昆明动物所在家犬起源进化研究中取得新进展
5月14日，中科院北京基因组研究所与中科院昆明动物研究所在家犬起源进化合作研究中取得重要进展，相关论文在最新一期《自然·通讯》在线发表。该研究成果从全基因组层面上阐述了狗的起源进化，并首次将其进化历史和人类的近期演化联系了起来。 在昆明动物所张亚平教授和基因组所吴仲义教授的带领下，昆明动物
张亚平等揭示青藏高原家犬低氧适应机制
记者8月27日从中科院昆明动物所获悉，该所张亚平课题组与云南大学、中科院北京基因组所、青海大学等合作发现，藏犬群体表现出与藏族人群非常相似的高原适应性模式。相关成果发表于《基因组生物学与进化》杂志。 据了解，家犬自古以来跟随人类活动迁徙和扩散，即使在海拔超过3500米的青藏高原上，依然表现出与
家犬基因组联盟发表dog10K计划白皮书
2016年，来自世界各地的20多位科学家成立家犬基因组联盟，全面深度探讨家犬起源与驯化、人工选择、疾病机制、医学模型等重大科学问题。自成立后，科研工作积极有序进行，近期研究联盟在国际刊物National Science Review上发表dog10K计划白皮书。 研究联盟指出，家犬是行为和表型
昆明动物所等揭示澳洲野犬群体起源机制
澳洲野犬（Canis lupus dingo）英文名dingo，分类学上属于犬属，灰狼种，澳洲野犬亚种，是澳大利亚特有的一种野生动物。它也是一种非常有趣的动物，首先，它生活在与外界孤立的澳大利亚，却不是澳洲的原生物种，由于澳洲的特殊地理位置，澳洲野犬只会是人类迁移澳洲携带过去的，因此研究澳洲野犬
人工智能证实了狗狗的尾巴“会说话”
在中科院遗传发育所昌平实验基地拍摄的一只比格犬。这只幼犬刚开始见到记者时惊慌失措猛烈摇尾巴，此后逐渐安静下来，偶尔与记者对视。 冯丽妃摄 俗话说，眼睛是心灵的窗户。对于狗狗来说，尾巴则是情感的窗户。 “它们高兴时，尾巴会摇得很快；生气时，尾巴会翘起来；害怕时，会夹着尾巴逃跑。”多年的研究，让中科
跟你熟不熟，狗狗尾巴会说话
7月底，记者在中科院遗传发育所昌平实验基地拍摄的一只比格犬。这只幼犬从一开始接触时的惊慌失措猛烈摇尾巴逐渐安静下来，偶尔与观察者目光对视。 冯丽妃摄俗话说，眼睛是心灵的窗户。对于狗狗来说，尾巴是情感的窗户。“高兴时，它们的尾巴会摇得欢快；生气时，它们的尾巴会竖着翘起来；害怕时，它们会夹着尾巴逃跑。”
我国科学家破解中国古代家犬线粒体全基因组
2020年1月8日，《分子生物学与进化》（Molecular Biology and Evolution）在线发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所古DNA实验室研究员付巧妹团队与中国科学院昆明动物研究所、陕西省考古研究院、浙江省文物考古研究所、兰州大学和四川大学等合作完成的关于中国古代家犬线
中国古代家犬线粒体全基因组揭示其种群扩散
1月8日，中科院生物一区杂志《分子生物学与进化》（Molecular Biology and Evolution）在线发表了中国科学院古脊椎动物与古人类研究所古DNA实验室付巧妹研究员团队与中国科学院昆明动物研究所、陕西省考古研究院、浙江省文物考古研究所、兰州大学和四川大学等合作完成的关于中国古
研究揭示锐目猎犬的群体历史及擅长奔跑的遗传机制
家犬约在1万五千年前到4万年前从欧亚大陆的灰狼驯化而来，现已培育超过400个品种。而多数品种均是在距今200年内的维多利亚时期或更晚的时间培育出的。锐目猎犬是一类辅助早期人类狩猎的家犬品种。这类家犬依靠视觉辨认目标并高速奔跑进行捕猎。有的锐目猎犬品种甚至具有8000年的种群历史。不同品种的锐目猎
北京大数据研究院成立拟推动数据研究成果转化
8月27日，国内首个整合了政府、大学和市场三方面资源的大数据研究机构——北京大数据研究院今天在北京大学揭牌。北京大数据研究院是在北京市委市政府的支持与指导下，由中关村管委会、海淀区政府、北京大学、北京工业大学四方共同支持中科院院士、北京大学教授鄂维南牵头筹建。目标是吸引国际一流大数据研究人员来京
张亚平团队揭示非洲家犬抵御疟原虫侵害遗传机制
中国科学院昆明动物所张亚平院士团队首次揭示家犬在伴随人类的过程中适应非洲炎热自然环境的遗传机制，为今后非洲人群疟疾研究工作提供重要靶点和参考，这是该研究团队在推动万犬基因组计划发展中取得的又一新成果。相关研究结果近日发表在《分子生物学与进化》上。 家犬约在3万多年前从东亚的灰狼驯化而来，并于
呼吁数据共享！数据烂手里，何谈研究话语权？
导 读 在大气、海洋、冰川等需要国际合作的研究领域，中国普遍缺乏拿得出手的高质量数据。问题出在了哪里？ “我们国家在数据方面基本没有话语权。” 在谈到IPCC报告里鲜有来自中国的数据时，A学者不无感慨地告诉《知识分子》。这位要求匿名的研究者举例说，在2013年第五次IPCC报告中，为决策者
大数据研究推翻常规认识
近年来，科学创新日渐进入"大数据"时代，各种高通量的分析手段以及各类"组学"的发展，使得我们对生命科学的基本原理以及与人类健康有关的疾病发生机制方面有了更加深入的认识。针对最近一段时间以来科学家们利用"大数据"的手段产生的科学进展，我们进行简要的盘点，希望大家能够喜欢。 1. Nat Gene
狗鼻子生来平等
为什么夏洛克·福尔摩斯会用猎犬来寻找线索，而不是用哈巴狗？根据预印本平台bioRxiv发布的一项研究，这一切都归结为行为和训练，而不是狗本身具有的气味探测能力。该研究没有发现任何证据能够表明某些家犬品种的嗅觉比其他品种更好。狗鼻子是超敏感的，但研究人员认为训练和行为可能会导致不同品种气味检测能力的差
中国科学家通过基因编辑技术建立孤独症家犬模型
作为儿童和青少年常见的一种精神疾病，孤独症(又称自闭症)致病机理及医疗研究长期以来备受学界和社会广泛关注。 中国科学院遗传与发育生物学研究所(遗传发育所)10月27日在北京举行脑疾病家犬模型成果研讨会宣布，该所张永清团队联合中外多家科研机构长期协力攻关，在国际上首创孤独症家犬模型，基因编辑突变犬
大数据时代：海量数据为科学研究带来重大机遇
“大数据的概念听上去和云计算一样，有些‘高大上’，但是大数据绝不是一个空泛的口号，事实上它不仅改变了人们的生存面貌，更为科学研究带来重大的机遇。”中国科学院遥感与数字地球所研究员郭华东说。 依托海量的数据状态和云级别的数据处理能力，大数据以其Volume（大量）、Velocity（高速）、Va
科学家研究认为：大数据时代“小数据”仍有未来
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504106.shtm大数据时代，“小数据”有未来吗？武汉纺织大学数理科学学院江健教授团队与美国密歇根州立大学Guo-wei Wei教授团队共同研究认为：“有！”相关研究成果日前在线发表在国际期刊《化学评论